BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-475H23.T7 (MSMg01no475_h23.b1) | MSMg01-475H23.TJ (MSMg01no475_h23.g1) |
ACC | AG557310 | AG557311 |
length | 1,612 | 791 |
length of high quality (start - end) | --- | 353 (79 - 431) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no475_h23.b1 PHD_FILE: MSMg01no475_h23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:54:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no475_h23.g1 PHD_FILE: MSMg01no475_h23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:54:18 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATCCTATATCCCTTCGTAGTCCTACCGTGGGCGCGACTTGTATGGCGACG
CGCTGATTGGTATTTCCAACGAGTAACAGCGGCGGCGCACAGTTATGTTA
TTTGAGCTTCTTCCCCATAATACNACACTGTCTCCACACCACTCAGTCGA
CCAGAGCCGAGTAAGCGCGGCCACGAGCATCGAGATGATAGTTAGACCTA
TTGCGCAACGACGGCACTGGGTANCNACGTGAGATATGTCAATATAACGA
CGCGATCGCCACGTATGATCGACTCGTAATATGCGCCGACATTAATTGAG
AAGGGATGGTGCCGTCCATAGCAAGTAGACTTCACTCTGAGCGGTACTCT
ATCACCAGGGTTTGTTGATATGTACTTAGTCCTGGCGCTTGCTGAAATGT
TCTGTGATACCATGTCTGCGCTGACGCTAGTGGTAGCTAGCTCCATGTGA
TGGATATCGCACTACAAGCTNCGGCGGATGCTCACCGTCGAGATATCATT
GCGATGTACTCCGAGCGTCTCACTGCGTGTCGTGCTACTGTGCAATCGTA
TATACTATATCGCGAGTCACTCTCCGACGATCCGCTGTTTACGCCTCCAN
GCGCTACTCACACATTAATGATGCGCTCTTCACTCATCTCGCTTACGCGC
GCTCCACTCCGTNCATATGTATGTATGTNCACTCTATTGTGGTGGGCGAA
GTATCTCNGCGCAGAAGAGATATACCGTAATCGCTCGTGTATGTAGAACC
ACATCAACGCGATNTTCACGCAACACGCGACTCGCAATCATATATATATA
CGTATGCAGANGTGAATGCTTACGTGCGCTGTCGCATGTTCTGTATGAGT
AGTACAGACTAGACGAGATGATACTCACCGAGATCTAGATACTCATCTAC
TCAACGNTTTGACGCATATGNCTTATGAACGTTATTACGCTGTGGCATAT
CTATGCACGAGTGCGTCTTGCTATCTATTCACATAATATATAACGTGCGT
ACGTAGCAGATGCACACTGATCGTCTCATNGTCTGCGTACTACTACTCCG
TGACCGTGTGTGCGCCGACGCTCGCGCCGCATCGCCTATTTGTATCACAG
AGCCGCTTCTTCATCGCGCGTGCATCACCTGACAGAGCGCTACGCACCAG
GATATGATCACGGTGCCTACAGCGANCCCGACGTACTCGCCGTCTATCTG
TCGCGGACGNCGCGCAGATATCGTGTCTCATTGCCTCATCGTATTGTGAT
GTCTACCCCACTCACTTACTGTGTATTNTNGTATGTTGCGACACGAGCAC
AGCTGCGCTCACTATGTATATGAATGCGCGTCGTGACTCAANATACGACT
GATCTACATCTTGACCNANCTCGNCCGACGATCTATAGATNTGTATACNC
NCACAGGCGGTATATCGCACCTGATGTGTGGTNTGTCGTCTTACGCTGCG
ATATTAATTATATCTCGCTCATACGAACGCATNATCTCATTCGATCGCGC
TGATGTTCTCATATCATATTCGACGCACTGCTGTATACTATCACGCGGCA
CGACGTTCGTCGCGTCTCTATGTCGCAGCTCTCTGTGAGTCGTTACTCAC
GTATGCGTGGCG
| NNCCCGATGAAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATCCCCATCGACTTTATTTTTA
TTTTCCTAAGATCTTTTTTTTTTTCACACCATGGGAAAACAATGTGCTGA
CTTTAAATTAGAAAGTTTACTTTCATTTCTTGGTAGTGATAGAAATGCAG
TGTTTCTAGTTTCTTGGAAATTGATGCCTCCTGTGCTACTATGTCTACCT
TTGATTTCTATTTGTCTGTGAAGATGATATTAGAAGGGAGTGCCTGGATT
TTTCAATGAGTGGCCTCACATTTAATTCTAGGTATAGTGGGAATGAATTT
TGTCCCACTGAAGCACATGTAATGTGTTGCTACTTGTTAGGTACACATTC
GACTCATCCTTAACTCATACCCGATATGCGTTCCAGATTCATCATGCTAG
CCTCCTAATCTTCTTCTTCCCACAAACACAAATTGAACTCCTCATGGGAC
AACACCTCCCACTCCTTAGGGTTGCAGGATTTTTGGCATACATTTTTTTC
ACGACTTCGTTGAAAAGAACATTTCAGGCCTTTCCTCCCCCTCTTGGTAC
CCTTTTCCCCCATATACGCTCACACTTTCTCCGGTTCTCTTGCCCCCCCG
TTTTCCCCCCCCCCTCTTGCCTCTACATCTACACATTTCTTTTCCCCCTT
TTTCCCCCTTTTCTCCTTCCCTATCTCTTTCTTCTCGCTCTCTTCTCCCA
TTCCCGTTTCCCCTACTCCCCACCCTTCCCCTTCTTATCTG
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 13 10 10 10 10 10 7 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 10 10 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 10 6 8 8 8 8 8 6
9 6 7 8 8 10 10 6 6 6 6 10 7 15 10 13 9 9 7 7 8 8 3 0 3 10 13 12 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 6 8 7 6 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 10 8 10 8 8 8 6 6
6 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 9 9 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8
8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 6 10 10 6 8 8 8 10 8 9 8 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 7 8
8 8 10 8 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 10 10 10 13 10 10
10 10 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 6 6 6 6 9 9 9 6 8 6 6 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 8
8 8 8 10 8 8 9 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 10 10 9 9 9 9 10 8 8 6 6 6 8 9 8 8 6 9 6 6 6 7 6 6 6
6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 9 6 8 8 10 10 10 3 0 3 6 6 6 6 6 6 10 11 11 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 8
12 9 6 8 8 10 6 6 6 6 10 6 6 8 10 10 10 10 9 14 13 10 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 9 8 10 8 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 7 6 6 8 8 10 9 9 8 8 6 6 6 8 8 10 12 9 9 9 8 6 8 6 6 6 8 13 10 9 8 8 8 8 6 6 12 6 9 9 9 11 9 10 15 10 3 0
3 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 14 12 9 8 10 8 8 8 9 9 9 10 9 9 9 10 10 10 10 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6
9 7 6 8 8 6 8 6 6 8 8 3 0 3 8 6 6 6 6 6 7 6 6 6 7 8 8 3 0 3 8 11 12 10 10 10 10 12 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6
6 8 8 10 8 8 3 0 3 10 8 8 7 7 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 6 8 8
8 10 10 10 10 10 10 15 10 8 8 8 3 0 3 9 9 9 10 9 9 10 8 6 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 11 10 10 11 17 16 13 16 10 8 8 8
8 8 8 10 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6
7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 19 14 13 16 16 12 13 8 8 8 8 10 10 13 10 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 8 9 10 13 10 10 8 8 8
8 11 11 11 11 3 0 3 9 9 9 9 10 8 8 12 8 8 8 3 0 3 8 6 6 8 8 8 7 8 8 6 6 6 9 9 9 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 11 15 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 13 10 10 15 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 10 10 8 8 7 7
8 8 10 11 12 11 10 10 12 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 10 10 13 3 0 3 8 8 8 10 9 10 10 10 6 8 6 6 8 10 6 6 6 6 6
6 6 6 6 8 8 10 12 10 15 10 8 6 6 6 6 8 9 7 8 6 6 6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 7 7 7 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 11 8 8 9 8 9 9 9 9 6 7 7 7 6 6 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 10 10 16 14 14 11 15 10 10 8 7 8 6 6 8
7 8 12 10 7 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 3 0 3 6 6 6 6 6 10 14 13 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 11 11 11 10
10 9 8 8 8 6 6 7 3 0 3 8 7 7 7 7 7 9 9 9 9 10 10 10 11 11 11 10 10 7 6 6 6 6 8 8 8 10 10 6 6 8 10 11 8 8 9 7 6 8
6 6 6 6 6 7 7 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 0 3 6 8 6 7 6 6 6 7 8 8 9 9 9 9 9 11 8 8 8
6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 7 7 6 6 8 6 9 9 12 9 11 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 3 0 3 9 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 6 6 11 11 7 7 7 8 3 0 3 0 3 6 6 3 0 3 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 6 6 6 3 0 3 9 10 11 11 11 3 0 3
0 3 6 8 6 6 6 6 9 10 10 11 17 12 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 9 10 10 9 6 6 6 6 8 8 11 8
8 6 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 8 8 9 9 6 6 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 9 8 3 0 3 6 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6
6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 6 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6
6 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 6 7 6 6 8 8 8 7 8 8 8 8 9 9 9 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 8 10 8
8 8 8 8 8 10 12 12 11 11 10 10 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 7 10 14 11 11 9 8 7 7 6 6 8 11 19 36 36 39 39 39 39 39 37 31 31 37 32 32 43 27 22 9 9 12 16 14 16 18 22 22 27 26 34 34 37 43
39 39 39 39 39 44 44 59 59 59 50 30 27 13 8 8 8 9 10 10 13 16 12 24 19 22 30 28 33 36 36 48 53 57 57 53 53 53 50 53 53 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 37 37 37 41 44 57 57 57 47 57 57 68 68 50 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 57 57 43 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 57 50 43 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 59 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68
68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 50 50 43 43 43 57 52 57 47 44 43 23 23 23 43 43 43 36 36 50 50 57 57 57 48 48 48 59 48 48 57 57 57 57 57 57 57 43
59 35 35 35 44 42 42 35 39 36 36 36 36 18 27 23 30 30 30 30 30 22 30 30 40 48 48 44 44 36 28 32 28 23 23 32 30 43 28 28 15 12 12 19 19 25 43 27 28 12
12 13 24 23 30 30 32 39 39 39 37 32 32 28 28 28 27 27 17 13 13 16 23 25 32 26 26 15 15 15 17 13 8 6 6 8 6 9 11 15 20 21 28 12 8 8 9 11 11 13
20 24 29 37 22 17 10 9 9 15 19 33 24 24 22 21 22 12 12 12 15 15 14 16 10 10 11 13 18 15 12 12 12 15 13 10 9 10 10 11 9 10 9 9 9 9 12 12 13 22
18 10 10 10 7 6 8 8 8 8 9 9 8 15 8 8 8 10 10 13 9 9 9 12 17 17 11 12 12 18 12 13 12 12 10 8 8 8 8 8 9 9 9 11 22 22 22 15 13 8
8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 11 10 11 11 12 12 14 11 17 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 13 9 9 10 12 12 17 19 21 15 15 11 9 12 12 12 9
16 28 24 20 20 12 10 10 13 13 11 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 12 15 14 15 15 10 10 10 9 8 6 6 6 8 10 12 12 14 32 24 10 10 8 8
10 15 15 8 6 8 8 9 9 16 14 11 11 11 11 15 11 11 8 8 8 10 15 8 10 8 8 12 11 10 8 8 8 8 8 8 15 10 10 10 11 13 15 19 14 17 12 12 12 10
10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 7 7 7 7 14 15 19 12 13 10 13 7 7 8 8 8 6 6 11 8 8 8 6 6 8 6 6 11 10 10 8 8 8 11 8 10 10 10 11 12
11 21 12 12 10 10 10 11 11 14 9 9 12 9 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 10 25 22 18 13 15 11 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 |