| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-540M07.T7 (MSMg01no540_m07.b1) | MSMg01-540M07.TJ (MSMg01no540_m07.g1) |
|---|
| ACC | AG606942 | AG606943 |
|---|
| length | 741 | 826 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 435 (52 - 486) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no540_m07.b1 PHD_FILE: MSMg01no540_m07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:20:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no540_m07.g1 PHD_FILE: MSMg01no540_m07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:20:09 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CCAACATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCATGTTTTGCGAATCTACCACTGAGCCACGCCCACAGTCC
CTCCCTGGGGGATTCTAGGCAGGGGCTCTACCACTGAGCCACGCCCACAG
CCCCTCCCTGGGGGATTCTAGGCAGGGGCTCTACCACTGAGCCACGCCCC
CAGCCCCTCATTGGGGGATTCTAGGCAGGGGCTCTAGCATTGAACCATGT
CCCCAGAACTTAAAGCCTACATGAGGAACAACCCAACAATTAGACCTAAC
CTGGTCTTGGCTGAAGCCAGTGGGTCCAGGAGATGAGGATATGTGGGGCT
TCCTTTCCCACTTCTCCTAGAATGGGAATTTCCAAGTTTCTCCCTGAAAT
TTTCCACCCACTAATCCCAGCCTGTGTGAAGAGCTCTAAACCCTTTGTCC
CTAAGACATCTCTTTCCCACCTTTGTAATGCCAAACATAGGCAGCCAAGG
CCTTTGGTGACAATTTCCTAATGGTCGAGCTATTGTGAAAGGTCCTTTCC
ATTCCCTGAAGAGTTCTGCAAGACATACCTCATAGGGAAGAGTATAGGCC
TGTTCTTCTGATGCTATATAATACCATCAGGTTCTGAGATGTACAAACAT
TGTGACTTTGATAGTCTTCTTGTGGGGGAAGTGTGGCGGCCGGTCATTGG
TGAGGGGGACACCTTACATTTCTTGTAGACCGCTTGGGTAT
| TTTTTATTATATACCCCACCCCCACTAAGAATACTCTTTTCTCTTGCACG
CGACTATAATTATTACCATCCTTTCACTACACCACAAACAACAAACCCAC
TTAAAAAAAAATTTCCTCCTTCTCCCNCCACATTCATTTTTTGTTATCAT
TTTCTCCCCCATTTGTTCCTCTACCAACGCAAACAATTATGCATCCCGCC
CCCGCTACGCGTCTTTGTTTTCCCCCTCCCCCTCTATCTTCATTTTTTTA
ATGCTATTAACTACCCATTTTTATTTTTCCCTATAATATAAATTAATCCC
TTTTATAACCACCCCCCCCCCCACCCCCTCCTCCCCCTTACACACACTAA
AAAAATAAAAAATAAATTAATTTCTACGCCTTACCTCTTCACCAAACTTT
AATATCCCACTTATATAACATAACCCAACCATTGCCTTATTATTATCACC
TATTTACTTCCCCAAAATCAATCTCCTCATCATTACCAATTTTTAACCTC
ATTCCCTCATTCATTTTTCTATTTCTTCTTCTCTTTATAATCTACACTAA
ATTATATCTTCCTCCTATCTTAAATTCTTCTCATTATTTGTATCACATTC
CCCCACACTGTAGTGCCGCTCTCTTTCCCTATCATAATAAAAATACTATA
TTTAGTTAACATAAAACATTTCCTTTCATACTAAATACACTAATCACTCA
CACTATAAAATACTATTCTTGTGGCGTTTCTGACCTATCTCATATCAATC
CCCCAATCTAACAATATTAATTTATTAAACAAATCACAAATATAAAATAG
ATATATACAATCACACCCTTTAATAT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 7 9 9 11 12 10 9 9 9 9 11 27 37 27 21 13 9 9 9 21 21 14 12 12 23 26 59 29 20 24 13 10 9 9 9 9 9 9 12 15 22 28 28 28 31 28
28 28 47 47 41 23 19 17 22 28 27 37 19 21 10 9 8 8 8 8 8 13 15 20 30 30 33 33 33 33 28 28 33 34 33 32 39 43 43 43 36 36 37 42 42 42 31 31 30 41
41 41 35 35 35 42 42 48 54 47 50 47 47 47 47 54 48 48 54 54 54 54 54 57 57 57 48 48 48 47 47 54 54 41 41 48 42 36 35 39 37 37 39 44 47 44 46 39 39 47
42 42 44 50 57 47 47 44 44 46 57 57 32 32 20 22 22 30 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 43 52 43 50 43 41 41 50 43 57 43 43 35 43 43 57 52 52 52 52 43
43 39 59 43 52 57 57 52 45 45 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 43 43 41 43 43 57 57 57 57 57 57 57 62 62 52 52 52 62 62 62
52 52 43 43 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 45 43 43 43 45 62 62 62 52 43 43 43 52 52 43 43 43 39 31 43 39 52 52 57 57 57 57 52 57 57 59 57 57 52
52 57 59 59 57 57 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 42 39 37 37 37 57 57 43 42 35 29 29 38 38 38 38 38 50 43 37 35 35 43 43 52 52 52 52 52 57 52 52 43 44
35 35 43 43 59 50 26 24 11 11 11 15 32 43 43 50 32 47 42 42 59 59 59 48 48 47 54 57 57 57 39 42 37 39 43 57 59 54 47 47 43 43 43 43 39 44 43 43 44 46
46 48 47 47 43 47 47 48 48 48 48 47 46 41 41 35 39 37 39 39 42 36 28 25 25 28 33 39 43 43 43 48 43 46 39 39 32 32 30 37 39 37 37 37 37 37 37 39 39 31
28 32 34 32 21 21 12 12 15 30 30 48 48 43 47 28 28 25 34 34 43 43 43 39 39 39 42 39 39 32 32 30 27 21 12 12 12 15 13 13 15 13 13 12 12 12 21 21 28 20
20 20 19 19 22 22 28 27 31 19 19 18 18 21 16 16 11 11 11 12 22 28 26 24 13 13 12 20 13 14 14 18 19 15 10 10 10 13 19 23 12 11 11 11 18 23 34 28 28 28
25 25 28 28 28 37 37 33 24 22 8 8 6 6 8 8 10 10 10 11 9 10 10 13 12 12 12 12 12 15 12 11 13 24 18 19 20 15 12 12 13 13 14 10 17 17 13 13 15 16
13 10 12 12 12 14 14 23 18 15 13 9 10 13 8 8 8 8 8 10 8 9 12 15 15 21 19 19 16 16 14 17 17 18 18 16 10 9 13 10 8 8 8 10 13 13 11 11 11 10
10 8 8 12 9 11 10 16 13 11 11 10 10 10 11 12 12 8 12 9 11 8 8 8 8 10 11 11 14 17 17 10 10 8 8 6 6 8 10 15 10 10 8 8 8 8 8 10 9 15
15 11 11 11 13 13 9 8 8 8 9 9 10 10 16 9 9 9 10 10 6 6 8 8 9 9 9 15 12 19 10 11 12 8 8 8 9 10 9 9 9 | Open.Hide.10 11 10 10 10 11 10 13 10 10 10 11 11 11 11 9 7 7 8 8 9 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 8 10 7 7 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 12 15 12 11 13 10 11 8 8 8 8 8 8 10 9 8 10 8 8 8 10 11 10 9 8 8 8 8 13 11 8 8 6 6 8 8 11 8 8 10 8 10
15 11 15 15 18 19 15 15 10 10 9 9 9 8 8 8 10 10 8 9 10 11 9 9 9 3 0 3 10 8 9 9 9 9 9 9 9 9 15 9 11 11 14 13 10 8 8 8 8 8
13 13 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 10 8 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 10 9 8 10 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 11 10 10 8 8 7 6 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 14 14 21 18 16 10 9 9 8 8 11 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 14 9 8 8 8 8
8 10 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 7 7 12 9 10 11 17 11 11 11 12 21 19 19 10 13 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 13 9
8 8 8 8 8 10 12 11 10 10 9 8 8 8 17 21 18 19 22 12 13 6 7 7 15 20 22 14 18 11 11 12 15 18 15 16 19 13 8 8 8 12 8 8 10 10 10 10 15 12
14 17 11 9 10 10 8 12 8 10 9 10 10 8 8 6 6 6 6 8 11 15 11 9 9 9 9 9 9 8 8 8 9 9 19 19 20 15 15 8 8 8 8 8 11 11 11 9 9 12
12 9 9 12 11 9 12 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 10 6 6 8 10 9 9 11 9 9 8 10 8 8 10 6 6 8 10 10 10 15 10 13 10 11
11 13 13 12 11 16 16 12 11 11 8 8 8 6 6 8 9 10 16 12 16 12 12 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 16 13 16 11 10 8 8 9 9 10 9 10
10 10 9 9 13 10 8 8 8 8 8 8 12 12 12 9 9 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 9 10 9 9 9 9 9 13 13 13 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9
11 11 10 9 10 9 9 9 9 11 12 12 11 11 11 10 9 10 8 12 10 8 8 8 8 10 10 10 8 9 9 11 11 10 10 10 10 10 7 7 7 10 8 8 8 8 7 7 6 6
8 8 10 10 10 15 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 10 8 11 11 10 10 15 13 11 11 10 10 10 8 6 6 8 8 10 13 12 13 13 10 10 11 10
12 14 9 9 9 8 8 10 10 10 8 10 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 8 8
6 6 8 8 8 8 11 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10
10 6 6 9 9 10 10 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 9 6 8 8 8 6 8 13 8 8 6 6 8 8 8 13 13 8 8 11 11 9 12 10 8 8 8 8 8 8 8
8 12 11 14 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 11 13 15 8 8 8 |
|---|
