BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332G09.T7 (MSMg01no332_g09.b1) | MSMg01-332G09.TJ (MSMg01no332_g09.g1) |
ACC | AG448442 | AG448443 |
length | 1,259 | 1,293 |
length of high quality (start - end) | 551 (125 - 675) | 662 (126 - 787) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_g09.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_g09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_g09.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_g09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:48 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (24,004,522 - 24,005,072) | (24,166,839 - 24,167,353) |
---|
sequence | NNCCGCGTCGCGGGGNNCCATTGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCCATCTCTGTTCTTATTCATTATAGGATGGGTGTGGATCAA
GTGAGCCTCTGACGGTCTTTCAGAGTTGTATGGCCCAGAGCCCACTGTGG
CCTAGGGACCCAGGACCCCAAGGGGGTAGAGAAGCTCACACAAGGGGAGA
TGGAGAGAGGAGCTACCGGTTTACATGTGGGCAAAGGCATTCTCTTAAGG
GTCCGTCCTCAGGAGGAACCCAGCAAGAGAAAATTTTCAGGGATGTGCTG
TCACTGAGGTGAGAGACTGCGGGGCCAGAGAAGTAGCCAGAACTTAGGGT
CAGGGGTGTCCCTGGCGGAATGTATGGCTCACTCTAGGGTCATATAAGCA
CTGTGTCTCTCTTGCCCCCATGTCAAGTCACACTGCCCAGTGACAGTTGT
TCGGGGCCAGTGACCTCTGGAAATAGATATGTCTGAATGTCTTTCCGGGG
TCTAATGGGCAAGCACAACTCCCGGGTCACAGTGTGGACTCCTGTGCTTG
TCACTACAGATGTCCTTGGGTTCCTGTTGGTTCCCATCTTCCAGTTCTTG
GAGAAAACATCTCTTCCCCCACCCACTTGCCCTTCCTGCCTGTCTACACC
AGGGCAGTGGGGGAGGGGCCTAGCTCCCAGGAGCCCTGTGCTGACGCCGT
CCAGAATATTGGGTTTAATGAGCTGCAAAATGAGGAGGCTGCAGCTGACA
CGTACGGATGGTGCTCACACCCGCCTCCTTGCCCGGGATGTGGCTTCTAT
TACCGCCGCGGCCTTCTCCGACACTTAAATCATGTCTCTCCCGGTTGGCT
CCCCCTGGGGGCCATTCCTGATATTGTTTTTGAAGANAAGNACAGNAACC
CCCATTTTTTTGGTTTCTCGGTGGGTAGAAACAGAAAGGAAGGGAATCCC
CCTTGTGCCTTTTTTAAAAAAAGAAAAAAGTGTTTTAACCGGGTCTGGTT
GGGGTTTTGGATTGGGTTGGGGGCCTCTGTTTTATTTTTATTTAAAAAAT
TAAAGGTCATTTTTTTCCCCTTTCAAAAAAATCTTTGTTTTTGGTTTGTG
TCCTCTTTTGGTCAATTGGTTATTTATGTCTTCTCCTAACAAAGCTTTAA
ATTTTCTAAAACNNTTTGTCTTTTCGTCCTCTTCACATTTTTCTCTTTAT
CNTAAACTATTTATTTGTTATCTCTTTTTATCTCCTTTATTCTTATTTCT
TTATTATTA
| CCCGCACTTTTNNNAAACAAGTGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATAAAAGGAACACACCACAAA
ACTTCTGGGGGTGCTCTCGTTGATTCCTGCTGCTTCCATGGACTCAGGCC
AATTGGCAGAGTGATGTCTGTTGATACAGGCTCACGTGGTTAGGCAAGAC
AATAAAAAAGAAAAGAAACTGAGTATAAAAAAAAATCATAGGAAGAAATA
TTTAGTTTGAAAGTCCTTAAGGAGAGAGTTAGAGATTAAAAAGAAAAATA
TTTTCTGTTAAAATGGAAAACGTGCCAGGCGTGGTGGCACACGCCTTTAA
TCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAAGCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAG
CCTGGTCTACTATGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACC
CTGTCTCGAAAACAAAACAAAACAAAAAAAGGAAAACGCAATGGCACAAC
ACACCTGGATCCCATGTGACTTTGTTCCATTTACCAGCATGTACATAATA
ATGATTAAAAATTTATATATCCTCTTTAAGAAAGATATCAGAATACATCA
GACTTAGAGGACCGAAAAATGGAATTCTGGGTTACAAGATATAAAACAGA
GGTTAGAGGATTCTTTAAATCAGAATAAAGAACCTTCAGAAGAGTCCAGT
CTGGAACTTACAATAACAGCAAAAAAGGGTAGTTCCAGGTGAGAAGAATC
CACAAAGCCTCGAGGAATTAGAATGCAACCCATAAAGATGCAGTATATTG
AATTAAGAATTTAGCCGGGCAGTGGTGGCACACACCTTTAATTCCAGCAC
TCGGGAGGCAGAAACAGGTGGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCCGGTCTA
ACAAGTGAGTTGCAAGAACAGCAGGGCTATACAGAGAAACAAGGCCCCTA
AGCCAACTGAAGCAAGCACTCCCAGAGACTGAACCAGCATGCCCAGGGCC
TAGTGGGTCTGCCCCAGCCCTCAGGGAAGGGTTATGGCTTCCAGTTTAAA
TGTTATATGGAAATTCTGGGTGGGTGAAAAAGGGGGTCTCTGAACTTTGG
GCTTCCCCCCAAACCTTTTCCCCCCGGGTTTTTTTATTCTTTTTTTTGGT
CACATTCAAGCGGCCAAGTTTGTTTTTCACCTATACGTGTATTAATCCTA
TCTACCCCCCTTTTAATTCCCCCGCGAAGCCGTTTTCAATAGAAATAAAA
AAATTGTCTTCCTATACATGTGGGCGCTTTAACATACCTCACC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 9 12 11 11 19 3 0 0 3 7 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 12 15 10 10 8 8 8 8 12 21 28 23 24 24 28 24 30 37 37
37 41 37 37 37 32 19 17 8 10 8 21 21 31 33 31 31 31 31 31 25 21 21 9 9 9 9 6 6 8 6 6 6 9 9 9 16 17 16 29 29 31 31 36 36 53 53 53 50 50
50 50 50 36 36 31 31 31 30 28 25 22 19 12 9 9 9 10 10 9 9 9 10 12 20 20 30 30 33 33 33 33 48 47 47 48 48 48 48 57 53 57 50 50 50 50 50 50 50 50
43 43 47 43 43 50 57 57 57 57 54 57 57 57 59 59 50 54 54 54 54 54 59 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 44 44 43 43 44 59 57 57 68 68 68 68
68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 59 57 68 68 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 54 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 59 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59
68 59 59 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 50 48 46 34 34 26 28 19 17 11 11 11 14 19 34 41 59 59 59 43 43 41 44 43 48 48 57 57 59 59 57 57 48 48 48 57 57 57 48 54 54 54 54 54 54 59 59 59
54 59 57 59 54 41 44 23 23 23 25 36 42 42 43 46 44 47 57 57 57 57 57 59 46 57 43 46 46 57 48 48 47 57 47 48 44 57 43 43 43 57 57 54 54 46 59 57 57 57
48 48 48 48 57 57 57 48 57 57 57 57 59 57 57 57 57 44 44 41 41 43 44 44 44 59 47 54 48 46 46 39 41 35 41 37 46 46 54 54 57 47 59 43 43 43 47 47 57 43
43 39 43 43 47 47 39 37 37 32 34 35 35 35 47 47 48 59 59 39 39 35 43 32 32 18 18 20 32 32 47 36 47 47 46 46 46 47 47 39 37 28 28 23 34 30 37 37 41 30
30 30 30 30 37 41 35 35 35 35 39 43 47 47 39 40 40 43 43 57 48 48 48 57 57 57 37 37 23 23 23 41 41 43 43 31 41 20 20 20 41 28 35 35 30 30 30 30 33 37
43 41 47 41 41 41 41 41 32 37 43 34 34 28 28 23 30 28 29 22 34 25 19 19 19 29 26 19 14 14 24 18 15 18 28 28 28 18 18 18 28 28 43 35 30 28 30 22 23 23
24 24 23 18 19 16 21 23 28 28 22 18 18 17 17 19 19 22 29 23 22 22 23 23 22 13 8 8 8 8 11 13 15 15 16 19 21 15 22 11 12 11 23 25 32 22 27 19 17 15
15 15 18 23 30 23 25 28 18 14 11 11 11 12 12 15 13 14 15 18 18 21 30 18 15 19 18 15 13 13 11 11 12 16 12 16 11 11 11 10 9 9 9 9 10 10 10 10 9 10
10 10 9 10 14 10 10 10 15 15 19 15 15 15 11 11 10 10 9 10 9 10 10 11 13 19 13 10 20 11 13 14 23 21 24 19 13 11 15 12 13 8 8 8 8 8 8 8 13 13
10 15 15 15 9 13 8 8 8 8 8 10 10 9 13 8 8 6 6 8 8 9 11 11 11 13 15 16 22 12 13 11 12 8 8 3 0 3 16 3 0 3 11 11 3 0 3 8 8 11
11 11 9 9 8 12 13 12 12 10 8 8 8 7 7 8 6 6 6 10 10 10 11 13 13 17 16 16 15 17 12 11 9 9 9 9 9 8 6 6 6 6 6 13 8 8 8 11 9 11
9 9 15 10 9 9 9 9 10 15 21 15 17 15 14 14 10 8 7 9 9 6 8 6 6 8 6 7 9 6 8 6 6 6 8 11 11 9 21 19 17 15 6 8 8 15 8 8 9 10
9 8 8 8 8 10 14 10 10 8 8 10 10 16 17 12 12 10 8 8 8 8 6 7 6 6 8 10 8 8 8 7 6 6 6 6 9 8 9 9 6 15 8 8 8 8 8 8 7 10
6 10 9 6 6 6 6 8 8 9 17 15 10 9 9 9 10 10 10 11 13 10 10 9 9 9 15 19 30 33 37 30 24 21 22 15 10 10 10 11 11 10 8 6 6 8 6 6 6 6
8 8 8 6 6 6 10 8 12 10 12 10 10 14 11 10 8 6 7 9 9 9 14 11 10 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 9 9 9 8
8 8 8 10 8 8 8 9 8 8 6 3 0 0 3 8 11 11 8 6 6 15 8 7 8 9 8 8 8 7 10 7 6 8 8 7 6 8 8 10 10 9 9 9 9 9 21 14 12 11
3 0 3 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 10 14 9 7 10 6 6 6 10 10 13 13 8 8 8 6 6 6 13 15 8 6 6 6 8 8 8 9 19 12 12 7 7 8 8 8 8
13 13 15 12 11 9 9 9 9 | Open.Hide. 7 7 6 6 6 6 6 8 9 9 3 0 0 0 3 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 10 11 8 8 9 8 11 8 12 11 17 8 9 9 15 15 17 10
10 17 22 28 35 35 36 37 37 33 29 35 35 36 36 36 44 44 39 37 42 47 27 27 9 9 11 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 10 10 10 10 21 33 59 59 59 59 59 59 57
57 53 36 36 36 36 33 33 39 33 33 30 29 19 17 6 6 8 8 8 15 8 8 8 13 17 29 26 33 33 28 28 28 29 29 37 37 43 50 47 53 50 50 50 53 53 53 57 57 57
57 57 57 68 68 57 57 54 54 47 48 50 50 50 50 50 50 50 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 47 47 47 48 48 41 41 41 41 57 57 57 59 57 68 57 57
57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 54 52 57 57 57 57 59 59 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 68 68 59 59 59 59 68 68 57 57
57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 68 68 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53
53 50 59 59 47 47 30 21 13 8 8 8 8 8 10 25 18 32 34 59 59 59 50 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 48 48 54 48 48 48 48 48 48 48 54 54
54 57 57 57 57 57 48 47 43 43 43 43 44 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 54 59 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 50 50 57 57 57 54 54 59 57 46
57 43 57 44 44 44 54 43 44 44 57 57 57 57 57 54 47 47 57 57 57 57 57 44 44 48 43 42 44 44 59 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48 48 48
50 50 48 48 48 57 59 27 27 28 33 33 36 43 59 59 59 59 59 36 34 28 25 24 26 28 30 33 47 37 37 37 37 37 37 32 32 30 39 31 37 41 37 39 39 46 41 41 34 25
25 32 36 36 41 41 43 44 37 37 32 31 31 37 39 39 39 40 41 39 30 24 20 19 19 20 32 37 28 30 17 13 13 15 26 24 32 26 32 22 25 11 11 12 21 17 25 27 32 29
29 35 39 37 37 30 30 20 15 24 26 26 35 39 23 22 18 15 15 16 19 16 20 18 22 23 32 30 25 34 41 23 17 8 8 8 19 10 24 22 22 21 24 19 21 22 26 31 36 43
44 44 37 27 27 22 24 18 16 18 14 14 10 12 12 25 16 14 21 17 18 24 20 24 24 22 25 19 20 10 15 15 19 22 22 15 9 8 8 8 9 11 10 10 11 12 16 16 17 15
12 9 11 21 17 11 12 12 23 9 9 8 9 9 14 16 12 12 17 9 9 9 9 8 10 9 10 15 9 9 9 9 9 10 10 15 17 17 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
6 6 10 17 8 9 9 9 16 19 27 21 10 9 8 8 6 6 6 8 8 10 13 18 19 14 8 8 8 8 10 8 11 12 16 18 12 14 10 12 12 13 14 9 8 8 8 10 10 15
10 13 10 10 10 11 11 11 10 7 6 6 8 15 22 15 11 10 10 8 8 8 11 8 13 8 8 8 11 16 13 11 11 8 8 6 8 8 10 10 10 9 9 12 15 11 20 19 14 11
16 11 11 8 8 8 8 8 8 10 12 12 13 11 9 9 9 10 12 11 12 12 10 9 9 11 9 10 10 11 10 15 10 15 10 8 8 10 8 8 8 9 10 10 20 12 11 11 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 8 11 9 10 10 10 10 8 8 8 9 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 17 9 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 10
10 9 11 11 11 11 11 12 8 10 8 8 8 10 11 13 18 23 23 16 10 9 8 9 10 11 13 22 25 28 27 31 13 8 8 7 7 8 9 9 11 17 19 32 28 17 10 9 9 8
8 6 6 8 6 8 8 8 7 8 8 8 6 6 8 8 11 11 8 10 10 10 10 6 6 8 12 13 13 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8
13 12 12 9 9 11 11 9 7 8 6 10 10 7 6 8 8 10 10 10 13 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 10 12 18 10 8 8 10 8 8 8 9 9 9 12 22 28 24
14 11 7 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 9 10 12 12 18 12 12 11 11 9 8 8 8 10 8 10 8 |