BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155K11
Chromosome6 (Build37)
Map Location 87,894,157 - 88,067,162
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665416, H1fx, EG434064, LOC100043131, Rab7, Rpn1
Upstream geneAak1, LOC100043555, Nfu1, Gfpt1, D6Ertd527e, Antxr1, Gkn1, Gkn2, 1190003M12Rik, Bmp10, Arhgap25, Prokr1, 2010301N04Rik, 1810020O05Rik, AB041550, LOC100043118, EG545864, Gp9, Rab43, Isy1, Cnbp, Copg, 8430410A17Rik
Downstream geneGata2, Dnajb8, Eefsec, Ruvbl1, Sec61a1, 4933428M03Rik, Mgll, Abtb1, Podxl2, LOC100043146, Mcm2, Gpr175, 4933427D06Rik
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155K11.bB6Ng01-155K11.g
ACCDH950376DH950377
length1,1111,044
definitionDH950376|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155K11, 5' end.DH950377|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155K11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(88,066,040 - 88,067,162)(87,894,157 - 87,895,209)
sequence
gaattctgaaataattccattgagaccggaattcatgcaatgctctgtat
cctgatgtggtaaagaaggtggcccacggggtggcggggggaggcagggg
ctgtgaaggcccagggatggtgagacagccatcaggccctgcagcagggg
ttctgctggcccccctcacccacgggctccggaaggcccatctgacagga
gcagggccctgataagcgccacctgaccatgaggccccaggcagagagat
taatgctcaaattgtcaacagcctcccacgacataccccatgggggagca
ggggccaagaagagacaaccgggaaaggacagaagagatgtcagcgagaa
atggacaagaggaaggctcagtctccctgcctcctgcgctcagcttgcta
cgtcaacccacactggcctgggttggcctaccagggcaagatgccaagac
ttgaggcacagcaagcatcatggcgctcagtcatgttccaagctggcccc
aagcctgagcaggccctggctatgttatacaggaggatggctggtaatct
gccaacatccaggaagcctcggggcttctctaggcaggcaggtcagctcc
ggagcctcctctcctgggccaggactccaaccctatcagcccctggctgc
tgtcctggatggaacgtgggtttcccctgcatgggtccccgcctcattct
tcggcagactggtatcatatctgggtttggcagtcgctgggccattacat
tcaggactcgctgcagtcctcaggttccggctgactaaggttcctaagct
gtggggaaaccagaaactcaagagatgggttttctacgaagcaaaatgta
ttctctgaatgcctttcctgtgctctgtggttatctaacgccccatccct
gtcttcttaagggaaaacccgccctcccccccctttttttctgaagaaag
gtgatctgagaaatcagtgtcataaagccagaccctgggtctctcacccg
ctccacggtgactgggttttgattcatctctatgtgcatttggttcaact
ggtgtggtgaaatccagcttggcttagagcctaactccgctttggcaacc
cagccactgcc
gaattcaaattaagcatcaactgcctccagtacccccaaaacacaagtca
ccctcatccagggattggtaaaagaatgacattgaggtcaatacagtatc
agtgctggattctgagcacagagctaggttctatccagtcactggaagtt
tgatcttcgtgtgttatgtgtttccaaggatgtgggagtcacttgctgca
gctgatgtgtctgagcaatcctgtctctcaacaccaatgcaaggtaagga
cagtcctgcttatgagacatctgttctacagaaaggagtgagggagaggc
ctctcacagcccttgaaatgttttccatagttagccactgctgcccattc
atgaatggacttgtgactggaccacctgagaagattcgtagtggattggc
acagattaaacatagagtgaagaccctcatggttaccctagggaagtctg
ggtgtgtggaggcagctacacatctcaatacttatccacccagtgcagac
attgattggctcaagtctcagccctggttgggaatccttactgtttaggt
tcttctcaactatattctggtcacctgggaaagaggtcatggtccagatc
cgaatggtggcatcatatgcccaagtgacaatgtatgtgccgattaagca
atacttaggacagtgcatggatggaacatttgccttgccacaagctgagt
ttgaaataccaaccttcctgtctgtggagaagaatctcagaaagcacaca
ggtgaataggcactcttcactatcaagcttgcttccagagcgtccccaaa
tctgtcatcagcagcacttttccggagtaagcttgagagtgcaatgatga
tggcacctaagacacctgtgatccagcctttgacagagcctttgctatac
taggctcagagcatcaagtataggacaggacagtcagagaaacgagtcct
gagtacaggctgtctcagggttgtgatgtactgcatttgccatggaaagt
gaaccatgcttataattaaaaagaaagagggggaggtaggaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_88066040_88067162
seq2: B6Ng01-155K11.b_45_1155 (reverse)

seq1  GGCAGTGGCCTGGGTTGCCAGAGCGGAGTAGAGCTTCTAAGGCAAAGCTG  50
      |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||||| || ||||||
seq2  GGCAGTGG-CTGGGTTGCCAAAGCGGAGT-TAGGCTCTAA-GCCAAGCTG  47

seq1  GAAATACAACACA-CAGTGAAAACCCAAATGCACATAGAGATGGAAATTC  99
      | | | || |||| ||||  ||  |||||||||||||||||||   | ||
seq2  G-ATTTCACCACACCAGTTGAA--CCAAATGCACATAGAGATG---AATC  91

seq1  AAAACCCAGTCACCGTGGAGCGGGTGAGAGACCCAGGGTCTGGCTTTATG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCCAGTCACCGTGGAGCGGGTGAGAGACCCAGGGTCTGGCTTTATG  141

seq1  ACACTGATTTCTCAGATCACCCTTTCTTCAGAAAAAAAAGGGGGGGGGAG  199
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||
seq2  ACACTGATTTCTCAGATCA-CCTTTCTTCAGAAAAAAA--GGGGGGGGAG  188

seq1  GGCGGGTTTTCCCTTAAGAAGACAGGGATGGGGGCGTTAGATAACCACAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GGCGGGTTTTCCCTTAAGAAGACAGGGAT-GGGGCGTTAGATAACCACAG  237

seq1  AGCACAGGGAAGGCATTCAGAGAATACATTTTGCTTCGTAGAAAACCCAT  299
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGGAAAGGCATTCAGAGAATACATTTTGCTTCGTAGAAAACCCAT  287

seq1  CTCTTGAGTTTCTGGTTTCCCCACAGCTTAGGAACCTTAGTCAGCCGGAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGAGTTTCTGGTTTCCCCACAGCTTAGGAACCTTAGTCAGCCGGAA  337

seq1  CCTGAGGACTGCAGCGAGTCCTGAATGTAATGGCCCAGCGACTGCCAAAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGGACTGCAGCGAGTCCTGAATGTAATGGCCCAGCGACTGCCAAAC  387

seq1  CCAGATATGATACCAGTCTGCCGAAGAATGAGGCGGGGACCCATGCAGGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATATGATACCAGTCTGCCGAAGAATGAGGCGGGGACCCATGCAGGG  437

seq1  GAAACCCACGTTCCATCCAGGACAGCAGCCAGGGGCTGATAGGGTTGGAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCCACGTTCCATCCAGGACAGCAGCCAGGGGCTGATAGGGTTGGAG  487

seq1  TCCTGGCCCAGGAGAGGAGGCTCCGGAGCTGACCTGCCTGCCTAGAGAAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGCCCAGGAGAGGAGGCTCCGGAGCTGACCTGCCTGCCTAGAGAAG  537

seq1  CCCCGAGGCTTCCTGGATGTTGGCAGATTACCAGCCATCCTCCTGTATAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCGAGGCTTCCTGGATGTTGGCAGATTACCAGCCATCCTCCTGTATAA  587

seq1  CATAGCCAGGGCCTGCTCAGGCTTGGGGCCAGCTTGGAACATGACTGAGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCCAGGGCCTGCTCAGGCTTGGGGCCAGCTTGGAACATGACTGAGC  637

seq1  GCCATGATGCTTGCTGTGCCTCAAGTCTTGGCATCTTGCCCTGGTAGGCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGATGCTTGCTGTGCCTCAAGTCTTGGCATCTTGCCCTGGTAGGCC  687

seq1  AACCCAGGCCAGTGTGGGTTGACGTAGCAAGCTGAGCGCAGGAGGCAGGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAGGCCAGTGTGGGTTGACGTAGCAAGCTGAGCGCAGGAGGCAGGG  737

seq1  AGACTGAGCCTTCCTCTTGTCCATTTCTCGCTGACATCTCTTCTGTCCTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGAGCCTTCCTCTTGTCCATTTCTCGCTGACATCTCTTCTGTCCTT  787

seq1  TCCCGGTTGTCTCTTCTTGGCCCCTGCTCCCCCATGGGGTATGTCGTGGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGGTTGTCTCTTCTTGGCCCCTGCTCCCCCATGGGGTATGTCGTGGG  837

seq1  AGGCTGTTGACAATTTGAGCATTAATCTCTCTGCCTGGGGCCTCATGGTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTTGACAATTTGAGCATTAATCTCTCTGCCTGGGGCCTCATGGTC  887

seq1  AGGTGGCGCTTATCAGGGCCCTGCTCCTGTCAGATGGGCCTTCCGGAGCC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGCGCTTATCAGGGCCCTGCTCCTGTCAGATGGGCCTTCCGGAGCC  937

seq1  CGTGGGTGAGGGGGGCCAGCAGAACCCCTGCTGCAGGGCCTGATGGCTGT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGGTGAGGGGGGCCAGCAGAACCCCTGCTGCAGGGCCTGATGGCTGT  987

seq1  CTCACCATCCCTGGGCCTTCACAGCCCCTGCCTCCCCCCGCCACCCCGTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCATCCCTGGGCCTTCACAGCCCCTGCCTCCCCCCGCCACCCCGTG  1037

seq1  GGCCACCTTCTTTACCACATCAGGATACAGAGCATTGCATGAATTCCGGT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACCTTCTTTACCACATCAGGATACAGAGCATTGCATGAATTCCGGT  1087

seq1  CTCAATGGAATTATTTCAGAATTC  1123
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATGGAATTATTTCAGAATTC  1111

seq1: chr6_87894157_87895209
seq2: B6Ng01-155K11.g_67_1110

seq1  GAATTCAAATTAAGCATCAACTGCCTCCAGTACCCCCAAAACACAAGTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATTAAGCATCAACTGCCTCCAGTACCCCCAAAACACAAGTCA  50

seq1  CCCTCATCCAGGGATTGGTAAAAGAATGACATTGAGGTCAATACAGTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCATCCAGGGATTGGTAAAAGAATGACATTGAGGTCAATACAGTATC  100

seq1  AGTGCTGGATTCTGAGCACAGAGCTAGGTTCTATCCAGTCACTGGAAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGGATTCTGAGCACAGAGCTAGGTTCTATCCAGTCACTGGAAGTT  150

seq1  TGATCTTCGTGTGTTATGTGTTTCCAAGGATGTGGGAGTCACTTGCTGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTTCGTGTGTTATGTGTTTCCAAGGATGTGGGAGTCACTTGCTGCA  200

seq1  GCTGATGTGTCTGAGCAATCCTGTCTCTCAACACCAATGCAAGGTAAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATGTGTCTGAGCAATCCTGTCTCTCAACACCAATGCAAGGTAAGGA  250

seq1  CAGTCCTGCTTATGAGACATCTGTTCTACAGAAAGGAGTGAGGGAGAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCTGCTTATGAGACATCTGTTCTACAGAAAGGAGTGAGGGAGAGGC  300

seq1  CTCTCACAGCCCTTGAAATGTTTTCCATAGTTAGCCACTGCTGCCCATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCACAGCCCTTGAAATGTTTTCCATAGTTAGCCACTGCTGCCCATTC  350

seq1  ATGAATGGACTTGTGACTGGACCACCTGAGAAGATTCGTAGTGGATTGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGGACTTGTGACTGGACCACCTGAGAAGATTCGTAGTGGATTGGC  400

seq1  ACAGATTAAACATAGAGTGAAGACCCTCATGGTTACCCTAGGGAAGTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATTAAACATAGAGTGAAGACCCTCATGGTTACCCTAGGGAAGTCTG  450

seq1  GGTGTGTGGAGGCAGCTACACATCTCAATACTTATCCACCCAGTGCAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGTGGAGGCAGCTACACATCTCAATACTTATCCACCCAGTGCAGAC  500

seq1  ATTGATTGGCTCAAGTCTCAGCCCTGGTTGGGAATCCTTACTGTTTAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTGGCTCAAGTCTCAGCCCTGGTTGGGAATCCTTACTGTTTAGGT  550

seq1  TCTTCTCAACTATATTCTGGTCACCTGGGAAAGAGGTCATGGTCCAGATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTCAACTATATTCTGGTCACCTGGGAAAGAGGTCATGGTCCAGATC  600

seq1  CGAATGGTGGCATCATATGCCCAAGTGACAATGTATGTGCCGATTAAGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAATGGTGGCATCATATGCCCAAGTGACAATGTATGTGCCGATTAAGCA  650

seq1  ATACTTAGGACAGTGCATGGATGGAACATTTGCCTTGCCACAAGCTGAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTAGGACAGTGCATGGATGGAACATTTGCCTTGCCACAAGCTGAGT  700

seq1  TTGAAATACCAACCTTCCTGTCTGTGGAGAAGAATCTCAGAAAGCACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAATACCAACCTTCCTGTCTGTGGAGAAGAATCTCAGAAAGCACACA  750

seq1  GGTGAATAGGCACTCTTCACTATCAAGCTTGCTTCCAGAGCGTCCCCAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAATAGGCACTCTTCACTATCAAGCTTGCTTCCAGAGCGTCCCCAAA  800

seq1  TCTGTCATCAGCAGCACTTTTCCGGAGTAAGCTTGAGAGTGCAATGATGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCATCAGCAGCACTTTTCCGGAGTAAGCTTGAGAGTGCAATGATGA  850

seq1  TGGCACCTAAGACACCTGTGATCCAGCCTTTGACAGAGCCTTTGCTATAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACCTAAGACACCTGTGATCCAGCCTTTGACAGAGCCTTTGCTATAC  900

seq1  TAGGCTCAAGAGCATCAAGTAATAAGACAAGGAACAGTCAGAGAAACGAG  950
      ||||||| |||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||
seq2  TAGGCTC-AGAGCATCAAGT-ATAGGACA--GGACAGTCAGAGAAACGAG  946

seq1  TCCTGGAGTACCAGGCTGTTCTCAGGGTTGTTGATGTTACTGCATTTGCC  1000
      |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||
seq2  TCCT-GAGTA-CAGGCTG-TCTCAGGGTTG-TGATG-TACTGCATTTGCC  991

seq1  ATGGAAAAGTGAACCAATGCTATAAATTAAAAAGAAAGAAGGGGGAG---  1047
      |||| |||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||   
seq2  ATGG-AAAGTGAACC-ATGCTTATAATTAAAAAGAAAG-AGGGGGAGGTA  1038

seq1  GGAGGG  1053
      ||||||
seq2  GGAGGG  1044