BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-537F19.T7 (MSMg01no537_f19.b1) | MSMg01-537F19.TJ (MSMg01no537_f19.g1) |
ACC | AG604352 | AG604353 |
length | 772 | 752 |
length of high quality (start - end) | 249 (153 - 401) | 434 (77 - 510) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no537_f19.b1 PHD_FILE: MSMg01no537_f19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:15:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no537_f19.g1 PHD_FILE: MSMg01no537_f19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:15:43 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NAAACCTATTAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGAGGATG
CGCGGAATTCCTGTCGTGTACCATGTGACCACGACACCCCACGAAGAGGA
GAAGACAGTGACAACTGGTCAGGTAACAGAGCCTAGAGTTCTCCATGCTA
ATGAGGTGTCTAGGAGTCTCCGAGTGTGGCCAATGAGCTTCCCTTCATAG
GCATCCCTTCCCACAAAAGGTATTTCAGCTCTGGTTCACCCTGAGTACAT
CGCACACATCCCCATCTGCCAGGAATAAACAATTTGGACAAGCAAGGACT
GTCTCCTCCATCAAGAACCACCTTAGGAGAGGCCTTCGGTCATACAGAGC
CATGTCTAAGTCTCCTGCACAAGGCTCTTCCATACTCCTGCCATTCACCC
TGAGCTAAGCAGCATCCTGCCACCCTCCACCCCCATGCTCATGGTAGGCC
GAGGCTGTTCCTAACTCTTCAAGGTCAGCGCCCCCGCCCCCGTCACCCTG
TTCCTAACTTCCTGAGGTCATGTGGCCACCATTCCCAACTCAAGGTCCCC
CGTGGTGCCCCACTTGGCTAATGATAGCCCCACCCCTACCTCCTTCCTAC
TTCCTCCAAGGTTCTCATAAACCCTCTGGGGTGCCCTGGTAATTGAAGAA
CCCCCAGTCTCTTTCCTAGTCCCCCTCCTATCCCGGCCCCTGATTTTTTT
ATTTTATAAAGAAACTAAGGGGCTGGGTAACCCTTTATATTTTAAACTTG
TTTTTTGTTGTTCGGAGCCTCT
| TTCCCATGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATCTGGATCCTTCTGAGATAAGGT
GCTTGCTTGCAAAGGTATCAGTGTCTCTCTGGCCAGAGGTGACAACGGAA
GCGAAGCCGGTCCTGTTTGGCTTAGTGCATCCGACCTGCCACAGGCCTGG
GCTGCCCAGGCACGCGCAGCGGATGCACCGGCCCTGAACTCTTTCTCCGA
GTAGTCCCCAGAGGCGACGGCTGCCTTTCAGTTTCTCCACTTGTTTATTT
TCGAAGGGACGTTGCCAGACCACAAGGCCACCCCTGCCCTTTCATGGTGT
GCTACGGGAGATTTCAGGAAGAGCGAGAAGTCAAGACCCAGAAACCAATC
CTCCTGCCAGCAAAGGACCACAAGGAGCCCCAGCTGTTAGGTTGCAGGGG
TGCGCATCCGGCAGGTGACTCATTTGCAAAGTGGGATCAGAAAAGTCCCC
CGAAAACCCGGAACCTGGAAAATACTGATAGTGCTAATGGTGATTACAAA
CAGCCACTAAGAGGTGCTGAAATAATCGGACATCTGTGTGCAAAAATAAT
GACCCTGTACTTGGTACGTTAGTCACAAAATAAGCCATAATTAACCTACC
GAAGATGGTTCAGTGGTTAAGAGCATATACTTGGCTGGACGTAAGTGGCT
CATGCTTTTAAATCCCCGCCCCTGGGAAGGCAAAAACCGGTGGGAACTCT
GG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 11 12 15 10 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 9 19 21 20 15 15 12 11 11 20 17 14 14 16 16 18 17 18 11 13 12 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 12 25 25 19 10 10 14 15 11 23 28 29 27 13 10 6 8 6 8 8 8 15 28 28 28 28 19 16 15 15 16 22 29 25 24 29 23 28 28 29 30 31 29 34 22 23 24 34 36
44 44 41 37 37 37 37 37 37 30 29 24 22 22 28 37 37 37 30 30 30 31 31 39 39 39 34 31 22 15 16 16 16 21 37 23 23 19 14 15 19 19 22 22 17 19 11 12 10 19
19 20 23 19 28 28 32 32 37 47 42 50 39 44 41 47 36 36 36 33 33 33 32 32 19 19 15 23 11 11 11 15 15 21 30 28 40 37 37 22 26 17 19 16 19 17 15 15 19 24
28 32 37 21 24 16 25 25 34 30 37 28 28 34 34 39 43 28 21 13 11 11 25 25 28 33 19 19 13 18 26 34 28 32 28 28 30 37 37 37 40 41 39 41 41 47 50 57 57 53
36 36 25 25 28 32 32 50 57 44 44 42 33 33 25 33 34 43 41 34 34 13 12 16 16 19 32 28 43 43 43 43 41 41 46 41 37 37 37 32 31 37 37 41 41 32 37 41 44 44
47 59 34 34 23 28 24 30 30 47 39 39 36 36 36 43 34 37 30 30 30 37 32 34 28 18 15 19 18 20 24 19 18 18 28 34 34 41 46 46 32 34 21 21 14 28 28 41 43 34
36 41 41 41 39 40 30 30 17 17 17 29 30 43 37 46 46 37 37 30 31 31 32 32 43 43 43 31 30 17 15 14 14 19 28 34 47 47 59 48 41 41 41 36 34 28 19 14 12 15
15 23 19 22 22 21 29 24 19 24 23 19 23 21 20 30 34 34 29 19 17 17 22 27 28 26 16 10 10 12 11 13 18 20 18 13 17 15 19 24 24 30 37 37 33 30 20 20 27 22
19 18 12 11 11 12 25 26 37 40 40 34 29 14 14 14 16 16 18 19 19 17 12 10 13 10 10 10 11 12 9 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10 13 19 19 15 18 20 19
16 16 17 12 10 15 9 14 9 8 10 10 10 17 15 20 15 10 10 10 10 9 9 11 12 10 10 10 10 10 10 28 13 13 13 11 11 10 15 14 11 10 9 12 13 15 22 19 15 9
9 9 9 9 10 12 11 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 9 8 8 10 9 9 9 11 10 10 10 8 8 8 8 10 10 12 10 10 12 13 15 14 14 10 10 13 12 13 10 10 10
10 10 12 12 12 9 9 12 8 9 11 9 10 9 9 9 11 9 8 8 8 8 8 10 11 13 12 10 9 9 8 8 8 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 11 12 10 10 9 9 9
9 10 12 11 11 11 8 10 8 8 8 8 11 11 9 9 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 10 10 10 10 10 10 19 24 24 14 14 11
11 10 15 10 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 9 8 11 11 9 9 9 10 8 9 10 10 10 10 11 10 10 10 10 6 6 8 8 11 10 8 8
8 8 8 8 12 9 9 9 10 10 12 15 12 12 11 11 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 8 8 3 0 3 13 17 24 32 32 24 28 18 18 22 23 32 28 28 41 41 27 17 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 10 9 10 10 10 15 18
10 10 10 17 19 37 37 39 22 18 10 9 9 9 9 10 9 9 9 13 10 10 11 13 15 14 20 22 29 36 33 33 32 37 31 32 39 39 39 41 39 37 32 30 37 30 28 20 19 24
19 24 33 33 33 37 41 30 30 28 24 24 26 32 32 37 39 39 41 40 46 46 44 44 48 41 41 42 41 33 29 19 13 13 16 17 15 15 15 28 37 39 38 32 31 37 37 33 33 33
33 33 37 37 32 32 28 28 37 37 33 33 37 28 28 31 31 36 36 50 50 50 47 47 47 48 48 41 42 42 41 39 39 35 34 36 39 37 32 32 37 32 32 32 32 31 37 39 39 39
41 39 39 38 27 24 27 25 30 30 37 39 47 43 48 48 48 48 48 39 37 30 30 37 37 37 47 39 39 39 39 37 37 39 39 32 28 28 32 37 37 47 42 50 42 48 48 48 48 57
43 48 48 48 59 47 47 34 34 34 34 41 36 36 44 59 59 47 47 47 59 59 59 59 59 59 47 47 44 44 44 39 41 44 59 37 37 37 37 39 44 50 53 53 47 47 41 44 39 50
47 47 33 30 28 26 26 30 39 39 41 42 46 46 48 48 48 48 37 37 37 34 28 28 28 24 24 24 31 35 41 41 59 59 50 50 50 50 53 53 53 53 50 47 47 50 59 59 57 48
48 48 48 48 57 48 43 39 37 37 37 37 37 37 37 35 31 36 43 59 41 41 41 41 41 48 59 48 48 48 57 59 59 57 57 57 48 39 37 39 39 39 39 39 47 47 47 37 41 42
50 59 41 39 39 39 39 37 37 37 37 37 37 37 37 37 41 37 31 37 35 35 31 34 31 39 39 31 31 39 37 35 39 39 59 43 43 30 25 12 12 14 23 25 39 35 29 29 29 32
37 39 59 59 46 46 46 46 39 39 36 36 32 31 31 30 30 25 25 28 34 34 46 41 31 23 22 18 20 20 32 38 34 16 15 9 10 10 15 25 37 40 18 12 10 10 11 14 14 16
13 28 24 26 25 32 26 24 27 31 11 11 11 12 11 17 19 19 20 24 25 31 38 37 39 32 32 28 30 26 28 28 28 33 34 31 34 39 36 17 23 11 18 18 25 24 25 26 26 18
17 17 30 26 28 30 30 30 30 15 11 10 16 14 18 30 37 37 22 19 17 17 18 25 22 22 22 20 22 30 22 26 17 16 16 11 11 13 23 26 28 28 28 28 28 22 20 18 27 30
30 31 25 25 17 19 15 15 21 21 24 24 14 12 18 11 10 10 9 9 8 11 10 8 8 8 12 8 10 14 12 12 10 10 10 14 13 14 14 10 11 12 11 10 8 9 10 10 8 8
8 9 9 11 11 10 10 10 10 9 10 8 8 6 6 7 7 10 12 9 9 11 11 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 10 10 9 9 9 9 9 8 8
8 11 11 12 22 22 21 23 12 9 8 8 10 9 9 10 8 9 14 12 12 9 8 8 8 10 8 12 9 9 10 10 8 9 17 17 14 14 8 8 13 8 9 8 8 9 9 10 10 10
11 11 |