MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-104A08
Chromosome	6 (Build37)
Map Location	108,049,359 - 108,050,512
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Lrrn1, Setmar
Downstream gene	Sumf1, LOC100043718, Itpr1, LOC677205, Bhlhb2, Arl8b, Edem1, EG627371
Link	Open Mouse BAC browser

no map image available.

Click to get alignment info.

BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-104A08.b	B6Ng01-104A08.g
ACC	DH912439	DH912440
length	1,164	1,128
definition	DH912439\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104A08, 5' end.	DH912440\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104A08, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattctcacctgaggaataccgaatggcagagaagcacctgaaaaaatg ttcaacatccttaatcatcagggaaatgcaaatcaaaacaaccctgagat tccacctcacaccagtcagaatggctaagatcaaaaattcaggtgacagc agatgctggcgtggatgtggagaaagaggaacactcctccattgttggtg ggattgaaggcttgtacaaccactctggaaatccgtctggcggttcctca gaaaattggacatagtactaccggaggagccagcaatacctctcctgggc atatatccagaagatgtcccaaccggtaagaattacacatgctccactat gttcatagcagccttatttataatagccagaagctgaaaagaacccagat gcccctcaacagaggaatggatacagaatatgtggtacatctacacaatg caatactactcagctattaaaaaatgaatttatgaaattcctagccaaat ggatagacctggagggcatcatcctgagtgaggtaacatattcacaaagg aattcacacaatatgtactcactgataagtggatattagcccaaaaccta ggatacccaagatataagatacaatttgctaaacacatgaaactcaagaa aaatgaagactgaagtgtggacactacacccctccttagaagtgggaaca aaacacccatggaaggagttatagagacaaagtttggagctgagatgaaa ggatggaccatgtagagactaccatatccagggatccaccccataatcag catccaaacgctgacaccattgcatacactagcaagattttatcaaaagg acccagatgtagctgtctcttgtgagactatgccagggcctagcaacaca gaagtggatgctcacagtcagctaatggatggatcacagggctcccaatg gaggagctagagaaagtagccaagagctaaagggatctgcaccctatagt ggaacaacatatgactacagtacccggatctcttgactctagctgcatat gtatcaaagatgactagtgggcatcactgtaaggaagccattggacatgc actttatatgcccagtacagtgaattgctcacgctaaagtggagtgggtg gggtttggggaatg	gaattctctaggagagaagccaggtcccacagtaactacctgtctttgtc tttgaagaacatgactcacccttctccaacccctctgaagacagcccagc aagaactgagcacaaattactctaagaacagcttaaatgaccttccaaga agctgccatgcacgtcacatcttccacatagcctttgaaacatcatgtgg tgcatggacaagtctcatagctggaatcagtctaatgtcagactcccaca agtgttccacatgtcaaggaaggtttctcaacatggaagccttcactcga ggggacaatggtctgggaccctctgtgtccttaatgtcttctctttagga gatggctgtattacaaagccagttagaagggccaggctcttgcagtctga agcacccacttcgctcttccctgctgaggtttgacttcttggtgctatgg cttctgattactatacttcgcagctagcaatttcaggcacctcctaggtg ctcaggagtgcttaatgcccatgatctagtttgatctggagcacagtggt gggaggaactagttgttttgggtcattattcccagtgggcatgtaggaaa ctaggactcttaagtgtctgcaaggtgccctggggcagctgtgggatgag gtaggctcaggacttactgtttttgttgctgctatggtattggatatttg actttattgtgcctttggtgacgggaaacatggatggagtctgagaaatt atgaggctgagcaaaaggtccgtagggagaaacaggcaggagggaggtgg ctgagaacattaacttcaggctgtcaaattcaatgatttaaatctggtcc caccgcttgttagatctatgactttgactgagttcaccagcccatttatg gcttgaaagcaagtgaaatatgtatagatgacatagaacccaggctgggc tgttacgtcgtatagtgtgatgtacgcatagaccctgacttgccttaatc agtcccacttgaatgttctctgctttgccaatctcagtcctcagtgagtt aataagacattggagtagactatgcatttgaagacaacttttggtctctt cctctcctgccaatgtacacttattttt
quality values	Open. Hide. 47 34 24 20 61 48 61 38 32 61 61 61 61 61 61 61 61 36 38 55 55 61 61 61 61 14 15 9 11 12 11 10 8 12 25 13 49 35 41 59 61 61 59 61 59 59 59 61 59 59 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 28 18 13 28 21 22 26 26 23 30 36 49 52 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 52 61 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 52 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 55 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 52 59 59 59 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 49 61 59 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 55 61 55 55 61 61 61 61 61 61 61 55 52 61 61 61 61 55 55 55 61 61 55 55 61 55 52 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 55 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 55 55 55 55 55 61 61 55 55 61 55 61 55 61 55 55 50 50 47 47 50 55 61 47 61 55 61 55 55 61 61 61 53 61 61 61 61 61 50 61 61 61 61 53 50 53 52 50 50 50 61 61 61 61 53 61 61 61 61 61 50 61 61 61 53 61 50 61 53 61 50 61 47 50 61 61 61 61 39 40 61 61 50 61 53 61 50 61 53 61 61 61 61 53 61 61 61 47 61 61 61 61 61 61 61 53 47 61 61 61 52 46 61 61 61 53 61 61 61 35 53 46 47 47 53 47 53 43 57 47 40 36 47 47 53 50 57 53 53 33 52 50 43 57 45 57 42 53 53 45 53 47 46 50 52 47 50 45 57 57 53 52 53 50 57 57 57 53 57 45 53 53 45 53 52 57 57 57 57 52 38 52 53 50 27 57 30 53 57 53 53 37 39 39 25 57 42 46 38 47 53 45 42 45 32 34 39 35 43 52 47 38 36 41 50 37 41 47 34 52 53 53 47 45 50 38 30 47 47 38 45 45 43 26 32 34 50 47 57 47 34 16 43 43 19 27 43 30 40 32 42 53 41 45 50 36 52 52 32 37 57 52 42 43 53 30 37 53 30 53 31 39 33 30 42 57 47 11 46 33 27 50 57 33 27 50 30 39 53 52 38 18 34 31 37 38 44 42 39 37 20 44 42 50 42 53 27 52 53 53 28 35 21 46 15 13 46 45 46 29 33 18 39 43 33 19 28 32 30 35 37 52 23 45 28 29 19 41 48 36 42 30 27 26 21 20 46 41 34 31 24 26 17 29 12 37 33 33 28 41 36 46 36 40 33 53 57 34 26 44 21 23 45 53 29 30 29 32 22 45 30 23 6 31 19 32 30 17 24 29 31 30 36 32 30 32 28 25 24 23 30 34 28 39 17 27 29 32 20 9 27 24 12 17 15 11 29 28 31 15 27 39 31 23 23 39 22 16 47 27 17 18 21 26 29 21 28 28 34 20 6 21 13 14 17 28 31 28 28 34 43 16 23 29 15 28 29 29 29 28 30 30 20 23 25 20 51 34 27 29 23 30 20 10 21 23 28 29 30 19 13 40 14 24 20 29 18 29 17 22 51 38 17 26 34 23 21 12 11 7 15 12 15 23 28 14 41 17 11 44 16 20 21 23 28 31 15 20 12 46 35 25 15 11 22 25 5 30 21 21 13 23 6 19 29 14 22 13 23 16 38 25 26 13 8 6 14 21 17 38 38 38 10 16 17 17 19 12 9 15 34 29 12 17 25 18 15 27 26 31 31 22 12 8 27 15 9 17 13 8 6 16 23 35 19 7 25 10 6 4 9 18 20 8 9 19 34 20 22 10 24 29 8 7 19 6 3 7 16 7 8 9 4 7 15 21 12 22 18 18 8 4 7 5 8 6 11 6 7 19 34 17 8 20 10 12 5 9 19 26 6 5 5 7 13 6 21 13 20 8 25 9 9 8 22 5 9 4 9 10 3 3 22 27 8 2 1 10 5 12 5 5 10 26 15 11 20 19 12 8 8 6 4 4 4 14 5 24 3 1 3	Open. Hide. 61 49 61 49 61 61 17 19 12 8 12 19 21 12 21 18 59 55 59 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 49 49 30 28 30 28 28 59 52 52 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 55 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 52 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 59 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 53 61 47 53 53 61 53 61 61 61 61 53 37 61 61 45 61 61 61 61 61 61 61 61 61 52 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 47 53 61 61 61 61 61 61 53 53 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 33 41 53 61 50 61 47 61 61 61 61 43 57 57 57 57 57 52 53 46 47 47 53 43 36 47 50 53 46 39 53 45 53 42 27 38 45 57 57 53 53 42 53 57 53 47 47 53 45 47 57 53 47 57 40 53 53 52 53 53 57 57 53 45 57 57 47 42 53 36 46 28 53 45 43 24 44 53 53 47 47 42 52 38 47 57 52 45 57 41 47 53 24 53 52 30 52 39 52 35 37 37 57 45 42 25 57 52 38 52 57 40 57 53 57 25 57 57 57 57 35 25 57 37 37 53 50 42 53 52 52 43 46 30 53 37 38 57 43 38 31 42 47 57 57 53 38 31 50 57 52 42 34 57 53 30 36 37 57 36 57 53 44 53 30 50 39 25 32 57 53 37 57 36 35 33 52 57 52 29 26 52 52 31 29 37 37 40 40 34 12 33 57 53 17 33 31 44 36 52 29 37 21 44 27 39 12 43 37 57 57 47 24 51 17 37 53 37 37 41 16 45 53 40 20 35 37 41 27 16 17 45 17 30 28 31 32 17 46 32 31 13 47 22 22 9 10 39 29 41 8 37 43 26 24 25 29 30 31 24 22 20 27 11 12 27 21 37 29 8 29 33 45 27 24 17 15 20 14 18 33 28 19 51 18 24 51 47 25 29 29 48 48 28 36 46 30 12 30 30 21 26 34 35 25 8 35 38 15 29 23 34 35 29 29 23 29 23 33 46 29 19 28 28 28 29 29 14 28 28 29 16 21 43 23 20 29 31 23 17 29 51 30 25 29 26 33 26 30 32 26 32 46 36 12 28 9 24 21 27 36 35 51 39 18 9 11 23 15 18 7 8 23 25 18 17 33 12 6 18 23 12 34 23 17 36 28 17 14 18 20 30 39 51 21 19 13 14 13 11 8 5 16 10 17 9 7 12 19 31 12 20 19 10 19 12 16 29 21 23 10 5 15 9 22 25 19 28 17 26 9 4 9 7 11 23 27 26 19 16 19 13 24 17 9 23 12 28 6 5 25 10 6 10 12 7 22 7 19 7 7 6 6 5 4 5 7 14 27 14 42 11 17 20 12 7 4 10 12 8 5 6 5 29 14 7 6 30 13 13 16 15 17 9 24 18 29 18 11 15 22 6 8 5 10 10 15 8 20 14 20 23 24 5 15 8 6 4 6 11 5 5 17 15 10 4 6 12 11 20 9 6 6 17 7 14 31 5 3 2 6 17 4 7 10 7 5 4 5 9 8 16 25 10 14 4 12 7 16 4 10 4 4 8 6 9 9 12 5 13 11 19 20 27

Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr6_108049359_108050512 seq2: B6Ng01-104A08.g_67_1194 (reverse) seq1 AAAAATAAGTGGTACATTTGGCAGGGAGGGGGAAGATGGGCTCAAAGTGT 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\| \| seq2 AAAAATAAGT-GTACA-TTGGCAGG--AGAGGAAGA--GACCAAAAGT-T 43 seq1 GTCTTTCCAAAAATGCCATGGTCTTAACCTCCAATGTCTTATTAACTCAC 100 \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTCTT----CAAATG-CATAGTCT---ACTCCAATGTCTTATTAACTCAC 85 seq1 TGGAGGAACTGAGATGTGGCAAAGCAGAG-ACATTCCAAGTTGGGACTGG 149 \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| seq2 T-GAGG-ACTGAGAT-TGGCAAAGCAGAGAACATT-CAAG-TGGGACTG- 129 seq1 ATTTAAGGCAAGTCAAGGGTCTATGCGTACATCACACTATACGACCTTAA 199 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| seq2 -ATTAAGGCAAGTC-AGGGTCTATGCGTACATCACACTATACGA-CGTAA 176 seq1 CAGCCCAGCCTGGGTTCTATGTCATCTATACATATTTTCACTTGCTTTTC 249 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| seq2 CAGCCCAGCCTGGGTTCTATGTCATCTATACATA-TTTCACTTGC-TTTC 224 seq1 AAGCCATAAATGGGCTGGTGAACTCAGTCAAAGTCATAGATCTAACAAGC 299 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAGCCATAAATGGGCTGGTGAACTCAGTCAAAGTCATAGATCTAACAAGC 274 seq1 GGTGGGACCAGATTTTAAATCATTGAATTTGACAGCCTGAAGTTAATGTT 349 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGTGGGACCAGA-TTTAAATCATTGAATTTGACAGCCTGAAGTTAATGTT 323 seq1 CTCAGCCACCTCCCTCCTGCCTGTTTCTCCCTACGGACCTTTTGCTCAGC 399 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCAGCCACCTCCCTCCTGCCTGTTTCTCCCTACGGACCTTTTGCTCAGC 373 seq1 CTCATAATTTCTCAGACTCCATCCATGTTTCCCGTCACCAAAGGCACAAT 449 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCATAATTTCTCAGACTCCATCCATGTTTCCCGTCACCAAAGGCACAAT 423 seq1 AAAGTCAAATATCCAATACCATAGCAGCAACAAAAACAGTAAGTCCTGAG 499 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAGTCAAATATCCAATACCATAGCAGCAACAAAAACAGTAAGTCCTGAG 473 seq1 CCTACCTCATCCCACAGCTGCCCCAGGGCACCTTGCAGACACTTAAGAGT 549 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTACCTCATCCCACAGCTGCCCCAGGGCACCTTGCAGACACTTAAGAGT 523 seq1 CCTAGTTTCCTACATGCCCACTGGGAATAATGACCCAAAACAACTAGTTC 599 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTAGTTTCCTACATGCCCACTGGGAATAATGACCCAAAACAACTAGTTC 573 seq1 CTCCCACCACTGTGCTCCAGATCAAACTAGATCATGGGCATTAAGCACTC 649 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCCCACCACTGTGCTCCAGATCAAACTAGATCATGGGCATTAAGCACTC 623 seq1 CTGAGCACCTAGGAGGTGCCTGAAATTGCTAGCTGCGAAGTATAGTAATC 699 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTGAGCACCTAGGAGGTGCCTGAAATTGCTAGCTGCGAAGTATAGTAATC 673 seq1 AGAAGCCATAGCACCAAGAAGTCAAACCTCAGCAGGGAAGAGCGAAGTGG 749 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAAGCCATAGCACCAAGAAGTCAAACCTCAGCAGGGAAGAGCGAAGTGG 723 seq1 GTGCTTCAGACTGCAAGAGCCTGGCCCTTCTAACTGGCTTTGTAATACAG 799 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGCTTCAGACTGCAAGAGCCTGGCCCTTCTAACTGGCTTTGTAATACAG 773 seq1 CCATCTCCTAAAGAGAAGACATTAAGGACACAGAGGGTCCCAGACCATTG 849 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCATCTCCTAAAGAGAAGACATTAAGGACACAGAGGGTCCCAGACCATTG 823 seq1 TCCCCTCGAGTGAAGGCTTCCATGTTGAGAAACCTTCCTTGACATGTGGA 899 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCCCTCGAGTGAAGGCTTCCATGTTGAGAAACCTTCCTTGACATGTGGA 873 seq1 ACACTTGTGGGAGTCTGACATTAGACTGATTCCAGCTATGAGACTTGTCC 949 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACACTTGTGGGAGTCTGACATTAGACTGATTCCAGCTATGAGACTTGTCC 923 seq1 ATGCACCACATGATGTTTCAAAGGCTATGTGGAAGATGTGACGTGCATGG 999 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGCACCACATGATGTTTCAAAGGCTATGTGGAAGATGTGACGTGCATGG 973 seq1 CAGCTTCTTGGAAGGTCATTTAAGCTGTTCTTAGAGTAATTTGTGCTCAG 1049 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGCTTCTTGGAAGGTCATTTAAGCTGTTCTTAGAGTAATTTGTGCTCAG 1023 seq1 TTCTTGCTGGGCTGTCTTCAGAGGGGTTGGAGAAGGGTGAGTCATGTTCT 1099 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTCTTGCTGGGCTGTCTTCAGAGGGGTTGGAGAAGGGTGAGTCATGTTCT 1073 seq1 TCAAAGACAAAGACAGGTAGTTACTGTGGGACCTGGCTTCTCTCCTAGAG 1149 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCAAAGACAAAGACAGGTAGTTACTGTGGGACCTGGCTTCTCTCCTAGAG 1123 seq1 AATTC 1154 \|\|\|\|\| seq2 AATTC 1128

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr6_108049359_108050512
seq2: B6Ng01-104A08.g_67_1194 (reverse)

seq1  AAAAATAAGTGGTACATTTGGCAGGGAGGGGGAAGATGGGCTCAAAGTGT  50
      |||||||||| ||||| ||||||||   | ||||||  | |  ||||| |
seq2  AAAAATAAGT-GTACA-TTGGCAGG--AGAGGAAGA--GACCAAAAGT-T  43

seq1  GTCTTTCCAAAAATGCCATGGTCTTAACCTCCAATGTCTTATTAACTCAC  100
      |||||     ||||| ||| ||||    ||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTT----CAAATG-CATAGTCT---ACTCCAATGTCTTATTAACTCAC  85

seq1  TGGAGGAACTGAGATGTGGCAAAGCAGAG-ACATTCCAAGTTGGGACTGG  149
      | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| 
seq2  T-GAGG-ACTGAGAT-TGGCAAAGCAGAGAACATT-CAAG-TGGGACTG-  129

seq1  ATTTAAGGCAAGTCAAGGGTCTATGCGTACATCACACTATACGACCTTAA  199
        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||
seq2  -ATTAAGGCAAGTC-AGGGTCTATGCGTACATCACACTATACGA-CGTAA  176

seq1  CAGCCCAGCCTGGGTTCTATGTCATCTATACATATTTTCACTTGCTTTTC  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  CAGCCCAGCCTGGGTTCTATGTCATCTATACATA-TTTCACTTGC-TTTC  224

seq1  AAGCCATAAATGGGCTGGTGAACTCAGTCAAAGTCATAGATCTAACAAGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCATAAATGGGCTGGTGAACTCAGTCAAAGTCATAGATCTAACAAGC  274

seq1  GGTGGGACCAGATTTTAAATCATTGAATTTGACAGCCTGAAGTTAATGTT  349
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGACCAGA-TTTAAATCATTGAATTTGACAGCCTGAAGTTAATGTT  323

seq1  CTCAGCCACCTCCCTCCTGCCTGTTTCTCCCTACGGACCTTTTGCTCAGC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCCACCTCCCTCCTGCCTGTTTCTCCCTACGGACCTTTTGCTCAGC  373

seq1  CTCATAATTTCTCAGACTCCATCCATGTTTCCCGTCACCAAAGGCACAAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAATTTCTCAGACTCCATCCATGTTTCCCGTCACCAAAGGCACAAT  423

seq1  AAAGTCAAATATCCAATACCATAGCAGCAACAAAAACAGTAAGTCCTGAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCAAATATCCAATACCATAGCAGCAACAAAAACAGTAAGTCCTGAG  473

seq1  CCTACCTCATCCCACAGCTGCCCCAGGGCACCTTGCAGACACTTAAGAGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCTCATCCCACAGCTGCCCCAGGGCACCTTGCAGACACTTAAGAGT  523

seq1  CCTAGTTTCCTACATGCCCACTGGGAATAATGACCCAAAACAACTAGTTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTTTCCTACATGCCCACTGGGAATAATGACCCAAAACAACTAGTTC  573

seq1  CTCCCACCACTGTGCTCCAGATCAAACTAGATCATGGGCATTAAGCACTC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCACCACTGTGCTCCAGATCAAACTAGATCATGGGCATTAAGCACTC  623

seq1  CTGAGCACCTAGGAGGTGCCTGAAATTGCTAGCTGCGAAGTATAGTAATC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCACCTAGGAGGTGCCTGAAATTGCTAGCTGCGAAGTATAGTAATC  673

seq1  AGAAGCCATAGCACCAAGAAGTCAAACCTCAGCAGGGAAGAGCGAAGTGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCATAGCACCAAGAAGTCAAACCTCAGCAGGGAAGAGCGAAGTGG  723

seq1  GTGCTTCAGACTGCAAGAGCCTGGCCCTTCTAACTGGCTTTGTAATACAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTCAGACTGCAAGAGCCTGGCCCTTCTAACTGGCTTTGTAATACAG  773

seq1  CCATCTCCTAAAGAGAAGACATTAAGGACACAGAGGGTCCCAGACCATTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCCTAAAGAGAAGACATTAAGGACACAGAGGGTCCCAGACCATTG  823

seq1  TCCCCTCGAGTGAAGGCTTCCATGTTGAGAAACCTTCCTTGACATGTGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCGAGTGAAGGCTTCCATGTTGAGAAACCTTCCTTGACATGTGGA  873

seq1  ACACTTGTGGGAGTCTGACATTAGACTGATTCCAGCTATGAGACTTGTCC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTGTGGGAGTCTGACATTAGACTGATTCCAGCTATGAGACTTGTCC  923

seq1  ATGCACCACATGATGTTTCAAAGGCTATGTGGAAGATGTGACGTGCATGG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACCACATGATGTTTCAAAGGCTATGTGGAAGATGTGACGTGCATGG  973

seq1  CAGCTTCTTGGAAGGTCATTTAAGCTGTTCTTAGAGTAATTTGTGCTCAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCTTGGAAGGTCATTTAAGCTGTTCTTAGAGTAATTTGTGCTCAG  1023

seq1  TTCTTGCTGGGCTGTCTTCAGAGGGGTTGGAGAAGGGTGAGTCATGTTCT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGCTGGGCTGTCTTCAGAGGGGTTGGAGAAGGGTGAGTCATGTTCT  1073

seq1  TCAAAGACAAAGACAGGTAGTTACTGTGGGACCTGGCTTCTCTCCTAGAG  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGACAAAGACAGGTAGTTACTGTGGGACCTGGCTTCTCTCCTAGAG  1123

seq1  AATTC  1154
      |||||
seq2  AATTC  1128

BAC Information

Search Parameter

Search Result

BAC

no map image available.

BAC End Information

Alignment Information