BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176J14.T7 (MSMg01no176_j14.b1) | MSMg01-176J14.TJ (MSMg01no176_j14.g1) |
ACC | AG371250 | AG371251 |
length | 1,322 | 1,338 |
length of high quality (start - end) | 327 (129 - 455) | 278 (124 - 401) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_j14.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_j14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_j14.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_j14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:33 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCCGGGCATTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCTCCTGACTCTACCTCCCACTTAATAGGCTTTCCCCCAAGNTCTTACT
ACATAGTCCGCACTTGCCTACACCTCCTCCTATGTTGTAGATCAGGCTGC
CTTTGAACTCCCAGAGATCCACCTGCCTCTACCTCCTGAGTGCTGGAAGT
TTAAAGGCGTGTGCCACCACCAGGCTTGGCTTCCAGGTGGTTTTTAATGT
ATTAAACCAATGAACAAAACTGTGTGTGCCCACGTCACTTGCTCTCATAG
ACTCCAGCGCTGGACAGTCACTAACTTTCTGTCTGATTGTGGACATTTCA
TTATGTGTGGGATCAGACCCCATGTGGCACTGTGTGAGTATGTGAGAGCC
TTCTTTTTTGCATGATATTTTCTAGACTCATCCATGTTGTATCATGTGCC
ACCTGTGTCAATACTCCCTTCCCTTTTAAGACCAGCAGTGCATGCCGGTG
ACACTGTCTCCTGTGTGTTCATCAGTTGATGGGCACTTGAGGTGTTTCCA
TTGCTGATCGTAACATTGATGTGAGCATCCACATATGCATTGCTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCACTCCCTG
GCTTTGAAGTTACAGACAATCTTGAGTGTTGGTATTCAGGATAGCACAAA
GCACTCGTTATGGCTAAAGCTGTCTCTCCGCCCCCCATGTATACATTTTC
ATATGACCATATGCCTTTCCATTCTCTGCATTATTTGCCTAGGAACTGCC
CTTGCTCTCTTTTTATTCTGTCTCGGTATCTTAATTGAAATTTTCTTTAT
CACTCCTCTCTTCTTATTTATTCCTCTCCCATTCCCTTCATATTTGTTTT
ATTTTATCTATTTCTTCTTCTGCTATTTTTTCTTCTATATTCTCTTTTGT
CTCCTTAACCTTCTCTTTTTCTTTCCTCTACCTCTTGTCTCTTTACTTCT
TCCTATCTTATCTTCCCTTTTTTCCTCTTTTCCCCTTATCTCCTTCTCTT
CTCCCCTTTTTCTCTCTCTCTCTCCTCAATCTGTTTCTCCCTCCTCTTTT
TCTCTTTACTTCCGCGGCTTCTCTTTTTCTCTCTCCTCTCTTCTTTTCTC
TCTATTTCCCAATCTTCTTTATGTCCTTCTCCTTTTTTCTCGTTTTTTCC
ATTTTCTCCCCTTCTTTCCTTCTTACCTTTTCCCTCTCCTCCCTTACCTC
TCTTCTCATCCCTCCTCTCACTTAACTCTTACTATCTCCTCCTCTCTCTC
TTTCTTCTCTTTTTTCTTCTAC
| TTTTTACGCATGGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTGAGCTCCCTAAACTCAAACATCCTTTT
CTAATCTACCCTTTAAGATCCCCACACCCCCCCGNACGCGCGCGCGCGCC
TCTTCCCACCCCCCACCCCATCCCCCGCACGCGGTACTTTTCTGCAACAA
CGCTAGGTAGATGTGCTACAATAAGACCATTCGCCACCTATATCTCGTAG
CGGGGGCGGGGGGGGTTAATCTTTGGTCAAGTCTGAAATGACTTGAAAAG
AAAAAGTAAGAGGAGAAGAGAAAAGGAATGGAAGAGGAAAAAGGCGCGGC
TTGGAACGCACGGGTCGGCTCAGGTAGACTCACTCCGGGAGGGCGTAAGG
AATTTTCTCCGTAATTTACAGGTGTAAGGCCGGGTCAATCTGGGAAGCGG
CCATATTTTTACACCCCCCAAATGGAAGCTTACCGCCAGCCGCACCGATG
CGGCGGTCAAAGCCAGAACACGGAGTTAACAACGAAAAGGGAAGGGGTGG
CGGATCGCTTTCCCCTCCACGTGCCCCTCGGTGGTTTCTGCCGCACGTTT
ACTGCGGTGCCTTTACGGTCCCCCCGCTTGTCTCCGCCCCCTCCCTTTAT
TGCATAGTCTTGGCTCCACCTCTCCGCTCCCATTTTACTTCCTAACTCCT
AATTCCCTTCTCTTCTCCCCTCATATCTACTCCTTCTCATACTCTCCACC
TCCCCTATCCTCCTTCCCACTCCCAACACCCCCTCCTTCCTTCTTTTTAT
CTTCTCCCCCTCTTATTCATCTTCACTTCCCAACTCTCCTCATCCTTCCC
TCTCTTTACCTCCCCCTCCCCACTCTCCCCTTCTCCTTCTCTCTTTTCCT
TCATTTTCACTCCATTCTCCCCCCCCTCCATCCCTTTTCTATCTCTCTTC
TTCTTTCACTTTTCTCCCACTCCTCGCCCCTCCCTTCACTTCTTCTCCAT
TCTCCCTCTCCTTCTCATTCTCATCACTCCCTCATCTCACTCTCTCCCCA
TCTCCTTTTCCTATCCCCAACCACCTCCTCTCTTCTCACTTCTTCATTTT
ACTCTCTCTCCATCCCTCTCATCTCTTTTTTCTCTTCTATTTATCTCTCT
CACTCTCGTCCTCTCCACTCCCTTTTCTCTCCTCAACTTCATCCTCTCTA
TATCCCCTTCATCTATCTCTCTTTCCTCATCCTCTCCTCTCCTACTCACT
ATCGATCCTCTCTATATCTCTCTTCTCCACTCTCACTCTCTCTCCTATCA
CTTTTCTTCCCTCTAACACCTTTCTCTTCTTCGTNCTC
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 13 6 6 8 6 6 8 10 9 9 14 12 12 12 13 10 8 8 8 10 13 11 12 10 12 12 14 16 22 24 35 34 32 32 32 33 33 33 28 28 33 34 37 30 27 26 26
30 37 37 59 37 37 37 41 41 53 41 41 37 37 37 37 25 21 8 8 8 8 8 6 7 7 8 8 10 11 12 12 15 18 27 28 47 59 59 23 23 3 0 3 21 25 39 37 37 37
33 33 33 33 33 33 33 21 19 9 9 9 9 11 10 10 10 10 13 12 10 10 13 15 19 19 14 14 14 27 27 36 37 36 43 43 50 53 53 53 57 59 57 57 57 57 57 57 43 44
36 42 42 46 46 57 57 59 48 48 47 47 43 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 50 50 47 47 47 42 36 44 44 57 57 57 57 54 59 57 68 68 57
57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 52 52 43 52 43 52 52 50 50 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59
57 57 57 52 52 43 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 54 54 54 57 57 52 43 43 37 37
37 50 50 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 50 57 57 57 57 57 59 59 59 57 46 43 43 44 57 46 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59
59 59 59 59 54 54 54 59 59 54 32 32 30 24 30 42 43 59 43 47 43 47 47 59 59 57 43 43 43 47 59 48 48 48 48 46 46 43 43 46 57 48 48 48 50 50 37 37 32 22
23 12 12 11 17 17 21 22 23 35 30 39 37 48 48 48 48 48 57 59 59 43 43 39 47 47 59 59 43 43 23 32 23 28 37 43 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 48 33 33 33
33 30 29 25 15 11 11 11 11 11 12 12 20 12 12 10 12 12 14 16 30 41 59 59 59 59 57 50 39 39 28 30 22 17 18 22 22 25 25 28 31 29 30 30 30 24 24 17 20 20
34 34 48 48 57 57 57 59 54 57 57 59 59 48 48 48 57 57 34 34 14 12 15 27 27 54 57 57 59 57 57 48 42 42 35 42 43 44 44 37 37 37 47 47 44 44 43 43 33 43
43 57 43 43 43 59 59 59 44 43 43 43 43 37 43 43 57 46 46 46 43 43 43 43 43 43 59 44 44 36 28 28 33 44 44 44 43 32 32 30 40 32 24 32 24 28 28 36 44 44
39 35 35 37 59 39 36 33 30 32 32 37 24 24 13 12 12 12 12 17 22 17 20 20 20 20 23 23 28 28 35 30 32 28 24 20 20 20 28 19 16 15 13 12 16 14 15 15 15 8
8 8 10 15 13 19 15 16 11 11 13 13 11 12 12 12 12 13 8 10 6 6 8 8 9 10 9 9 9 9 9 9 9 9 10 12 11 11 11 15 16 12 9 9 9 9 9 11 11 10
10 10 10 10 15 11 11 11 13 11 11 11 11 11 12 12 12 16 16 12 13 19 12 17 14 16 11 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 19 15 15 12 12 12 10 9 10 9 9 9
10 11 18 10 9 9 9 9 10 16 12 12 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 10 9 9 9 10 10 11 12 12 12 12 12 11 11 11 11 9 11 9 8 8 6 6 8 8 8
8 9 9 13 9 10 8 10 10 10 12 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 10 16 12 12 12 11 11 8 8 8
8 8 8 8 8 8 15 10 10 9 10 11 13 21 16 15 12 15 11 16 10 11 12 12 10 13 14 14 8 8 6 6 10 8 10 9 8 8 8 8 8 8 10 14 16 17 21 24 16 15
15 14 10 11 12 8 8 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 6 6 8 8 10 10 10 10 11 11 13 11 8 8 6 7 8 8 11 12 15 10 13 9 6 8 6
6 10 14 6 6 8 8 9 11 13 10 15 13 11 8 8 12 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 11 18 12 14 13 12 8 8 8
6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 8 8 9 10 11 13 12 10 8 8 8 10 10 11 15 11 11 10 8 8 8 8 8 6 8 10 10 8 8 8 12 8 8 12 12
11 11 10 8 8 6 6 10 11 15 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 7 7 8 8 8 8 8 8 6 8 8 12 15 15 14 8 8 8 8 6 7 8 6 8 12 12
10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 9 8 8 8 10 10 8 16 16 10 8 8 8 8 8 9 9 9 10 11 11 11 12 12 9
6 8 8 8 8 10 8 9 10 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 12 12 12 11 10 10 11 10 7 6 8 8 10 8 8 9 8 8 8
8 8 10 10 10 13 11 12 14 12 8 8 7 7 10 10 12 19 11 11 10 10 9 9 6 6 6 7 12 9 9 13 10 9 6 11 8 8 11 11 9 8 10 8 8 8 8 11 12 19
10 10 12 16 11 11 6 6 6 7 8 8 8 9 9 10 11 10 8 8 8 9 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 7 6 8 8 8 8 6 7 8 8 12 9
12 10 12 10 6 6 9 9 13 15 22 14 10 13 10 10 8 8 8 8 8 6 | Open.Hide. 7 7 7 8 8 8 8 6 6 6 7 6 7 7 7 6 8 6 6 6 6 8 10 15 9 9 8 8 8 7 8 15 10 10 8 8 10 22 19 28 22 24 28 36 33 34 34 36 36 36
29 29 29 33 33 41 37 42 41 39 23 23 3 0 3 15 8 8 8 9 9 9 9 9 12 10 7 7 6 8 8 10 10 21 23 33 33 33 33 50 53 50 57 57 57 57 57 53 53 50
50 50 50 33 30 21 21 8 8 7 8 11 17 10 9 8 8 8 8 8 8 13 13 15 23 32 32 41 41 59 59 27 27 3 0 3 23 23 19 19 34 41 59 48 48 48 59 57 50 50
53 53 53 53 47 57 57 59 48 48 57 59 59 59 54 54 54 40 40 42 42 42 54 59 59 57 54 54 54 57 57 57 48 42 42 32 42 42 57 57 68 68 59 59 48 47 47 43 47 47
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 47 57 44 44 44 50 50 57 57 57 57 50 50 50 50 54 44 44 23 23 23 43 43 54 54 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 44 44
43 43 42 41 41 43 28 28 17 38 28 43 43 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 37 37 35 43 43 37 43 38 43 43 57 57 57 57 57 59 52 54 52 52 52 52 52 43 43
47 52 43 43 43 35 35 42 43 44 48 50 50 44 50 43 43 43 44 44 44 44 44 43 43 43 42 32 27 17 17 17 18 19 27 32 35 43 47 57 57 47 47 47 47 42 40 37 30 28
28 32 28 37 35 42 42 43 43 47 42 39 30 32 31 31 33 33 37 32 42 30 33 37 43 47 39 35 39 37 39 39 39 39 39 39 39 33 30 28 37 28 37 33 39 39 28 25 12 12
11 12 12 13 13 11 11 11 16 12 18 21 28 37 37 43 43 43 43 37 37 28 33 33 37 29 35 32 39 30 28 23 23 23 25 33 31 43 40 37 28 28 18 25 25 37 27 31 16 16
11 9 9 9 9 10 16 14 12 9 9 9 9 11 11 18 15 15 11 13 18 31 31 47 39 35 28 26 18 21 19 19 18 13 11 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 11 15 15
23 24 21 18 13 10 10 10 17 21 24 17 17 17 22 24 28 28 28 28 31 28 31 32 32 28 43 36 37 35 29 29 25 25 25 28 28 21 15 11 11 19 22 29 28 23 24 16 15 12
12 10 12 12 21 18 23 23 23 17 17 15 17 16 17 24 22 18 19 16 14 16 10 9 9 15 14 14 15 10 10 8 8 8 8 8 8 11 17 21 24 18 16 14 18 19 29 22 17 10
10 10 10 14 11 8 8 8 8 8 8 12 15 16 16 11 11 11 11 18 16 13 12 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 11 11 9 9 9 8 8 8 7 13 9 6 8 8 8 8
10 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 8 8 8 10 10 8 10 10 8 9 10 10 9
11 15 24 22 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 14 12 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 7 6 8 8 9 9 9 13 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8 8
6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 11 11 10 10 10 10 10 10 18 22 24 19 10 10 10 10 10 10 13 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 10 9 8 8 10 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 10 12 8
9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 16 16 19 19 10 10 10 12 13 8 9 9 9 9 10 10 10 11 12 10 8 8 6 6 8 8 8 11 9 10 10 12 10 10 10 10 10 10 10 8
8 6 7 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 11 8 10 8 8 8 10
8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 6 6 6 6 10 8 10 8 8 10 7 6 8 8 12 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 11
11 11 20 11 11 11 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 12 11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 8 8 7 6
8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 12 11 9 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 8 15 10 8 6 6 8 8 11 9
8 8 6 6 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 12 11 11 8 8 6 7 10 10 10 10 11 10 13 8 8 6 6 8 8 11 11 8 8 8
8 8 8 8 8 10 9 9 8 10 10 10 10 6 6 8 9 6 6 8 10 7 6 8 8 13 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 10 13 9 9 8 10 6 6 8 8 12 10 8
10 10 10 10 8 8 8 10 10 8 9 8 10 10 8 8 8 8 8 6 7 8 10 10 10 8 8 12 11 9 8 8 8 6 6 7 11 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 8 9 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 11 11 9 8 8 8 8 8 9 9
8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 9 8 3 0 3 8 8 |