BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176P10.T7 (MSMg01no176_p10.b1) | MSMg01-176P10.TJ (MSMg01no176_p10.g1) |
ACC | AG371502 | AG371503 |
length | 1,258 | 1,221 |
length of high quality (start - end) | 271 (136 - 406) | 376 (71 - 446) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_p10.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_p10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:49:22 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_p10.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_p10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:49:22 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | CGGTTCTNNNNNCCATCTCTGGGCGCTAACGACTCCTAAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCCTTGGGGCCAGCTTCCCCTTTAAGGCTCGGATCAGGCCAA
AAAAGGGTAAGGTAAGACCTTAAATTCCCACGCCAGTCTCCCCCTGTTTG
CTGTTGGTAAGCCTCGTGTAGAACTTCCTCCAGGAATTCAGTGTCTTGCC
GGACCAGATCCAGAAGCCCGATGTGATGCCCACAATCAGCGTCATGAGAT
ACTTGATCATGAAGACTGTAAAGTCTGGGCTCATGGGCGTGTGTGGTGGG
ACTCCTCCACCTCCCTGGAGGTGAGGGCAAGGGATGGCATAACTCTTGCA
GCTCTGGGCCACCCAGCTGCGCTCCCACTGGTCCCGAAAGGCCTGTTCAT
AGAAGTTTTTTTTTATGACGATGGTGGCCGGCACAGTGTAGAGGACACTG
AAGACTCCTATTTTTTTTCCCCCCTTCTCCAGCTTCTCTGTCTTGATGAA
AAAATGCTTCATGATGGTGCGGATGCGGAAGAGTGACACGAAACCAGCCA
GCAGGAAAGAAGTGCCAATGAACAGATAAACGAAGAGAGGCGCCAGCACA
AAGCCACGCAGTGCGTCCACGTTGTTGAGCCCCACAAAACACACTCCGCT
CAGTACGTCGCCATCCACCTGGTCCAACGCCAAGATGGTTATAGTTTTGA
TGGCTGGCACAGCCCAGGCGGCTAAATGGAAATACTGTGAGTTGGCCTCG
ATGGCTTCGTGGCCCCACTTCATGCCGGCTGCCAGGAATCAGTTGAGGGA
CAGGATCACCCACCAGATGGAGCTGGCCTTGCTGAATAAGTATAGCATCC
TAATGAGTATAGTGCACCCTTCTTTCTTATTGCCCTGCGCCCTCGTGCGC
GCCCCGTCCTCCGGAAACTTGTTTCTGCCCCACACCCGGACCCTCCATTA
AAATGCCGTCGAATGTATTTCCTTCGTCACCGTTGTTTTTTCTTTCTCAT
ATCAAAATGTTTGGTCCCTTTCCCCGTTATCTTCAATTCCCTTATTGCCC
CCTAACAACTTTTACTCCCCTTCTTTACTCTGTCATTTTTCACTCCCTTT
NCCTTACCCTATTCCCTTTTTCTATTTCTCCAAAATTTTCTTCTTCTTGT
GTCTCTAATCTCTTATTTCCCTCTATCTCCTCTATGCTCTTCCCTCATTC
TCTCTCTCTCTTNTCTTTCCTTCTATCATCCTTTTCATCCTTCTCTTCTC
TCCATCAC
| NNTTTATGATTGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTAGCTCTGTGCCCCATTTTTTAAT
GGGGTAATTTGGTTTTCTGCAGTCCATCTTCTTGAGTTCTTTATATATAT
TGGATATTAGTCCCCTATCTGATTTAGGATTGGTAAAGATCTTTTCCCAA
TCTGTTGGTGGCCTTTCTGTCGCTATACCAGTACCATGCAGTTTTTATCA
CTATTGCTCTGTAGTAAAGCTTTAGGTCAGGTGTGGTGATTCCACCAGAG
ATTCTTTTATCATTGAGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGGTTTCTTGTTATT
CCAGATGAATTTGCAAATTGCCCTTTCTAACTTAGTGAAAAATTGATTTG
TAATTTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTCGGCAATATT
TTTTTTTCCCCCCCCCCTTGATCCTCTCACTCCATTAAAAAAAGAGAGCT
TTCCATCCTCTGCGCTTTCAAATTCTAGAGGCAGCGTCATAAGATGATGA
AGCTGAAATCTGCATCCCCATCAAATACATTGTTCTTCATTTGAGCTAAC
TGTCAGTAAGTCTTTGACCTGTAACCTGATTTTTTTTTTCTTTAAGTGGG
ACCCACCTTGTTTTTGACGATGCTCCCATTCCTACCCTTTTAATGCCTTC
AATATACAAGGTGACATTGTTTAAGGGGTAGAGACACTGTCTTCTGTGTC
ACCATAAAATACCAATGTGACATTAACATAAAGGTTTTTAGCTCTGTAGG
TTCTTACTGTCTTGGGCGGTGTCCCGTCTGTAAGGGAATAAACTTGAAGA
GAGAGTTCTGCCTTATGCTAACTGCTCTCTGTTTCTCCCCTTTTTATTGT
ACTCCAAGATTCCCCAGTGGTTGATATAATTTCTCCCTGCCAACTTTAAG
GTGGGCATCAAAACCTGCCTCCTGGTCCCTTCAATAAAGGTCTGGTGATT
TTCCTTTCCCTCCTTTTGGTAAAACCTTGGCTTATGTTTTAAGTGATAAA
TTGGGTTCCTATTTTTTAGCTCTTTTTTCTTTTTGTTTAGTATGCTATTC
TCCCCTCCCTTAGAAGCTCTATCATTAATATCCTCCTTTTCTAATTCCTC
TTCCTTCCAAAATTACTAACTATCCTTCTCTTTTCTTGTGATATTTTCTC
TCTTTTAATTTTCTCTCCGTC
|
quality values | Open.Hide.10 10 9 10 10 9 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 9 7 7 8 8 8 8 8 13 15 15 10 8 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 22 22 24 20 24 24 22 22 22 33 33
37 33 26 22 14 14 15 25 31 37 30 30 30 30 17 19 23 20 17 18 18 28 17 19 11 15 12 11 10 12 8 6 6 8 8 8 10 10 10 10 18 22 36 34 41 43 50 48 41 41
37 30 30 32 37 33 33 36 33 31 31 31 31 21 21 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 10 15 11 10 9 9 15 17 20 28 33 37 35 34 36 34 34 34 34 34 34 43
40 42 43 39 37 29 30 30 30 42 36 41 31 31 21 20 22 22 23 27 42 42 42 32 40 37 32 37 37 37 28 36 28 37 42 57 32 32 20 20 19 24 32 37 39 39 39 43 47 42
35 35 32 36 28 32 32 43 44 44 33 33 33 42 42 42 42 41 42 43 57 57 54 57 57 57 57 54 54 57 41 32 20 20 20 34 32 57 44 44 32 32 30 37 37 48 48 50 57 57
57 59 59 57 48 40 37 30 30 30 34 28 30 30 30 42 40 43 43 43 43 47 47 37 43 36 34 21 21 14 21 24 32 30 25 25 16 15 10 9 9 10 17 24 37 36 39 39 35 59
35 39 39 47 47 37 37 28 32 37 39 59 59 57 43 48 43 43 43 42 42 35 35 31 41 41 43 43 39 42 39 32 28 28 32 23 25 27 30 41 41 39 47 59 59 59 57 43 43 57
57 57 48 57 47 41 35 35 28 37 31 32 39 37 37 44 43 46 43 43 43 59 43 39 39 32 42 43 43 36 37 37 39 39 43 39 39 40 39 39 39 39 39 47 43 43 43 41 43 30
30 15 15 12 9 9 10 10 13 19 16 12 12 13 19 32 27 46 46 46 48 46 46 48 57 48 47 47 39 39 35 28 37 23 28 28 39 30 34 14 14 14 30 30 48 48 48 47 48 37
37 37 37 23 25 18 13 13 10 10 10 17 20 27 18 12 11 10 10 11 13 15 15 12 12 11 15 27 29 47 50 50 46 41 59 30 34 28 28 20 20 17 18 15 10 10 9 8 8 8
8 8 8 10 12 12 28 24 34 32 37 43 48 48 53 50 57 59 59 57 48 43 43 43 43 43 44 44 44 43 43 34 43 29 29 37 40 33 36 43 43 41 31 23 23 23 30 30 15 15
13 15 13 19 19 32 44 44 37 24 20 20 20 28 32 20 20 20 27 31 28 24 28 28 40 33 36 32 24 24 20 24 24 26 26 24 24 24 35 37 37 32 25 22 23 27 28 33 36 41
47 42 42 30 30 25 30 32 28 23 36 36 36 30 30 28 29 39 43 57 44 44 36 36 36 37 40 35 47 39 43 43 39 39 39 39 48 40 40 33 28 28 28 25 28 36 39 35 35 28
32 32 37 37 39 28 28 28 25 25 24 27 33 32 34 20 22 19 20 22 18 12 11 11 15 10 10 10 19 19 16 16 19 30 37 37 37 37 37 37 41 48 48 48 37 37 37 37 37 37
37 25 25 30 15 16 15 10 10 10 19 16 20 22 18 12 12 12 15 12 18 15 19 26 32 28 30 22 23 25 24 21 13 15 15 24 29 22 30 23 23 16 17 8 8 8 8 10 11 18
20 30 20 20 18 15 12 8 8 13 10 27 18 17 18 18 22 18 27 27 15 15 12 15 13 16 10 12 11 12 19 22 12 12 9 8 8 8 8 8 10 11 10 19 20 20 23 10 10 8
10 10 10 10 8 15 11 9 9 10 9 9 9 10 10 10 10 17 12 16 19 19 15 21 17 13 14 10 10 8 12 12 14 20 20 28 30 26 20 19 14 10 10 9 9 9 10 10 10 10
8 8 8 8 8 8 13 13 13 10 8 8 8 10 8 8 8 7 8 13 13 15 15 19 9 9 9 13 9 10 9 8 8 8 9 12 9 11 11 8 10 8 8 8 8 10 8 10 10 8
10 6 6 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 10 13 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 15 13 9 6 6 6 8 8 8 9 9 11 12 12 12
7 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 7 7 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 12 12 12 11 12 15 16 16 9 10 10 10 10 10 10 8 12 8 8 8 8 8
8 8 8 10 11 14 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 11 9 9 10 9 13 10 10 8 8 8 9 10 12 10 8 8 6 7 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 7 6 8 6 6 10 8 10 8 8 8 8 8 8 13 13 15 13 9 8 8 8 15 8 6 8 10 13 15 11 3
0 3 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 7 7 9 10 10 13 9 10 8 10 6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 10 10 10 9 9 7
8 8 8 8 8 12 10 6 6 8 8 8 8 8 6 6 10 8 12 17 15 14 13 11 8 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 8 8 10 7 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 10
6 7 12 15 9 9 10 10 8 8 7 3 0 3 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 14 14 11 9 8 8 8 8 8 8 9 10 9 11 10 10 13 16 17
13 8 8 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 6 6 6 7 6 7 8 8 8 6 6 8 6 8 10 13 8 7 9 3 0 3 13 15 15 9 9 13 10 23 27 28 28 35 36 36 36 34 36 42 47 43
44 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 28 24 12 12 19 23 28 28 35 44 44 54 41 41 42 41 41 41 48 48 41 46 46 46 46 44 43 31 35 35 42 47 50 48 50 47 47 47
48 48 37 36 28 23 28 32 44 44 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 35 35 28 36 28 32 37 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 52 57 52 57 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57
57 59 62 62 62 62 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 43 43 43 57 57 57 57 54 52 57 52 52 52 52 59 59 57 57 54 54 52 57 52 54 54 57
57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 57
57 54 54 54 54 57 54 54 54 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 59 43 43 39 43 47 59 41 47 47 36 28 28 14 12 12 12 12
12 12 12 18 30 34 48 48 48 59 47 48 48 48 43 43 43 48 48 59 57 57 57 57 57 48 48 57 47 43 40 40 40 44 44 50 53 50 50 59 59 47 30 23 10 9 9 9 10 11
16 12 23 19 17 13 8 10 10 13 15 19 14 11 9 9 11 13 27 31 43 47 46 47 47 25 23 11 11 11 12 15 12 12 12 19 24 22 16 15 11 10 10 11 11 10 8 8 8 12
17 32 37 41 47 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 57 48 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 59 48 48 40 32 41 20 20 31 32 43 47 47 48 48 54 54 57 57
57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 59 57 48 48 48 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 44 44 37
37 37 42 42 48 57 57 57 48 48 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 50 57 57 57 48 48 48 50 53 57 59 59 59 59 57 57 48 59 47 43 43 41 39 35 35 31 39
39 37 37 39 39 39 39 41 47 47 48 48 48 50 57 59 48 48 48 48 39 39 43 43 43 59 47 47 47 59 59 59 59 41 32 32 43 43 37 37 37 29 29 35 43 43 59 42 42 40
48 48 43 47 48 48 48 59 43 43 37 33 28 33 28 28 34 34 37 37 34 23 18 18 17 17 27 37 31 31 24 28 37 37 37 39 37 34 28 30 30 32 37 37 37 37 22 18 18 24
21 32 29 26 15 14 14 28 28 41 41 39 33 33 24 24 16 16 18 28 13 17 17 24 14 18 12 12 12 21 23 33 30 37 37 39 39 39 33 21 16 16 10 14 12 9 9 13 17 18
16 13 17 37 37 30 24 26 21 19 23 21 25 17 22 24 24 22 22 17 17 17 12 12 16 16 14 14 19 19 21 19 17 16 11 10 10 17 19 22 18 22 22 22 22 18 12 9 8 8
8 8 19 19 19 19 9 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 13 17 10 10 10 10 16 10 11 21 9 9 9 9 18 20 17 14 12 10 9 9 9 14 9 8 8 8 15 16 23 13 13
13 15 18 21 10 10 13 12 13 8 11 14 16 15 8 8 8 8 9 13 12 10 8 8 8 8 8 9 12 13 10 10 6 6 6 7 7 14 15 21 18 14 10 10 8 7 7 12 13 7
8 8 11 9 9 9 10 10 10 12 10 11 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 10 10 14 10 8 8 8 8 10 10 16 10 10 9 8 8 8 9 9 10 13 15
15 15 14 15 10 8 10 10 10 8 12 12 11 11 19 14 14 8 8 8 7 7 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 10
11 10 9 9 12 16 14 8 8 8 10 10 12 19 14 11 10 8 8 8 8 10 10 10 10 16 10 10 6 6 8 8 10 10 13 13 19 16 11 11 10 10 8 8 10 10 10 10 8 8
10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 15 10 8 8 10 8 11 11 11 11 11 8
8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 7 7 6 7 6 6 8 7 6 9 7 13 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6
7 6 6 8 12 8 8 6 6 8 10 10 11 10 8 9 9 9 9 9 9 |