BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-304M04.T7 (MSMg01no304_m04.b1) | MSMg01-304M04.TJ (MSMg01no304_m04.g1) |
ACC | AG429943 | AG429944 |
length | 1,366 | 1,349 |
length of high quality (start - end) | 709 (94 - 802) | 284 (129 - 412) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_m04.b1 PHD_FILE: MSMg01no304_m04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:43:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_m04.g1 PHD_FILE: MSMg01no304_m04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:43:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNCCAGGTCANNNNNNNNCCATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGA
GGATCCGCGGAATTCTCACCTGAGGAATACCCCATGTAATGAGAAGCACC
TGAAAAAATGCTCAGCATCCTTAACCTTCAGGGAAATACAAATCAAAACA
ACACTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTC
AGGTTATAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCC
ATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAAAAACTCTGGAAATCAGTCTGG
CTGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACGGGAGGATCCCGCAATACC
TCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACTGGTAATAAGGACACAT
GCTATACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAA
GAACCCAGATGTCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACAT
TTACACAATGGAGTACTACTCAGGTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAAT
TCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATTATCCTGAGTGAGGTAACC
CAATGACAAGAGAACTCACATGATCTTTACTCACTGATAAGTGGATATTA
ACTCAGAAACTTAGAATACCCAAGTTACATTTTGCAAAACACATGAAACT
CAAGAAGAACGAAGACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTCCTTAGAATGG
GGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGCTTGGAGCTGAG
ACGTAAGGATGGACCATCCAGAGACTATGCTGGTGATTCTGCTTCCCCAC
ACCATTTTCTGCCGAAGAAAGAGAACAATGAGATTATGGAATTCTCAGTC
CGTAGGCCCCCACTATGTTCCATGGGGTGCCAGGAACCACTTTTATTTTT
AGTCTCACTCACGTTCTTTAAAGAAGAAGTGTTGGCAATTTTGTTATTTT
TGAAACCACCCCCGTGCTTGAATGGGGAGAACTTATCTCATGTTTCTATT
ACATGACAAAGTAATAACCCGATTTCTTCTTGATACTTTGTAAACCCATT
CCCCTTTATTATATCGCATTATAACTTCCGTACTTAATAACAACTATTTC
TTGCGAATTCTCCCTTATTAATGATACACTCCTCCATATATAACCTTTTA
TACTTTCACTTATCCTCTTTTATTAAATCAAATATCTATCTATGTCTTAT
CTCNATTATATTTTTACGTAACCCTCTTCTTTACATTATCCTTCTTTCTC
GACTTTATTANNNNCTTTTAAATAATGNGAGCTAGTGTGTGGTTGTGTGT
TGTGTGTTTTTTTTGG
| NNCCCAATCATNTNNNNAAGATGGGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAGAATGATTTAATG
GGAAATTGTAGGTGGAAGGCCTTTCAATTTGCTGTACATGCCAACATGGT
TGTGGTGCGCTGAAAATGAATTAATTGGATTTGTTAAAAATGTGACCTGC
TCTCTCCCACAAAAGAGGGAGGATACACAAAGGAAGGAAGACAGAAAGAC
TTTCACAGACTGATCTTTGCTGCCTTGTACATTTTTAATAAAGACTCAGT
ATGTGGGAAGTAATTATAATGACTATCTTCAGTTACAAGATATTAATTTT
GTGCTCCAAGGTTATTAACCACCTTTAAACATACGGTTAACAGGCAAGTG
AATGGGCTTAATCCTGATATTAAGACACAAAACAAACCAAATAATCCGAT
GTTTCACGACTTTCAAAGTTGATTGTCTCCTTGACAAGGCTTTACCAGAG
GCCAGATATACAACTGCCATTTTAGAAAAGAGGTGCTGGCAGTCTCCAGC
AGATGCCTGTTGAAGGAGACTTAATCCCCATTTAATAGCCATTCCTATTT
AGGCCAGATATAAAAGGTCACTGAGGAAAGAGGTTTATCTCCCATTGATT
CCACCTTATTGAGTTTGTCCAGTGTCCTTATCCAATGATCAACAAATCCT
AAAAGGGGACTTCTTAACATACTGTATAGCTACATTTGCCAATGTCAACA
ATCCAGATGAGAATATAAAGTATTTAAGATTAATGACCTTTGATGTCCAA
AAATCCCAGACCAATTCTTTTGATTTTTTTTTCCCATTCTTCCCGCGAAA
AAAAACGGTCCAATAATTCTTAAACAATCCTCTTTCTTAAAAAAAAAAAT
TTCCTTTTCTTCTTTATCCAGGACTTTTTTTCTTTTAAACAGGTTATTAT
ATCCCGGGTCCGTGCTAAAAAAAAATGACCATCCCCCCTTCTTTGGGGTA
CACGTTTTTACTATTTTTCTTTTACAAAAAAAAACCTGTATATATATTCC
TACTCCCACTCAGAATTTGCATAACTATTCCTTCTATCATTAACAATTTC
CTTTACCCCTGCAACACTCCATCTCTCTCTATATTACAATACTTTTTATT
CTTTTTTACCTTTACAAACTGCTACTACCTGTCCACTCTTCTCTCACTAA
CATTAATTTATANTAACAACCNTATTCTCTTCTATTTTNCCTTTNNCTTG
CACTGTCTTCCTCATATTTCATTATCTTCGCTCATCCTAACATACATTNA
TNTTNTNGTCGGGGGGGGNNNNANATATATAACGAAATCTTTCACAATA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 8 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 7 6 6 6 7 8 9 10 8 8 6 6 6 6 8 12 15 8 8 8 10 12 13 19 19 35 28 28 28 28
33 36 42 47 53 53 53 47 47 47 47 42 42 43 42 42 42 36 36 35 35 31 31 31 30 33 33 33 21 19 9 10 8 8 10 9 8 8 8 10 10 10 14 19 22 29 37 30 35 35
35 35 38 38 53 59 57 57 36 36 36 36 36 36 50 50 50 33 33 30 23 22 10 10 10 9 9 10 21 23 39 40 47 47 33 33 47 47 47 38 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 47 47 50 51 51 51 68 68 68 51 51 51 51 50 50 68 68 68 68 68 50 51 50 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 43 43 31 31 31 31 35 39 44 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 43 43 35 43 39 62 62 62 47 44 35 35 35 43 44 62 45 45 45 62 62 68 62 62 62 62 62 45 45 45 57 57 57 44 44 35 35 35 38 38 52 57 57 57
59 59 57 52 52 45 45 45 57 57 57 43 39 39 39 43 43 52 52 43 43 39 39 43 43 43 57 57 52 52 59 59 59 54 54 50 50 43 43 43 59 59 59 57 57 54 54 54 44 44
35 38 32 38 23 29 29 33 33 35 50 50 50 57 48 48 47 57 43 43 43 50 44 50 43 42 42 42 42 43 42 44 44 48 48 48 42 42 35 33 33 35 42 42 37 42 42 57 44 57
43 43 41 44 36 32 23 36 36 42 32 43 43 43 43 43 39 39 43 43 42 43 36 36 36 47 47 47 43 33 33 32 32 32 40 39 35 28 32 31 36 36 37 37 33 36 37 43 43 40
40 47 32 31 20 20 28 28 39 41 32 32 18 17 17 28 28 36 35 35 35 37 39 43 43 39 43 39 43 43 57 43 37 32 28 25 36 36 57 48 48 48 48 48 46 46 46 34 30 19
15 13 18 28 31 37 41 37 37 41 41 39 24 25 12 14 14 22 26 39 34 34 25 25 22 30 34 37 37 39 39 34 43 31 26 26 43 37 41 41 41 28 28 13 13 17 22 30 31 36
39 39 36 31 35 41 41 41 41 41 41 39 41 36 36 32 31 27 27 25 25 24 30 28 22 22 34 31 26 26 15 15 17 19 17 28 28 35 32 34 32 19 19 22 22 28 26 30 14 14
13 15 13 11 11 10 12 12 16 24 22 22 30 26 28 35 28 22 17 12 12 12 14 15 19 19 25 26 20 24 21 27 13 12 12 15 12 15 15 15 13 18 14 19 24 19 28 20 19 19
19 18 16 18 22 15 23 10 12 9 8 8 8 10 9 8 13 11 19 10 10 10 10 10 11 11 11 17 23 20 20 20 21 16 12 15 13 17 11 17 14 10 9 9 9 10 9 9 8 8
8 8 8 8 10 11 11 11 12 8 8 8 9 9 10 10 13 10 8 8 8 8 8 8 9 8 7 9 7 12 8 14 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 18 12 10 10
9 10 11 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 8 8 9 9 9 10 8 10 9 9 9 12 9 9 9 9 9 10 9 9 10 12 16 15 11 11 12 23 11 11 11 9 8 8 9 10 8
6 6 7 8 10 8 11 11 11 15 19 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 6 6 6 7 10 6 8 8 8 8 9 11 13 8 8 8 10 10 10 6 6 8
8 9 8 8 8 6 6 6 8 8 12 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 21 12 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 10 10 11 11 11 12 12 10 8 6
6 8 8 10 11 9 6 6 6 8 8 8 11 6 6 6 8 10 8 6 6 8 6 7 8 8 10 11 8 9 9 9 9 9 6 6 8 8 8 6 8 8 11 8 6 6 6 10 8 6
6 7 8 6 6 8 8 8 10 10 15 8 8 8 6 13 7 9 10 10 9 9 9 10 8 10 7 7 8 8 8 8 8 6 8 8 8 9 7 11 10 10 10 10 9 9 10 15 9 8
8 8 9 9 9 8 13 11 10 8 10 6 6 8 8 6 6 8 11 12 15 11 13 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 12 11 20 12 20 10 9 9 10 9 10 9 9 10 10 15 13
10 8 3 0 3 8 8 10 10 8 10 8 13 11 11 9 11 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 17 11 9 8 8 6 6 8 10 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 9 10 10 10 9 9 3 0 0 0 0 3 7 7 10 6 6 8 19 19 22 10 13 3 0 3 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6
6 6 6 6 8 8 8 8 10 12 19 12 13 11 11 11 | Open.Hide. 0 0 3 8 8 10 10 12 9 8 3 0 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 7 7 13 8 8 8 13 8 7 9 9 13 10 15 16 16 18 17 22 29 29
19 19 8 8 19 23 35 35 37 37 37 37 34 34 34 36 53 53 53 50 50 50 50 47 41 27 27 9 9 12 14 14 14 12 8 8 6 6 6 10 14 28 23 27 29 33 33 33 36 53
53 53 57 57 57 57 53 53 53 36 31 31 31 31 31 37 34 22 16 9 11 12 12 10 10 10 10 10 10 25 27 33 33 33 33 37 47 47 50 53 53 57 59 57 57 57 53 53 53 53
53 53 57 57 57 68 68 68 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 51 50 47 47 47 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 57 37 37 52
57 57 57 57 59 52 43 43 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 57 57 54 54 40 40 28 37 37 57 57 57 59 68 68 59 59
57 57 57 59 59 59 54 54 48 57 57 57 57 46 47 54 57 59 59 54 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 59 48 59 48 57 48 48 48 57 57 48 48 48 57
57 57 43 47 47 59 37 37 36 25 28 12 12 12 12 11 11 12 19 19 24 23 22 41 17 24 24 28 32 33 59 59 48 48 48 43 43 30 30 30 42 42 40 43 33 33 28 32 23 28
23 37 34 39 37 37 32 36 30 41 41 32 34 23 30 28 32 32 41 36 40 28 28 28 24 28 20 24 24 37 37 39 37 28 28 28 28 28 35 39 37 39 39 40 30 30 15 15 11 11
11 25 18 12 12 9 12 12 23 22 23 28 28 34 32 35 35 35 37 39 47 29 23 11 11 11 25 25 12 12 11 11 11 23 21 33 33 33 28 34 28 28 28 23 32 28 28 14 12 21
12 12 11 20 18 34 32 37 30 30 30 24 24 13 12 12 11 11 11 19 19 34 34 39 39 39 43 43 37 37 37 40 39 43 25 25 12 12 12 19 20 24 22 24 25 34 32 37 22 19
11 11 11 22 23 18 18 11 18 18 32 32 37 41 37 37 32 31 30 30 30 28 28 14 14 14 30 31 21 21 12 12 11 16 17 28 26 36 36 39 34 37 30 30 30 37 37 36 36 28
30 23 23 23 32 22 25 27 28 28 28 28 31 25 31 37 35 35 39 28 28 14 21 14 22 18 27 29 32 35 22 26 16 16 11 12 15 23 23 28 30 39 39 47 37 37 31 31 28 28
23 21 27 10 9 8 8 8 8 12 19 16 12 12 14 14 14 25 25 30 30 23 26 17 17 12 15 11 13 10 15 19 21 28 30 28 16 10 9 9 10 15 14 13 13 10 10 12 20 14
11 15 12 11 11 11 10 14 17 15 19 15 13 10 10 10 11 13 26 28 34 34 34 34 24 28 12 14 9 9 8 8 8 8 13 10 12 12 13 19 12 13 13 13 18 12 12 11 11 11
6 7 9 7 10 8 13 10 9 9 8 8 8 8 10 12 12 11 9 8 8 8 17 15 24 22 22 28 28 24 18 15 11 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 9 11 11 11 8 8 8
8 8 8 10 10 8 9 8 8 8 8 11 11 8 8 8 13 10 9 9 12 15 11 11 10 10 10 10 8 7 7 10 10 10 6 6 6 6 10 11 16 24 28 22 19 16 12 10 10 11
14 19 12 12 12 11 9 10 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 7 6 6 8 8 8 8 10 21 23 17 17 11 11 11 12 12 12 12 6 7 6 6 8 8 8 6 6 10 8 10 8
9 9 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 19 14 12 11 20 16 17 8 8 6 8 10 11 19 11 17 13 10 9 9 9 9 9 12 16 13 9 9 10 10 9 9 8
8 6 6 8 10 15 14 12 8 8 8 8 8 10 10 9 10 8 8 8 8 10 19 15 13 12 12 11 12 12 27 17 16 9 9 8 11 10 8 8 8 11 12 13 13 12 10 10 16 10
10 10 8 8 8 8 8 10 12 12 9 9 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 7 9 8 8 8 15 15 10 10 9 15 15 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
11 8 15 12 8 8 8 13 8 8 6 8 8 10 10 10 10 8 9 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 13 10 7 8 10 8 10 10 10 13 8 8 8 7
9 9 9 10 10 15 15 10 8 6 6 7 7 12 10 11 8 8 8 8 8 8 9 7 10 6 6 14 13 9 9 9 9 9 9 9 12 12 12 8 8 11 11 11 12 9 9 9 8 13
12 8 8 8 11 11 10 16 15 8 6 3 0 3 6 8 7 6 6 6 3 0 3 6 6 7 7 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 3 0 3 14 14 19 3 0 0 3 8 7 7
6 6 8 6 9 9 9 9 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 7 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 3 0 3
3 0 3 3 0 3 0 3 6 6 7 7 9 19 14 12 9 3 0 0 0 0 3 0 3 6 8 8 11 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 9 6 6 8 8 8 8 6 |