BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-102D03
Chromosome6 (Build37)
Map Location 147,432,065 - 147,567,600
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCcdc91
Upstream geneItpr2, 4933424B01Rik, Fgfr1op2, Tm7sf3, Surb7, EG626175, Stk38l, LOC621842, Arntl2, 1700023A16Rik, Ppfibp1, 1700034J05Rik, 2210417D09Rik, Mrps35, EG545893, Klhdc5, EG665288, LOC100039641, Pthlh, EG622129
Downstream geneLOC100039712, LOC100039727, LOC100039736, Mlstd1, Ergic2, Tmtc1, 1110033J19Rik, EG622319
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-102D03.bB6Ng01-102D03.g
ACCDH911156DH911157
length1,2031,148
definitionDH911156|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-102D03, 5' end.DH911157|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-102D03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(147,566,356 - 147,567,600)(147,432,065 - 147,433,234)
sequence
gaattcattaagttctgtaaaatgaatgaataatatagcaaaagactatc
tgttcccaaatatatgatgattccaagggcttggtatgagtgctctacaa
tttctgctacccttccagagggccagaattcacttcccagcatccacatg
gtggctcacaacatcctgtaattcaggttccaggggtatccaatgccctc
ttttggtctctgtggacactgtaagttacacacacacacaccacataaaa
tcaattcatattttaaggtatatgaaaacatttacataaaaattaatcag
aaaatatctctaagcactccttagtgacaaagattataaaggattttggt
tgtcaagatcaaacagtaaagctaggggagaggctaaagaaacacattaa
ccgagctcaaaaaaaataaatccatccctgaaaggcagtgttcttacctc
tgcgccccttggaggcaagaagttgggaatacagtgaatatttagggtca
ttataatgcctgattattctgaacatgtacttctaaacaacatgtgcctc
aagctaacatttggtaacaaaagtacagttgaaagatatttatcaagtaa
gatatcagaactatagctacaaatgacaaaggatgactaactaccaaaac
tacttgataataaactctacaaagtgttttgaactattcaaaaaacagta
tgtattttataggcaaccatggcacatataggaaatgaacaaatttactt
agtaaaaacaaaaggatttggtttacagacagaactgcttgtataaattg
taacaaagtgagaggaagcccatggaaatattttaccagaacactgtggg
caaggtagtgcctttggttataaatgaagcacgctttatgaatatgaaag
aattttatagatgtaattcccagataaatacagggcttgggtcaccatca
gtaactgccaatgcccaaatcccacatgtggcagagatcatacatagtat
ataagatctgtagaagagcatgttgctcataatgtgctctgagagtcttc
aagatgcgactccgtgtccacagtgctctgaccgactatagcctccattc
tttggattctatctacagcctgctgtcatcactaaccacgctatattact
tgaagagacttagttacgttcatctagacttccaaggatcctccaggctc
ctt
gaattcattgatgtgggtacattaaaccagtattctgaagtttttcagtt
tggggacttacgaagaactatgatacttcatcccaagcatggccccaaat
gcagtttacagagcaggttggaaatgctggacctgctatggtctggtggc
caagttggaatctgtaggcttagggagacataaaagtgagtctgtgtgcc
atttaaggttactccccgaggttgggagtggtagagcataccagtcatcc
cagtgttgggaagatcaaaagttgagccatcctagtctatagacagagtt
aaaggccagccagagctacatgaaattctgccttaagaagagctgggata
catctttagaggagccctgatatcccgaaagaactctggattctgtactt
gggtggaagaccttacagtgggaatggcagccactgaattgaggaacctt
aacacagcactcagtgtctaaggatgagatgggcggagctaccaggatat
gcagcagaaccaaacagaccagtctggcttatgcagacccagagcttatt
gattatgatattcccatcagtgaaacagaattgatcttcataagcagaaa
ggttaaggtgagataaaatctaattctgttcagtcatcctaatagagatg
gatgctaggtatgttttggcactgtggacgtccactcactaaggagtgct
atggatttgtactcattaaggctgatctgcatgtgggcactgctgaatgt
acagtttgccagcagactcactgatatgcaggtgctgatacagtgccatt
ccctaggatgatcacccagctccccagccgcaggtgattctgttggtccc
cctgtgttatggaaagagcagacttttgttcttatccggaggatgtcggc
atggatgttccttcctatatgcagtttgtggagactactgcctttgggtc
acagaagtccttaaccacttctgtaacattctacacagagttgcttctga
tcattcgacctgtttcatggtaaatctgtcaataactcatgactacagga
agtatggcagtggtcccaggctatgggtcaccaacttactgtcctcaata
gtatagtagatggcctgtagatgtgcatgcttgaagactcagttacaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_147566356_147567600
seq2: B6Ng01-102D03.b_43_1245 (reverse)

seq1  AAGGAGGCCTGGAGGACACTTGTGGAAGTTCCTAAAGAGATGGAACAACG  50
      ||||| ||||||||||  ||  |||||||  ||    |||||    ||||
seq2  AAGGA-GCCTGGAGGATCCT--TGGAAGT--CT----AGATG----AACG  37

seq1  TAAACATTATGTCTCTTCAAAAGTAATTATTAGCGTGGTTTTAAGTTGAT  100
      ||   | || ||||||||  |||||||   ||||||||||   || ||||
seq2  TA---ACTAAGTCTCTTC--AAGTAAT--ATAGCGTGGTT---AG-TGAT  76

seq1  GACAGCAAGCTGTAGATAAGAAACCCAGAGAATGGAGGCTATAGTCGTGT  150
      ||||||| ||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  GACAGCAGGCTGTAGATA--GAATCCAAAGAATGGAGGCTATAGTCG-GT  123

seq1  CAGAAGCACTGTGGACACGGAGTCGCATCCTTTGAAGACTCTCAGAGCAC  200
      ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
seq2  CAG-AGCACTGTGGACACGGAGTCGCATC--TTGAAGACTCTCAGAGCAC  170

seq1  ATTTATGAGCAACATTGCTCTTTCTACAGATCTTTATTAATACCTATGGT  250
      | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||  
seq2  A-TTATGAGCAACA-TGCTC-TTCTACAGATC-TTAT--ATA-CTATG--  211

seq1  TATGGATCCTCTGCCACATGTGGGATTTGGGCATTGGCAGTTACTGATGG  300
      ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAT-GAT-CTCTGCCACATGTGGGATTTGGGCATTGGCAGTTACTGATGG  259

seq1  TGACCCAAGCCCTGTATTTTATCTGGGAATTACATCTATAAAATTTCTTT  350
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGACCCAAGCCCTGTA-TTTATCTGGGAATTACATCTATAAAA-TTCTTT  307

seq1  CATATTCATAAAGCGTGCTTCATTTATAACC-AAGGCACTACCTTGCCCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CATATTCATAAAGCGTGCTTCATTTATAACCAAAGGCACTACCTTGCCCA  357

seq1  CAGTGTTCTGGTAAAATATTTCCATGGGCTTCCTCTCACTTTGTTACAAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTCTGGTAAAATATTTCCATGGGCTTCCTCTCACTTTGTTACAAT  407

seq1  TTATACAAGCAGTTCTGTCTGTAAACCAAATCCTTTTGTTTTTACTAAGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACAAGCAGTTCTGTCTGTAAACCAAATCCTTTTGTTTTTACTAAGT  457

seq1  AAATTTGTTCATTTCCTATATGTGCCATGGTTGCCTATAAAATACATACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGTTCATTTCCTATATGTGCCATGGTTGCCTATAAAATACATACT  507

seq1  GTTTTTTGAATAGTTCAAAACACTTTGTAGAGTTTATTATCAAGTAGTTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTTGAATAGTTCAAAACACTTTGTAGAGTTTATTATCAAGTAGTTT  557

seq1  TGGTAGTTAGTCATCCTTTGTCATTTGTAGCTATAGTTCTGATATCTTAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGTTAGTCATCCTTTGTCATTTGTAGCTATAGTTCTGATATCTTAC  607

seq1  TTGATAAATATCTTTCAACTGTACTTTTGTTACCAAATGTTAGCTTGAGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATAAATATCTTTCAACTGTACTTTTGTTACCAAATGTTAGCTTGAGG  657

seq1  CACATGTTGTTTAGAAGTACATGTTCAGAATAATCAGGCATTATAATGAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTTGTTTAGAAGTACATGTTCAGAATAATCAGGCATTATAATGAC  707

seq1  CCTAAATATTCACTGTATTCCCAACTTCTTGCCTCCAAGGGGCGCAGAGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAATATTCACTGTATTCCCAACTTCTTGCCTCCAAGGGGCGCAGAGG  757

seq1  TAAGAACACTGCCTTTCAGGGATGGATTTATTTTTTTTGAGCTCGGTTAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAACACTGCCTTTCAGGGATGGATTTATTTTTTTTGAGCTCGGTTAA  807

seq1  TGTGTTTCTTTAGCCTCTCCCCTAGCTTTACTGTTTGATCTTGACAACCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTCTTTAGCCTCTCCCCTAGCTTTACTGTTTGATCTTGACAACCA  857

seq1  AAATCCTTTATAATCTTTGTCACTAAGGAGTGCTTAGAGATATTTTCTGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCTTTATAATCTTTGTCACTAAGGAGTGCTTAGAGATATTTTCTGA  907

seq1  TTAATTTTTATGTAAATGTTTTCATATACCTTAAAATATGAATTGATTTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTTTATGTAAATGTTTTCATATACCTTAAAATATGAATTGATTTT  957

seq1  ATGTGGTGTGTGTGTGTGTAACTTACAGTGTCCACAGAGACCAAAAGAGG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGTGTGTGTGTGTGTAACTTACAGTGTCCACAGAGACCAAAAGAGG  1007

seq1  GCATTGGATACCCCTGGAACCTGAATTACAGGATGTTGTGAGCCACCATG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGGATACCCCTGGAACCTGAATTACAGGATGTTGTGAGCCACCATG  1057

seq1  TGGATGCTGGGAAGTGAATTCTGGCCCTCTGGAAGGGTAGCAGAAATTGT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGCTGGGAAGTGAATTCTGGCCCTCTGGAAGGGTAGCAGAAATTGT  1107

seq1  AGAGCACTCATACCAAGCCCTTGGAATCATCATATATTTGGGAACAGATA  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACTCATACCAAGCCCTTGGAATCATCATATATTTGGGAACAGATA  1157

seq1  GTCTTTTGCTATATTATTCATTCATTTTACAGAACTTAATGAATTC  1245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTGCTATATTATTCATTCATTTTACAGAACTTAATGAATTC  1203

seq1: chr6_147432065_147433234
seq2: B6Ng01-102D03.g_67_1214

seq1  GAATTCATTGATGTGGGTACATTAAACCAGTATTCTGAAGTTTTTCAGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGATGTGGGTACATTAAACCAGTATTCTGAAGTTTTTCAGTT  50

seq1  TGGGGACTTACGAAGAACTATGATACTTCATCCCAAGCATGGCCCCAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGACTTACGAAGAACTATGATACTTCATCCCAAGCATGGCCCCAAAT  100

seq1  GCAGTTTACAGAGCAGGTTGGAAATGCTGGACCTGCTATGGTCTGGTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTTACAGAGCAGGTTGGAAATGCTGGACCTGCTATGGTCTGGTGGC  150

seq1  CAAGTTGGAATCTGTAGGCTTAGGGAGACATAAAAGTGAGTCTGTGTGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTGGAATCTGTAGGCTTAGGGAGACATAAAAGTGAGTCTGTGTGCC  200

seq1  ATTTAAGGTTACTCCCCGAGGTTGGGAGTGGTAGAGCATACCAGTCATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGGTTACTCCCCGAGGTTGGGAGTGGTAGAGCATACCAGTCATCC  250

seq1  CAGTGTTGGGAAGATCAAAAGTTGAGCCATCCTAGTCTATAGACAGAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTGGGAAGATCAAAAGTTGAGCCATCCTAGTCTATAGACAGAGTT  300

seq1  AAAGGCCAGCCAGAGCTACATGAAATTCTGCCTTAAGAAGAGCTGGGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCCAGCCAGAGCTACATGAAATTCTGCCTTAAGAAGAGCTGGGATA  350

seq1  CATCTTTAGAGGAGCCCTGATATCCCGAAAGAACTCTGGATTCTGTACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTTAGAGGAGCCCTGATATCCCGAAAGAACTCTGGATTCTGTACTT  400

seq1  GGGTGGAAGACCTTACAGTGGGAATGGCAGCCACTGAATTGAGGAACCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGAAGACCTTACAGTGGGAATGGCAGCCACTGAATTGAGGAACCTT  450

seq1  AACACAGCACTCAGTGTCTAAGGATGAGATGGGCGGAGCTACCAGGATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGCACTCAGTGTCTAAGGATGAGATGGGCGGAGCTACCAGGATAT  500

seq1  GCAGCAGAACCAAACAGACCAGTCTGGCTTATGCAGACCCAGAGCTTATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGAACCAAACAGACCAGTCTGGCTTATGCAGACCCAGAGCTTATT  550

seq1  GATTATGATATTCCCATCAGTGAAACAGAATTGATCTTCATAAGCAGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATGATATTCCCATCAGTGAAACAGAATTGATCTTCATAAGCAGAAA  600

seq1  GGTTAAGGTGAGATAAAATCTAATTCTGTTCAGTCATCCTAATAGAGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAAGGTGAGATAAAATCTAATTCTGTTCAGTCATCCTAATAGAGATG  650

seq1  GATGCTAGGTATGTTTTGGCACTGTGGACGTCCACTCACTAAGGAGTGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTAGGTATGTTTTGGCACTGTGGACGTCCACTCACTAAGGAGTGCT  700

seq1  ATGGATTTGTACTCATTAAGGCTGATCTGCATGTGGGCACTGCTGAATGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATTTGTACTCATTAAGGCTGATCTGCATGTGGGCACTGCTGAATGT  750

seq1  ACAGTTTGCCAGCAGGACTCACTGATATGCAGGTGCTGATACAGTGCCAT  800
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTTGCCAGCA-GACTCACTGATATGCAGGTGCTGATACAGTGCCAT  799

seq1  TCCCTAGGATGATCACCCAGCTCCCCAGCCGCAGGTTGATTCTGTTGGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCCCTAGGATGATCACCCAGCTCCCCAGCCGCAGG-TGATTCTGTTGGTC  848

seq1  CCCCTGTGTTATGGAAAGAGCAGACTTTTGTTCTTATCCGGAGGATGTCG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGTGTTATGGAAAGAGCAGACTTTTGTTCTTATCCGGAGGATGTCG  898

seq1  GCATGGATGTTCCTTCCTATATGCAGTTTTGTGGAGACTACTGCCTTTGG  950
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGATGTTCCTTCCTATATGCAG-TTTGTGGAGACTACTGCCTTTGG  947

seq1  GTCACAGAAGTCCTTAACCACTTCTGTAACATTCTACACAAGAGTTGCTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTCACAGAAGTCCTTAACCACTTCTGTAACATTCTACAC-AGAGTTGCTT  996

seq1  CTGATCATTCGACCTGTTTCATGGTAAATCTGGTCAAATAACTCATGACT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
seq2  CTGATCATTCGACCTGTTTCATGGTAAATCT-GTC-AATAACTCATGACT  1044

seq1  ACAGG-AGTATGGCAGTGGTCCCAAGCCTATGGGGTTCACCAACTTTACT  1099
      ||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||
seq2  ACAGGAAGTATGGCAGTGGTCCC-AGGCTATGGG--TCACCAAC-TTACT  1090

seq1  GTCTTCCATGGTATTTAAAGTTAGATGGCTTGGTAGAATGTTTGCATGGT  1149
      ||| || || ||||    || |||||||| | |||||   | ||||||  
seq2  GTCCTCAATAGTAT----AG-TAGATGGCCT-GTAGA---TGTGCATG--  1129

seq1  CTTTTGAAGACTCAGTTACAA  1170
         ||||||||||||||||||
seq2  --CTTGAAGACTCAGTTACAA  1148