BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-476C01.T7 (MSMg01no476_c01.b1) | MSMg01-476C01.TJ (MSMg01no476_c01.g1) |
ACC | AG557792 | AG557793 |
length | 752 | 732 |
length of high quality (start - end) | 280 (42 - 321) | 577 (81 - 657) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no476_c01.b1 PHD_FILE: MSMg01no476_c01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:55:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no476_c01.g1 PHD_FILE: MSMg01no476_c01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:55:08 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GTCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCAAGAGGATCCGCG
GAATTCTCCTCTGTACAAACAGACTGGGAGGAAGAAGCAGCTCATTATGA
GAAAAAAGGGTACCAGCCAGGTAAAGTGCTAGCTAATCAGTTAAGGAAGC
CAAAAGCGGCTGGCGAAGGCCAGTTTGCTGATTGGCCTCAGGGCAGTCGG
TTTCAAGGTCCGCCCTATGCGGAGCCCCCGCCCTGCGTAGTGCGTCAGCA
ATGCGCAGAGAGGCAATGCGCAGAGAGGCAATGCGCAGAGAGGCAATGCG
CAGAGAGGCAGTGCGCAGAGAGATTTTGTGCAGAGAGGCAATGCGCAGAC
TCATTCATTCCCAGAGAGGAACAAAGGAAAATACAACAGGCATTTCCAGT
CTTTGAAGGAGCCGAGGGTGGGCGTGTCCATGCTCCGGTAGAATATGTAC
AGATTAAAGAACTTGCCGAGTCGGTCCGTAAATACGGAACCAATGCTAAT
TTTACCTTGGTGCAGTTAGACAGGCTCGCCGGCATGGCACTAACTCCTGC
CGACTGGCAAACGGTTGTAAAAGCCGCTCTCCCTAGTATGGGCAAATATA
TGGAATGGAGATCTCTTTGGCATGAAGCTGCACAAGCGCAGGCCCGAGCA
AACGCAGCTGCTTTGACTCTAGAGTAGAGAGATTGCACTTTTGACTTGTT
ATACGGTCAGGTAGCTTATTCTGCTGATTAGACAACCTACTCTGGGCAGT
TT
| GCGGGCGAATGAAGGGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGCATATCTACAGAAGGAA
AATATCTTACTTTAAGATGCTATTCATTAGAAATTGTGTTCCAATAAAGC
TCAATTTATATCCAGTTAATTATTTTTAGGCATAACTAGTCCATCTTCTT
GGGCAACAGGAATCCACGTAGTGGCAATTCTTTTTGATTAGTCTATGAGT
AGCACCTATATTATTGCTTTCTCTCTTTTTATACTTTTTCTTCAAGGAAC
TCCATTTTTATATTACAACTACAGTTGTTTAATTAAGTCTGAACTGGGGC
ATAATTTTGTTAAATAGCATACTTACTATTGGTCAAAAAATCACATTATG
TTGATGTGATTTTCATTCATGACTAATTATTACAACATAGTTATAAGTTG
AGAGAATTATGCTATTAAATGATATTGGTATTTATGGTAAAAAATTAACA
TACAATTTTCCATTTATACTACAATTCATTCTTTAAAAAAGTCCTAATGC
TGGATAATTATTTTTTCATTAAGTAGAAGAATTAAAATATAATTCTTTCT
ATATCACACTATCTGCTACTTCAAAGTACAAAATTGAAGTAAATTTATAA
CTGACATACTAAATCAGAAAGTAGTCTATACACAAACACAATTTTCTTCA
TTTTGTAAACTCAAGGATGTAATTTATCTGCT
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 11 11 19 19 30 30 30 34 28 28 28 20 19 13 17 13 10 8 8 10 22 22 30 10 10 14 13 11 6 6 6 7 7 6 6 10 10 10 21 19 28 28 30 30 39 47 47
31 31 24 26 30 30 40 34 34 19 12 9 8 8 8 8 10 15 18 30 33 33 33 39 37 47 47 57 57 57 57 59 59 57 44 44 40 40 43 34 42 28 33 33 42 42 57 57 57 57
57 59 68 68 68 68 68 68 68 47 44 28 31 37 29 36 22 24 24 32 32 59 48 48 48 57 57 43 47 47 59 48 48 48 44 48 37 32 28 44 44 68 68 68 68 68 57 44 43 35
32 32 44 44 59 43 43 39 43 43 48 57 52 52 52 57 57 44 43 29 31 43 44 44 59 59 52 52 52 57 57 68 57 44 43 27 27 43 33 21 38 38 39 39 38 41 23 23 27 44
44 44 43 28 33 44 44 44 33 31 43 38 38 35 43 43 59 59 50 50 37 44 38 38 21 31 43 43 43 33 35 33 43 43 43 43 42 44 44 59 59 39 43 36 35 35 37 42 42 48
59 59 32 28 15 15 11 15 15 34 34 59 54 54 54 59 59 42 43 36 36 27 44 44 59 59 59 48 48 48 59 59 43 43 36 36 23 43 43 68 43 57 48 48 48 48 59 42 43 32
32 23 41 41 59 59 59 59 59 59 59 59 37 43 39 37 30 41 24 22 12 15 12 18 13 14 12 12 11 12 12 11 20 25 41 37 47 40 40 40 59 44 43 46 39 39 28 43 18 28
24 30 30 43 37 30 30 43 37 33 33 32 28 43 40 54 54 57 57 57 47 43 43 43 47 46 48 59 57 68 44 44 36 23 23 28 36 42 59 35 35 35 34 34 42 42 24 27 35 17
17 30 41 59 68 68 68 59 57 32 32 20 27 27 34 38 68 68 68 59 59 43 52 52 38 44 27 27 38 38 59 43 43 43 43 32 21 38 41 68 68 68 68 68 68 68 50 59 37 42
42 57 57 68 68 68 68 68 48 48 47 48 46 44 41 27 27 24 34 34 33 33 31 32 18 14 27 14 32 32 57 44 44 37 32 30 44 44 37 32 35 35 59 59 59 59 59 59 59 59
68 57 44 48 48 48 40 41 34 37 34 23 31 28 43 43 57 57 57 48 48 48 48 41 41 30 32 28 32 26 28 34 34 41 43 38 28 35 36 47 59 59 46 46 46 47 47 43 39 28
28 36 37 34 36 34 29 41 41 59 43 39 31 31 23 23 31 34 47 59 37 37 37 37 37 27 28 17 22 22 30 30 25 25 30 30 39 37 34 24 19 20 20 18 24 22 22 28 34 34
34 24 24 28 31 32 18 20 20 15 9 9 9 13 15 28 27 27 18 12 12 12 16 21 20 19 28 30 28 28 14 14 14 21 15 20 20 18 18 14 28 28 26 19 18 18 13 21 21 39
34 34 33 29 22 19 32 20 24 24 25 25 25 26 28 14 12 12 12 10 10 11 11 11 11 12 12 11 12 12 21 22 17 20 11 11 11 15 12 14 24 19 21 17 19 19 26 10 10 8
6 6 6 11 8 14 16 14 12 15 11 11 11 16 17 30 30 24 21 15 20 18 10 10 10 10 13 10 12 12 13 13 15 12 11 11 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6
6 6 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 10 10 12 8 12 10 10 10 10 13 12 8 9 16 19 17 17 10 10 10 17 7 8 6 6 8 13 13 15 8 10 11 13 13 11 10 10 10 10 18 18 37 26 28 15
15 33 33 36 36 36 33 33 33 59 46 23 23 9 18 10 10 10 10 12 10 15 18 12 10 10 20 23 33 33 43 43 44 44 57 59 59 59 57 37 34 34 37 42 42 59 59 59 59 68
68 57 43 46 42 43 48 57 48 48 48 59 59 59 57 57 48 48 43 48 48 44 43 39 35 35 24 25 20 41 29 48 50 50 50 50 57 48 48 37 39 37 37 57 57 57 59 59 42 42
35 43 28 44 44 68 68 68 57 57 43 43 32 32 43 44 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 52 52 52 57 59 52 52 52 44 41 28 20 32 32 39 43 43 43 43 41 38
38 59 39 41 43 43 52 52 57 50 50 50 37 37 35 38 43 38 59 59 59 59 57 52 52 52 38 44 35 43 43 59 59 68 68 68 68 68 68 43 44 27 27 36 44 44 68 68 68 68
68 59 44 44 42 43 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 54 54 54 54 54 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 43 43 43 43 43 43 57 57 43 43
43 43 36 39 44 44 57 59 59 59 59 59 59 44 43 40 40 40 34 32 28 15 12 11 12 11 12 12 12 12 14 14 28 30 36 59 59 35 35 37 59 59 57 57 59 48 59 59 39 39
43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 43 42 35 35 35 59 39 48 48 59 48 48 48 59 59 59 44 44 23 23 32 44 59 68 44 44 32 30 30 42 42 57 57 57 68 68
68 68 68 57 59 59 57 57 57 68 44 44 43 43 43 44 42 29 29 44 44 57 57 57 57 57 68 68 68 59 44 43 32 32 32 43 43 44 44 57 57 57 57 57 59 59 57 54 48 57
50 54 54 57 57 57 57 57 57 57 54 54 48 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 59 59 59 57 57 57 59 59 59 42 40 31 36 36 48 59 59 54 54 54 54 54 54 54 54 54
48 48 48 48 43 48 47 57 48 48 48 50 50 50 59 59 59 59 59 47 47 39 39 37 37 39 37 36 36 39 47 39 39 39 37 37 44 59 44 41 39 36 36 43 43 43 43 43 48 43
43 43 43 43 57 57 57 48 48 48 57 57 48 43 37 32 28 28 34 30 37 30 28 28 34 34 40 36 32 26 30 34 37 37 39 40 40 41 48 50 53 41 41 32 32 30 36 28 24 24
33 32 40 25 23 23 28 28 35 43 43 43 48 48 48 46 43 43 43 39 39 28 28 17 16 16 23 23 22 25 22 32 29 31 29 25 31 19 15 13 13 13 13 22 26 28 28 28 28 28
28 22 21 11 11 11 18 12 14 13 15 12 12 12 11 9 9 9 9 11 11 17 11 11 11 11 12 16 18 21 12 9 9 9 9 12 19 23 20 23 23 31 30 30 30 18 15 15 13 18
18 24 11 11 10 10 10 10 12 12 21 16 11 11 15 19 22 22 12 12 12 12 21 17 24 14 14 9 10 10 14 11 |