BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155D07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 95,102,052 - 95,245,170
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC435912
Upstream geneMagi1, LOC100043262, LOC665856, Slc25a26, Lrig1, LOC625941, EG665865, LOC100043276, LOC100043680, Kbtbd8
Downstream geneSuclg2, LOC665886, LOC545867, C630007B19Rik, LOC100043685, 1700123L14Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155D07.bB6Ng01-155D07.g
ACCDH950052DH950053
length1,144859
definitionDH950052|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155D07, 5' end.DH950053|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155D07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,102,052 - 95,103,209)(95,244,312 - 95,245,170)
sequence
gaattcctaattcttactagtcagatactcttcctcctcctcctcctctt
ccttctactccatcttcttctgccccctcccccgcccccatgtgtgtatt
tgtgtatggctgtaatggggatatggggatagaacctagagccttgggct
tagtaaccaaatactccccagctcctgcttttaaatctacattttgtttg
tttgcttgtttgtttgtttgttttgcctgattgttagtgctcagggacct
ggtccttcactctcaggacactgagctttctttgttatcttctgtcattt
actatgtgaagaggaggaggaagaagaagagaaggaggaggaggaagagt
atcatttcactcttactcctttgtgaataagcaattattgcttctaaaat
atacaggatttaaacttcattatgaaaattaagcacaccaagcatagcct
tggggtacagttgtggagcaagtatcaggaacccatgaccttagcatgaa
ccaaaagtcatagcaagactggagcaacatgcttttaccacctacaggta
tgttttccttagagacttccaagggaaagttcaaaagggtcccctgttag
tctttcaacttgtggactcagctattcggtgcaatccacaggataaaacc
gttgttctactctgccttacgaagccttgctaactgccatcctaacccta
tgtcttaccaaagtcaccggctgccattgaaatctgaggagttcctgtac
agaggttagaaacatcaatcactctggcagacttgacttctgagaagcag
agatccttagaaaagcgccattggaaagaagttgggattcatgagaggac
tttcaggtcatggggagggctatggcatggtactgtaacagtcttttctc
actttctctttagcaacaatggaagtggtttgctctgccctgtctaacac
tttgataactggtctcacatatggggccatgtgagccaagagaaaccttt
tctctttgtaagtattgtcttctgtgtggctgtcctttggctacgtggta
gatcttcttctccatccttctccatcccctttctccaccgttcaaccctg
aaccagtaagaagagaaaaaggatgagataaaggacacgagatc
gaattcaagcaaatttatagcttgtgagccaacagaaggggaagagcact
tgtggatgtaaaacattatttcccaggggttcaaactgctttctaaacat
tagctcattaattgctcctttaaatctttctcattgatttttatatattt
ttgaaagaacaaatttactgtttgttttgcatatgaagaaaagagttcat
atcagttagaaagtaaggtcttaaatctcttctaaaacagacatcataat
ttaacttacaagttaccggatggacttaaaaggggctggataatgttata
tatttatgaacccacccaaaagttccataatatcttgggaacattgcatc
agaaatctgaatatttgaataagggcccttcctgtatcagtcagaaagga
tgcatctgaagattagagctgggtaagtctttcagtttggagaggaatat
aaaatgctggtatatattatcagaagatggtaagaatcaataaaacaatg
acgatagtgaccagtggaggtcactgccaaggtcaaggtcatcccaagcc
agctacagtcaaagtgaaacttttaaataacttctgttttttaaagttgt
tttattcatttgttatttatttatttatttatttatttatttatttattt
taaataactttcgatctttagcaagtcactagacatctcggagtgggtgc
tgaggtccaccatttaataccatactgcattgcttattttgagcattaga
ctaactagctcacatcaagcactgatgttccctgcacatgctaccatatc
agctacagctaggatcttcagatgcagagacagaaagagtgtgtgtgtgg
ggggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_95102052_95103209
seq2: B6Ng01-155D07.b_47_1190

seq1  GAATTCCTAATTCTTACTAGTCAGATACTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAATTCTTACTAGTCAGATACTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTT  50

seq1  CCTTCTACTCCATCTTCTTCTGCCCCCTCCCCCGCCCCCATGTGTGTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTACTCCATCTTCTTCTGCCCCCTCCCCCGCCCCCATGTGTGTATT  100

seq1  TGTGTATGGCTGTAATGGGGATATGGGGATAGAACCTAGAGCCTTGGGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATGGCTGTAATGGGGATATGGGGATAGAACCTAGAGCCTTGGGCT  150

seq1  TAGTAACCAAATACTCCCCAGCTCCTGCTTTTAAATCTACATTTTGTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAACCAAATACTCCCCAGCTCCTGCTTTTAAATCTACATTTTGTTTG  200

seq1  TTTGCTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGCCTGATTGTTAGTGCTCAGGGACCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGCCTGATTGTTAGTGCTCAGGGACCT  250

seq1  GGTCCTTCACTCTCAGGACACTGAGCTTTCTTTGTTATCTTCTGTCATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTTCACTCTCAGGACACTGAGCTTTCTTTGTTATCTTCTGTCATTT  300

seq1  ACTATGTGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAGAAGGAGGAGGAGGAAGAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGTGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAGAAGGAGGAGGAGGAAGAGT  350

seq1  ATCATTTCACTCTTACTCCTTTGTGAATAAGCAATTATTGCTTCTAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTCACTCTTACTCCTTTGTGAATAAGCAATTATTGCTTCTAAAAT  400

seq1  ATACAGGATTTAAACTTCATTATGAAAATTAAGCACACCAAGCATAGCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGGATTTAAACTTCATTATGAAAATTAAGCACACCAAGCATAGCCT  450

seq1  TGGGGTACAGTTGTGGAGCAAGTATCAGGAACCCATGACCTTAGCATGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTACAGTTGTGGAGCAAGTATCAGGAACCCATGACCTTAGCATGAA  500

seq1  CCAAAAGTCATAGCAAGACTGGAGCAACATGCTTTTACCACCTACAGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAGTCATAGCAAGACTGGAGCAACATGCTTTTACCACCTACAGGTA  550

seq1  TGTTTTCCTTAGAGACTTCCAAGGGAAAGTTCAAAAGGGTCCCCTGTTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTCCTTAGAGACTTCCAAGGGAAAGTTCAAAAGGGTCCCCTGTTAG  600

seq1  TCTTTCAACTTGTGGACTCAGCTATTCGGTGCAATCCACAGGATAAAACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAACTTGTGGACTCAGCTATTCGGTGCAATCCACAGGATAAAACC  650

seq1  GTTGTTCTACTCTGCCTTACGAAGCCTTGCTAACTGCCATCCTAACCCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTCTACTCTGCCTTACGAAGCCTTGCTAACTGCCATCCTAACCCTA  700

seq1  TGTCTTACCAAAGTCACCGGCTGCCATTGAAATCTGAGGAGTTCCTGTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTACCAAAGTCACCGGCTGCCATTGAAATCTGAGGAGTTCCTGTAC  750

seq1  AGAGGTTAGAAACATCAATCACTCTGGCAGACTTGACTTCTGAGAAGCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTTAGAAACATCAATCACTCTGGCAGACTTGACTTCTGAGAAGCAG  800

seq1  AGATCCTTAGAAAAGCGCCATTGGAAAGAAGTTGGGATTCATGAGAGGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCTTAGAAAAGCGCCATTGGAAAGAAGTTGGGATTCATGAGAGGAC  850

seq1  -TTCAGGTCATGGGGAGGGCTATGGCATGGTACTGTAACAGTCTTTTCTC  899
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGGTCATGGGGAGGGCTATGGCATGGTACTGTAACAGTCTTTTCTC  900

seq1  ACTTTCTCTTTAGCAACAATGGAAGTGGTTTTGCTCTGCCCTGTACTAAC  949
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  ACTTTCTCTTTAGCAACAATGGAAGTGG-TTTGCTCTGCCCTGT-CTAAC  948

seq1  ACTTTGATAACTGGTCTCACATAATGGGGCCAATGTTGAGCCAAGAGAAA  999
      |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||
seq2  ACTTTGATAACTGGTCTCACAT-ATGGGGCC-ATG-TGAGCCAAGAGAAA  995

seq1  CCTTTTCTCTTTGTAAGTTAATTGTCTTCTGTGTGGCTGT-CTTTGGCTA  1048
      ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CCTTTTCTCTTTGTAAGT--ATTGTCTTCTGTGTGGCTGTCCTTTGGCTA  1043

seq1  CGTGGTAGATTCTTCTTTCTTCCATCCTTCTCCATCCCCTTTCTTCCACC  1098
      ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |
seq2  CGTGGTAGA-TCTTCTT--CTCCATCCTTCTCCATCCCCTTTC-TCCA-C  1088

seq1  CTTTCAACCCCTGAACACAGGTAAGAGAGA-AAAAAGGATAGAGAGAAAA  1147
      | ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||| ||| 
seq2  CGTTCAA-CCCTGAAC-CA-GTAAGA-AGAGAAAAAGGAT-GAGATAAAG  1133

seq1  GGAACGAGATC  1158
      |  ||||||||
seq2  GACACGAGATC  1144

seq1: chr6_95244312_95245170
seq2: B6Ng01-155D07.g_67_925 (reverse)

seq1  CCCCCCCCCCCACACACACACTCTTTCTGTCTCTGCATCTGAAGATCCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCCCCACACACACACTCTTTCTGTCTCTGCATCTGAAGATCCTA  50

seq1  GCTGTAGCTGATATGGTAGCATGTGCAGGGAACATCAGTGCTTGATGTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAGCTGATATGGTAGCATGTGCAGGGAACATCAGTGCTTGATGTGA  100

seq1  GCTAGTTAGTCTAATGCTCAAAATAAGCAATGCAGTATGGTATTAAATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGTTAGTCTAATGCTCAAAATAAGCAATGCAGTATGGTATTAAATGG  150

seq1  TGGACCTCAGCACCCACTCCGAGATGTCTAGTGACTTGCTAAAGATCGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCTCAGCACCCACTCCGAGATGTCTAGTGACTTGCTAAAGATCGAA  200

seq1  AGTTATTTAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTTAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAACAA  250

seq1  ATGAATAAAACAACTTTAAAAAACAGAAGTTATTTAAAAGTTTCACTTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATAAAACAACTTTAAAAAACAGAAGTTATTTAAAAGTTTCACTTTG  300

seq1  ACTGTAGCTGGCTTGGGATGACCTTGACCTTGGCAGTGACCTCCACTGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGCTGGCTTGGGATGACCTTGACCTTGGCAGTGACCTCCACTGGT  350

seq1  CACTATCGTCATTGTTTTATTGATTCTTACCATCTTCTGATAATATATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATCGTCATTGTTTTATTGATTCTTACCATCTTCTGATAATATATAC  400

seq1  CAGCATTTTATATTCCTCTCCAAACTGAAAGACTTACCCAGCTCTAATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATTTTATATTCCTCTCCAAACTGAAAGACTTACCCAGCTCTAATCT  450

seq1  TCAGATGCATCCTTTCTGACTGATACAGGAAGGGCCCTTATTCAAATATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATGCATCCTTTCTGACTGATACAGGAAGGGCCCTTATTCAAATATT  500

seq1  CAGATTTCTGATGCAATGTTCCCAAGATATTATGGAACTTTTGGGTGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTTCTGATGCAATGTTCCCAAGATATTATGGAACTTTTGGGTGGGT  550

seq1  TCATAAATATATAACATTATCCAGCCCCTTTTAAGTCCATCCGGTAACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAATATATAACATTATCCAGCCCCTTTTAAGTCCATCCGGTAACTT  600

seq1  GTAAGTTAAATTATGATGTCTGTTTTAGAAGAGATTTAAGACCTTACTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTTAAATTATGATGTCTGTTTTAGAAGAGATTTAAGACCTTACTTT  650

seq1  CTAACTGATATGAACTCTTTTCTTCATATGCAAAACAAACAGTAAATTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTGATATGAACTCTTTTCTTCATATGCAAAACAAACAGTAAATTTG  700

seq1  TTCTTTCAAAAATATATAAAAATCAATGAGAAAGATTTAAAGGAGCAATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCAAAAATATATAAAAATCAATGAGAAAGATTTAAAGGAGCAATT  750

seq1  AATGAGCTAATGTTTAGAAAGCAGTTTGAACCCCTGGGAAATAATGTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGCTAATGTTTAGAAAGCAGTTTGAACCCCTGGGAAATAATGTTTT  800

seq1  ACATCCACAAGTGCTCTTCCCCTTCTGTTGGCTCACAAGCTATAAATTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCACAAGTGCTCTTCCCCTTCTGTTGGCTCACAAGCTATAAATTTG  850

seq1  CTTGAATTC  859
      |||||||||
seq2  CTTGAATTC  859