BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176J24.T7 (MSMg01no176_j24.b1) | MSMg01-176J24.TJ (MSMg01no176_j24.g1) |
ACC | AG371269 | AG371270 |
length | 1,202 | 1,213 |
length of high quality (start - end) | 335 (118 - 452) | 332 (122 - 453) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_j24.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_j24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_j24.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_j24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:36 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGTTCATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CTCTGTTTATCTCTGTACTTTTTAGTTACTTGAGTTATTTGGTTTGTTGA
TGTCAAACCTTTTTAATTATTTATATATTTTAATATTAATCCTTTGTCAG
ATGTAGGGTGGATGAATATCTTCTGTAGGTTGCTGTTCTGTCCTATTGAT
AGTGTCCTTATCTTAGCAAAAACTTTTTAGTTTCATGAGGTCCTATTTAT
TAATTCTTCACCTTAATGCCTGAGCCATTGGTGTTCTGTTCAGGAATTTG
TCTCCTGTGTCAATGTATTCAGGGTTGTTCCCCACTTCCTCTTCTATTAG
ATTTAGTGTGTCTGGGTTTATGTTGAGGTCTATGATTGACTTGGACTTTT
TTTTTGTGTAAGGCAATAGATATTGCCTTATTTGCATTCTTCTATATTTT
TTTCTCCCCCCCCACCAGGACCATTCGTTGAACATGTTTTAATCTTCCCA
TTGTATGGTTTAGGCTTCTACATCAAATATCATGTGTCTATAAGTATGTG
AGTTTATTTCTGGCTATTAGATTCTATTCCATTAATCAACCTGTCTGTTT
TTATGCCAATACTACGCTATTTGTATTACTATTGTTTTTTAGTACAGCTT
GAAATCAGGTATGGTGATACCTCCAGAAGTTCTTTTGTTTTACTGGTTTT
CTAACTGGATTAAATTGCTTTGGATGACTTAACTTTAAGTCTGTGTACTA
CTAACTACTTTATCTCATGTGATTGATATCCCATTGTATATGCCAAATTG
GACTTTATTGCTGATTTGTGTTTATATTTCCTAAAATTATTTTTGAATTT
TTTACCTTATATATTTTTCATATAATCTTGTTAATAATGTCAAATTGTTA
TTTATTTCCATGTTTTCTTTACCTACTTTTCATCTTCTAATTTCTGAGAT
TTATTTCCCTTTTTTTTTCTTTTGATCCATTTTTTATTTTTGTCTTTTTA
TATTATAATTCCTTTTTTTTCTTCCCTCTTTATTATTTATTTCTTTCCTC
TTTCTTTCTTTCCTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTCTCTTTCT
CTTACTATTCCTTTTTTTTTCTTTTCTATCTGTCTATTTCTTCTTTTTCT
ATATTTTTCTTATTCACTCTTCTTTTCTCTAATTTCATTCTTTTTTCATT
TA
| NNNCCACGCATGGAGNCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTTATGCTCTGCAAGGCCAGAGGACTATGA
AATGGCCCCTTTGAAGTGCCTATAGCACATGGATTTTGTAGACGTGCTAA
ATAAGTGCTCTGTTGTAGAAAACAGGATGCAATTTTTCACTTCTTCAGGT
TTAGCTGGGCTCCTGTGGGTGTCATGGAAAGGGCACTGCCAATATACTCA
AGAAACAAATGCTTCTGGTGAGTACTTAGTGTCTATTTGCTTATCAACTT
AGAGAAACATTCTAAGATGATGCTTTCATGTTCATATTAGACACTGAGTA
TCATACACGTTCACATGAGTTCATGATCAGGTTATTTTTGCCTTTAGCTA
CTAGCGATCTTATCTCACATTTTCTTAAAGTTTTAAAAGAAAGTAACATC
TATTGTTCTTACCTAACTCATCAGTGCAGCACGCCATTTAAATTTTATTC
ATTGGTGACTTTGTATAAATCTTCAGGTATTGTTTACAATCTAAGTTGAC
CTTCTTAATAGTTCCAACTGTTAAAATAGTTTATAACCTAATTCCCTTTG
ACTTATATTCCTTTCTTCAGGAGTCAGAGCACTACATAAATTATTTTGTT
TTAATGACAGTGTTCTTGCAATAAAAGACATGGGAAATGATACAAAGGCT
TGCTAGCTCGTCTCTAAGTTCTTTAAAATATGTAAATTATGTGCATATAA
TGTGTTTTCTTTTTTCCGTTTTATTTATTTTGCATTATGTTTACAGACCC
GGACATATGGGCTAAAGGCTGAATGTTCTCCCTACGGAAAAGATGTTTGC
TGCCATAATGCAGCCCATGTTCATCACCTTTAGCAGCAGAATCTGAATTC
CCAGCTGAAAATGCACAACTAGCATGGAAAATACTGTTCTCCGACCAACT
TTGACCAAGACCTTTATTTTAATTAAATTATCCCTACCCCCTTGCCCCTT
TGGTCCTATATAAAAAAACCTGTGCCCAACTATTGGCCGCGTGTGTTCAT
TTTTCTCCCCCCTTACTTCCCCCCCCCTCATTTCCCATTCATCCTCTTAA
TTTCTTTCCTCTTTTCCCCTCTTTCTCTCTTTTCCTGTCATCAACCCCCC
ACATTCCTTCCTCTCTTTTTCTTCTCGTCTTCCTCCCACCTCTTAATCCT
CCGTCTTCTCTTG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 10 12 10 8 10 8 8 8 13 15 8 8 8 8 10 8 15 18 35 39 28 28 24 22 22 29 33 33 33 30 33 32 32 28 28 37 37
37 41 37 37 39 31 30 31 28 28 28 37 23 23 10 10 10 9 10 10 13 12 10 9 9 7 10 8 8 8 15 19 32 33 33 33 33 44 53 53 57 57 53 53 53 53 53 53 44 44
39 37 37 34 23 16 8 6 6 6 8 9 15 14 10 10 15 16 30 30 33 37 33 33 33 36 36 38 35 42 42 36 42 42 43 47 50 50 50 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 50 50 50 50 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 42 28 22 15 15 24 32 44 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 37 37 37 50 50 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 35 43 43 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 68 57 57 57 52 52 52 52 52 54 57 57 68 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54
54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 39 43 44 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 34 34 12 12 11 12 12 22 21 25
21 28 32 44 68 59 68 68 68 68 57 57 46 46 43 43 43 48 43 54 43 43 48 48 43 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 22 22 11 13 11 15
10 10 11 11 11 25 25 25 22 19 11 11 10 13 12 21 21 42 42 42 48 48 59 59 59 47 39 39 37 39 43 40 30 28 19 15 20 20 19 19 20 32 40 43 43 59 57 57 57 68
57 57 48 48 57 50 50 50 50 50 50 43 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 37 37 35 47 47 42 43 47 59 57 57 57 47 47 47 48 48 57 42 42 32 32 43 43 50 50 43 43
37 37 37 50 50 50 44 38 18 12 12 23 24 52 52 57 38 32 18 12 12 32 34 59 54 54 50 44 38 33 33 43 43 57 57 43 36 28 23 23 28 43 35 37 50 50 54 54 57 57
57 57 57 57 36 36 28 19 19 13 20 27 32 32 35 35 39 42 57 57 57 43 39 35 35 42 42 44 36 23 23 26 32 30 40 40 43 47 44 44 41 39 30 36 21 21 13 13 13 28
15 10 10 16 10 10 10 12 12 15 15 28 15 17 19 26 33 39 36 31 30 21 19 12 12 12 12 15 19 23 24 31 37 39 22 17 8 8 8 8 10 16 17 24 21 10 10 10 10 10
13 21 13 23 17 13 11 11 11 11 12 12 10 8 8 9 12 20 28 24 18 6 6 6 6 8 10 12 17 21 18 15 15 19 26 17 17 11 11 11 11 17 10 9 9 9 9 10 15 8
8 8 13 13 24 15 19 16 23 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 9 9 9 10 10 10 8 10 10 10 12 10 8 8 8 8 8 12 8 8 10 12 9 10 10 9
9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 12 11 11 15 17 10 12 9 9 10 17 12 10 8 6 6 8 12 17 13 10 10 10 10 9 12 12 22 15 17 10 11 11 12
13 11 10 8 8 8 8 8 10 10 10 15 11 14 13 19 19 10 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 7 10 10 13 10 10
10 16 13 12 10 9 9 9 8 8 11 8 10 8 17 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11
18 18 15 16 11 11 11 11 10 9 14 15 22 24 14 10 10 10 10 10 10 11 8 10 10 10 10 10 10 10 15 12 12 12 13 11 11 16 16 10 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8
6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 11 19 18 13 8 8 8 8 8 10 10 8 6 7 10 8 8 8 6 6 10 12 10 8 8 8 8 8 12 11 10 8 9 8 10
8 8 11 10 10 8 8 7 7 8 8 8 6 6 10 10 12 9 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 12 12 10 9 10 10 8 8 8 8 11 8 8 10
6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 11 18 16 15 17 14 12 8 8 10 12 16 15 18 12 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 8 8 13 7 7 8
8 6 6 8 13 8 11 7 7 7 6 8 8 8 8 11 9 9 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 7 6 6 6 8 8 15 9 8 8 3 0 3 17 16 19 10 10 10 21 21 31 26 26 35 38 35 36 42 43 36 37 34
36 36 42 53 57 53 59 59 59 50 50 47 27 27 9 9 9 9 9 9 15 10 12 12 11 11 11 11 11 17 16 34 34 50 50 43 44 36 43 43 47 42 38 38 36 36 33 33 33 37
37 41 23 19 8 7 8 8 10 10 17 10 11 10 10 13 11 11 13 16 17 15 23 23 34 39 39 32 18 9 9 9 9 24 24 39 33 33 33 33 33 33 37 37 39 38 42 42 42 43
47 50 48 48 48 47 42 42 43 43 48 43 43 40 40 42 41 41 48 59 57 57 57 54 54 54 57 68 57 59 57 57 54 57 59 57 57 41 41 41 57 57 48 43 39 42 39 48 57 57
68 68 50 50 50 57 57 57 57 44 44 44 57 57 50 50 57 43 43 43 59 44 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57
52 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 50 43 38 38 50 38 57
57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 44 43 43 43 46 46 57 57 57 57 68 59 59 59 59 39 47 44 57 57 57 57 57 50 68
68 68 68 68 68 59 59 59 54 47 48 48 48 48 48 43 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 34 25 18 11 11 9 8
8 8 6 6 11 16 27 34 59 59 59 59 59 59 53 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 28 32 18 17
10 10 10 10 10 11 13 16 15 12 12 12 11 11 11 11 12 29 27 47 47 50 50 50 32 31 24 15 15 11 11 11 13 11 13 11 21 18 23 20 30 18 18 18 19 24 33 32 37 43
43 43 44 43 48 48 48 59 59 59 57 57 43 59 59 59 59 43 43 39 43 43 47 39 43 43 43 32 32 37 37 35 39 39 47 43 37 31 31 39 43 59 59 41 40 40 43 47 48 48
57 48 48 48 43 43 39 43 43 44 43 39 39 42 43 43 43 43 46 48 46 46 48 48 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 47 47 47 47 48 48 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 44 43 43 57 44 44 32 30 26 26 44 44 39 44 43 47 59 59 57 57 54 54 50 44 44 48 48 54 59 47 48 42 43
41 39 36 43 43 43 43 43 24 16 16 16 20 29 39 47 36 28 21 14 14 15 27 28 37 36 36 37 39 37 34 24 26 32 23 32 32 40 40 40 37 37 30 30 39 37 39 39 39 39
39 43 37 40 25 25 17 24 24 23 23 28 37 37 39 37 37 41 21 25 19 23 23 24 20 25 32 32 37 37 39 39 40 43 43 48 43 43 37 39 30 24 24 24 24 28 34 28 34 18
18 11 11 11 17 21 30 28 20 12 10 10 10 15 15 12 12 10 10 11 12 12 12 26 24 31 28 31 31 19 15 9 9 10 15 23 28 34 28 23 23 14 15 10 10 10 18 13 17 13
13 13 13 10 10 10 17 15 12 10 10 10 13 12 10 12 10 14 14 22 18 18 15 15 10 9 9 8 11 8 9 9 8 10 8 8 9 9 8 8 7 7 10 15 22 33 24 24 24 25
28 21 13 10 8 8 8 8 12 9 9 9 9 9 21 19 24 22 15 11 10 10 10 12 15 16 19 28 24 18 18 11 9 9 9 12 9 9 9 9 12 10 10 10 9 14 12 12 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 15 9 8 8 8 8 10 11 11 11 11 11 10 10 10 10 8 8 8 8 11 13 8 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 10
15 13 10 11 15 15 10 8 8 8 12 12 22 19 19 23 23 23 28 16 12 12 12 17 15 22 19 12 11 12 18 19 15 13 10 12 8 13 8 8 8 8 10 9 9 9 10 14 11 12
12 11 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 15 13 16 11 19 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 6 6 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8
8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 10 12 10 9 9 9 9 12 17 12 12 9 9 10 8 12 10 10 10 11 10 8 8 8 8 10 8 12 7 7 8 8 13
13 9 8 8 8 8 11 13 10 10 10 8 8 8 6 7 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 12 11 13 13 18 14 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 10 28 28 10
12 11 11 10 8 8 15 8 6 6 10 11 8 8 6 6 10 13 10 8 6 6 8 8 11 10 9 9 6 6 6 6 8 8 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 10 8
10 8 8 8 8 11 10 10 6 6 8 6 6 |