BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-023E14
Chromosome6 (Build37)
Map Location 148,339,575 - 148,502,383
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmtc1
Upstream geneEG622129, Ccdc91, LOC100039712, LOC100039727, LOC100039736, Mlstd1, Ergic2, 1110033J19Rik
Downstream geneEG622319, LOC100042984, LOC665372, Ipo8, Caprin2, EG665395, Tera, LOC667138, D030011O10Rik, 4833442J19Rik, C730024G19Rik, 2810474O19Rik, LOC665426, LOC622481, LOC665441, Bicd1, LOC667182
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-023E14.bB6Ng01-023E14.g
ACCDH855249DH855250
length771983
definitionDH855249|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023E14, 5' end.DH855250|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023E14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(148,501,616 - 148,502,383)(148,339,575 - 148,340,552)
sequence
gaattctgttcattccattcatttgggcacacagcctcacacatacttca
gaaggaacattggagaccagaaatattgctgcggccatttttagaaacta
cagtctgctctgttggaacgagaagtcatttcagttgactcattattctc
tacgttccctttcatcctagggagcaaactgcttcaggtgggttttgtgg
tgggtaagagaatcctttatgtgctggggtaattatggcacacaatctcc
tccctaatccagcctgctcttcctcaccaacctctgattatcctaaggga
agaactcttacacatgtgaaaactagacccatgtggatttgagagtttta
ttacaacagctttagaaatagccccacagactattgaatagaattaaatt
tagacctgttcactgtgcaccactgcaagacgtacaggaaattcaagaat
tgaattgagatcacataggcttcccacagtgaccaagttcacaaacccaa
acacctacacattcagagatgtaaataaagaggctgcctagaatacattg
atatatatatatacacatatacatatatatgtatatgtatatatatacat
acacacatatacatacatatatacatatatgtgtgtatatacatatatgc
atatataatatataaactcaatttgtacttgattaagcagcattgttttt
agcaaatctccctctgtctctctgtctctgtctctgtatctgtctctgtc
tctgtctgtctgtctgtctgt
gaattccttagctcaactgagtatgctgccaagttctcagtctgagcaga
atctaaatacacacaggatgttctgggacatccaactctcctctggaaac
aatgcaggcacaggggacaccacccatccccatggcctctgagacagagc
tgtagagaaccaaagtgggggagggaaggaagcaggtctcagggaagcac
ccagagctcccctcaatagctaatgtttttaagacaaaaaaaaaaaaaaa
aaaagtaaaaatcagctttaaggatgctcgggacatttacaaatcgaatt
tactgttagtaatggattcgctccatctcggtctgaaaacagcgtcctta
gacttttaataaagtcttctccattccccaagacataagtaaggcacaca
gccaagacaagcacactagcagaggcacccacagaccttgctcctgcagg
gggcaatcaagcccagactccatcctgctgttctagaactctccctgtcc
tctcccacactcatcaccagccttataaccaaacctgacacactgctcac
ctatcctgtaaccacctcagcattcctgccccaggttaaatcccgggcat
gccagcatggtgcttgtgagccgcaggaagaatatttcttgggttggaag
aacactcctaaaaacagagaaagagaaggcagaaaggcagcagcctcaac
acaaccttcctggcctgttcaggtggggactctaactatgtagagaggct
gctgagaaggttttctgagcaagcatgaagttctgagttcattgcagtac
ttatgtaaaaagctggggatgtgcttggtaaggtctagtgctgagaggtg
gagacaggaagtttctcttgaggtttgttagttaaataaactagtcctgg
ggagaagactgtcttaaatagtaagatgggaagcattgagagaccaactt
gggcttcaaccacaagcctcccacatacatgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_148501616_148502383
seq2: B6Ng01-023E14.b_38_808 (reverse)

seq1  ACAGACAGACAGACAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ACAGACAGACAGACAGACAGAGACAGAGACAGATACAGAGACAGAGACAG  50

seq1  AGAGACAGAGGGAGATTTGCT-AAAACAATGCTGCTTAATCAAGTAC-AA  98
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGAGACAGAGGGAGATTTGCTAAAAACAATGCTGCTTAATCAAGTACAAA  100

seq1  TTGAGTTTATATA-TATATATGCATATATGTATATACACACATATATGTA  147
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTTTATATATTATATATGCATATATGTATATACACACATATATGTA  150

seq1  TATATGTATGTATATGTGTGTATGTATATATATACATATACATATATATG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTATGTATATGTGTGTATGTATATATATACATATACATATATATG  200

seq1  TATATGTGTATATATATATATCAATGTATTCTAGGCAGCCTCTTTATTTA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTGTATATATATATATCAATGTATTCTAGGCAGCCTCTTTATTTA  250

seq1  CATCTCTGAATGTGTAGGTGTTTGGGTTTGTGAACTTGGTCACTGTGGGA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTGAATGTGTAGGTGTTTGGGTTTGTGAACTTGGTCACTGTGGGA  300

seq1  AGCCTATGTGATCTCAATTCAATTCTTGAATTTCCTGTACGTCTTGCAGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTATGTGATCTCAATTCAATTCTTGAATTTCCTGTACGTCTTGCAGT  350

seq1  GGTGCACAGTGAACAGGTCTAAATTTAATTCTATTCAATAGTCTGTGGGG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCACAGTGAACAGGTCTAAATTTAATTCTATTCAATAGTCTGTGGGG  400

seq1  CTATTTCTAAAGCTGTTGTAATAAAACTCTCAAATCCACATGGGTCTAGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTCTAAAGCTGTTGTAATAAAACTCTCAAATCCACATGGGTCTAGT  450

seq1  TTTCACATGTGTAAGAGTTCTTCCCTTAGGATAATCAGAGGTTGGTGAGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACATGTGTAAGAGTTCTTCCCTTAGGATAATCAGAGGTTGGTGAGG  500

seq1  AAGAGCAGGCTGGATTAGGGAGGAGATTGTGTGCCATAATTACCCCAGCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCAGGCTGGATTAGGGAGGAGATTGTGTGCCATAATTACCCCAGCA  550

seq1  CATAAAGGATTCTCTTACCCACCACAAAACCCACCTGAAGCAGTTTGCTC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAGGATTCTCTTACCCACCACAAAACCCACCTGAAGCAGTTTGCTC  600

seq1  CCTAGGATGAAAGGGAACGTAGAGAATAATGAGTCAACTGAAATGACTTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGATGAAAGGGAACGTAGAGAATAATGAGTCAACTGAAATGACTTC  650

seq1  TCGTTCCAACAGAGCAGACTGTAGTTTCTAAAAATGGCCGCAGCAATATT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTTCCAACAGAGCAGACTGTAGTTTCTAAAAATGGCCGCAGCAATATT  700

seq1  TCTGGTCTCCAATGTTCCTTCTGAAGTATGTGTGAGGCTGTGTGCCCAAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTCTCCAATGTTCCTTCTGAAGTATGTGTGAGGCTGTGTGCCCAAA  750

seq1  TGAATGGAATGAACAGAATTC  768
      |||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGGAATGAACAGAATTC  771

seq1: chr6_148339575_148340552
seq2: B6Ng01-023E14.g_68_1050

seq1  GAATTCCACAGCTCAACTGAGTATGCTGCCAAGTTCTCAGTCTGAGCAGA  50
      |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAGCTCAACTGAGTATGCTGCCAAGTTCTCAGTCTGAGCAGA  50

seq1  ATCTAAATACACACAGGATGTTCTGGGACATCCAACTCTCCTCTGGAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAATACACACAGGATGTTCTGGGACATCCAACTCTCCTCTGGAAAC  100

seq1  AATGCAGGCACAGGGGACACCACCCATCCCCATGGCCTCTGAGACAGAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCAGGCACAGGGGACACCACCCATCCCCATGGCCTCTGAGACAGAGC  150

seq1  TGTAGAGAACCAAAGTGGGGGAGGGAAGGAAGCAGGTCTCAGGGAAGCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAGAACCAAAGTGGGGGAGGGAAGGAAGCAGGTCTCAGGGAAGCAC  200

seq1  CCAGAGCTCCCCTCAATAGCTAATGTTTTTAAGACAAAAAAAAAAAAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGCTCCCCTCAATAGCTAATGTTTTTAAGACAAAAAAAAAAAAAAA  250

seq1  AAAAGTAAAAATCAGCTTTAAGGATGCTCGGGACATTTACAAATCGAATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTAAAAATCAGCTTTAAGGATGCTCGGGACATTTACAAATCGAATT  300

seq1  TACTGTTAGTAATGGATTCGCTCCATCTCGGTCTGAAAACAGCGTCCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTTAGTAATGGATTCGCTCCATCTCGGTCTGAAAACAGCGTCCTTA  350

seq1  GACTTTTAATAAAGTCTTCTCCATTCCCCAAGACATAAGTAAGGCACACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTTAATAAAGTCTTCTCCATTCCCCAAGACATAAGTAAGGCACACA  400

seq1  GCCAAGACAAGCACACTAGCAGAGGCACCCACAGACCTTGCTCCTGCAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGACAAGCACACTAGCAGAGGCACCCACAGACCTTGCTCCTGCAGG  450

seq1  GGGCAATCAAGCCCAGACTCCATCCTGCTGTTCTAGAACTCTCCCTGTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAATCAAGCCCAGACTCCATCCTGCTGTTCTAGAACTCTCCCTGTCC  500

seq1  TCTCCCACACTCATCACCAGCCTTATAACCAAACCTGACACACTGCTCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCACACTCATCACCAGCCTTATAACCAAACCTGACACACTGCTCAC  550

seq1  CTATCCTGTAACCACCTCAGCATTCCTGCCCCAGGTTAAATCCCGGGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCTGTAACCACCTCAGCATTCCTGCCCCAGGTTAAATCCCGGGCAT  600

seq1  GCCAGCATGGTGCTTGTGAGCCGCAGGAAGAATATTCCTTGGGTTGGAAG  650
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCCAGCATGGTGCTTGTGAGCCGCAGGAAGAATATTTCTTGGGTTGGAAG  650

seq1  AACACTCCTAAAAACAGAGAAAGAGAAGGCAGAAAGGCAGCAGCCTCAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTCCTAAAAACAGAGAAAGAGAAGGCAGAAAGGCAGCAGCCTCAAC  700

seq1  ACAACCTTCCTGGCCTGTTCAGGTGGGGACTCTAACTATGTAGAGAGGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACCTTCCTGGCCTGTTCAGGTGGGGACTCTAACTATGTAGAGAGGCT  750

seq1  GCTGAGAAGGTTTTCTGAGCAAGCATGAAGTCCTGAGTTCAATTGCAGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
seq2  GCTGAGAAGGTTTTCTGAGCAAGCATGAAGTTCTGAGTTC-ATTGCAGTA  799

seq1  CTTATGTAAAAAGCTGGGGATGTGC-TGGTAAGG-CCAGTGCTGAGAGGT  848
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||
seq2  CTTATGTAAAAAGCTGGGGATGTGCTTGGTAAGGTCTAGTGCTGAGAGGT  849

seq1  GGAGACAGGAAGTTTC-CCTGAGGTTTGTTAGTTAAATAAACCAGTCC-A  896
      |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  
seq2  GGAGACAGGAAGTTTCTCTTGAGGTTTGTTAGTTAAATAAACTAGTCCTG  899

seq1  GGGAG-AGACTGTCTTAAATAGTAAGATGGGAAGCAATGAGAGACATACT  945
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||
seq2  GGGAGAAGACTGTCTTAAATAGTAAGATGGGAAGCATTGAGAGACCAACT  949

seq1  T-GGCTTCAACCACAAGCCCCCCACATACATGTT  978
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGGGCTTCAACCACAAGCCTCCCACATACATGTT  983