BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-185G01
Chromosome6 (Build37)
Map Location 69,456,638 - 69,684,747
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIgk, Igkv13-57-2, Gm1418, Igkv13-57-1, Gm189, Igkv13-56-1, Igkv4-56, Igkv13-55-1, Gm1524, Igkv13-54-1, Igkv4-54, Gm1420, Igkv4-51, Gm1069, Igkv12-49, Igkv5-48
Upstream geneIgkv14-100, Igkv1-99, Igkv12-98, Igkv15-97, Igkv10-96, Igkv2-95-2, Igkv2-95-1, EG434031, EG667550, Igkv2-93-1, Igkv19-93, Gm1408, ENSMUSG00000056850, Igkv4-90, Igkv13-89-1, Igkv12-89, Igkv1-88, Igkv13-87, Gm459, Igkv13-85, Igkv13-84, Igkv4-83, Igkv13-82, Gm460, Igkv13-80-1, Igkv4-80, Gm194, EG628498, Igkv4-78, EG667621, Igkv13-76, Igkv4-75, Igkv13-74-1, LOC236047, Igkv13-73-1, EG628516, Gm1499, Igkv13-71-1, Igkv4-71, Gm1502, EG628541, Gm1419, Igkv12-67, Igkv12-66, Igkv4-65, Igkv13-64, EG628571, Igkv13-62-1, EG636752, Igkv13-61-1, Igkv4-61, EG667683, Igkv4-60, Gm1077
Downstream geneENSMUSG00000029975, Igkv12-46, Igkv5-45, Igkv12-44, Igkv5-43, Igkv12-42, Igkv12-41, Igkv5-40-1, Igkv12-40, Gm1409, Igkv12-38, Gm1410, Igkv18-36, Igkv1-35, Igkv8-34, U29423, ENSMUSG00000053690, Igkv8-31, Igkv8-30, LOC545852, Igkv6-29, Igkv8-28, Igkv8-27, Igkv8-26, LOC667812, Igkv6-25, Igkv8-24, Igkv8-23-1, Igkv6-23, LOC667829, Igkv8-22, Igk-V8-21, EG667840, Igk-V19-20, Igk-V8-19, Igk-V8-18, LOC667863, Igk-V19-17, Igk-V8-16, Igk-V19-15, LOC667872, LOC620497, Igk-V19-14, LOC667889, Igk-V19-13, LOC667902, Igkv3-12-1, Igk-V21-12, Igk-V21-11, Igk-V21-10, Igk-V21-9, Igk-V21-8, Igk-V21-7, Igk-V21-6, Igk-V21-5, Igk-V21-4, Igk-V21-3, Igk-V21-2, Igk-V21-1, Igk-J1, Igk-J2, Igk-J3, Igk-J4, Igk-J5, Igk-C
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-185G01.bB6Ng01-185G01.g
ACCGA010509GA010510
length1,181740
definitionB6Ng01-185G01.b B6Ng01-185G01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,683,583 - 69,684,747)(69,456,638 - 69,457,376)
sequence
gaattcaaaccaatacattggccaccattttgttgcggtaaatctttcaa
acccaaacatgccttggcaatgattctgtgctcctatattgggcaaatgt
atctgtgtaaatctgctctggagtagtttacgtttaagctgctgttatag
aagttatagtgatttttatttatttattttttacattactcttttttgaa
attacatagtttgttttccttactaatgtaatgtcttgcataaacactta
tgcatcacctacatttaggtcctctccagaaccatttcattctccatgtc
ctggtgctggcaagaccctgtccacaagagactgccttagagaaatttct
ctattcatctgcatctgtgtgtggttttgacatatggtggttgtgtaatt
tcctttaattaaatctaaatgcctaaacttgctatttacctccagcatag
atggctcaaggcaccttacaggtacttctctattctcataaaactaatga
ctaaatgtccattttgaaaatccactaactcaacaattttcttcgtaggc
tacatcggggattgctatggtgtagtattatcatctttggcaggtaccag
aacacaagtaggcctagatagcaccaatagctccatctctgaacttgaat
ttgctggtagtcataatttgtattagtcatttatggcaagacataaagct
gtggaagtgattacagactttgttattacacttaggtatacatctatcca
tgtaaaataagaagcaaaccaaagcttgtaaggtctaatacaaaagctaa
catttcgatctcaagcaggataacttgagtacaaccaaactttaaagctt
gagaagtctagcatcccaagttttggcaatccaaacacataccaaatatt
aattccacataaagggctttgtgtattttatgatgcttacataatgaggc
aatttgaattttataatgattgcacatagtgtgaacaagcaacttaattg
cttgacaatgtgagtgtttaataagaattgttttatcaggtattacagag
gtcactattaaacaccaccaaaacactattttagttatattgaaccccac
tggaaatggaatctgggcctttaccaagataaacctggttgaaataaagt
ctctcttgatcaactctccctcagaatctat
gaattcttaactgaggaataccaaatgtttgagaatcaccaaaagaaatg
ttcaacatccttactcaacagggaaatgcaaatcaaaacaaccctgcaat
tccatctcacacaagtcagaatggaaaaaaaaaaaaaaaacaggtgacac
agatgctggtgaggttgtagaaaaagaggaaattcttgttttctaatatt
atgtaattacaactcttgggctggtgatattgactgaatagaaatatgat
tgtgagcatcaacttctgtatttgccaggtattggcagagcctctcagga
gacagctatatcaggctcctgtcagcaagctcttgttcacatctgccata
gtgcctgggtttagtggttgtttatgggatggatcctcaagtggggtagt
ctctggatggttattcctttagtttctgctccaacatttgtctctgtaac
tcattccatggctattttgttctcccttctaagaagtattctgagcttct
ggactatatccacttatcagtgaatacagtacccccagagctccatgggt
ctaaaccaaaaatcaaagaaaacacatggtgggactcatggcgcttgcta
catatgtagctgagtatggcctatttggtcattagtgggagaagagtccc
taggtcttgtgtaggttctatgccccattatagaggactgccagggccag
gaatgggagtgaaagggtttggggagcaggagaagggtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_69683583_69684747
seq2: B6Ng01-185G01.b_40_1220 (reverse)

seq1  ATAGTATTCTGA--GAGATTTGAATCAAGAGAGA--TTATTTC-ACCAGG  45
      |||| |||||||  |||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||
seq2  ATAG-ATTCTGAGGGAGAGTTG-ATCAAGAGAGACTTTATTTCAACCAGG  48

seq1  TTTATCTT-GTAAAG--CCAGA-TCCATTT-CAGTGGGGT--CATATAAC  88
      |||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||   |||||||
seq2  TTTATCTTGGTAAAGGCCCAGATTCCATTTCCAGTGGGGTTCAATATAAC  98

seq1  TAAAATAGTGTTT--GT-GTGTTTAATAGTGA-CTCTGTATTTACCTGAT  134
      |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||  ||||||||
seq2  TAAAATAGTGTTTTGGTGGTGTTTAATAGTGACCTCTGTA-ATACCTGAT  147

seq1  AAAAC-ATCCTTATTAAACACTCACATTGTCAAGC-ATTAAGTTGCTTGT  182
      ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AAAACAATTCTTATTAAACACTCACATTGTCAAGCAATTAAGTTGCTTGT  197

seq1  TCAACACTATGTGCAATCATTATAAAATTCAAATTGCCTCATTATGTAAG  232
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TC-ACACTATGTGCAATCATTATAAAATTCAAATTGCCTCATTATGTAAG  246

seq1  CATCATAAAATACACAAAGCCC-TTATGTGGAATT-ATATTTGGTATGTG  280
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CATCATAAAATACACAAAGCCCTTTATGTGGAATTAATATTTGGTATGTG  296

seq1  TTTGGATTGCCAAAACTTGGGATGCTAGACTTCTCAAGCTTTAAAGTTTG  330
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGATTGCCAAAACTTGGGATGCTAGACTTCTCAAGCTTTAAAGTTTG  346

seq1  GTTGTACTCAAGTTATCCTGCTTGAGATCGAAATGTTAGCTTTTGTATTA  380
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTACTCAAGTTATCCTGCTTGAGATCGAAATGTTAGCTTTTGTATTA  396

seq1  GACCTTACAAGCTTTGGTTTGCTTCTTATTTTACATGGATAGATGTATAC  430
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTACAAGCTTTGGTTTGCTTCTTATTTTACATGGATAGATGTATAC  446

seq1  CTAAGTGTAATAACAAAGTCTGTAATCACTTCCACAGCTTTATGTCTTGC  480
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTGTAATAACAAAGTCTGTAATCACTTCCACAGCTTTATGTCTTGC  496

seq1  CATAAATGACTAATACAAATTATGACTACCAGCAAATTCAAGTTCAGAGA  530
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATGACTAATACAAATTATGACTACCAGCAAATTCAAGTTCAGAGA  546

seq1  TGGAGCTATTGGTGCTATCTAGGCCTACTTGTGTTCTGGTACCTGCCAAA  580
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTATTGGTGCTATCTAGGCCTACTTGTGTTCTGGTACCTGCCAAA  596

seq1  GATGATAATACTACACCATAGCAATCCCCGATGTAGCCTACGAAGAAAAT  630
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATAATACTACACCATAGCAATCCCCGATGTAGCCTACGAAGAAAAT  646

seq1  TGTTGAGTTAGTGGATTTTCAAAATGGACATTTAGTCATTAGTTTTATGA  680
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGAGTTAGTGGATTTTCAAAATGGACATTTAGTCATTAGTTTTATGA  696

seq1  GAATAGAGAAGTACCTGTAAGGTGCCTTGAGCCATCTATGCTGGAGGTAA  730
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGAGAAGTACCTGTAAGGTGCCTTGAGCCATCTATGCTGGAGGTAA  746

seq1  ATAGCAAGTTTAGGCATTTAGATTTAATTAAAGGAAATTACACAACCACC  780
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCAAGTTTAGGCATTTAGATTTAATTAAAGGAAATTACACAACCACC  796

seq1  ATATGTCAAAACCACACACAGATGCAGATGAATAGAGAAATTTCTCTAAG  830
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTCAAAACCACACACAGATGCAGATGAATAGAGAAATTTCTCTAAG  846

seq1  GCAGTCTCTTGTGGACAGGGTCTTGCCAGCACCAGGACATGGAGAATGAA  880
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTCTCTTGTGGACAGGGTCTTGCCAGCACCAGGACATGGAGAATGAA  896

seq1  ATGGTTCTGGAGAGGACCTAAATGTAGGTGATGCATAAGTGTTTATGCAA  930
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTCTGGAGAGGACCTAAATGTAGGTGATGCATAAGTGTTTATGCAA  946

seq1  GACATTACATTAGTAAGGAAAACAAACTATGTAATTTCAAAAAAGAGTAA  980
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTACATTAGTAAGGAAAACAAACTATGTAATTTCAAAAAAGAGTAA  996

seq1  TGTAAAAAATAAATAAATAAAAATCACTATAACTTCTATAACAGCAGCTT  1030
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAAAATAAATAAATAAAAATCACTATAACTTCTATAACAGCAGCTT  1046

seq1  AAACGTAAACTACTCCAGAGCAGATTTACACAGATACATTTGCCCAATAT  1080
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGTAAACTACTCCAGAGCAGATTTACACAGATACATTTGCCCAATAT  1096

seq1  AGGAGCACAGAATCATTGCCAAGGCATGTTTGGGTTTGAAAGATTTACCG  1130
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCACAGAATCATTGCCAAGGCATGTTTGGGTTTGAAAGATTTACCG  1146

seq1  CAACAAAATGGTGGCCAATGTATTGGTTTGAATTC  1165
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAAATGGTGGCCAATGTATTGGTTTGAATTC  1181

seq1: chr6_69456638_69457376
seq2: B6Ng01-185G01.g_67_806

seq1  GAATTCTTAACTGAGGAATACCAAATGTTTGAGAATCACCAAAAGAAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAACTGAGGAATACCAAATGTTTGAGAATCACCAAAAGAAATG  50

seq1  TTCAACATCCTTACTCAACAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACATCCTTACTCAACAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGCAAT  100

seq1  TCCATCTCACACAAGTCAGAATGGAAAAAAAAAAAAAAAACAGGTGACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCTCACACAAGTCAGAATGGAAAAAAAAAAAAAAAACAGGTGACAC  150

seq1  AGATGCTGGTGAGGTTGTAGAAAAAGAGGAAATTCTTGTTTTCTAATATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTGGTGAGGTTGTAGAAAAAGAGGAAATTCTTGTTTTCTAATATT  200

seq1  ATGTAATTACAACTCTTGGGCTGGTGATATTGACTGAATAGAAATATGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATTACAACTCTTGGGCTGGTGATATTGACTGAATAGAAATATGAT  250

seq1  TGTGAGCATCAACTTCTGTATTTGCCAGGTATTGGCAGAGCCTCTCAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCATCAACTTCTGTATTTGCCAGGTATTGGCAGAGCCTCTCAGGA  300

seq1  GACAGCTATATCAGGCTCCTGTCAGCAAGCTCTTGTTCACATCTGCCATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTATATCAGGCTCCTGTCAGCAAGCTCTTGTTCACATCTGCCATA  350

seq1  GTGCCTGGGTTTAGTGGTTGTTTATGGGATGGATCCTCAAGTGGGGTAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGGGTTTAGTGGTTGTTTATGGGATGGATCCTCAAGTGGGGTAGT  400

seq1  CTCTGGATGGTTATTCCTTTAGTTTCTGCTCCAACATTTGTCTCTGTAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGATGGTTATTCCTTTAGTTTCTGCTCCAACATTTGTCTCTGTAAC  450

seq1  TCATTCCATGGCTATTTTGTTCTCCCTTCTAAGAAGTATTCTGAGCTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCCATGGCTATTTTGTTCTCCCTTCTAAGAAGTATTCTGAGCTTCT  500

seq1  GGACTATATCCACTTATCAGTGAATACAGTACCCCCAGAGCTCCATGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTATATCCACTTATCAGTGAATACAGTACCCCCAGAGCTCCATGGGT  550

seq1  CTAAACCAAAAATCAAAGAAAACACATGGTGGGACTCATGGCGCTTGCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACCAAAAATCAAAGAAAACACATGGTGGGACTCATGGCGCTTGCTA  600

seq1  CATATGTAGCTGAGTATGGCCTATTTGGTCATTAGTGGGAGAAGAGTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTAGCTGAGTATGGCCTATTTGGTCATTAGTGGGAGAAGAGTCCC  650

seq1  TAGGTCTTGTGTAGGTTCTATGCCCCATTATAGAGGACTGCCAGGGCCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCTTGTGTAGGTTCTATGCCCCATTATAGAGGACTGCCAGGGCCAG  700

seq1  GAATGGGAGTGAAAGGG-TTGGGGAGCAGGAGAAGGGGGT  739
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  GAATGGGAGTGAAAGGGTTTGGGGAGCAGGAGAAGGGTGT  740