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MSMg01no237_m04.b1 PHD_FILE: MSMg01no237_m04.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
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(675 letters)
>mm_chr5_101181062_101182136
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Query: 490 cacatacacacactcacacatcacattcactcaaatacacacactcacacacattcactc 549
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Sbjct: 674 cacatacacacactcacacatcacattcactcaaatacacacactcacacacattcactc 733
Query: 550 atacacacacacacactcatacacacacacacactcatacacatacacacactcacacac 609
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Sbjct: 734 atacacacacacacactcatacacacacacacactcatacacacacacacactcacacac 793
Query: 610 atacacacacacatcacattcacacaaataca----ttcacacacattcagtcatacaca 665
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Sbjct: 794 atacacaca----tcacattcacacaaatacacacattcacacacattcagttatacaca 849
Query: 666 cacatacata 675
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Sbjct: 611 acacatactcacacacattcactcatacacacacacacactcatacacatacacacactc 670
Query: 190 aca----tgtacacacactcacacatcacattcac----atacat----tcacacacatt 237
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Sbjct: 671 acacacat--acacacactcacacatcacattcactcaaatacacacactcacacacatt 728
Query: 238 catacacatacacacacacacacactcacacatatacacagactca----catgtacaca 293
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Sbjct: 729 ca--ctcatacacacacacacac--tcatacacacacacacactcatacacac--acaca 782
Query: 294 cactcacacattatattcacat-acattcatacacatacacacacattcactcatacaca 352
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Sbjct: 783 cactcacacac-atacacacatcacattcacacaaatacacaca--ttcac------aca 833
Query: 353 ca--ca--tatacacacactcatacacacacatgcactcacacacatacacacactcaca 408
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Sbjct: 834 cattcagttatacacacac--atacatataca--cactcacacacatac------tcact 883
Query: 409 catcacattcacacaaatacacatactcacacacattcactcatacacacacaca----- 463
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Sbjct: 884 cataa-atacacacatatacttatacacacacacatt-a---attcacacacacatatat 938
Query: 464 -cactcatacacatacaca----cactcacacacata--cacacactcacacatcacatt 516
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Sbjct: 939 acactcaaacaca--cacatattcactgacacacatatacacacactcacaca----att 992
Query: 517 cactca---aatacacacactcacacacattcactcatacacacacac 561
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Sbjct: 993 cactcacacaatacatacac--acacac--tcactcttacacaaacac 1036
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 708225
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X3: 517 (999.5 bits)
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S2: 8 (16.2 bits)
| Query= MSMg01no237_m04.g1 MSMg01no237_m04.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no237_m04.g1 PHD_FILE: MSMg01no237_m04.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 20:55:40 2005
(344 letters)
>mm_chr5_101318559_101319306
Length = 748
Score = 607 bits (314), Expect = e-178
Identities = 338/348 (97%), Gaps = 4/348 (1%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 428 aatcaaagggttggcaaagccaaccaagagtccaaaaatgtgctcttcatcagcacactg 369
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Sbjct: 368 taagttcagctcacttttctccactggctgtgctggaactctgaatgaagagcagagatc 309
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Sbjct: 248 atgcatccaagtaacaaggattaagcgcttgacagcgcaccctgattc 201
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
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Number of Hits to DB: 15
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Number of sequences better than 10.0: 1
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Effective search space used: 247565
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X3: 517 (999.5 bits)
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