| Query= MSMg01no376_b21.g1 MSMg01no376_b21.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no376_b21.g1 PHD_FILE: MSMg01no376_b21.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 23:15:56 2005
(405 letters)
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Sbjct: 336 atgttgaacatatttttggatatatggactgctttttggagatttgatagtcaaagttcc 277
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Sbjct: 276 ctttggacccaataacagccacaacgcattttatttcatatttttaagaaaatgatctaa 217
Query: 126 catctttcctcctctctctctctctttctctctctctctctctctgtcccccttccttcc 185
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Sbjct: 216 catctt---tcctctctctctc----tctctctctctctctctctgtcccccttccttcc 164
Query: 186 ttccattatctatctatctatctacctatctacctatctacctatctatctatctatcta 245
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Sbjct: 163 ttccat------------------------------------------------------ 158
Query: 246 tctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcta 305
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Query: 306 tctatctatgtgtgtg------tgtatatatatatatgtacatatatatgtatatatatg 359
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Sbjct: 107 tctatctatgtgtgtgtatatatatatatatatatatgtacatatatatgtatatatatg 48
Query: 360 catatatatttttcctgagagccatggggtaacaaaaaccaatggt 405
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Sbjct: 47 catatatatttttcctgagagccatggggtaacaaaaaccaatggt 2
Score = 124 bits (64), Expect = 1e-32
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Strand = Plus / Plus
Query: 192 tatctatctatctatctacctatctacctatctacctatctatct-a---tctatctatc 247
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Sbjct: 651 tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcacgttctatctatc 710
Query: 248 ----tatc--t-atcta----tctatctatctatctatctatctatctatctatctatct 296
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Sbjct: 711 taaatatcaatcatctatttttctacctacctacctacctatccatctatctatctatct 770
Query: 297 atctatctatctatctat 314
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Sbjct: 771 atctatctatctatctat 788
Score = 124 bits (64), Expect = 1e-32
Identities = 111/130 (85%), Gaps = 9/130 (6%)
Strand = Plus / Plus
Query: 192 tatctatctatctatctacctatctacctatct-ac---ctatctatc----tatctatc 243
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Sbjct: 663 tatctatctatctatctatctatctatctatctcacgttctatctatctaaatatcaatc 722
Query: 244 tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatc 303
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Sbjct: 723 -atctatttttctacctacctacctacctatccatctatctatctatctatctatctatc 781
Query: 304 tatctatcta 313
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Sbjct: 782 tatctatcta 791
Score = 110 bits (57), Expect = 1e-28
Identities = 111/135 (82%), Gaps = 15/135 (11%)
Strand = Plus / Plus
Query: 192 tatctatctatctatctacctatct-ac---ctatctacc----tatc--t-atcta--- 237
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Sbjct: 671 tatctatctatctatctatctatctcacgttctatctatctaaatatcaatcatctattt 730
Query: 238 -tctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatct 296
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Sbjct: 731 ttctacctacctacctacctatccatctatctatctatctatctatctatctatctatct 790
Query: 297 atctatctatctatc 311
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Sbjct: 791 acctacctatctatc 805
Score = 103 bits (53), Expect = 3e-26
Identities = 76/85 (89%), Gaps = 6/85 (7%)
Strand = Plus / Plus
Query: 231 ctatc-tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatct-a---tcta 285
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Sbjct: 645 ctatcctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcacgttcta 704
Query: 286 tctatctatctatctatctatctat 310
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Sbjct: 705 tctatctaaatatcaatc-atctat 728
Score = 103 bits (53), Expect = 3e-26
Identities = 73/81 (90%), Gaps = 5/81 (6%)
Strand = Plus / Plus
Query: 226 cctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatct-a---tctatcta 281
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Sbjct: 649 cctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcacgttctatcta 708
Query: 282 tctatctatctatctatctat 302
|||| |||| ||| ||||||
Sbjct: 709 tctaaatatcaatc-atctat 728
Score = 97.4 bits (50), Expect = 2e-24
Identities = 98/120 (81%), Gaps = 15/120 (12%)
Strand = Plus / Plus
Query: 210 cctatctacctatctacctatctatctatctatctatctatctatct-a---tctatcta 265
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Sbjct: 649 cctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcacgttctatcta 708
Query: 266 tcta----tc--t-atctat----ctatctatctatctatctatctatctatctatctat 314
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Sbjct: 709 tctaaatatcaatcatctatttttctacctacctacctacctatccatctatctatctat 768
Score = 95.5 bits (49), Expect = 6e-24
Identities = 60/65 (92%), Gaps = 5/65 (7%)
Strand = Plus / Plus
Query: 255 ctatc-tatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatct-a---tcta 309
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Sbjct: 645 ctatcctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctcacgttcta 704
Query: 310 tctat 314
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Sbjct: 705 tctat 709
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 186
Number of extensions: 63
Number of successful extensions: 63
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 43
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Length of query: 405
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Length adjustment: 9
Effective length of query: 396
Effective length of database: 796
Effective search space: 315216
Effective search space used: 315216
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
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