BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-142D15.T7 (MSMg01no142_d15.b1) | MSMg01-142D15.TJ (MSMg01no142_d15.g1) |
ACC | AG346892 | AG346893 |
length | 1,253 | 1,262 |
length of high quality (start - end) | 677 (87 - 763) | 280 (131 - 410) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_d15.b1 PHD_FILE: MSMg01no142_d15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:01:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_d15.g1 PHD_FILE: MSMg01no142_d15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:01:38 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (117,224,720 - 117,225,396) | (117,364,956 - 117,365,235) |
---|
sequence | CTTTCCTTNNNCACCATTCGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGATCCGCG
GAATTCTCAGAGTCTCACACAGCCCTTTAAGTCTCCTCAAACAATCTCAT
TTGATTTTCTTATCCCTTTTATGTGTGCATTTGCCCGCCTGCCTGAGTTT
ATGTGTAGTGCATGCATGGAGACACTCATGGAGATCAGAGCGTGTCACAC
CCCTTTGTAATTTTTAATTTATAGCTGGATGTTTTGGGAATCTTAAGCAT
TTATTAAAGTATTCAAGCTATACCATTAAAAATATGAGGAAGCCATGTTC
AGGGAGAAAGGAATCTGAATGTATGTCTTTGGAAAGGAGCTTATGTGTCT
GAGGTACCAGATATGTAAGCCCAATGAGTAGAAAGTCAAATGGAAAATGA
CCCCTGTACCCCAAATGGCCAAAAGTCCCAAAGACACCCTCCACAAAATA
ACTAAAGGGGCTGTGGAGATTGCTCAGTGAGTAAGTATATTTGCCCTACA
AGCATGTGGGCTTGAGTCTGAATCTCCAGCACCCACCTAAAACTATGGGC
ACAGCTTCATGTAACCCCTGTGATATTGGGTTAAAACATGGTAGATCCTT
TGGGCTTGCTGGCTGCCAGCCTAGCTCCAAGTTCAGTGAGAGACCCTGTC
TCAATAGAAAAAGGCAGAGAAAGATGGAACACAGTCAATGATCTCTTCAA
TCCTCTGGGAACTTGAACACATGTGTAGACATCACACATCACATATACAC
TCATATATGAATACAAAATACATACTTACCTAAAAATTTAAAATATGTAC
AAATGGATAGAGAGAGAAGGTTCCACAGTTAAGAGTACTTCCTGTTCTGG
CAGAGTGCCTGGATTTGTTAACAGCATTCCCCAGTGTCTCCTAACCCTTC
CTTGACTCTGCTTCTAAAGGTTTGGTGCCCCCTCTGGTCCTCCTTTGGCA
CCAATCTTGTACTTGGTGCCCAATAATTTCCTAATAACTAAAACCTTTCT
ATGTTATCTAACTTTCTAACTTTTCTATCTCATTATTTTATTATTTTTTG
GCTCTTTACCAATCCTCTCCCTAAAAAAATATTTGGTGGTTCTAATTTTT
TCTCTAAATATTATTTCTTTATAACCGTATATAAATCCCTTTTGTGTTCT
CCTTCATATTCTCTTTTTATTCTCTTTCANCTTCCTATTGTTTTTTCTTC
TAATAATAATACAAGTAAATGTTCTTCTCAATCTATTCGCTGTTTAATAT
AAN
| CCCGCTTTTNTTNNAATCATGTGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTAAGGTCTACCATAGGAC
CCGGGNTTTTGTCCCTAGAACCCTTAAACATACACGTACACCCTTAAAAT
CATTTTCCGAATCAAAGCATTGGCTCTGATTGTTTGTTTTCTGGTTAATA
ATAGGCCCAGAAGAGTCATAGCCACACTGAGGATCGCGAGGATCTCGGAA
GAGGTGCCAGAGAAGGAGACCACGCGGAAAGGGCGCTCTCCAGGGTCCTG
AAACCCCATCTCAGTCTGCGCTCTAAAGGGCGGTCTGAGACACCTGGGTG
AGCTTTAGGACAAATAGAGGGCTTGTGTTCCCTGAGTACCATGACCTTCC
AATTGAGAAAATTATAAATGAGACTCAATATTAATAGTTCTTACCAACTG
CTGGGTGATTACAGAGTTGAAAAGGTGCAGGAGGCCTTCGCGACAGAATT
GCTATGTGGAGAAGCAAAAATGATGGGAAAGGAAAGGGCTGTGGGCTGAG
CGGAGTAGCGGCTTGAATTAAGCAAGGTTGCCATTTGAGAGCAGGGACCA
CATATTCTCTGTTATCAGGTGAATTGAGCCCTTCGGTTGATCAAAATGCC
CCCTAGGTTCACAGTGGGGAAGTTCATCCTCAGAGCCGAGGTGGATGACC
TTGGCAGGGGCAATGGCAGCTGGAGGGATCGTTGCATTGTTATTGTCTCT
TATCCTCCCTGTCTGCTGTGGCTTGAGTATACAACTAGAACCCCTCGTGG
CCTCAGGGCCCATTCTGTGCATCTATCCCTGTTTTCTGTGGAAGGATGTG
TGATGTTAGGAAAACATGGACCTGCAAGTTGGACTCCCCTCTGGAGTTTA
CCGCAAGGATCCCGGGTAAATGGTTTGTTCCTGCATCTGGTTTAGGGAAA
GGCTTTTTTTGTTGTCGTTTCCCAGGGGTTTGTCCAAAATACTTTTTTTA
TCCCACGTTTTATCACTTTTCTTCTCTCCACCCCATTTTTTACTTTTATT
ATACCCCTTTTTTATACCATGGTTGCTACAATACCTTTTTATTTCTCGCC
TTCATCATAAAACACTGTGGCTTTCTCTTCTTTCCTTTCTCTTTTAAAAG
CATAATAAAATATTATTTCTCTTTTTTGCTTTATCTTAATTTTTCCATCC
TTATATCTTAATAAATACACTTTTCTTTAATCTTGTTTTTCTTTCATCAT
AAGATATTTTAT
|
quality values | Open.Hide.12 12 12 12 9 7 8 3 0 0 0 3 6 6 6 9 9 9 8 8 13 15 8 8 8 8 8 19 19 9 8 8 10 10 8 8 21 15 28 33 30 33 34 42 43 47 50 43 50 37
37 34 34 34 42 36 34 34 28 23 29 31 31 31 31 31 33 41 27 23 10 10 9 10 10 11 16 11 11 8 11 10 8 8 8 10 21 22 25 37 59 50 50 50 53 53 53 50 53 53
53 53 53 50 50 50 33 33 27 22 22 10 10 10 13 13 19 19 19 30 28 29 19 21 14 14 14 26 30 32 30 16 12 9 9 9 10 22 22 33 33 33 37 37 33 33 36 36 36 36
42 42 43 43 43 47 47 47 43 48 48 48 48 48 48 54 48 48 48 48 46 46 34 34 41 48 47 47 47 48 48 54 54 54 57 57 59 57 57 57 47 47 47 47 47 47 47 57 57 59
57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 59 68 68 59 59 57 57 59 57 57 57 68 57 57 57 59 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 57 52 52 57 59 59 52 52 52 57 52 52 52 57 57
57 57 52 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 35 35 35 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 45 45 43 44 62 43 39 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 43 43 31 31 43 44 43 52 52 45 45 52 62 62 62 62 52 52 52 62 43 39 39
26 16 12 12 12 15 11 13 13 26 39 39 47 62 62 62 62 52 45 45 52 52 52 52 62 52 62 62 52 43 43 35 39 39 39 39 43 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52
52 52 43 43 43 43 43 62 35 35 35 43 41 35 31 31 31 35 35 43 44 62 62 44 43 35 35 44 44 62 57 57 57 35 35 35 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 41 38 43 35
35 43 43 57 57 59 57 52 52 52 52 57 57 57 38 38 20 32 32 44 44 59 57 59 57 57 52 52 52 52 57 52 57 52 52 52 52 57 52 52 52 52 57 59 57 43 43 31 28 28
43 43 43 37 43 38 44 44 59 59 59 50 44 44 43 50 50 50 50 35 35 44 48 57 57 59 59 47 41 37 37 44 44 54 48 48 46 48 39 37 32 40 36 39 32 32 28 43 47 44
41 22 17 17 32 32 44 46 46 46 43 43 43 44 37 27 24 17 26 26 37 43 28 23 23 32 32 30 30 25 25 25 32 26 28 28 36 36 25 25 19 26 15 21 21 33 37 37 32 32
32 28 19 14 24 18 18 11 12 12 24 30 30 28 21 14 14 14 14 14 21 27 24 28 31 28 28 33 30 24 28 23 23 20 32 24 25 25 32 37 37 37 37 37 37 32 34 23 28 23
28 32 33 34 31 25 26 21 28 29 29 28 36 28 28 14 14 12 16 10 15 17 30 30 28 28 14 12 15 11 11 11 20 20 34 22 23 23 23 23 23 25 30 28 33 23 24 19 11 11
22 21 21 20 26 19 30 28 27 16 18 15 28 15 19 19 29 13 13 6 6 6 11 19 12 10 10 15 18 39 18 14 11 9 9 14 21 27 39 27 22 12 12 11 11 13 18 13 22 18
18 13 13 12 15 15 11 13 11 12 12 12 11 15 15 10 10 12 9 9 13 13 9 9 10 10 8 10 10 8 8 8 10 7 7 8 12 12 20 15 15 10 10 10 15 13 8 8 8 8
10 10 10 10 11 11 19 20 19 22 9 9 9 9 10 15 10 10 10 9 9 9 11 11 11 10 9 12 12 20 19 15 9 9 10 11 11 9 9 10 10 13 10 10 11 11 15 11 13 9
10 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 9 9 9 9 13 15 8 8 8 8 8 8 9 15 16 17 10 9 9 9 9 9 10 11 13 11 14 19 18 14 8 8 8 10
8 8 9 9 9 9 8 10 6 6 6 8 12 10 10 9 10 9 9 9 12 12 11 9 9 9 10 10 9 8 8 10 10 11 10 8 8 8 8 8 9 12 11 9 9 8 12 8 8 8
8 8 8 8 10 10 6 6 6 8 8 10 9 9 8 9 8 8 9 11 12 14 14 12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 16 10 10 10 9 9 8 8 8 8 10 10 18 22 16 11 8
8 8 10 10 10 12 8 8 8 8 9 10 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 11 17 11 10 10 12 10 10 10 16 10 10 10 10 10 10 11 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9
8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 10 8 10 11 11 12 15 15 16 11 10 10 9 10 10 10 8
8 8 8 9 11 8 8 6 6 8 6 6 6 6 12 12 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 13 12 10 10 10 13 14 10 9 10 14 15 9 9 8 7 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 6 10 8 8 8 15 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 6 6 8 10 8 8
8 3 0 | Open.Hide. 9 9 8 8 8 8 7 8 3 0 3 3 0 0 3 7 3 3 8 8 6 6 7 6 6 6 8 7 7 8 12 9 8 9 6 6 6 6 8 7 9 15 15 19 8 8 8 15 15 17
10 10 17 19 26 30 32 36 37 36 35 35 35 35 36 36 33 41 39 50 42 47 27 27 8 7 6 6 8 8 9 9 9 8 6 6 9 10 17 25 27 31 31 31 31 31 31 31 37 37
24 24 7 7 3 0 3 21 21 29 30 31 30 28 25 21 19 9 9 9 9 10 10 10 12 13 17 11 11 11 21 21 33 33 33 33 33 30 23 25 8 8 8 8 13 15 34 41 59 50
50 50 53 53 57 57 59 59 57 57 50 47 47 47 57 57 57 57 53 50 50 48 50 50 48 48 48 48 48 48 48 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 50 50 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 48 48 48 59 59 54 48 48 48 48 54 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 54 54 54 54
52 54 54 54 54 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 59 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59
57 57 57 57 52 52 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 41 41 15 15 13 34 34 44 44 37 37 35 42 42 47 44 57 59 44 44 28 30
30 42 42 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 54 48 48 42 42 48 47 57 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 50 50 50 41 28 18 16 10 10 8 8 8 8 8 8 10 18 25 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 57 57
57 68 59 59 41 36 23 25 19 19 19 32 32 43 43 43 43 47 57 43 42 32 41 28 20 20 18 32 30 37 43 46 57 48 54 54 59 59 47 47 47 47 47 48 57 48 54 57 59 50
48 48 50 57 57 57 57 59 59 59 50 50 35 35 35 50 50 52 52 52 57 57 44 38 21 14 14 32 38 57 57 57 57 57 57 57 54 52 57 57 57 43 43 41 43 43 57 57 57 57
37 52 52 52 43 43 43 38 38 38 38 43 52 59 59 59 59 59 59 50 35 35 35 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 48 43 43 43 42 37 42 42 37 37 46 57 57
59 59 39 47 47 59 59 57 54 48 57 47 47 47 43 43 57 57 57 34 34 32 23 25 12 15 11 27 27 59 59 59 59 54 54 54 54 42 36 29 30 29 36 43 48 32 26 16 17 17
26 26 33 37 30 30 39 43 43 48 48 43 43 39 37 37 35 39 39 35 37 30 30 20 28 28 43 39 40 32 32 23 23 23 28 28 28 34 32 20 17 17 17 17 17 30 30 39 40 40
39 39 36 33 33 30 28 28 23 23 23 26 28 37 28 20 22 12 12 12 19 19 30 12 15 12 12 12 11 9 10 17 17 24 24 25 20 22 18 24 31 32 32 34 19 19 12 19 19 32
41 48 48 48 48 48 36 35 30 30 30 30 30 31 31 28 30 37 30 18 18 15 16 15 14 15 14 9 7 10 15 16 16 17 13 13 10 12 12 17 10 10 10 10 20 21 10 10 10 10
10 14 17 15 12 9 9 9 13 14 20 20 20 24 14 14 12 18 18 14 18 23 28 28 30 30 33 33 30 27 18 18 17 17 18 21 11 10 10 8 8 8 11 10 10 8 10 8 10 13
16 15 24 21 32 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 13 10 10 10 9 9 10 10 14 14 12 10 8 10 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 10 11 11 16 13 15
12 12 13 14 16 16 10 11 9 10 9 8 9 9 9 9 9 10 11 11 14 9 11 8 8 10 8 11 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 12 10 15 10 10 9 9 12 12 10 10 6
8 7 6 8 8 14 10 9 10 8 7 10 7 7 8 8 8 8 9 10 9 9 10 10 12 12 11 13 10 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 10 9 9 9 9 9 9 10 10 6 6
6 6 10 10 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 9 7 6 6 10 10 8 8 6 7 12 11 15 12 10 10 10 10 15 15 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 12 15 15 17 15 10 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 12 11 11 11 12 11 15 10 9 15 10 8 8 8
8 8 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 8 9 8 10 6 6 8 8 6 6 10 6 6 8 8 8 11 12 10 13 11 9 6 6 7 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 10 8 8
8 8 8 8 8 10 11 10 12 8 11 10 8 9 12 11 8 8 8 10 10 10 9 18 15 15 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 26 15 13 6 6 8 8 8 6 6
8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 6 7 8 8 10 8 6 6 8 8 11 10 15 12 8 8 8 6 6 6 8 14 12 9 9 10 10 10 21 12 12 18 8 8 6 6 6 6 8 8
8 7 7 8 8 8 10 8 10 10 10 10 |