BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124M02.T7 (MSMg01no124_m02.b1) | MSMg01-124M02.TJ (MSMg01no124_m02.g1) |
ACC | AG334028 | AG334029 |
length | 1,274 | 1,181 |
length of high quality (start - end) | 423 (33 - 455) | 698 (118 - 815) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_m02.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_m02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_m02.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_m02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:16 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCCCGCCAGCACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGG
AATTCCATGTCTGCCTAAGTGCTGCCATGCTCCCTGCCATGAGGATTGTG
GGTCTCCTTCTGCCCAGGGTCATTGGCCACCAGCCCACAAGGACAAAGGG
AGCACACTCAACTAACAGGGTTTAAAAAAGCTAGACAGGGTTTAGTGAGC
TTGAATGGAAATAATGACATTTCAGGATCAGCTTTCAAGAGACAGATCAA
CTTTATACAGGTGACTCAAGGGTAATATTGAAGGGCTATCAATATCCAGG
GTAAGCAAACGTCACTGGCGAAAGGCTAGAGTACCTAGATGCCTCATTAC
CATGGGGAGGCAGTCCCAGAATTCAGGTGCTTCCAATACAATCTCACCTA
GGTTATGTTACATTCTGCTGGTAGCGGTTGGAAAGATTTCAGGCTTCTCA
CATAATTTTTTTTTCCCCCCCCCGTCCCACTGGTCCCCCCCCCCCAAAAA
AAAGGGGCGAGCTCAGCGATTCCGGGTAGTGGCAGACTCAGATCTTAGCT
AGCAGGGCTCAGCATAGGATAATGAACTTAACCCTCTGACACCGTGAGCA
AGCCCCAATTAAACGCTTTCTTTATACGTTACTATGATTGTGGCTTCTTT
TCCCAGCAATAGAACAGACTGAGGCACCACATGTCCCTTCTCTTCTCCTA
GGGGTAAGGGACATGATTCTTTTTTTTTTAAAGACTTACCTTATTTTATT
ATATATCGGTACCTGGTACGCTGTCTTCAGACCCTCCCGAAAAAGCTCAC
CAGATCTTATTACCCTTGGCTGTGACCCACTGCTTTCTATCTGGCGCGTG
AAAAGCGCCCTCCTGTCTTCTCTGCCCCCCCCAGGTCGCCATTTACTAGG
CCCGCTCTTCCCTCTTCCTTTTCAACTATTTCATCCTCCCTGGTGCCCCC
TGCCTTCCCCATATTCACTTTCGCTCAACCTATGCCTTGTGACACCAAAC
CCTTCCCATGTATCTCCCGCCCCCTTGCTCTTCCCACACCTCCTCTTCAT
CCCCCACCCCCTTTCCCCCACAACCACAATCCCTCCCTACATAAATCCCG
TCATTTCCCAGACGCCACTCCTTCCTTCTCTCCCCTCACTCACCTCTCCC
TCCAACATATTCCCCTCTCCTTCTTCTACCTAACGCAATCCCCTTCCGCA
CTCACATCACCCCACGCTTCTCCTAATCTTCCTCTCTACCACCTATCTCT
ACTCATCCTCACATCCCACATAAC
| TTTTTAACCAGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTCTAAAAAGACCATTGTCTGACTCACTCCTTC
CTGTCCACCCTTATACAGTCCGTGTGTCTCCTTAACCAGCTCTTCTCCAT
TCATCCAATCTGAAACATCTCTGCTGTGGATCTTTGTCTCATGACTTTCA
TTTTCTTATAGCCCATGGCCCATCCTGAGATGTCTTGCCTAGTTTAGAGA
AACTGCATCACTGCTTGAATTGTTTTCTGCCTGCACAGACAGGCTAAGGA
GAAAATGTCCCTCAAGGAGAGATAATAAGTTACAAAGCAGTATTTGGCAT
GGTCCTTGTGATACTCATAACACACATATATGTTAGGTGAATCATGCTTT
GTAAAAGTGTCTGAGAAATGGCTAGGTAAAAAAAATAAATAGGCACACAT
ATAAAGAGTGCCTCTTCCTGGGAATAGGATTATAAATATACTTTTCCTCT
ACATTTACTTGAACAGTTTGTGTCCGTATATAATCAATCAATTACATTAA
TTGTACTCAGAAAACAAAATCAAGCTATTTCTGTTTTTAAAAGAAGAAAA
CCAGGTATAGCTATAAGAAATCTGATGCTTAAAAAGAAGTGCATCACAGG
ATCTGAACCAATGACTGACAAAAAGAACTACACGTGACTTTAAAAACAAA
AGGCTTTCCTGGTTACACCAGGCTATGTGCTCACATCTGAAGATTTGGAC
TTAGGAGCCTCAAATGGGAGAAAGCATGTAGCGTTTGCCTTTCAGTTCCA
TGCATGTACCTGAAAAGTTCATGTTTGGATTTGTTTTTTGTTTTTGTTTT
ACAGCTGAATAGTACAATATATATGTACCACGCTTTCATTATCCACTTGT
CAACTGAAAGGCATCAAAATTGTTACCACTTCCCAGCTATTGAAAAAAAA
TGGCAGTGAATCCCTATGGAGAATTGGCAAATTTCCTTGGACACAACTGA
ACCTAATAATAACTTTTTTAAAAATTCTCCACCTACTTTTCCAAAAGGGT
TGTACCACTTTCCTAATCCCAAAACTGGAAAAAGGGGTTCTTTTTTCTCC
CCCATTCTTTTCAAAAAATTGGGGGTGGAAAAATCCTTAAACCTTGCCCC
CCCCAAAAGGGGAAAAAAAAAAAATCTCCAA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 7 6 3 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 16 21 13 11 10 8 8 8 15 19 10 10 10 15 12 12 24 25 42 37 33 37 32 32 36 35 23 23 11 10 10 15 17
34 35 39 24 19 13 11 15 19 31 25 28 28 31 25 30 24 28 36 26 26 16 18 14 19 21 28 28 29 30 30 37 36 31 31 22 34 28 28 28 36 36 41 46 46 39 39 36 36 39
39 28 32 15 21 24 28 28 28 32 32 37 37 36 24 19 13 20 19 26 30 38 42 57 57 43 43 32 42 42 42 42 43 41 41 27 29 29 43 43 57 43 57 47 47 50 57 59 59 57
44 44 18 18 16 16 24 36 21 28 28 27 27 32 44 44 57 57 57 57 46 46 36 42 37 37 52 47 47 52 52 52 52 38 38 20 16 16 28 30 39 33 39 33 39 39 45 44 44 39
39 43 47 43 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 43 43 24 23 23 43 44 44 43 39 33 33 44 43 44 26 26 23 43 43 43 43 39 39 39 43 43 35 35 35
43 43 62 62 62 62 62 35 35 35 44 43 45 52 43 38 16 14 14 32 32 62 62 62 62 62 62 44 44 43 41 27 35 27 43 20 20 35 38 38 45 45 52 57 57 57 57 57 57 57
52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 30 25 10 10 10 13 12 10 23 23 57 57 57 57 57 46 46 41 41 52 43 43 33 43 43 43 32 35 35 43 43 57 50 41 41 41 36 36 15 15
15 30 32 43 38 26 27 13 18 18 19 19 15 36 32 38 19 15 14 14 18 30 30 43 32 32 23 23 23 38 42 38 42 37 37 37 39 57 46 54 54 57 47 47 47 47 47 46 27 27
11 11 12 18 25 15 15 12 11 11 18 23 37 46 48 42 42 28 24 18 18 28 32 32 20 23 23 23 23 31 28 23 32 28 37 37 47 47 48 48 48 48 59 48 34 34 23 23 23 34
32 30 30 17 17 10 21 15 15 18 10 11 9 10 10 12 17 26 24 19 12 11 9 9 11 18 17 30 33 39 39 23 23 11 11 11 10 11 10 13 11 24 23 20 16 15 14 17 20 22
17 14 14 9 8 8 8 7 7 11 22 23 19 17 10 8 8 8 15 19 13 21 19 22 22 33 28 28 20 20 20 28 18 21 12 13 21 23 12 11 11 16 26 28 28 25 12 12 12 24
21 24 18 18 18 30 24 14 19 21 11 11 12 23 27 23 23 25 32 32 36 35 35 37 37 42 35 41 33 37 30 28 24 19 20 19 32 27 14 11 11 14 18 22 32 28 25 25 28 33
37 31 31 21 23 11 11 13 24 24 25 16 15 14 21 14 16 14 18 28 30 28 31 21 17 10 10 10 15 17 30 28 25 25 28 32 24 22 21 22 12 10 10 13 8 8 8 8 11 15
15 15 27 23 15 12 11 17 11 12 11 12 12 21 21 20 15 20 19 17 17 13 15 15 14 14 12 18 11 11 11 10 12 27 27 33 21 29 37 29 29 31 31 20 23 12 12 12 16 10
8 8 10 8 8 10 11 11 10 9 9 9 9 9 10 12 24 24 28 33 25 24 28 19 16 16 24 26 13 11 11 11 11 10 13 12 10 10 8 8 10 10 15 18 29 32 22 22 16 16
8 8 8 8 8 8 9 9 11 9 10 12 12 11 18 9 8 8 8 8 8 13 8 10 9 9 8 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8
8 10 10 10 15 12 12 12 12 12 11 12 10 10 10 9 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 15 9 9 11 10 10 10 10 8 12 7 6 8 8 10 10 10 10 9 9 9 9 13 10
10 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 12 14 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 12 13 10 8 8 6 7 10 8 8 10
10 12 12 11 8 8 8 10 10 8 9 9 8 10 10 10 13 11 11 11 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 15 10 19 13 9 8 8 8 10 10 12 19 21 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 12 12 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 10
9 9 9 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 12 11 11 8 8 9 9 13 8 9 10 11
15 16 14 10 10 10 10 10 19 21 16 16 15 17 17 15 15 13 9 9 12 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 13 12 10 10 10 13 10 13 8 8 6 6 8 8 11 12 16 11 11
8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 10 10 6 6 8 8 9 10 9 8 8 10 10 14 15 15 10 10 7 7 8 8 8 8 9 10 10 13 10 10 10 15
10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 13 11 6 6 6 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 11 12 9 9 10 10 8 8 8 8
8 10 9 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 13 8 9 9 9 9 8 8 8 15 15 10 8 8 8 9 9 9 8 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 3 3 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 15 8 9 9 9 16 14 19 21 19 8 9 10 19 19 19 12 12 24 30 36 38 36 37 37 34 24
24 29 30 50 50 53 50 50 50 50 47 43 27 23 9 9 12 14 12 12 11 11 11 12 12 12 18 25 28 33 33 31 31 31 35 35 35 38 42 42 53 50 50 50 50 50 36 53 44 44
33 33 33 29 21 17 11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 18 23 33 33 37 37 36 36 35 36 36 36 42 43 43 43 43 53 47 53 53 50 50 50 53 68 47 47 47 47 47 47 68
68 68 68 68 54 53 50 50 50 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 57 57 52 57 57 59 59 57 57 59 59 59 68 57 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 39 39 23
23 23 39 39 43 44 62 68 68 62 62 62 62 39 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 39
43 35 35 31 31 29 27 14 14 13 12 12 12 13 39 39 52 44 44 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 41 41 43 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 59 44 57
52 43 42 57 43 43 33 33 28 38 38 16 24 19 26 27 32 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 50 59 43 43 52 52 52 52 57 52 57 57
57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 50 57 57 57 47 57 54 57 57 57 57 57 32 32 20 24 24 36 38 42 43 46 57 57 57 47 47 54 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 48
46 46 40 40 43 59 59 54 48 48 41 41 48 42 43 36 43 33 40 34 34 13 13 15 32 32 48 48 48 57 57 57 59 48 48 48 48 48 39 39 37 37 39 39 39 34 30 20 23 32
31 30 36 32 37 26 24 18 24 32 37 37 43 39 34 24 18 22 28 30 37 37 37 41 43 43 43 34 34 36 36 37 32 30 28 24 28 25 22 20 26 23 30 37 41 46 41 42 48 41
36 30 28 21 21 13 16 23 36 36 15 11 11 12 12 18 26 16 16 24 27 27 19 16 16 18 14 19 19 22 22 20 13 11 8 8 8 21 21 8 8 8 14 21 23 33 33 37 37 39
37 24 19 9 9 9 19 15 19 14 11 11 14 15 17 19 10 10 8 12 12 8 8 8 12 12 18 15 23 16 20 20 20 31 31 39 21 21 12 12 12 13 25 15 21 16 14 19 9 8
8 9 9 12 13 18 16 22 16 19 9 10 10 10 15 15 11 8 8 8 8 8 9 9 9 21 22 15 15 13 14 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 10 8 9 12 12 9 9 8 8
8 8 8 8 8 17 10 9 8 8 10 8 6 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 11 12 12 11 11 18 28 21 11 9 9 9 10 6 8 6 6 8 15 8 8 8 6 6
7 8 8 8 8 8 10 9 9 10 8 8 8 9 17 21 12 10 12 10 11 11 15 12 10 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9 14 21 22 22 10 9 9 9 9 9 10 9 9 9
9 9 9 11 9 12 19 23 15 16 11 11 10 10 9 9 9 9 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 12 9 9 12 12 10 10 8 8 8 15 21 30 15 12 11 11 11 16
11 6 6 6 6 8 6 8 13 24 21 17 17 24 21 9 9 7 10 6 6 8 6 8 8 10 10 10 12 16 15 12 9 9 9 9 15 15 8 8 8 8 6 6 6 6 8 11 18 17
17 11 8 8 8 9 12 16 14 12 11 15 14 19 26 21 32 28 36 32 17 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |