BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-054B17
Chromosome6 (Build37)
Map Location 60,945,842 - 61,097,051
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041756, LOC100041764
Upstream geneEG434019, LOC671300, EG627178, LOC100041706, LOC100041717, A530053G22Rik, LOC667066, LOC100041726, Snca, ENSMUSG00000064018, Mmrn1
Downstream geneC130092O11Rik, LOC100042694
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-054B17.bB6Ng01-054B17.g
ACCDH876951DH876952
length751879
definitionDH876951|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054B17, 5' end.DH876952|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054B17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,096,301 - 61,097,051)(60,945,842 - 60,946,710)
sequence
gaattcctacatcttcaactaatgattcctctgccaaatatttgttttcc
ccaagtagaaagaagagagagcaaaacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacaggggttggggagattagcaggtaaaccttttaga
aacttcaaagtccactctcagtgacacatctccttcaacaaggtcatagg
tcctaaccattcccaaatagccctaacaaacaggggaccaaatattcaaa
cacatgagcctataggaccactcttattcaaaccacggtacactctgaat
ctcccatgaacctgtctcactgtgctctgccatactatgctgggtacagc
cctgcctcagacaactgtccttctagtgactttctgtccagaatcatggt
tgcctagaaacacatgcttttcaggatgaacatccttcatgcccatgtga
accaacacagtcataccacatgacatttgctttctcttgggatctctcat
catctaacccaaactctatcattctttttatttcatagcttgaaggcata
gattccagggggcaggggttgtcatttgttgcctttctaatttttcaata
gtgtaaaatttaacacttggaacacattccaatctacaacacattaaaat
gtaactttatgttgttaatgtgactaaatctgggaatacagaaacctgga
aaaacatttcagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtg
t
gaattctccacaaaacctgctacgatccaacatggtgaatttgcattcgt
ttctctaggttagcacgccaattgaatacaaaactctggaaaaagtccaa
atttaagaggttttatgatttacatatgaatcccttcataggttgtgaaa
gcccaggaatttgcctgggggatgttttgtgggtggtagctgtgatagtt
ttgttttgttttaattttttgcttcgtatttgattttctgagaccaggct
acaatctatctgagactttcctccagcttgttacctcttgccacaccctc
ctaagtacaggaattagaggtatgtgccactaaaccagaccataaaagcc
caggtttgaataaaacattttccatgtcttagtttcagctgccctgagga
aatactaatgtctttgaggcataaacagcatatatttctccaattctgga
gggttagaaggtatctgcagacttggtgcctggtaagggctgttccttgg
ctttcaggctgtcttttcatagaagcaatgtagattaaagaacttttgct
tagaaggtctcagcccagcaaggtatgatgatatacacaagtaataacag
cacttgggaggctgagacagaggacctcaagctcaaggcccacctgggtt
acatactgagttccaggtcagccacacggactttatgagacccttgacac
tctctcacactgaggctattctctctcataatggaggccccatatgtatg
gtctcctgcaaatctaatttatccctgaagacttttaccttcatcacatt
cttttagagtgaagttttaatacacaaattctgagggggggtggcatgtc
atccaggaccagattccatgcgtagtgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_61096301_61097051
seq2: B6Ng01-054B17.b_46_796 (reverse)

seq1  ACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACTGAAATGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACTGAAATGTTT  50

seq1  TTCCAGGTTTCTGTATTCCCAGATTTAGTCACATTAACAACATAAAGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGTTTCTGTATTCCCAGATTTAGTCACATTAACAACATAAAGTTA  100

seq1  CATTTTAATGTGTTGTAGATTGGAATGTGTTCCAAGTGTTAAATTTTACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTAATGTGTTGTAGATTGGAATGTGTTCCAAGTGTTAAATTTTACA  150

seq1  CTATTGAAAAATTAGAAAGGCAACAAATGACAACCCCTGCCCCCTGGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGAAAAATTAGAAAGGCAACAAATGACAACCCCTGCCCCCTGGAAT  200

seq1  CTATGCCTTCAAGCTATGAAATAAAAAGAATGATAGAGTTTGGGTTAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCCTTCAAGCTATGAAATAAAAAGAATGATAGAGTTTGGGTTAGAT  250

seq1  GATGAGAGATCCCAAGAGAAAGCAAATGTCATGTGGTATGACTGTGTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGAGATCCCAAGAGAAAGCAAATGTCATGTGGTATGACTGTGTTGG  300

seq1  TTCACATGGGCATGAAGGATGTTCATCCTGAAAAGCATGTGTTTCTAGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATGGGCATGAAGGATGTTCATCCTGAAAAGCATGTGTTTCTAGGC  350

seq1  AACCATGATTCTGGACAGAAAGTCACTAGAAGGACAGTTGTCTGAGGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATGATTCTGGACAGAAAGTCACTAGAAGGACAGTTGTCTGAGGCAG  400

seq1  GGCTGTACCCAGCATAGTATGGCAGAGCACAGTGAGACAGGTTCATGGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTACCCAGCATAGTATGGCAGAGCACAGTGAGACAGGTTCATGGGA  450

seq1  GATTCAGAGTGTACCGTGGTTTGAATAAGAGTGGTCCTATAGGCTCATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAGAGTGTACCGTGGTTTGAATAAGAGTGGTCCTATAGGCTCATGT  500

seq1  GTTTGAATATTTGGTCCCCTGTTTGTTAGGGCTATTTGGGAATGGTTAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGAATATTTGGTCCCCTGTTTGTTAGGGCTATTTGGGAATGGTTAGG  550

seq1  ACCTATGACCTTGTTGAAGGAGATGTGTCACTGAGAGTGGACTTTGAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATGACCTTGTTGAAGGAGATGTGTCACTGAGAGTGGACTTTGAAGT  600

seq1  TTCTAAAAGGTTTACCTGCTAATCTCCCCAACCCCTGTGTGTGTGTGTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAAGGTTTACCTGCTAATCTCCCCAACCCCTGTGTGTGTGTGTGT  650

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGCTCTCTCTTCTTTCTACTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGCTCTCTCTTCTTTCTACTTG  700

seq1  GGGAAAACAAATATTTGGCAGAGGAATCATTAGTTGAAGATGTAGGAATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAACAAATATTTGGCAGAGGAATCATTAGTTGAAGATGTAGGAATT  750

seq1  C  751
      |
seq2  C  751

seq1: chr6_60945842_60946710
seq2: B6Ng01-054B17.g_69_933

seq1  GAATTCTCCACAAAACCTGCTACGATCCAACATGGTGAATTTGCATTCGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCACAAAACCTGCTACGATCCAACATGGTGAATTTGCATTCGT  50

seq1  TTCTCTAGGTTAGCACGCCAATTGAATACAAAACTCTGGAAAAAGTCCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTAGGTTAGCACGCCAATTGAATACAAAACTCTGGAAAAAGTCCAA  100

seq1  ATTTAAGAGGTTTTATGATTTACATATGAATCCCTTCATAGGTTGTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGAGGTTTTATGATTTACATATGAATCCCTTCATAGGTTGTGAAA  150

seq1  GCCCAGGAATTTGCCTGGGGGATGTTTTGTGGGTGGTAGCTGTGATAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGGAATTTGCCTGGGGGATGTTTTGTGGGTGGTAGCTGTGATAGTT  200

seq1  TTGTTTTGTTTTAATTTTTTGCTTCGTATTTGATTTTCTGAGACCAGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTGTTTTAATTTTTTGCTTCGTATTTGATTTTCTGAGACCAGGCT  250

seq1  ACAATCTATCTGAGACTTTCCTCCAGCTTGTTACCTCTTGCCACACCCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTATCTGAGACTTTCCTCCAGCTTGTTACCTCTTGCCACACCCTC  300

seq1  CTAAGTACAGGAATTAGAGGTATGTGCCACTAAACCAGACCATAAAAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTACAGGAATTAGAGGTATGTGCCACTAAACCAGACCATAAAAGCC  350

seq1  CAGGTTTGAATAAAACATTTTCCATGTCTTAGTTTCAGCTGCCCTGAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTTGAATAAAACATTTTCCATGTCTTAGTTTCAGCTGCCCTGAGGA  400

seq1  AATACTAATGTCTTTGAGGCATAAACAGCATATATTTCTCCAATTCTGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTAATGTCTTTGAGGCATAAACAGCATATATTTCTCCAATTCTGGA  450

seq1  GGGTTAGAAGGTATCTGCAGACTTGGTGCCTGGTAAGGGCTGTTCCTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAGAAGGTATCTGCAGACTTGGTGCCTGGTAAGGGCTGTTCCTTGG  500

seq1  CTTTCAGGCTGTCTTTTCATAGAAGCAATGTAGATTAAAGAACTTTTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAGGCTGTCTTTTCATAGAAGCAATGTAGATTAAAGAACTTTTGCT  550

seq1  TAGAAGGTCTCAGCCCAGCAAGGTATGATGATATACACAAGTAATAACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGGTCTCAGCCCAGCAAGGTATGATGATATACACAAGTAATAACAG  600

seq1  CACTTGGGAGGCTGAGACAGAGGACCTCAAGCTCAAGGCCCACCTGGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGGAGGCTGAGACAGAGGACCTCAAGCTCAAGGCCCACCTGGGTT  650

seq1  ACATACTGAGTTCCAGGTCAGCCACACGGACTTTATGAGACCCTTGACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACTGAGTTCCAGGTCAGCCACACGGACTTTATGAGACCCTTGACAC  700

seq1  TCTCTCACACTGAGGCTATTCTCTCTCATAATGGAGGCCCCATATGTATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCACACTGAGGCTATTCTCTCTCATAATGGAGGCCCCATATGTATG  750

seq1  GTCTCCTGCAAATCTAATTTTATCCTGAAGAC-TTTACCTTCAATCACAT  799
      ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  GTCTCCTGCAAATCTAATTTATCCCTGAAGACTTTTACCTTC-ATCACAT  799

seq1  TCTTTTAGAGTGAAGTTTTAATACACAAAGTTCTGAGGGGGGGTGGGCAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
seq2  TCTTTTAGAGTGAAGTTTTAATACACAAA-TTCTGAGGGGGGGT-GGCAT  847

seq1  GTCATTCCCAGGACCAGATT  869
      |||||  |||||||||||||
seq2  GTCAT--CCAGGACCAGATT  865