BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-145F19
Chromosome6 (Build37)
Map Location 148,249,709 - 148,434,144
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmtc1, 1110033J19Rik
Upstream geneEG622129, Ccdc91, LOC100039712, LOC100039727, LOC100039736, Mlstd1, Ergic2
Downstream geneEG622319, LOC100042984, LOC665372, Ipo8, Caprin2, EG665395, Tera, LOC667138, D030011O10Rik, 4833442J19Rik, C730024G19Rik, 2810474O19Rik, LOC665426, LOC622481, LOC665441, Bicd1, LOC667182
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-145F19.bB6Ng01-145F19.g
ACCDH942785DH942786
length1,0321,064
definitionDH942785|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145F19, 5' end.DH942786|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145F19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(148,249,709 - 148,250,740)(148,433,074 - 148,434,144)
sequence
gaattcctgtcctgacttccttggtgatgaacagcaatgtggaagtataa
gctgaataaaccctttcctccccaatttgcttcttggtcatgatgttctg
tgcaggaatgcaaactctaagtcactctttacatggttaaagcatgtgat
tagagctatagataaactcaggggtttttgtttgtttgcttgtttgtttt
ttgttgtttttgtttttgtttttgtttttttggtttttcgagacagggtt
tctctgtatagccctggctgtcctggaactcactttataaattcagttta
ttaaaggcgcccttaaacaaaacatctggtttacaggacaattccaacca
ttttaagaacactcatgaaaaatatctttgaaactacaatctcacctgta
tagtagtatttgcttcaagtattggattaatctactatggtatatggtgt
aaatgtcatacaatgtaagacaaacaggtagtatgtgaaatatatgtggt
catatacttatattgacattcacatacctcagaaacaaacacatatgtaa
attttcccttacacaactttggtattgatatatgtgtccataacaagctc
acatttaatgcattttaagcatatgggggtgactcacattcttgaacttt
tgtcttcctaattcatgcacagtctgtgcccttctctgctcatccagtgt
cccctgcaatagctgggcaatgcactttctagaatggaaggaccgcaacc
tgcagcgcaggtgacagtcaactgcttgtgttactgcctgagagacttca
tcaaccattgttgcttcataaattctatggaattttagggttttctgttt
ttgttttgtttttttatgttttgagccttctattatgtcttttaatataa
aatgcaaaaaagatatccataaaattatatgcttctctgggaagcagata
aagagcataatttctgttaaagaatgactttagtcccagactcccttgct
ctgcctcaccatggattgcacaaagtggcatt
gaattccacagcttcagagccaaattttgttcggtcatttctcacttcct
taatgcccacccactgcccatctgtgtcagacacccacctgtgtcagacc
tagcatcttggtgactcgcagttaaaccttctagaacatgttaacttaga
agaccgatagcttttaccaagtcatttcctgtgggcctatggcagccatt
ttcattcagaccagcaccacaccaggtatggggctgtaaaggttctaagc
cttgctggttgaataaggaatactagggaaccttagaaataggtttggga
ttgactgcctaactttaaaagttttttgaaagtccagcttgctattcctt
attaagtttcaggaacatagatgtgaagggaatctaaatagttcctattg
tcactacaagaaatcagattttatgagagcaggacccattgtataaacaa
actggagcttactctgattttttttttaaatgaaaatgactgtaaggaga
gaacattgatctgtagtaaatgtcttgtgagaatctgacccactgtgttc
tgtataaagcctctgttccaaagctctgcgaagcagagaacttgataacc
acatcagaggattacaatcagccctgctgctgagtggctgttcagggtgt
tccctgcaacagagggtgccacagccataaacattcagactacaatgcag
gaaaacatcaggctcaaaggccgagcttccagtgtgttctggttactaaa
ctttgttgttcttttggttatcttagcaagttcatctattggttggtctt
gactgaggcacatcctctagtattttggttttattcctcggaaagctact
gttgaaatctttaggtgtgatatatttatctcagtattcttccaagcata
tcatcagtcttgtccatttttggatggtctttttatgacaactgtaggtc
aatgatccaggaagtcattcttcaggagtttgctagcattatgagttatg
gagtcttgatgaggcagactacccatttttaatgtggttattaaggtaga
gagactgactcaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_148249709_148250740
seq2: B6Ng01-145F19.b_45_1076

seq1  GAATTCCTGTCCTGACTTCCTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGTATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGTCCTGACTTCCTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGTATAA  50

seq1  GCTGAATAAACCCTTTCCTCCCCAATTTGCTTCTTGGTCATGATGTTCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAATAAACCCTTTCCTCCCCAATTTGCTTCTTGGTCATGATGTTCTG  100

seq1  TGCAGGAATGCAAACTCTAAGTCACTCTTTACATGGTTAAAGCATGTGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGAATGCAAACTCTAAGTCACTCTTTACATGGTTAAAGCATGTGAT  150

seq1  TAGAGCTATAGATAAACTCAGGGGTTTTTGTTTGTTTGCTTGTTTGTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCTATAGATAAACTCAGGGGTTTTTGTTTGTTTGCTTGTTTGTTTT  200

seq1  TTGTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTT  250

seq1  TCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTATAAATTCAGTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTATAAATTCAGTTTA  300

seq1  TTAAAGGCGCCCTTAAACAAAACATCTGGTTTACAGGACAATTCCAACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGGCGCCCTTAAACAAAACATCTGGTTTACAGGACAATTCCAACCA  350

seq1  TTTTAAGAACACTCATGAAAAATATCTTTGAAACTACAATCTCACCTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGAACACTCATGAAAAATATCTTTGAAACTACAATCTCACCTGTA  400

seq1  TAGTAGTATTTGCTTCAAGTATTGGATTAATCTACTATGGTATATGGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAGTATTTGCTTCAAGTATTGGATTAATCTACTATGGTATATGGTGT  450

seq1  AAATGTCATACAATGTAAGACAAACAGGTAGTATGTGAAATATATGTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCATACAATGTAAGACAAACAGGTAGTATGTGAAATATATGTGGT  500

seq1  CATATACTTATATTGACATTCACATACCTCAGAAACAAACACATATGTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATACTTATATTGACATTCACATACCTCAGAAACAAACACATATGTAA  550

seq1  ATTTTCCCTTACACAACTTTGGTATTGATATATGTGTCCATAACAAGCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCCTTACACAACTTTGGTATTGATATATGTGTCCATAACAAGCTC  600

seq1  ACATTTAATGCATTTTAAGCATATGGGGGTGACTCACATTCTTGAACTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTAATGCATTTTAAGCATATGGGGGTGACTCACATTCTTGAACTTT  650

seq1  TGTCTTCCTAATTCATGCACAGTCTGTGCCCTTCTCTGCTCATCCAGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCCTAATTCATGCACAGTCTGTGCCCTTCTCTGCTCATCCAGTGT  700

seq1  CCCCTGCAATAGCTGGGCAATGCACTTTCTAGAATGGAAGGACCGCAACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGCAATAGCTGGGCAATGCACTTTCTAGAATGGAAGGACCGCAACC  750

seq1  TGCAGCGCAGGTGACAGTCAACTGCTTGTGTTACTGCCTGAGAGACTTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCGCAGGTGACAGTCAACTGCTTGTGTTACTGCCTGAGAGACTTCA  800

seq1  TCAACCATTGTTGCTTCATAAATTCTATGGAATTTTAGGGTTTTCTG-TT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TCAACCATTGTTGCTTCATAAATTCTATGGAATTTTAGGGTTTTCTGTTT  850

seq1  TTGTTTTGTTTTTTTATGTTTTGAGCCTTCTACTATGTCTTTTTATATAA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
seq2  TTGTTTTGTTTTTTTATGTTTTGAGCCTTCTATTATGTCTTTTAATATAA  900

seq1  AATGC-AAAAAGATATCCATAAAATTATATGCTTCTCTGGGAGGCAGAAT  948
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  
seq2  AATGCAAAAAAGATATCCATAAAATTATATGCTTCTCTGGGAAGCAGA--  948

seq1  AAAAGAGCAAAATTTCTGTTAAAGAATGACTTTAGCCCCAGACTCCCTTG  998
       |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TAAAGAGCATAATTTCTGTTAAAGAATGACTTTAGTCCCAGACTCCCTTG  998

seq1  C-CTGCTCAAACATGACATGCACAAAAGTGGCATT  1032
      | ||||   | ||||   ||||| |||||||||||
seq2  CTCTGCCTCACCATGGATTGCAC-AAAGTGGCATT  1032

seq1: chr6_148433074_148434144
seq2: B6Ng01-145F19.g_67_1130 (reverse)

seq1  TCTGAGTCAGTTCTCT-TACTTAAATAACCAACATTTAAAAATGGGTTAG  49
      |||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||
seq2  TCTGAGTCAG-TCTCTCTACCTTAATAACC-ACA-TTAAAAATGGG-TAG  46

seq1  TCTGCCTCATCAAGGACT-CATAACTCATGATGCTAGCAAAACTCCTTGA  98
      ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||
seq2  TCTGCCTCATCAA-GACTCCATAACTCATAATGCTAGC-AAACTCC-TGA  93

seq1  AGAATGACTTCCTGGATCATTGACCTTACAGTTGTCATAAAAAGACCATC  148
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGACTTCCTGGATCATTGACC-TACAGTTGTCATAAAAAGACCATC  142

seq1  CAAAAATGGACAAGGACTGATGATATGCTTGGAAGAATACTGAGATAAAT  198
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAATGGACAA-GACTGATGATATGCTTGGAAGAATACTGAGATAAAT  191

seq1  ATATCACACCTAAAGATTTCAACAGTAGCTTTCCGAGGAATAAAACCAAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCACACCTAAAGATTTCAACAGTAGCTTTCCGAGGAATAAAACCAAA  241

seq1  ATACTAGAGGATGTGCCTCAGTCAAGACCAACCAATAGATGAACTTGCTA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTAGAGGATGTGCCTCAGTCAAGACCAACCAATAGATGAACTTGCTA  291

seq1  AGATAACCAAAAGAACAACAAAGTTTAGTAACCAGAACACACTGGAAGCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAACCAAAAGAACAACAAAGTTTAGTAACCAGAACACACTGGAAGCT  341

seq1  CGGCCTTTGAGCCTGATGTTTTCCTGCATTGTAGTCTGAATGTTTATGGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCCTTTGAGCCTGATGTTTTCCTGCATTGTAGTCTGAATGTTTATGGC  391

seq1  TGTGGCACCCTCTGTTGCAGGGAACACCCTGAACAGCCACTCAGCAGCAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCACCCTCTGTTGCAGGGAACACCCTGAACAGCCACTCAGCAGCAG  441

seq1  GGCTGATTGTAATCCTCTGATGTGGTTATCAAGTTCTCTGCTTCGCAGAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGATTGTAATCCTCTGATGTGGTTATCAAGTTCTCTGCTTCGCAGAG  491

seq1  CTTTGGAACAGAGGCTTTATACAGAACACAGTGGGTCAGATTCTCACAAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGAACAGAGGCTTTATACAGAACACAGTGGGTCAGATTCTCACAAG  541

seq1  ACATTTACTACAGATCAATGTTCTCTCCTTACAGTCATTTTCATTTAAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTACTACAGATCAATGTTCTCTCCTTACAGTCATTTTCATTTAAAA  591

seq1  AAAAAATCAGAGTAAGCTCCAGTTTGTTTATACAATGGGTCCTGCTCTCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATCAGAGTAAGCTCCAGTTTGTTTATACAATGGGTCCTGCTCTCA  641

seq1  TAAAATCTGATTTCTTGTAGTGACAATAGGAACTATTTAGATTCCCTTCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCTGATTTCTTGTAGTGACAATAGGAACTATTTAGATTCCCTTCA  691

seq1  CATCTATGTTCCTGAAACTTAATAAGGAATAGCAAGCTGGACTTTCAAAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTATGTTCCTGAAACTTAATAAGGAATAGCAAGCTGGACTTTCAAAA  741

seq1  AACTTTTAAAGTTAGGCAGTCAATCCCAAACCTATTTCTAAGGTTCCCTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTTAAAGTTAGGCAGTCAATCCCAAACCTATTTCTAAGGTTCCCTA  791

seq1  GTATTCCTTATTCAACCAGCAAGGCTTAGAACCTTTACAGCCCCATACCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTCCTTATTCAACCAGCAAGGCTTAGAACCTTTACAGCCCCATACCT  841

seq1  GGTGTGGTGCTGGTCTGAATGAAAATGGCTGCCATAGGCCCACAGGAAAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGGTGCTGGTCTGAATGAAAATGGCTGCCATAGGCCCACAGGAAAT  891

seq1  GACTTGGTAAAAGCTATCGGTCTTCTAAGTTAACATGTTCTAGAAGGTTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGGTAAAAGCTATCGGTCTTCTAAGTTAACATGTTCTAGAAGGTTT  941

seq1  AACTGCGAGTCACCAAGATGCTAGGTCTGACACAGGTGGGTGTCTGACAC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCGAGTCACCAAGATGCTAGGTCTGACACAGGTGGGTGTCTGACAC  991

seq1  AGATGGGCAGTGGGTGGGCATTAAGGAAGTGAGAAATGACCGAACAAAAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGGCAGTGGGTGGGCATTAAGGAAGTGAGAAATGACCGAACAAAAT  1041

seq1  TTGGCTCTGAAGCTGTGGAATTC  1071
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTCTGAAGCTGTGGAATTC  1064