MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-163L17
Chromosome	6 (Build37)
Map Location	112,348,720 - 112,383,144
singlet/doublet	doublet
Overlap gene	none
Upstream gene	Grm7, 1700054K19Rik, Lmcd1, D630042P16Rik, LOC619975
Downstream gene	Cav3, Oxtr, LOC434076, EG434077, Rad18, Srgap3, EG666387, EG620161, LOC666397, Thumpd3, EG434078, Setd5, Lhfpl4, Mtmr14, Cpne9, Brpf1, Ogg1, Camk1, Tada3l, Arpc4, Ttll3, Rpusd3, Cidec
Link	Open Mouse BAC browser

no map image available.

Click to get alignment info.

BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-163L17.b	B6Ng01-163L17.g
ACC	DH956244	DH956245
length	1,208	1,194
definition	DH956244\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163L17, 5' end.	DH956245\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163L17, 3' end.
singlet/doublet	doublet	doublet
BLAST hit	unique	unique
Map location.	(112,348,720 - 112,350,279)	(112,381,930 - 112,383,144)
sequence	gaattcatggtcttcttcccacctcattcttctaaatgctgagattagag tcatgagccaccatgtccacctctgcacactctacagtaccctaccagaa atgcacttctgatgtatttagctattcctctcttcatagatacccacctt gtttcctatcattcccaattagtgttatgatcattaataaacatgaacat atatgcttcagacaagttaggaactactggcttattttacaaatagatgc tggtgcctggagatcaggagaaagtatatgaatgcctaagtgtgtcagtg agcagactcctcagggtcacccctaagagcacagggctggcagcaaatgg ttctgattctcagacctgccaggctggtgcacacacccctccctgctcta tcctgttggaaacactggcctggaattagatacacatcttcattggcacc ccaggcatgtatgcagacagtttctagcaggcattgaagcttccagcttc tgcaaagacacctgcttacagcaagccaggccacctaatcactgggtctc atcacccctcagctttggtccccagaaggttctcactggatatgaaatag gaggcccccagctttagttaataggactgtgcatatacacagacatagac tatgattttacaacttcattctcttctatttcaagcctaaggtgctgggg aatttcaagaacacttccctgcaccccatgttctttctttccttccctat gcaccactgtggcaccgggtaaattgaatttcaaaagaatattattccaa ctaaacataaaactgtgctgctacaaaacgagtgcctgcattgttttggt ttttaacacatgtgcctcgctttaacaaatgctcaaggaaagagggagtt atcaggatttttacatactcagaacatacagcccaaagcagactcagacc tgagctcacaaatggaaaagatcaaccttctagggacaggtgatccccca ttatccccacccatactgcattactttctaccagcttggtcttcttcaaa gcaagatggcccgaagaagagggctgttcaagactcattttctcctatcc tattaaagaggacaatggtgactttcagaagtccatactgcagcctttca gggatgtctcctttgtacccctaaactggctgaactggtcctaaggtccc taacccta	gaattctcttatccctggagcctgctttggggagacattgccccatgtaa ccactggctgattggaattggtgtgtaaatacctttgcctcctaagtatg tggtgcttaatgctgtcaccttgacgtctccattagcattacactctaga cttcagcaaccaatgacaggataacccatggttggcaatgtccttttcct gcatccattccctccctgatgctaattttctttgtacctttcatacaatc aacatattctggagtagtctcagaatcttcccagaactcaaactcagaac ccctctatatcttaggacctgaccactgagtcacctctatatgctctatt ttgacagcagggacactgccacctgccctgtctgtcttggaggcttgggt cattcattcctgggcagccctgctcccaagaccatgccaagttccttgtg gcagtgtagtaatgaggcattagctgtgtatctaaatggtaactgtcatc tagaagcatcaggggacatttggctgtatctaggacctgaggtcgttctt ggtatccggattgtgcaaaatatcttactgctgaacattctggatgtaca agagagcctctgccacaaacaaagatgtggctatgaagtcattagcatga aggtgagacctctggccagataaagaaaaccagtctccccagtttggctc attggcaggagtctcatgcccaaggacacactacctagagaagaaacagc caggagactcatccaacgacacactacggggaagcctaaatgaggaccat ttcatgtggaggacattttaccttcttcaagtggcctgtagctagaatga ctcagagggacactgtcagaacccaaggactcaagcatctgactttccag actggaggataaacctcatgttcttacaaagtatagggagtgtcttaggt tttacttctgtgaacagacacgatgaccagcaagtcttataaaaacaaaa acaatcaaaccaacaacacccacatttaattgggctagcttacagttcag agctcagtccatttatcatcaagttgagagcattagcagcatccagcagt catgggccagcccgattgagaagtgagaatcctagggcctcatccaggcg tctatgcaagactgactctcagcacctaggggtgagagattaag
quality values	Open. Hide. 61 61 23 39 61 38 29 31 47 47 47 61 61 61 61 61 61 61 61 41 35 61 61 61 28 24 32 18 28 10 13 12 20 13 13 26 26 37 59 59 59 59 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 59 50 36 36 30 35 49 59 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 55 59 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 61 61 59 59 59 59 59 59 35 52 45 39 43 43 59 59 59 59 59 59 59 61 59 52 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 61 59 61 59 61 61 61 59 61 61 61 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 55 55 61 55 55 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 55 61 61 61 61 55 61 55 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 55 50 61 55 55 61 61 61 55 61 50 55 61 53 61 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 47 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 42 53 61 61 52 61 61 47 53 53 46 53 50 42 61 61 47 61 33 61 53 39 42 31 31 32 43 47 39 40 40 42 53 57 53 57 53 53 43 47 57 50 53 32 47 53 53 47 42 38 53 53 53 53 53 50 57 14 14 17 10 11 8 20 57 38 27 30 10 15 20 17 57 53 47 24 47 42 47 38 38 53 53 43 53 52 57 57 53 45 53 57 57 53 34 57 57 18 27 53 38 41 52 47 53 38 28 53 57 53 47 47 50 51 33 45 50 37 53 45 38 28 16 21 19 39 24 30 50 27 51 42 53 34 45 37 41 33 26 43 15 18 52 33 19 23 53 35 46 53 38 27 27 57 57 53 18 22 16 24 19 21 45 53 46 52 31 42 52 41 8 33 43 57 38 40 16 57 11 33 29 50 32 35 57 53 40 42 24 32 38 31 37 37 37 17 27 47 32 42 52 35 24 31 38 22 37 37 20 22 29 31 44 37 37 17 29 14 29 36 28 34 37 37 33 23 42 30 21 31 37 31 30 21 40 29 48 36 34 33 35 16 57 37 37 20 37 29 53 53 53 35 40 48 33 41 43 29 38 34 37 16 30 12 57 57 37 33 25 53 25 32 40 30 34 40 33 29 24 46 29 46 24 51 51 31 47 30 17 47 47 39 28 38 27 26 14 7 15 28 34 30 30 24 29 30 30 21 32 32 51 16 12 25 25 5 39 11 10 31 21 15 22 18 28 29 46 27 45 27 10 18 5 45 45 32 24 28 32 23 29 44 17 10 20 25 14 51 51 51 18 23 15 18 12 23 26 24 28 27 14 23 29 21 22 14 7 14 9 27 29 30 36 15 29 12 26 29 29 14 29 14 27 27 14 10 36 20 28 28 21 28 9 22 31 27 14 18 6 23 9 11 14 23 21 27 46 40 11 29 31 34 21 26 23 27 14 14 16 20 11 23 41 20 22 11 7 19 23 10 21 29 31 28 26 30 24 28 15 28 22 8 10 24 46 51 33 22 41 51 17 4 9 26 22 9 12 14 20 26 21 25 27 31 51 21 19 15 36 18 15 26 28 18 26 12 29 20 9 22 9 8 31 8 11 10 19 10 13 7 12 25 13 10 21 14 13 23 7 20 20 6 8 7 5 5 23 7 17 7 35 30 14 5 9 3 3 5 17 12 8 16 10 23 29 31 23 42 12 10 4 7 8 19 14 8 15 4 16 6 6 10 7 10 15 6 3 3 1 11 10 6 6 23 5 7 5 4 5 9 19 8 30 10 21 5 5 9 22 5 6 7 6 13 10 16 6 4 4 6 7 5 9 7 6 16 6 10 3 3 6 2 2 3 4 2 3 5 5 6 4 14 11 23 7 3 3 4 5 22 10 10 21 13 19 7 12 5 3 3 6 12 20 10 7 12 6 1 4 14 6 3 3 3 3 7 19 27 14 4 16 18 7 13 4 1 3	Open. Hide. 55 61 55 39 61 61 20 26 10 9 12 23 13 18 18 25 55 59 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 49 52 59 39 37 36 37 37 43 59 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 55 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 47 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 61 61 47 61 53 61 61 61 61 61 61 61 61 50 52 61 61 61 61 61 47 61 61 61 61 61 61 57 53 47 57 47 53 57 57 57 47 39 46 52 57 42 47 53 57 53 57 57 47 53 50 53 57 57 57 57 47 38 57 53 41 57 53 45 57 53 53 53 53 53 53 57 47 57 53 57 57 53 57 53 57 53 53 42 53 53 52 53 57 57 52 43 51 45 50 52 28 57 53 57 42 57 32 41 47 52 53 53 53 47 52 50 53 47 41 57 52 45 57 57 52 41 42 53 53 52 43 38 52 50 53 53 57 53 45 53 45 36 48 52 50 50 52 52 40 53 36 33 17 31 27 50 57 35 45 26 43 53 52 50 57 43 34 53 38 38 52 37 42 46 46 31 52 57 57 36 27 52 36 37 38 53 42 42 57 57 50 32 38 42 57 38 38 38 25 53 42 36 50 52 50 39 33 31 28 53 37 23 37 44 44 37 26 27 38 33 57 53 28 25 9 34 34 35 28 45 33 36 42 40 40 38 40 37 37 48 36 40 48 31 53 57 30 33 31 32 27 43 28 34 40 28 21 32 25 40 35 26 48 37 47 26 30 37 34 44 36 24 36 20 35 37 40 40 30 46 46 30 22 45 21 29 45 33 36 51 23 26 34 30 11 44 29 22 47 26 29 51 30 29 24 32 44 35 29 44 48 28 33 29 23 23 29 51 51 43 24 30 46 33 39 29 29 29 33 34 7 9 13 24 27 16 31 28 36 18 28 18 29 33 27 29 27 15 4 12 28 25 33 29 22 9 43 26 36 31 19 15 19 27 34 41 30 34 28 10 28 27 16 26 17 23 29 33 22 28 16 29 28 14 23 27 28 20 33 27 28 31 27 27 34 51 41 27 33 23 12 29 17 25 26 23 36 32 13 26 14 19 41 24 20 24 21 28 22 13 26 9 7 19 17 33 7 7 5 29 29 16 12 20 31 16 25 51 9 22 16 17 22 17 28 28 28 6 12 6 20 51 51 28 18 19 31 26 26 26 30 20 28 26 27 27 15 15 10 8 6 7 14 23 21 34 34 19 23 7 6 7 19 22 12 8 12 17 28 12 9 23 29 29 5 8 26 12 33 34 32 22 19 8 5 3 4 4 12 22 4 11 20 4 4 5 5 4 4 12 28 15 26 5 13 30 42 27 12 19 21 9 23 34 13 16 29 24 23 25 23 15 5 5 6 29 14 13 29 9 6 20 29 10 10 5 5 6 5 16 11 5 23 27 7 11 5 9 8 7 8 10 8 13 5 5 11 12 5 16 11 24 5 7 6 6 4 15 9 7 9 5 5 5 24 7 20 5 4 10 4 14 9 19 20 15 6 4 7 7 5 10 14 20 6 20 5 4 5 8 4 5 3 1 6 8 9 6 6 10 4 4 6 11 3 3 4 2 3 6 14 10 5 5 4 11 4 3 3 3 3 5 17 4 3 2 3 1 3 3 4 9 5 12 9 8 12 13 4 5 15 7 18 7 5 3 11 6 5 13 13 25 5 7 15 5 4 5 5 12 6 4 4 9 4

Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr6_112348720_112350279 seq2: B6Ng01-163L17.b_47_1254 seq1 GAATTCATGGTCTTCTTCCCACCTCATTCTTCTAAATGCTGAGATTAGAG 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCATGGTCTTCTTCCCACCTCATTCTTCTAAATGCTGAGATTAGAG 50 seq1 TCATGAGCCACCATGTCCACCTCTGCACACTCTACAGTACCCTACCAGAA 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCATGAGCCACCATGTCCACCTCTGCACACTCTACAGTACCCTACCAGAA 100 seq1 ATGCACTTCTGATGTATTTAGCTATTCCTCTCTTCATAGATACCCACCTT 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGCACTTCTGATGTATTTAGCTATTCCTCTCTTCATAGATACCCACCTT 150 seq1 GTTTCCTATCATTCCCAATTAGTGTTATGATCATTAATAAACATGAACAT 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTTTCCTATCATTCCCAATTAGTGTTATGATCATTAATAAACATGAACAT 200 seq1 ATATGCTTCAGACAAGTTAGGAACTACTGGCTTATTTTACAAATAGATGC 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATATGCTTCAGACAAGTTAGGAACTACTGGCTTATTTTACAAATAGATGC 250 seq1 TGGTGCCTGGAGATCAGGAGAAAGTATATGAATGCCTAAGTGTGTCAGTG 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGGTGCCTGGAGATCAGGAGAAAGTATATGAATGCCTAAGTGTGTCAGTG 300 seq1 AGCAGACTCCTCAGGGTCACCCCTAAGAGCACAGGGCTGGCAGCAAATGG 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGCAGACTCCTCAGGGTCACCCCTAAGAGCACAGGGCTGGCAGCAAATGG 350 seq1 TTCTGATTCTCAGACCTGCCAGGCTGGTGCACACACCCCTCCCTGCTCTA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTCTGATTCTCAGACCTGCCAGGCTGGTGCACACACCCCTCCCTGCTCTA 400 seq1 TCCTGTTGGAAACACTGGCCTGGAATTAGATACACATCTTCATTGGCACC 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCTGTTGGAAACACTGGCCTGGAATTAGATACACATCTTCATTGGCACC 450 seq1 CCAGGCATGTATGCAGACAGTTTCTAGCAGGCATTGAAGCTTCCAGCTTC 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCAGGCATGTATGCAGACAGTTTCTAGCAGGCATTGAAGCTTCCAGCTTC 500 seq1 TGCAAAGACACCTGCTTACAGCAAGCCAGGCCACCTAATCACTGGGTCTC 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCAAAGACACCTGCTTACAGCAAGCCAGGCCACCTAATCACTGGGTCTC 550 seq1 ATCACCCCTCAGCTTTGGTCCCCAGAAGGTTCTCACTGGATATGAAATAG 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATCACCCCTCAGCTTTGGTCCCCAGAAGGTTCTCACTGGATATGAAATAG 600 seq1 GAGGCCCCCAGCTTTAGTTAATAGGACTGTGCATATACACAGACATAGAC 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGGCCCCCAGCTTTAGTTAATAGGACTGTGCATATACACAGACATAGAC 650 seq1 TATGATTTTACAACTTCATTCTCTTCTATTTCAAGCCTAAGGTGCTGGGG 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATGATTTTACAACTTCATTCTCTTCTATTTCAAGCCTAAGGTGCTGGGG 700 seq1 AATTTCAAGAACACTTCCCTGCACCCCATGTTCTTTC-TTCCTTCCCTAT 749 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATTTCAAGAACACTTCCCTGCACCCCATGTTCTTTCTTTCCTTCCCTAT 750 seq1 GCACCACTGTGGCACCGGGTAAATTGAATTTCAAAAGAATATTATTCCAA 799 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCACCACTGTGGCACCGGGTAAATTGAATTTCAAAAGAATATTATTCCAA 800 seq1 CTAAACATAAAACTGTGCTGCTACAAAACGAGTGCCTGCATTGTTTTGGT 849 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTAAACATAAAACTGTGCTGCTACAAAACGAGTGCCTGCATTGTTTTGGT 850 seq1 TTTTAACAACATGTGCCTCGCTTTAAC-AATGCTCAAGGAAAGAGGGAGT 898 \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTTAAC-ACATGTGCCTCGCTTTAACAAATGCTCAAGGAAAGAGGGAGT 899 seq1 TATCAGGATTTTACAATACTCAGAACATACAGCCC-AAGCAGACTCAGAC 947 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATCAGGATTTTTACATACTCAGAACATACAGCCCAAAGCAGACTCAGAC 949 seq1 CTGAGCTCACAATGGAAAAAGATCAACC-TCTAGGGACAGGTGATCCCCC 996 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTGAGCTCACAAATGGAAAAGATCAACCTTCTAGGGACAGGTGATCCCCC 999 seq1 ATTATCCCCACCCCTTACTGCATTACTTTCTAACCAGC-TGGTCTCCTCA 1045 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| seq2 ATTATCCCCA-CCCATACTGCATTACTTTCT-ACCAGCTTGGTCTTCTTC 1047 seq1 AAAGCAAGATGGCCCG-AGAAGAGGGCTGTCCAAGACTCATTTCTTCCCT 1094 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\| seq2 AAAGCAAGATGGCCCGAAGAAGAGGGCTGTTCAAGACTCATTT-TCTCCT 1096 seq1 ATTCCTATAACACAGGACAAT-GTGACCTTCCAGAGT-CATACTGCAGCC 1142 \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 A-TCCTATTAAAGAGGACAATGGTGACTTTCAGAAGTCCATACTGCAGCC 1145 seq1 TTCCATGGGATGTCTCCTTTGTCACCCT-AACTGGCCTGAACTGGGTCCT 1191 \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| seq2 TTTCA-GGGATGTCTCCTTTGTACCCCTAAACTGG-CTGAACT-GGTC-- 1190 seq1 CTATGTCCCCTAAACCCCAAGACCACAAGGCATTTGTTTTCCTTCCTTTT 1241 \|\|\| \| \|\|\|\|\|\| \|\| seq2 CTAAGGTCCCTAACCCTA-------------------------------- 1208 seq1 ATTTGCCCACTATAATTTCAAAATCCCCAAAGATCAGGAATGGGACCCAG 1291 seq2 -------------------------------------------------- 1208 seq1 GAGCAGTAGACTGTGTGTTCAGACCATGGCGAGGTCCAGTGTCCTCTAGG 1341 seq2 -------------------------------------------------- 1208 seq1 AAACTGGAATGAGGATGTGGAAATGCAGTCAGTTGAATGCTCTGCCAATT 1391 seq2 -------------------------------------------------- 1208 seq1 CTACCCTCATCTTTCAGCAGAAGTAACTAAAAGGCCATTTAGATATAAAC 1441 seq2 -------------------------------------------------- 1208 seq1 TTTAATCCTGGCTCCAGTGATTTCCAACTTCCCCAGACTTCATCTTGCCT 1491 seq2 -------------------------------------------------- 1208 seq1 GCCTGTACAATGAGGCTGAGGCCAGACCAAGGAAAGGAGACCTCTAGAAA 1541 seq2 -------------------------------------------------- 1208 seq1 CTCTCTTTCCCTAACCCTA 1560 seq2 ------------------- 1208	seq1: chr6_112381930_112383144 seq2: B6Ng01-163L17.g_69_1262 (reverse) seq1 CTTAATACTCTCA-CCCTAGTTGCCTGGAAGTCAGTCTTCCACTAGCAGC 49 \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\| seq2 CTTAAT-CTCTCACCCCTAGGTG-CTGAGAGTCAGTCTTGCA-TAGACGC 47 seq1 CTTTGGATGAAGACATAGAATTCTCAACTCTCAACTCGGCTTGCGCCATG 99 \| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| seq2 C--TGGATGAGGCCCTAGGATTCTCACTTCTCAA-TCGGGCTGGCCCATG 94 seq1 CCTGCCTGGATGCTGCT-ATGCTCTCACCTTGATGAT-AATGGACTGAGC 147 \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTG-CTGGATGCTGCTAATGCTCTCAACTTGATGATAAATGGACTGAG- 142 seq1 CTCTGAACCTGTAAGCTAGCCCCAATTAAATGTTGGGTTTTTTTTTTTGT 197 \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \| \|\|\|\| seq2 CTCTGAA-CTGTAAGCTAG-CCCAATTAAATGTGGG--------TGTTGT 182 seq1 TTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTATAAGACTTGCCTTGGTCATCGTGTC 247 \| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGGTTTGATTGTTTTTG--TTTTTATAAGACTTGC--TGGTCATCGTGTC 228 seq1 TGTTCACAGAAGTAAAACCCTAAGACACTCCCTATACTTTGTAAGACCAT 297 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| seq2 TGTTCACAGAAGTAAAA-CCTAAGACACTCCCTATACTTTGTAAGAACAT 277 seq1 GAGGTTTATCCTCCAGTCTGGAAAGTCAGATGCTTGAGTCCTTGGGTTCT 347 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGGTTTATCCTCCAGTCTGGAAAGTCAGATGCTTGAGTCCTTGGGTTCT 327 seq1 GACAGTGTCCCTCTGAGTCCTTCTAGCTACAGGCCACCTTGAAGAAGGTA 397 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GACAGTGTCCCTCTGAGTCATTCTAGCTACAGGCCA-CTTGAAGAAGGTA 376 seq1 AAATGTCCTCCACATGAAATGGTCCTCATTTAGGCTTCCCCGTAGTGTGT 447 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAATGTCCTCCACATGAAATGGTCCTCATTTAGGCTTCCCCGTAGTGTGT 426 seq1 CGTTGGATGAGTCTCCTGGCTGTTTCTTCTCTAGGTAGTGTGTCCTTGGG 497 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CGTTGGATGAGTCTCCTGGCTGTTTCTTCTCTAGGTAGTGTGTCCTTGGG 476 seq1 CATGAGACTCCTGCCAATGAGCCAAACTGGGGAGACTGGTTTTCTTTATC 547 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATGAGACTCCTGCCAATGAGCCAAACTGGGGAGACTGGTTTTCTTTATC 526 seq1 TGGCCAGAGGTCTCACCTTCATGCTAATGACTTCATAGCCACATCTTTGT 597 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGGCCAGAGGTCTCACCTTCATGCTAATGACTTCATAGCCACATCTTTGT 576 seq1 TTGTGGCAGAGGCTCTCTTGTACATCCAGAATGTTCAGCAGTAAGATATT 647 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGTGGCAGAGGCTCTCTTGTACATCCAGAATGTTCAGCAGTAAGATATT 626 seq1 TTGCACAATCCGGATACCAAGAACGACCTCAGGTCCTAGATACAGCCAAA 697 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGCACAATCCGGATACCAAGAACGACCTCAGGTCCTAGATACAGCCAAA 676 seq1 TGTCCCCTGATGCTTCTAGATGACAGTTACCATTTAGATACACAGCTAAT 747 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTCCCCTGATGCTTCTAGATGACAGTTACCATTTAGATACACAGCTAAT 726 seq1 GCCTCATTACTACACTGCCACAAGGAACTTGGCATGGTCTTGGGAGCAGG 797 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCCTCATTACTACACTGCCACAAGGAACTTGGCATGGTCTTGGGAGCAGG 776 seq1 GCTGCCCAGGAATGAATGACCCAAGCCTCCAAGACAGACAGGGCAGGTGG 847 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCTGCCCAGGAATGAATGACCCAAGCCTCCAAGACAGACAGGGCAGGTGG 826 seq1 CAGTGTCCCTGCTGTCAAAATAGAGCATATAGAGGTGACTCAGTGGTCAG 897 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGTGTCCCTGCTGTCAAAATAGAGCATATAGAGGTGACTCAGTGGTCAG 876 seq1 GTCCTAAGATATAGAGGGGTTCTGAGTTTGAGTTCTGGGAAGATTCTGAG 947 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTCCTAAGATATAGAGGGGTTCTGAGTTTGAGTTCTGGGAAGATTCTGAG 926 seq1 ACTACTCCAGAATATGTTGATTGTATGAAAGGTACAAAGAAAATTAGCAT 997 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTACTCCAGAATATGTTGATTGTATGAAAGGTACAAAGAAAATTAGCAT 976 seq1 CAGGGAGGGAATGGATGCAGGAAAAGGACATTGCCAACCATGGGTTATCC 1047 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGGGAGGGAATGGATGCAGGAAAAGGACATTGCCAACCATGGGTTATCC 1026 seq1 TGTCATTGGTTGCTGAAGTCTAGAGTGTAATGCTAATGGAGACGTCAAGG 1097 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTCATTGGTTGCTGAAGTCTAGAGTGTAATGCTAATGGAGACGTCAAGG 1076 seq1 TGACAGCATTAAGCACCACATACTTAGGAGGCAAAGGTATTTACACACCA 1147 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGACAGCATTAAGCACCACATACTTAGGAGGCAAAGGTATTTACACACCA 1126 seq1 ATTCCAATCAGCCAGTGGTTACATGGGGCAATGTCTCCCCAAAGCAGGCT 1197 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTCCAATCAGCCAGTGGTTACATGGGGCAATGTCTCCCCAAAGCAGGCT 1176 seq1 CCAGGGATAAGAGAATTC 1215 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCAGGGATAAGAGAATTC 1194

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr6_112348720_112350279
seq2: B6Ng01-163L17.b_47_1254

seq1  GAATTCATGGTCTTCTTCCCACCTCATTCTTCTAAATGCTGAGATTAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGGTCTTCTTCCCACCTCATTCTTCTAAATGCTGAGATTAGAG  50

seq1  TCATGAGCCACCATGTCCACCTCTGCACACTCTACAGTACCCTACCAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAGCCACCATGTCCACCTCTGCACACTCTACAGTACCCTACCAGAA  100

seq1  ATGCACTTCTGATGTATTTAGCTATTCCTCTCTTCATAGATACCCACCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACTTCTGATGTATTTAGCTATTCCTCTCTTCATAGATACCCACCTT  150

seq1  GTTTCCTATCATTCCCAATTAGTGTTATGATCATTAATAAACATGAACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCTATCATTCCCAATTAGTGTTATGATCATTAATAAACATGAACAT  200

seq1  ATATGCTTCAGACAAGTTAGGAACTACTGGCTTATTTTACAAATAGATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCTTCAGACAAGTTAGGAACTACTGGCTTATTTTACAAATAGATGC  250

seq1  TGGTGCCTGGAGATCAGGAGAAAGTATATGAATGCCTAAGTGTGTCAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCCTGGAGATCAGGAGAAAGTATATGAATGCCTAAGTGTGTCAGTG  300

seq1  AGCAGACTCCTCAGGGTCACCCCTAAGAGCACAGGGCTGGCAGCAAATGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGACTCCTCAGGGTCACCCCTAAGAGCACAGGGCTGGCAGCAAATGG  350

seq1  TTCTGATTCTCAGACCTGCCAGGCTGGTGCACACACCCCTCCCTGCTCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATTCTCAGACCTGCCAGGCTGGTGCACACACCCCTCCCTGCTCTA  400

seq1  TCCTGTTGGAAACACTGGCCTGGAATTAGATACACATCTTCATTGGCACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTTGGAAACACTGGCCTGGAATTAGATACACATCTTCATTGGCACC  450

seq1  CCAGGCATGTATGCAGACAGTTTCTAGCAGGCATTGAAGCTTCCAGCTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCATGTATGCAGACAGTTTCTAGCAGGCATTGAAGCTTCCAGCTTC  500

seq1  TGCAAAGACACCTGCTTACAGCAAGCCAGGCCACCTAATCACTGGGTCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAGACACCTGCTTACAGCAAGCCAGGCCACCTAATCACTGGGTCTC  550

seq1  ATCACCCCTCAGCTTTGGTCCCCAGAAGGTTCTCACTGGATATGAAATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCCCTCAGCTTTGGTCCCCAGAAGGTTCTCACTGGATATGAAATAG  600

seq1  GAGGCCCCCAGCTTTAGTTAATAGGACTGTGCATATACACAGACATAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCCCCAGCTTTAGTTAATAGGACTGTGCATATACACAGACATAGAC  650

seq1  TATGATTTTACAACTTCATTCTCTTCTATTTCAAGCCTAAGGTGCTGGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATTTTACAACTTCATTCTCTTCTATTTCAAGCCTAAGGTGCTGGGG  700

seq1  AATTTCAAGAACACTTCCCTGCACCCCATGTTCTTTC-TTCCTTCCCTAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AATTTCAAGAACACTTCCCTGCACCCCATGTTCTTTCTTTCCTTCCCTAT  750

seq1  GCACCACTGTGGCACCGGGTAAATTGAATTTCAAAAGAATATTATTCCAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCACTGTGGCACCGGGTAAATTGAATTTCAAAAGAATATTATTCCAA  800

seq1  CTAAACATAAAACTGTGCTGCTACAAAACGAGTGCCTGCATTGTTTTGGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACATAAAACTGTGCTGCTACAAAACGAGTGCCTGCATTGTTTTGGT  850

seq1  TTTTAACAACATGTGCCTCGCTTTAAC-AATGCTCAAGGAAAGAGGGAGT  898
      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAC-ACATGTGCCTCGCTTTAACAAATGCTCAAGGAAAGAGGGAGT  899

seq1  TATCAGGATTTTACAATACTCAGAACATACAGCCC-AAGCAGACTCAGAC  947
      ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TATCAGGATTTTTACATACTCAGAACATACAGCCCAAAGCAGACTCAGAC  949

seq1  CTGAGCTCACAATGGAAAAAGATCAACC-TCTAGGGACAGGTGATCCCCC  996
      ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTCACAAATGGAAAAGATCAACCTTCTAGGGACAGGTGATCCCCC  999

seq1  ATTATCCCCACCCCTTACTGCATTACTTTCTAACCAGC-TGGTCTCCTCA  1045
      |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||  
seq2  ATTATCCCCA-CCCATACTGCATTACTTTCT-ACCAGCTTGGTCTTCTTC  1047

seq1  AAAGCAAGATGGCCCG-AGAAGAGGGCTGTCCAAGACTCATTTCTTCCCT  1094
      |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |||
seq2  AAAGCAAGATGGCCCGAAGAAGAGGGCTGTTCAAGACTCATTT-TCTCCT  1096

seq1  ATTCCTATAACACAGGACAAT-GTGACCTTCCAGAGT-CATACTGCAGCC  1142
      | |||||| | | |||||||| ||||| |||   ||| ||||||||||||
seq2  A-TCCTATTAAAGAGGACAATGGTGACTTTCAGAAGTCCATACTGCAGCC  1145

seq1  TTCCATGGGATGTCTCCTTTGTCACCCT-AACTGGCCTGAACTGGGTCCT  1191
      || || ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||  
seq2  TTTCA-GGGATGTCTCCTTTGTACCCCTAAACTGG-CTGAACT-GGTC--  1190

seq1  CTATGTCCCCTAAACCCCAAGACCACAAGGCATTTGTTTTCCTTCCTTTT  1241
      ||| |  |||||| ||                                  
seq2  CTAAGGTCCCTAACCCTA--------------------------------  1208

seq1  ATTTGCCCACTATAATTTCAAAATCCCCAAAGATCAGGAATGGGACCCAG  1291
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  1208

seq1  GAGCAGTAGACTGTGTGTTCAGACCATGGCGAGGTCCAGTGTCCTCTAGG  1341
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  1208

seq1  AAACTGGAATGAGGATGTGGAAATGCAGTCAGTTGAATGCTCTGCCAATT  1391
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  1208

seq1  CTACCCTCATCTTTCAGCAGAAGTAACTAAAAGGCCATTTAGATATAAAC  1441
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  1208

seq1  TTTAATCCTGGCTCCAGTGATTTCCAACTTCCCCAGACTTCATCTTGCCT  1491
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  1208

seq1  GCCTGTACAATGAGGCTGAGGCCAGACCAAGGAAAGGAGACCTCTAGAAA  1541
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  1208

seq1  CTCTCTTTCCCTAACCCTA  1560
                         
seq2  -------------------  1208

seq1: chr6_112381930_112383144
seq2: B6Ng01-163L17.g_69_1262 (reverse)

seq1  CTTAATACTCTCA-CCCTAGTTGCCTGGAAGTCAGTCTTCCACTAGCAGC  49
      |||||| |||||| |||||| || |||  |||||||||| || |||  ||
seq2  CTTAAT-CTCTCACCCCTAGGTG-CTGAGAGTCAGTCTTGCA-TAGACGC  47

seq1  CTTTGGATGAAGACATAGAATTCTCAACTCTCAACTCGGCTTGCGCCATG  99
      |  ||||||| | | ||| |||||||  |||||| ||||  ||  |||||
seq2  C--TGGATGAGGCCCTAGGATTCTCACTTCTCAA-TCGGGCTGGCCCATG  94

seq1  CCTGCCTGGATGCTGCT-ATGCTCTCACCTTGATGAT-AATGGACTGAGC  147
       ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| 
seq2  ACTG-CTGGATGCTGCTAATGCTCTCAACTTGATGATAAATGGACTGAG-  142

seq1  CTCTGAACCTGTAAGCTAGCCCCAATTAAATGTTGGGTTTTTTTTTTTGT  197
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||        | ||||
seq2  CTCTGAA-CTGTAAGCTAG-CCCAATTAAATGTGGG--------TGTTGT  182

seq1  TTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTATAAGACTTGCCTTGGTCATCGTGTC  247
      |  | |  |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||
seq2  TGGTTTGATTGTTTTTG--TTTTTATAAGACTTGC--TGGTCATCGTGTC  228

seq1  TGTTCACAGAAGTAAAACCCTAAGACACTCCCTATACTTTGTAAGACCAT  297
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGTTCACAGAAGTAAAA-CCTAAGACACTCCCTATACTTTGTAAGAACAT  277

seq1  GAGGTTTATCCTCCAGTCTGGAAAGTCAGATGCTTGAGTCCTTGGGTTCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTTATCCTCCAGTCTGGAAAGTCAGATGCTTGAGTCCTTGGGTTCT  327

seq1  GACAGTGTCCCTCTGAGTCCTTCTAGCTACAGGCCACCTTGAAGAAGGTA  397
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GACAGTGTCCCTCTGAGTCATTCTAGCTACAGGCCA-CTTGAAGAAGGTA  376

seq1  AAATGTCCTCCACATGAAATGGTCCTCATTTAGGCTTCCCCGTAGTGTGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCCTCCACATGAAATGGTCCTCATTTAGGCTTCCCCGTAGTGTGT  426

seq1  CGTTGGATGAGTCTCCTGGCTGTTTCTTCTCTAGGTAGTGTGTCCTTGGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTGGATGAGTCTCCTGGCTGTTTCTTCTCTAGGTAGTGTGTCCTTGGG  476

seq1  CATGAGACTCCTGCCAATGAGCCAAACTGGGGAGACTGGTTTTCTTTATC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGACTCCTGCCAATGAGCCAAACTGGGGAGACTGGTTTTCTTTATC  526

seq1  TGGCCAGAGGTCTCACCTTCATGCTAATGACTTCATAGCCACATCTTTGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCAGAGGTCTCACCTTCATGCTAATGACTTCATAGCCACATCTTTGT  576

seq1  TTGTGGCAGAGGCTCTCTTGTACATCCAGAATGTTCAGCAGTAAGATATT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGCAGAGGCTCTCTTGTACATCCAGAATGTTCAGCAGTAAGATATT  626

seq1  TTGCACAATCCGGATACCAAGAACGACCTCAGGTCCTAGATACAGCCAAA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACAATCCGGATACCAAGAACGACCTCAGGTCCTAGATACAGCCAAA  676

seq1  TGTCCCCTGATGCTTCTAGATGACAGTTACCATTTAGATACACAGCTAAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCCTGATGCTTCTAGATGACAGTTACCATTTAGATACACAGCTAAT  726

seq1  GCCTCATTACTACACTGCCACAAGGAACTTGGCATGGTCTTGGGAGCAGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCATTACTACACTGCCACAAGGAACTTGGCATGGTCTTGGGAGCAGG  776

seq1  GCTGCCCAGGAATGAATGACCCAAGCCTCCAAGACAGACAGGGCAGGTGG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCCAGGAATGAATGACCCAAGCCTCCAAGACAGACAGGGCAGGTGG  826

seq1  CAGTGTCCCTGCTGTCAAAATAGAGCATATAGAGGTGACTCAGTGGTCAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTCCCTGCTGTCAAAATAGAGCATATAGAGGTGACTCAGTGGTCAG  876

seq1  GTCCTAAGATATAGAGGGGTTCTGAGTTTGAGTTCTGGGAAGATTCTGAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTAAGATATAGAGGGGTTCTGAGTTTGAGTTCTGGGAAGATTCTGAG  926

seq1  ACTACTCCAGAATATGTTGATTGTATGAAAGGTACAAAGAAAATTAGCAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTCCAGAATATGTTGATTGTATGAAAGGTACAAAGAAAATTAGCAT  976

seq1  CAGGGAGGGAATGGATGCAGGAAAAGGACATTGCCAACCATGGGTTATCC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAGGGAATGGATGCAGGAAAAGGACATTGCCAACCATGGGTTATCC  1026

seq1  TGTCATTGGTTGCTGAAGTCTAGAGTGTAATGCTAATGGAGACGTCAAGG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATTGGTTGCTGAAGTCTAGAGTGTAATGCTAATGGAGACGTCAAGG  1076

seq1  TGACAGCATTAAGCACCACATACTTAGGAGGCAAAGGTATTTACACACCA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGCATTAAGCACCACATACTTAGGAGGCAAAGGTATTTACACACCA  1126

seq1  ATTCCAATCAGCCAGTGGTTACATGGGGCAATGTCTCCCCAAAGCAGGCT  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAATCAGCCAGTGGTTACATGGGGCAATGTCTCCCCAAAGCAGGCT  1176

seq1  CCAGGGATAAGAGAATTC  1215
      ||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGATAAGAGAATTC  1194

BAC Information

Search Parameter

Search Result

BAC

no map image available.

BAC End Information

Alignment Information