BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119J20
Chromosome6 (Build37)
Map Location 145,491,969 - 145,669,800
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042879, Tuba3b
Upstream gene4933425H06Rik, EG665149, Bcat1, Lrmp, Casc1, Lyrm5, Kras, LOC100039495, LOC100042866, LOC546917, 1700073E17Rik, Ifltd1
Downstream geneRassf8, Bhlhb3, Sspn, Itpr2, 4933424B01Rik, Fgfr1op2, Tm7sf3, Surb7, EG626175
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119J20.bB6Ng01-119J20.g
ACCDH923780DH923781
length1,123707
definitionDH923780|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119J20, 5' end.DH923781|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119J20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,491,969 - 145,493,102)(145,669,095 - 145,669,800)
sequence
gaattcctccttttgggcttgacactgctgcttgctgtgcaggggtcctg
ggatacctggagtaccaacaagagaaacctcactgaggggctcctagact
gaaatgccctgcagcctgctgggggaagcccctatacccaggggaagcct
gagctgagaacacagagcctctacagaacaggatggaccaagaagggcca
catgtctgtgcatccagtcatcaccggaagtgcagcactggagaacaaac
caggatgcaggaatcccacctgaacaggtgacatggggctgaggacacag
ctcagtcagcagtgtttgcctagcgttataaagacaccgatttgaacctc
caaactacaatccatgtgtggtgccactcaccgtgatcccagaattcaac
agggagattaggcgttcaaggtcaccctcgactatgtaagaggtgtagcc
tgggatgcataaaatcctgcccagaagtgaggggggtaagtaagctggac
tctgtctcttagtgttagagacaagtcatccagggttcagtaacataaat
ccctgacaaaccacaagcatcttaattgaataaaagtgacaatcaactaa
ctccaagcgcacatacactggtaccgaaattctgtgcgggtttaaataga
cttagtcggcatgcctcaacaactgaacacaggttttcttgacacagata
acaagggatctctgcaaagacagacagctctcttcaagaagggactggag
ggtggctgagatgtccgcagtctctggagtaaacatagttatcagtaaag
ggccacagcgaggtgattcagatcaccccatcagggataaaccatgggac
agaaagggtcacgcctgagcagacatccaagctctgggctggcctgccag
ttttatttttagaggtcctggtggagaatggaggatgacttcaagcctat
gatatctcagtcattggattctagtagccttaggctctgtcagatcagca
ggagatcaatggcacagtctctgggagctacagcgcttgggcctccccac
acgttccgcagccacatctgagcgtcgaaccaggagtgactccataaacg
tacgcaaaaacatctgagtaagg
gaattctggcattcccttgccaggaacccagaagcgaaaccaagcttgcc
catgaattccatatgtggacgtgcatggaagttgatatcgttgttgttaa
ttttcctgttgctgggatgaaatacccagacaaagcaacgtcaagagaga
aagggttcattttggcttttactcgggtaccccacgatggtgaggaagcc
acagcgcaggagcttgaggcagcagctgctctcgttgattccacagtaag
gagtgaagtcctgatcaacagctctctccattgtactctgtccctgaccc
aaagcacggggaatggcactaccaacgtttttaccataggtcttcttacc
tcagttaacctaagcaagacaagcccacacaggcatagccaggggggtta
tagcctacatggttctactagccaatcacagagccatgatcccagtgacc
taaacctatgccctaggccccgccccttaaaggccccacccatgatctca
tagcataaaactgagcagcaagcccacacataggagacttctggggagtc
cctttctaactgtggcgtcgctgtgtctacccaacatcattaggaccttg
tgctgtgcccttgaccttctgagggtgatgtgtgttacttcactatcttt
acagtgtggtttgaaaatgttattttactttgtgcgtctgtgggggtggg
gggtggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_145491969_145493102
seq2: B6Ng01-119J20.b_51_1173

seq1  GAATTCCTCCTTTTGGGCTTGACACTGCTGCTTGCTGTGCAGGGGTCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCTTTTGGGCTTGACACTGCTGCTTGCTGTGCAGGGGTCCTG  50

seq1  GGATACCTGGAGTACCAACAAGAGAAACCTCACTGAGGGGCTCCTAGACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACCTGGAGTACCAACAAGAGAAACCTCACTGAGGGGCTCCTAGACT  100

seq1  GAAATGCCCTGCAGCCTGCTGGGGGAAGCCCCTATACCCAGGGGAAGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGCCCTGCAGCCTGCTGGGGGAAGCCCCTATACCCAGGGGAAGCCT  150

seq1  GAGCTGAGAACACAGAGCCTCTACAGAACAGGATGGACCAAGAAGGGCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGAGAACACAGAGCCTCTACAGAACAGGATGGACCAAGAAGGGCCA  200

seq1  CATGTCTGTGCATCCAGTCATCACCGGAAGTGCAGCACTGGAGAACAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCTGTGCATCCAGTCATCACCGGAAGTGCAGCACTGGAGAACAAAC  250

seq1  CAGGATGCAGGAATCCCACCTGAACAGGTGACATGGGGCTGAGGACACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATGCAGGAATCCCACCTGAACAGGTGACATGGGGCTGAGGACACAG  300

seq1  CTCAGTCAGCAGTGTTTGCCTAGCGTTATAAAGACACCGATTTGAACCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTCAGCAGTGTTTGCCTAGCGTTATAAAGACACCGATTTGAACCTC  350

seq1  CAAACTACAATCCATGTGTGGTGCCACTCACCGTGATCCCAGAATTCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTACAATCCATGTGTGGTGCCACTCACCGTGATCCCAGAATTCAAC  400

seq1  AGGGAGATTAGGCGTTCAAGGTCACCCTCGACTATGTAAGAGGTGTAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGATTAGGCGTTCAAGGTCACCCTCGACTATGTAAGAGGTGTAGCC  450

seq1  TGGGATGCATAAAATCCTGCCCAGAAGTGAGGGGGGTAAGTAAGCTGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGCATAAAATCCTGCCCAGAAGTGAGGGGGGTAAGTAAGCTGGAC  500

seq1  TCTGTCTCTTAGTGTTAGAGACAAGTCATCCAGGGTTCAGTAACATAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTCTTAGTGTTAGAGACAAGTCATCCAGGGTTCAGTAACATAAAT  550

seq1  CCCTGACAAACCACAAGCATCTTAATTGAATAAAAGTGACAATCAACTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGACAAACCACAAGCATCTTAATTGAATAAAAGTGACAATCAACTAA  600

seq1  CTCCAAGCGCACATACACTGGTACCGAAATTCTGTGCGGGTTTAAATAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAGCGCACATACACTGGTACCGAAATTCTGTGCGGGTTTAAATAGA  650

seq1  CTTAGTCGGCATGCCTCAACAACTGAACACAGGTTTTCTTGACACAGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTCGGCATGCCTCAACAACTGAACACAGGTTTTCTTGACACAGATA  700

seq1  ACAAGGGATCTCTGCAAAGACAGACAGCTCTCTTCAAGAAGGGACTGGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGGATCTCTGCAAAGACAGACAGCTCTCTTCAAGAAGGGACTGGAG  750

seq1  GGTGGCTGAGATGTCCGCAGTCTCTGGAGTAAACATAGTTATCAGTAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCTGAGATGTCCGCAGTCTCTGGAGTAAACATAGTTATCAGTAAAG  800

seq1  GGCCACAGCGAGGTGATTCAGATCACCCCATCAGGGATAAACCATGGGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACAGCGAGGTGATTCAGATCACCCCATCAGGGATAAACCATGGGAC  850

seq1  AGAAGGGGTCACGCCTGAGCAGACATCCAAGCTCTGGGCTGGCCTGCCAG  900
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGGTCACGCCTGAGCAGACATCCAAGCTCTGGGCTGGCCTGCCAG  900

seq1  TTTTATTTTTAGAGGTCCTGGTGGGAAGAATGGAGGATGACTTCAAAGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||
seq2  TTTTATTTTTAGAGGTCCTGGTGG--AGAATGGAGGATGACTTCAAGCCT  948

seq1  ATGATAATCTCAGTCATTGGATTCTTAGTAGCCTTAAGGCTCTGTCAAGA  1000
      ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   
seq2  ATGAT-ATCTCAGTCATTGGATTC-TAGTAGCCTT-AGGCTCTGTCA--G  993

seq1  ATCAGCAAGGAGATCAATGGCAACAGTCTCT-GGAGCTAACAGCGC-TGG  1048
      |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||
seq2  ATCAGC-AGGAGATCAATGGC-ACAGTCTCTGGGAGCT-ACAGCGCTTGG  1040

seq1  GCCT-CCCACACGTCCCGCAG-CACATCTGAAGCGTCAGACACAGGAGTG  1096
      |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||
seq2  GCCTCCCCACACGTTCCGCAGCCACATCTG-AGCGTC-GAACCAGGAGTG  1088

seq1  ACTCCATAAACAGTACGCAGAGACCATCTGATGTAAGG  1134
      ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||
seq2  ACTCCATAAAC-GTACGCA-AAAACATCTGA-GTAAGG  1123

seq1: chr6_145669095_145669800
seq2: B6Ng01-119J20.g_68_774 (reverse)

seq1  ACCA-CCCCCACCCCCACAGACGCACAAAGTAAAATAACATTTTCAAACC  49
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCCCCCACCCCCACAGACGCACAAAGTAAAATAACATTTTCAAACC  50

seq1  ACACTGTAAAGATAGTGAAGTAACACACATCACCCTCAGAAGGTCAAGGG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGTAAAGATAGTGAAGTAACACACATCACCCTCAGAAGGTCAAGGG  100

seq1  CACAGCACAAGGTCCTAATGATGTTGGGTAGACACAGCGACGCCACAGTT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCACAAGGTCCTAATGATGTTGGGTAGACACAGCGACGCCACAGTT  150

seq1  AGAAAGGGACTCCCCAGAAGTCTCCTATGTGTGGGCTTGCTGCTCAGTTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGGACTCCCCAGAAGTCTCCTATGTGTGGGCTTGCTGCTCAGTTT  200

seq1  TATGCTATGAGATCATGGGTGGGGCCTTTAAGGGGCGGGGCCTAGGGCAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTATGAGATCATGGGTGGGGCCTTTAAGGGGCGGGGCCTAGGGCAT  250

seq1  AGGTTTAGGTCACTGGGATCATGGCTCTGTGATTGGCTAGTAGAACCATG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTAGGTCACTGGGATCATGGCTCTGTGATTGGCTAGTAGAACCATG  300

seq1  TAGGCTATAACCCCCCTGGCTATGCCTGTGTGGGCTTGTCTTGCTTAGGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTATAACCCCCCTGGCTATGCCTGTGTGGGCTTGTCTTGCTTAGGT  350

seq1  TAACTGAGGTAAGAAGACCTATGGTAAAAACGTTGGTAGTGCCATTCCCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGAGGTAAGAAGACCTATGGTAAAAACGTTGGTAGTGCCATTCCCC  400

seq1  GTGCTTTGGGTCAGGGACAGAGTACAATGGAGAGAGCTGTTGATCAGGAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTTGGGTCAGGGACAGAGTACAATGGAGAGAGCTGTTGATCAGGAC  450

seq1  TTCACTCCTTACTGTGGAATCAACGAGAGCAGCTGCTGCCTCAAGCTCCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTCCTTACTGTGGAATCAACGAGAGCAGCTGCTGCCTCAAGCTCCT  500

seq1  GCGCTGTGGCTTCCTCACCATCGTGGGGTACCCGAGTAAAAGCCAAAATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCTGTGGCTTCCTCACCATCGTGGGGTACCCGAGTAAAAGCCAAAATG  550

seq1  AACCCTTTCTCTCTTGACGTTGCTTTGTCTGGGTATTTCATCCCAGCAAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTTCTCTCTTGACGTTGCTTTGTCTGGGTATTTCATCCCAGCAAC  600

seq1  AGGAAAATTAACAACAACGATATCAACTTCCATGCACGTCCACATATGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAATTAACAACAACGATATCAACTTCCATGCACGTCCACATATGGA  650

seq1  ATTCATGGGCAAGCTTGGTTTCGCTTCTGGGTTCCTGGCAAGGGAATGCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATGGGCAAGCTTGGTTTCGCTTCTGGGTTCCTGGCAAGGGAATGCC  700

seq1  AGAATTC  706
      |||||||
seq2  AGAATTC  707