BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-334I24.T7 (MSMg01no334_i24.b1) | MSMg01-334I24.TJ (MSMg01no334_i24.g1) |
ACC | AG450028 | AG450029 |
length | 771 | 698 |
length of high quality (start - end) | 193 (118 - 310) | 229 (352 - 580) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no334_i24.b1 PHD_FILE: MSMg01no334_i24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:22:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no334_i24.g1 PHD_FILE: MSMg01no334_i24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:22:02 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (43,712,592 - 43,712,784) | (43,541,644 - 43,541,872) |
---|
sequence | ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCCGACCGGCGGAATTCA
GATTCTTTACAACACCATTGCTTTAAAACGTGCTACCTCTTCCTGGTTCT
GTATGTATTCTGACCCCAGGGTGTGGTCACCATGGAAGAATAAGAGTTGA
ATGGGAAAGGAGAATAGGAAAATTATTGGCTTCAAGTAAGCCGACAGGAG
CTTTGTGACTGCGTAAATTGAATTGACTCTGTTGTTGAATGCATCTCTGG
TGTTGGGAGATGTGCAAACTGAACTTGACTGGGCTCAGCCACCTCCAGCA
CTTAGAAAGATGNATGATTTAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAA
GGATGTAGGGAGGCCCGCAGGGAGGAAGGAAGTTAGTTTTTAATTTACTT
TTAATTTTTACCCCCCTCCTTCTTTCTCTATTACCTTACCCATTTTCCTT
CCTTTAATTTATCTCCCCTCCCTTTATTTTTTTTCCACCAATTTCATTCT
TTTTTTTTTCCCCTATTCTTTCTTTTTCTATACCTTATTTTCAACTTTGG
CGTTTTTTACATCTTCACACACTTACTTTATATTTTAAAAATATATCTCT
TCTACAAAAAAAATACATATTTCTTTCCTTATCTTTCTCATATCTCCCGA
CGCTTTATACTCCACACAAAAACACTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCAACG
TAAACATTTTCACATAACCCCTATTTCCCCCACCACATCCTCTTTTATAT
TCGCCGTTTTGGTGCATGTGG
| GACTGGACTTCCCCTACGGGTGAACTATAGAAGGATTTGCANAAATAAGC
TTCAACATCACATTTGCTACTTTATTATTTATTATTATTTTGTTTGCCAT
GTAGGCTTTATTATTTTTTAATCACCCGTATTTATTTCACCACTGGCAAG
CTCTGAGAACAGTTCCTGGCAAACAGGAATTGATAATTAATAAATTGTCT
AAATCCTAGCTTAAATTCCAACTATTTATTACCTACATGTCTTGAGTATA
TAGATCAAGCTTTCCATTGCTTATGCTTCTCATACCGAAAGTGTGAATAN
ATGTTTGTCCCTCATAAAATCGGTATGAGGCTTCACTAAGAGAATTGCAT
ATGGAAATCTCTAGCATAAAGTAGAATTTTTAAAATGTGAATTTTGTTGC
AAAACTTCACAGATGGTCCTAGCATGCCTTAGAAAAGAAATCTGCTTGTT
TTGATATTTTCAGCAGAAAGAATCAATAAACATTTGTAAACACCAGCTCA
GCACTGAGCCCAAGAAGCACTCTTGGACAGAGGGTAACTGCCCTAAAGAA
GCAACAAAGCCTTAAGAGAAACAGATCCAATGGTTAAGGATTACACTTCC
CAGGAGAAGTGCTTACAAGGTATAGGAGTAGTTATCAGCAGACACACTTC
TCTAATGCGTATTTGAACTAACCAGACAGAGGACATACTGTCAACAAG
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 21 22 59 39 31 28 28 25 24 16 14 10 10 10 23 23 39 33 33 33 30 30 21 27 9 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 10 10 10 11 17 21 22 21 8 8 10
21 21 25 16 13 12 12 9 9 9 7 7 8 7 7 7 11 15 24 25 34 27 21 10 10 10 21 21 59 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 53 53 53 50 50 50 53 53 50 50
50 50 47 31 23 11 11 11 11 13 8 12 9 9 7 8 21 17 28 28 30 32 32 43 43 48 57 57 57 57 57 53 50 50 50 53 53 42 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 51 47
47 47 42 50 57 57 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 68 68 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 57 48 48 48 48 50 53 53 53 53 57 57 57 57 59 48 57 48 48 48 48 37 37 37 27 16 8 8 8 8 8 13 25 30 31
59 59 59 59 59 59 48 39 47 47 47 47 47 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 54 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 53 57 57 57 59
59 59 59 59 59 27 27 14 9 9 9 3 0 3 6 6 6 9 11 11 11 23 28 59 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 32
22 10 8 8 8 8 8 15 12 24 12 15 13 10 10 10 10 11 16 22 12 18 16 28 12 12 11 12 12 17 13 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 17 15
10 9 11 11 11 12 16 16 11 11 11 12 12 10 13 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 12 10 10 11 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 12 8 8 10 10 21 14 14 17 8 8
8 8 8 9 10 10 12 13 13 14 12 11 11 11 10 8 14 8 10 10 10 12 13 13 10 11 9 12 10 9 14 10 9 13 10 8 6 6 8 8 10 8 8 9 9 9 9 8 8 8
8 8 10 10 10 9 9 9 9 9 11 24 24 16 16 10 10 10 12 15 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 9 10 9 11 15 15 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 11 11 10 10 9 10 10 8 8 8 9 9
9 12 10 6 6 6 8 9 9 13 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 12 10 10 9 8 13 9 10 8 12 8 8 8 8 10 8 8 8 6 8 10 10 9 9 12 12 13 8 8 8
8 8 7 9 9 8 10 12 12 13 10 10 8 7 9 9 8 7 7 7 8 9 9 8 9 10 10 15 21 25 13 14 14 14 18 17 11 8 8 8 15 10 19 15 8 8 8 8 8 8
6 6 11 8 10 10 11 12 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 11 8 9 9 9 8 8 10 12 12 12 9 9 9 12 9 8 8 8 6 6 8 8 10 9 10 15 10 7 7 6 8
8 6 6 8 8 10 9 7 8 9 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 9 15 20 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 10 13 12 12 12 25 25 42 50 42 47 33 29 11 9 9 7 8 7 7 6 3 0 3 6 7 6 6 8 12 23
23 19 9 8 8 22 22 36 36 38 38 53 53 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 53 53 59 59 59 59 59 59 44 27 16 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9
15 18 23 23 23 34 34 59 48 57 53 53 53 53 57 57 59 59 57 53 53 53 53 53 53 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 54 48 48 43 48 48 68 68 68
68 57 57 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 54 59 59 68 68 68 68 68 68 50 50 50 47 47 47 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 48 48 48 57 59
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 59 59 31 34 18 18 12 12 11 12 21 30 41 41 50 50 50 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50 59 59 59 59 59 25 23 9 9 7 6 6 6 6 3 0
3 7 7 10 27 25 37 39 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 40 23 12 9 9 9 10 12 18 18 12 12 12 11 12 12 12 12
15 16 18 28 40 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 33 32 32 44 44 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 48 48 57 59 59 57 50 50 43 44 44 50 52
59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 57 57 59 59 59 59 57 48 48 48 44 44 47 35 35 44 44 43 43 43 59 59 57 54 54 54 57 57 57 57 43 43
46 44 48 48 57 57 57 57 57 57 46 57 34 32 20 20 20 32 34 54 54 43 43 32 32 32 32 42 39 41 41 48 48 57 57 54 48 57 59 59 59 59 43 47 35 35 35 43 41 35
35 35 39 39 39 37 30 30 30 37 37 39 39 38 34 32 35 39 41 47 47 43 34 34 24 24 34 34 47 47 46 46 37 33 33 33 33 33 32 37 37 29 37 37 27 27 32 32 28 31
39 37 37 37 22 20 19 30 30 18 20 30 27 21 22 22 18 21 26 31 31 35 36 37 37 19 21 11 11 11 15 12 11 11 10 16 10 12 12 19 21 34 34 28 28 28 29 29 31 29
32 23 14 14 14 16 14 19 15 20 20 32 21 19 9 9 10 9 10 9 9 10 19 23 10 8 8 8 6 8 8 10 10 10 10 10 10 11 15 12 18 11 12 12 14 21 21 17 16 11
11 11 22 19 31 35 31 28 25 25 25 19 21 20 20 19 24 14 11 11 10 9 8 10 10 10 10 11 18 28 20 13 13 12 12 12 15 15 10 8 8 8 10 10 14 10 10 10 |