BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-235E06.T7 (MSMg01no235_e06.b1) | MSMg01-235E06.TJ (MSMg01no235_e06.g1) |
ACC | AG400894 | AG400895 |
length | 747 | 748 |
length of high quality (start - end) | 320 (45 - 364) | 287 (77 - 363) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no235_e06.b1 PHD_FILE: MSMg01no235_e06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:52:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no235_e06.g1 PHD_FILE: MSMg01no235_e06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:52:33 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCTAATCAACATTTTTTCCAGATATCCAACTATGTCAATGAAATAAA
GATACACTTTTCAGTTTATCATGTACAATAAAAGTGTGCTAACAGTAGAG
GGAAGAACTCGAAGGGCATTCCTTGTGAGATTTTAGAACTGAGGTGAATT
AACTGATATAAATACTACTTTGTATTCACTTTGGGTTTTTGAAATTTTTA
ATGTTACATGTGCCAAATTCACATCCATTCCCTCAGGTCAAGCATATAAT
AATTTCTTTTTATGCTATGAAAGAAAAATATATTGAACTATAAATATAAT
CAACTTAAACTAACGTACCACACACCTACTCAGCTATCTTAAAATTATAG
AATTACACTTCTGGCGGAATCACCATGCCAGACCTAAAGCTTTACTACAG
AGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTATAGAGACAGACAAGTAG
ACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACACCTATGGT
CACTTGATCTTCGACAAGGGAGCTAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAG
CATTTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGGTTGTTATCGTGTAGAAGAA
TGCGAATCGATCCATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGG
ATCAAGGAACTTCACATAAAGTCAGAGACACTGAAACTTATAGAGGA
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTGTTTAGCTCTGTACCACATTT
ATTTATAGGGGTGTTTGTTTCTCTGGAGTCTAACTTTATAAGTTCTTTGT
ATATATATTGGATATTAGCCCTCTATCAGATGGAGGGTTAGTAAAAAAAA
AAAATCTTTTCCCAATCTGTTGTTTGCCATTTTGTCCTATTGACAGTGCC
TTACAGAGGCTTTGCAATTTTATGAGGTTCCATTTGTCAATTATTGATAT
TAGGGCATATGCCATCGGTGTTCTGTTCAGGAAAAATTTCCCTGACCCTA
TGTGTTTGAGGCTCTTCCTCAAATTCTCTTCTATTAGTTTCAGTGTACCT
GGTTTTATGTTGAGGTCCTTGATCCACTTAGGCTTGAGCTTTGTACAAGG
AGATACGAATGGACTGATTTGCATTCTTCTACATGATGACCTCCAGTTGA
ACCAGCACCATTTGTTGAAGATGCTGTCTTTTTTCCACTGGATGGTTTTA
GCTCCCTTCTCAAATGTCAAGTGACAGTGGGTATATGGGTTTATTTCTGG
GTCTTCATTCTATTCTAATGATCTACCTGCCTTTTTCTGTACCAATATCA
TACAGGTTTTACCACTATTGCTCTGTAATACAGTTTAAGACCAGGGAAGA
TGATTTCCGCACAAGTTCCTTTATTGTTGAGAAAAGGTTTCAGAATCC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 12 26 59 37 37 37 39 41 41 47 35 35 30 32 32 35 48 57 42 37 32 32 32 42 48 48 48 48 48 48 48 57 57 42 42 32 41 41 42 59 57 57 50 50
50 42 50 48 57 57 57 48 47 41 41 47 48 50 50 50 68 59 57 47 47 47 47 50 50 57 57 50 50 46 46 50 50 57 57 59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 57 57 57 52 52 52 57 59 51 50 50 50 50 50 68 57 57 57 52 43 43 37 37 43 50 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 52 57 57 57 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57
57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 68 68 57 57 57 52 52 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57
52 52 52 59 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 52 57 57 59 59 57 54 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 44 59 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 43 41 41 43 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
48 48 59 59 59 59 31 30 13 19 16 12 12 12 12 18 25 28 19 19 12 9 9 9 9 8 12 12 8 8 8 8 8 8 9 17 25 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 48 48 48 57 59 57 57 57 57 57 43 44 40 37 37 36 36 32 44 36 43 39 39 43 37 37 37 43 43 46 47 59 59 54 57 57 59 59 57 57 43 43 43 43 43
43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 59 47 37 36 35 31 32 43 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 53 57 43 43
33 42 37 43 43 44 59 57 57 57 59 48 47 47 53 53 50 50 59 57 57 43 43 39 37 35 59 37 37 37 37 37 37 41 31 34 37 37 39 41 46 46 47 59 59 48 39 39 39 37
37 43 47 57 48 48 48 48 46 41 41 41 37 37 32 29 29 37 41 43 41 41 47 41 41 37 36 39 31 31 35 36 37 32 32 37 37 41 41 44 18 9 9 9 9 18 23 44 47 47
47 47 42 41 35 34 28 22 25 30 41 41 37 37 37 37 41 43 59 37 31 31 32 37 30 31 31 39 34 34 31 32 29 33 27 28 37 34 34 28 34 25 24 15 15 15 19 19 24 23
30 37 30 30 28 34 37 39 39 41 37 31 25 31 31 39 59 59 59 47 43 41 41 36 34 34 34 28 28 28 34 34 37 31 30 20 25 25 24 24 39 37 37 34 34 34 34 38 29 29
32 37 32 29 29 30 36 37 37 41 32 31 25 25 19 28 15 17 12 25 22 24 24 23 28 19 17 18 15 14 14 26 30 30 31 31 32 31 27 28 24 24 28 28 34 33 29 | Open.Hide. 6 6 8 19 12 8 8 8 8 15 17 35 37 37 41 41 37 47 46 43 43 43 43 57 48 48 43 43 43 48 43 40 40 35 35 39 42 43 40 40 40 40 40 42 57 68 68 57 48 48
48 47 47 47 48 48 48 54 57 68 68 48 50 41 41 46 46 57 57 57 48 48 48 48 41 41 47 47 47 54 57 57 57 57 57 57 48 59 59 54 59 57 50 50 50 50 50 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 52 57 52 57 54 57 57 57 57 54 52 52 57 50 57 57 43 43 52 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 52 57 57 59 59 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 59 47 43 39 57 43 57 57 57 57 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 43
62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62
68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 52 52 32 38 28 39 39 43 43 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 45 52 52 57 59 57 57 44 44 19 19 11 18 18 28 20 18 24 24 19 14 14 21 21 17 17 17 24 23 21 38 41 38 38 43 52 52 57 57 57 57 52 52 52 59 57 57 52 57
57 52 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 48 32 32 18 18 27 28 28 37 37 57 57 46 32 32 20 20 20 36 41 57 57 57 43 43 44 59 57 57 57 48 48 48 48 57 48
54 54 57 59 48 48 48 48 59 59 32 32 18 18 18 32 41 59 68 68 68 59 59 59 39 39 43 39 39 31 29 18 19 19 29 36 48 48 48 48 48 37 37 37 37 37 37 43 32 29
29 32 37 37 59 59 43 39 43 43 43 43 48 48 48 48 47 59 32 32 30 32 32 40 40 43 39 39 47 59 59 59 59 37 37 30 33 33 37 39 40 36 34 34 34 30 30 32 37 37
37 37 36 39 43 41 39 39 30 30 28 28 26 25 32 20 20 20 24 32 34 37 37 37 37 37 37 43 25 25 12 12 12 25 28 33 25 20 23 19 10 10 14 22 22 28 25 18 15 14
20 22 22 34 34 31 25 30 23 21 23 23 23 28 28 28 31 31 33 28 30 32 30 30 37 37 37 39 33 28 25 32 19 25 19 16 15 18 10 10 12 16 11 17 18 18 19 20 16 21
14 14 14 14 10 12 19 23 21 9 9 9 9 9 11 11 16 16 23 17 13 12 13 13 22 23 29 12 12 9 9 9 13 10 8 8 8 8 8 9 9 9 13 12 18 18 18 18 22 18
18 25 25 20 19 13 13 9 9 10 12 11 16 12 17 17 12 10 11 16 16 14 14 12 17 17 19 10 15 9 9 8 8 8 10 13 16 21 19 15 9 9 9 9 9 12 9 9 |