BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-032N03
Chromosome6 (Build37)
Map Location 138,348,661 - 138,513,815
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLmo3
Upstream genePtpro, Eps8, Strap, Dera, 9830102E05Rik, Mgst1
Downstream geneIgbp1b, EG668196, EG632971
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032N03.bB6Ng01-032N03.g
ACCDH862046DH862047
length917447
definitionDH862046|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032N03, 5' end.DH862047|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032N03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(138,512,900 - 138,513,815)(138,348,661 - 138,349,113)
sequence
gaattctcttgtcttctttctcaattcaccgggctacaggaagtggtcta
gctctgggtcactgggaattattcaaagaggcagaggtggtattaatatg
tggctaatcaagccctcctatagtaagaatcttgtattcaaatcaatacc
ctatttattgtgagggttgctctgctcatgcatagtaacacgcctcattc
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caattcgattcctattacaatcctactccttaaaatgctctatatcttaa
atactttcatgctgataggtatgaatacctcacttcgtatccacacaagg
tacatgctatacagatagtaactatttgagtactcttggggctagggggt
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atctctgtcaatgtagaacttcattagacattacattttagagttttctt
ctctatatgacccagtgagttgcagaacttaaaacttgcttatatttctg
tacagttttctccttttttcattcttctttaataaatatttcttaccaat
catccaaatcatctgtaggattaatccaatattctctttttttgattacc
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tttttatcacatactttctgccctgacattcatctcacccagccttctgc
aattccaccatgcgtcatgccctgtgttttaacctttacttcttccccat
taccatatttaaatgagatcatttgaatagtcttagaaataaacctcaaa
gaatataaatatctttatctatatatcaaaattcagaatatatataaaat
aaccaatatgtgttatatgttttatatttgtaatatatactatatatact
atataatatgttaaattatatttatgtaatatatttatatatttttattg
atattttatatattatattttttatacttatataatatataaatatgtga
tgtttatttatatttacatatgacatattatatataaatatatatggatt
aatagcaaacaaaactccaaagaacataaaaactctcatttctgaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_138512900_138513815
seq2: B6Ng01-032N03.b_47_963 (reverse)

seq1  CATCCCCCACATACATAGGTAATCAAAAAAAGAGAATATTGGATTAATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCCCACATACATAGGTAATCAAAAAAAGAGAATATTGGATTAATCC  50

seq1  TACAGATGATTTGGATGATTGGTAAGAAATATTTATTAAAAGAAGAATGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TACAGATGATTTGGATGATTGGTAAGAAATATTTATT-AAAGAAGAATGA  99

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGGAGAAAACTGTACAGAAATATAAGCAAGTTTTAAGTTCTGCAAC  149

seq1  TCACTGGGTCATATAGAGAAGAAAACTCTAAAATGTAATGTCTAATGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGGGTCATATAGAGAAGAAAACTCTAAAATGTAATGTCTAATGAAG  199

seq1  TTCTACATTGACAGAGATGTATAT-AACTATGTGTGACCTAATGTGGAAT  249
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACATTGACAGAGATGTATATAAACTATGTGTGACCTAATGTGGAAT  249

seq1  AAATCAACTACAGGGCCATGTTGGTTCCCACCATTCTGTGCCTCATTTTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAACTACAGGGCCATGTTGGTTCCCACCATTCTGTGCCTCATTTTA  299

seq1  GCTACAAGGGTCTTACATCTCCTGATAAAATGCCACCAATTGCTTCCTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACAAGGGTCTTACATCTCCTGATAAAATGCCACCAATTGCTTCCTGA  349

seq1  GACAGCAAACACTGTTCCCTGAACTCAAGCTCACCCTCACAACCAACTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCAAACACTGTTCCCTGAACTCAAGCTCACCCTCACAACCAACTTT  399

seq1  ACTTCTGGTATAGTGTGTACCCCCTAGCCCCAAGAGTACTCAAATAGTTA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTGGTATAGTGTGTACCCCCTAGCCCCAAGAGTACTCAAATAGTTA  449

seq1  CTATCTGTATAGCATGTACCTTGTGTGGATACGAAGTGAGGTATTCATAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTGTATAGCATGTACCTTGTGTGGATACGAAGTGAGGTATTCATAC  499

seq1  CTATCAGCATGAAAGTATTTAAGATATAGAGCATTTTAAGGAGTAGGATT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCAGCATGAAAGTATTTAAGATATAGAGCATTTTAAGGAGTAGGATT  549

seq1  GTAATAGGAATCGAATTGTTTATCTTACTCCTTGATAAGGCCATGTCTCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAGGAATCGAATTGTTTATCTTACTCCTTGATAAGGCCATGTCTCT  599

seq1  TTAAGAGGATTTAGAGATGAAGGATACACTTAAACTTAAATTTACATTGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGGATTTAGAGATGAAGGATACACTTAAACTTAAATTTACATTGA  649

seq1  TAATGGTAAGGAAAGAAGAGCATAAAATAACTACCAGGATATAGTATCTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGTAAGGAAAGAAGAGCATAAAATAACTACCAGGATATAGTATCTG  699

seq1  GTGCTCACATTAACTTGGGAATGAGGCGTGTTACTATGCATGAGCAGAGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCACATTAACTTGGGAATGAGGCGTGTTACTATGCATGAGCAGAGC  749

seq1  AACCCTCACAATAAATAGGGTATTGATTTGAATACAAGATTCTTACTATA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTCACAATAAATAGGGTATTGATTTGAATACAAGATTCTTACTATA  799

seq1  GGAGGGCTTGATTAGCCACATATTAATACCACCTCTGCCTCTTTGAATAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGCTTGATTAGCCACATATTAATACCACCTCTGCCTCTTTGAATAA  849

seq1  TTCCCAGTGACCCAGAGCTAGACCACTTCCTGTAGCCC-CTGAATTGAGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
seq2  TTCCCAGTGACCCAGAGCTAGACCACTTCCTGTAGCCCGGTGAATTGAGA  899

seq1  AAGAAGACAAGAGAATTC  916
      ||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGACAAGAGAATTC  917

seq1: chr6_138348661_138349113
seq2: B6Ng01-032N03.g_67_519

seq1  GAATTCTTTTTATCACATACTTTCTGCCCTGACATTCATCTCACCCAGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTATCACATACTTTCTGCCCTGACATTCATCTCACCCAGCC  50

seq1  TTCTGCAATTCCACCATGCGTCATGCCCTGTGTTTTAACCTTTACTTCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCAATTCCACCATGCGTCATGCCCTGTGTTTTAACCTTTACTTCTT  100

seq1  CCCCATTACCATATTTAAATGAGATCATTTGAATAGTCTTAGAAATAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATTACCATATTTAAATGAGATCATTTGAATAGTCTTAGAAATAAAC  150

seq1  CTCAAAGAATATAAATATCTTTATCTATATATCAAAATTCAGAATATATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAGAATATAAATATCTTTATCTATATATCAAAATTCAGAATATATA  200

seq1  TAAAATAACCAATATGTGTTATATGTTTTATATTTGTAATATATACTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATAACCAATATGTGTTATATGTTTTATATTTGTAATATATACTATA  250

seq1  TATACTATATAATATGTTAAATTATATTTATGTAATATATTTATATATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTATATAATATGTTAAATTATATTTATGTAATATATTTATATATTT  300

seq1  TTATTGATATTTTATATATTATATTTTTTATACTTATATAATATATAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGATATTTTATATATTATATTTTTTATACTTATATAATATATAAAT  350

seq1  ATGTGATGTTTATTTATATTTACATATGACATATTATATATAAATATATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGATGTTTATTTATATTTACATATGACATATTATATATAAATATATA  400

seq1  TGGATTAAGAGCAAACAAAACTCCAAAGAACATAAAAACTCTCATTTCTG  450
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTAATAGCAAACAAAACTCCAAAGAACATAAAAACTCTCATTTCTG  450

seq1  AAT  453
      |||
seq2  AAT  453