BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148D04
Chromosome6 (Build37)
Map Location 94,171,969 - 94,256,762
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMagi1
Upstream geneLOC100043253, LOC665831
Downstream geneLOC100043262, LOC665856, Slc25a26, Lrig1, LOC625941, EG665865, LOC100043276, LOC100043680, Kbtbd8, LOC435912
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148D04.bB6Ng01-148D04.g
ACCDH944874DH944875
length1,1861,049
definitionDH944874|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148D04, 5' end.DH944875|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148D04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(94,255,568 - 94,256,762)(94,171,969 - 94,173,022)
sequence
gaattctggatatttcatccaaattggaaccgtaccatgcagtcatttga
aggagaatgtcctccataggctcatgtgcttgaatacttagtccccagac
ggtggcaccatttgggagcgtatagaaccagtaggagttggagtcttgct
gtcttgctggaggaagatatcatagccagcttgaggttttgtcacagcaa
caagtaaagtaactaagatgctctttatagattttgtgctttccttcttt
caaggttcctccatgctttggcatgttagtaattggttccttttacagct
gagtaatttttcattgtatgaatatgtatatatacacatatattccaaac
atgtatatatttgtgtatatgtatatatatgtgtgtgtatttatattcat
atgtatatataaatggatatagttcattttgtttatgcatttattcactg
aagggtatcttctgtttattgtgaataaaactgctataggcatttttgta
caaggttttgttcatatacctttttaagtcctttgggtgtgtctacctcg
gagctgttggcttatgcatgaggaactgccaaactgctcacagccactat
gccactttctatttctatgtgcagtgcatgaagcttctgtcattttcact
ttgtcaacatttgttattttccattttacaaagtatagatggcctagtgg
gtatatggagggaccttatggctctggcttacatttccctaatgactaaa
gacgctaaaacttcaattcatgcgcttcaccatgttttttaaaaccaagc
tgtaatctttacgaggaaaggcttaagatagagaaaatgtgaaaagataa
tagaacagtattttagtaacataggctcatataaaatatactaagaagtt
gcttcctctgtgcctctactaactcatgtaccttaaattattatgataaa
agaattataccacaggagtacaccagcctgatttctactgcgttactgac
tttgcctacaaagcccacccgtctagagatctacagtggagtgtagagtt
aaaaatagaagctaggtgggctggctcatccctgtaatatccacacttga
gagttggacagaggattaacaaatttgagactagctgaactatataggca
ggttactctgctgagctacactgaataggccttgcc
gaattcacttcctcagcaccagcgttacaggcaaatgccatcatcgctcc
agacttgagcttttactgctgctgtttgattttggagcttcaggactttg
cttggaatttgttttaaggtgctctctttctaagatgggaatctcactac
atagccttgaactcagaaactccgacctctgcctcctaagtgttggggtt
acacaagtgtaccaccagttcacttcatcccctgctcgctctgtggtttg
ggggcaccacacaggtcctcacactcacacagcaagcacctaacgagcca
cgctatctccctagccccaacatgcagtgacagaatgtatttcaagttag
atttttcttctgagaattaagaggaaactgtgccaggctgaactccactg
tcaataagtgatggaaagtcccaagacactccttcctgccgctgtttccc
agcctgcagtcttcagatgtgcccgttctcaacggctcatacagttctga
gcgctaagaagccagggggtggggggtggggccgcaaactttctgttcca
gttgtgcctgctgacactctcccacagtcagcccatatgtgacattgcat
gatcctgaaggagctactaagtcataagacagtcacaaataaagcaaatc
accacaaatactttaagggatgtaattgtctagtctgtcaatagccagtc
tatgagttccacccctgtagattcaagggactgcatctgtgtccaatata
cagatttcctttcttgtcattactctctaaaaaataaagcatcacaacta
attccttaccatgtacattctttaggtattatggggagcctagggaggaa
ctttataaagtacatagggcaggctgcataaggctacatgcaaataacac
accgctgtatttaaaggacttggaggtttggatatctgtttggatacatc
tttaagactttgtgacattcggggggtgggggcatgccatggtgtactgg
tgaagtcagagaataacttacagggtttggctgttcttattacatgaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_94255568_94256762
seq2: B6Ng01-148D04.b_44_1229 (reverse)

seq1  GGCAAGGCCT-TACAGTGTAGCTCAAGCAGATGTAAAACTTGCTATATAG  49
      |||||||||| | ||||||||||| |||||| || || ||  ||||||||
seq2  GGCAAGGCCTATTCAGTGTAGCTC-AGCAGA-GT-AACCTGCCTATATAG  47

seq1  CTCAGGCTAGTCTCAAACTTTGTTAATCCTCCTGCTCCAACCTCTCAAGT  99
       ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||
seq2  TTCA-GCTAGTCTCAAA-TTTGTTAATCCT-CTG-TCCAA-CTCTCAAGT  92

seq1  GCTGATATTACAGGGATGAGCCAGCACACCTAGCTTCTATTTTTAACTTC  149
      |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
seq2  GTGGATATTACAGGGATGAGCCAGCCCACCTAGCTTCTATTTTTAAC-TC  141

seq1  TACACT-CACTGTAAGAATCTCTAGACGGGTGGGCTTTGTAGGCAAAGTC  198
      |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTCCACTGTA--GATCTCTAGACGGGTGGGCTTTGTAGGCAAAGTC  189

seq1  AGTAACGCAGTAGAAAATCAGGCTGGTGTACTCCTGTGGTATATTTC-TC  247
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | 
seq2  AGTAACGCAGTAG-AAATCAGGCTGGTGTACTCCTGTGGTATAATTCTTT  238

seq1  TATCATAATAATTTAAGGTACATGAGTTAGTAGAGGCACAGAGGAAGCAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATAATAATTTAAGGTACATGAGTTAGTAGAGGCACAGAGGAAGCAA  288

seq1  CTTC-TAGTATATTTTATATGAGCCTATGTTACTAAAATACTGTTCTATT  346
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTAGTATATTTTATATGAGCCTATGTTACTAAAATACTGTTCTATT  338

seq1  ATCTTTTCACATTTTCTCTAATCTTAAGCCTTTCCTCGTAAAGATTACAG  396
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTCACATTTTCTCT-ATCTTAAGCCTTTCCTCGTAAAGATTACAG  387

seq1  CTTGGTTTTAAAAAACATGGTGAAGCGCATGAATTGAAGTTTTAGCGTCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTTTTAAAAAACATGGTGAAGCGCATGAATTGAAGTTTTAGCGTCT  437

seq1  TTAGTCATTAGGGAAATGTAAGCCAGAGCCATAAGGTCCCTCCATATACC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCATTAGGGAAATGTAAGCCAGAGCCATAAGGTCCCTCCATATACC  487

seq1  CACTAGGCCATCTATACTTTGTAAAATGGAAAATAACAAATGTTGACAAA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAGGCCATCTATACTTTGTAAAATGGAAAATAACAAATGTTGACAAA  537

seq1  GTGAAAATGACAGAAGCTTCATGCACTGCACATAGAAATAGAAAGTGGCA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAATGACAGAAGCTTCATGCACTGCACATAGAAATAGAAAGTGGCA  587

seq1  TAGTGGCTGTGAGCAGTTTGGCAGTTCCTCATGCATAAGCCAACAGCTCC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGCTGTGAGCAGTTTGGCAGTTCCTCATGCATAAGCCAACAGCTCC  637

seq1  GAGGTAGACACACCCAAAGGACTTAAAAAGGTATATGAACAAAACCTTGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTAGACACACCCAAAGGACTTAAAAAGGTATATGAACAAAACCTTGT  687

seq1  ACAAAAATGCCTATAGCAGTTTTATTCACAATAAACAGAAGATACCCTTC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAATGCCTATAGCAGTTTTATTCACAATAAACAGAAGATACCCTTC  737

seq1  AGTGAATAAATGCATAAACAAAATGAACTATATCCATTTATATATACATA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAATAAATGCATAAACAAAATGAACTATATCCATTTATATATACATA  787

seq1  TGAATATAAATACACACACATATATATACATATACACAAATATATACATG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATATAAATACACACACATATATATACATATACACAAATATATACATG  837

seq1  TTTGGAATATATGTGTATATATACATATTCATACAATGAAAAATTACTCA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAATATATGTGTATATATACATATTCATACAATGAAAAATTACTCA  887

seq1  GCTGTAAAAGGAACCAATTACTAACATGCCAAAGCATGGAGGAACCTTGA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAAAAGGAACCAATTACTAACATGCCAAAGCATGGAGGAACCTTGA  937

seq1  AAGAAGGAAAGCACAAAATCTATAAAGAGCATCTTAGTTACTTTACTTGT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGGAAAGCACAAAATCTATAAAGAGCATCTTAGTTACTTTACTTGT  987

seq1  TGCTGTGACAAAACCTCAAGCTGGCTATGATATCTTCCTCCAGCAAGACA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGACAAAACCTCAAGCTGGCTATGATATCTTCCTCCAGCAAGACA  1037

seq1  GCAAGACTCCAACTCCTACTGGTTCTATACGCTCCCAAATGGTGCCACCG  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGACTCCAACTCCTACTGGTTCTATACGCTCCCAAATGGTGCCACCG  1087

seq1  TCTGGGGACTAAGTATTCAAGCACATGAGCCTATGGAGGACATTCTCCTT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGGACTAAGTATTCAAGCACATGAGCCTATGGAGGACATTCTCCTT  1137

seq1  CAAATGACTGCATGGTACGGTTCCAATTTGGATGAAATATCCAGAATTC  1195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGACTGCATGGTACGGTTCCAATTTGGATGAAATATCCAGAATTC  1186

seq1: chr6_94171969_94173022
seq2: B6Ng01-148D04.g_67_1115

seq1  GAATTCACTTCCTCAGCACCAGCGTTACAGGCAAATGCCATCATCGCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTCCTCAGCACCAGCGTTACAGGCAAATGCCATCATCGCTCC  50

seq1  AGACTTGAGCTTTTACTGCTGCTGTTTGATTTTGGAGCTTCAGGACTTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTGAGCTTTTACTGCTGCTGTTTGATTTTGGAGCTTCAGGACTTTG  100

seq1  CTTGGAATTTGTTTTAAGGTGCTCTCTTTCTAAGATGGGAATCTCACTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGAATTTGTTTTAAGGTGCTCTCTTTCTAAGATGGGAATCTCACTAC  150

seq1  ATAGCCTTGAACTCAGAAACTCCGACCTCTGCCTCCTAAGTGTTGGGGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCTTGAACTCAGAAACTCCGACCTCTGCCTCCTAAGTGTTGGGGTT  200

seq1  ACACAAGTGTACCACCAGTTCACTTCATCCCCTGCTCGCTCTGTGGTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGTGTACCACCAGTTCACTTCATCCCCTGCTCGCTCTGTGGTTTG  250

seq1  GGGGCACCACACAGGTCCTCACACTCACACAGCAAGCACCTAACGAGCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCACCACACAGGTCCTCACACTCACACAGCAAGCACCTAACGAGCCA  300

seq1  CGCTATCTCCCTAGCCCCAACATGCAGTGACAGAATGTATTTCAAGTTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTATCTCCCTAGCCCCAACATGCAGTGACAGAATGTATTTCAAGTTAG  350

seq1  ATTTTTCTTCTGAGAATTAAGAGGAAACTGTGCCAGGCTGAACTCCACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCTTCTGAGAATTAAGAGGAAACTGTGCCAGGCTGAACTCCACTG  400

seq1  TCAATAAGTGATGGAAAGTCCCAAGACACTCCTTCCTGCCGCTGTTTCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATAAGTGATGGAAAGTCCCAAGACACTCCTTCCTGCCGCTGTTTCCC  450

seq1  AGCCTGCAGTCTTCAGATGTGCCCGTTCTCAACGGCTCATACAGTTCTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGCAGTCTTCAGATGTGCCCGTTCTCAACGGCTCATACAGTTCTGA  500

seq1  GCGCTAAGAAGCCAGGGGGTGGGGGGTGGGGCCGCAAACTTTCTGTTCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCTAAGAAGCCAGGGGGTGGGGGGTGGGGCCGCAAACTTTCTGTTCCA  550

seq1  GTTGTGCCTGCTGACACTCTCCCACAGTCAGCCCATATGTGACATTGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGCCTGCTGACACTCTCCCACAGTCAGCCCATATGTGACATTGCAT  600

seq1  GATCCTGAAGGAGCTACTAAGTCATAAGACAGTCACAAATAAAGCAAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTGAAGGAGCTACTAAGTCATAAGACAGTCACAAATAAAGCAAATC  650

seq1  ACCACAAATACTTTAAGGGATGTAATTGTCTAGTCTGTCAATAGCCAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACAAATACTTTAAGGGATGTAATTGTCTAGTCTGTCAATAGCCAGTC  700

seq1  TATGAGTTCCACCCCTGTAGATTCAAGGGACTGCATCTGTGTCCAATATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGTTCCACCCCTGTAGATTCAAGGGACTGCATCTGTGTCCAATATA  750

seq1  CAGATTTCCTTTCTTGTCATTACTCTCTAAAAAATAAAGCATCACAACTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTTCCTTTCTTGTCATTACTCTCTAAAAAATAAAGCATCACAACTA  800

seq1  ATTCCTTACCATGTACATTCTTTAGGTATTATGGGGAGCCTAGGGAGGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTTACCATGTACATTCTTTAGGTATTATGGGGAGCCTAGGGAGGAA  850

seq1  CTTTATAAAGTACATAGGGCAGGCTGCATAAGGCTACATGCAAATAACAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATAAAGTACATAGGGCAGGCTGCATAAGGCTACATGCAAATAACAC  900

seq1  ACCGCTGTATTTAAAGGACTTGGAGGTTTGGATATCTGTTTGGATACATC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGCTGTATTTAAAGGACTTGGAGGTTTGGATATCTGTTTGGATACATC  950

seq1  TTTAAAGACTTTGTGACATTTCGGGGGGTGGGGGCATGCCATGGTGTACT  1000
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTT-AAGACTTTGTGACA-TTCGGGGGGTGGGGGCATGCCATGGTGTACT  998

seq1  TGTAGAAGTCAGAGAATAACTTACAGGGTTTGGCTGTCTCTTTATACCAT  1050
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||
seq2  GGT-GAAGTCAGAGAATAACTTACAGGGTTTGGCTGT-TC-TTATTACAT  1045

seq1  GAAG  1054
      ||||
seq2  GAAG  1049