BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-194A14
Chromosome6 (Build37)
Map Location 121,276,069 - 121,434,673
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc6a13, Slc6a12, Iqsec3
Upstream geneCcdc77, Jarid1a, Il17ra, Cecr6, Cecr5, 1700072O05Rik, Cecr2, Slc25a18, Atp6v1e1, Bcl2l13, Bid, Mical3, LOC100043793, Minpp1-ps, Pex26, Tuba8, Usp18
Downstream geneLOC100043486, A2m, EG640530, Mug1, Mug4, Mug2, Mug-ps1, Klrg1, LOC625931, M6pr, Phc1, 1700063H04Rik, LOC677375, 4933426K21Rik, EG667035
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-194A14.bB6Ng01-194A14.g
ACCGA016839GA016840
length184938
definitionB6Ng01-194A14.b B6Ng01-194A14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(121,434,490 - 121,434,673)(121,276,069 - 121,276,995)
sequence
cttaggccaagaggaggcttatcttgattccaccacacatagctatgcag
acagaggtcgggtcaattaacttgggttctctgtccaacctggagctcca
gctaaaagcttccccaaacatacttaatgccactccacagatgcccttcc
aagatcagcactagaaaggggggggggggttata
gaattccagtgcgcaccttacttcctcactctctccttgtctctcctggg
cccggggccaggtggtctacttcacagccactttcccttacctcatgctg
gtggtcctgttgattcgaggagtgacactgcccggagcagcccaaggaat
tcagttttacctgtaccccaacatcacacgtctgtgggatccccaggtga
gaagctgcccaaagtagggctctgggggtgtttgagctatatggagtatc
ccggatcttggatggtccccaatgcatctgtggtggtagtggtctgtgtg
gtgggggcggaagtgttccgttctgcagatatgggtcagcagttgtttat
ggtcatagggagcctgccactgctctttcttggtctaccgctgccccagg
gaacccagagacttgtgaccctggcaataacccatcggggctaaacgtct
gtcttaacgtcttaacggagctgtgcccctctcctctcctcattctcaaa
tccagtgcttccctctgagcttcctcccttgtttctccccctctcagcct
gccactcccttttgccctgtggtgccccttctctggcccagtgacctgac
cctctagcctctgcttcctgctcctcccctagcagttgggctggtgttcc
tgtcagttgtctcttttccttcaggccccctcttttcggtctaccctgca
gcttcagtgtgtacagggaggagtgctggagggtggtgttaacttttcca
gagcagcacagagcagaccgattgtaaagctcttgcttctggccaagtgt
ctgcttggcagccgccttgaaggtacgggtcaagtggctctggcacggga
ggagactgctcatcattactgcccacgccttccttggctcagaggagaga
ctgtgtattagttcagtgataccccttgtgtttgtggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_121434490_121434673
seq2: B6Ng01-194A14.b_48_231 (reverse)

seq1  TATAACCCCCCCCCCCCTTTCTAGTGCTGATCTTGGAAGGGCATCTGTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACCCCCCCCCCCCTTTCTAGTGCTGATCTTGGAAGGGCATCTGTGG  50

seq1  AGTGGCATTAAGTATGTTTGGGGAAGCTTTTAGCTGGAGCTCCAGGTTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCATTAAGTATGTTTGGGGAAGCTTTTAGCTGGAGCTCCAGGTTGG  100

seq1  ACAGAGAACCCAAGTTAATTGACCCGACCTCTGTCTGCATAGCTATGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGAACCCAAGTTAATTGACCCGACCTCTGTCTGCATAGCTATGTGT  150

seq1  GGTGGAATCAAGATAAGCCTCCTCTTGGCCTAAG  184
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAATCAAGATAAGCCTCCTCTTGGCCTAAG  184

seq1: chr6_121276069_121276995
seq2: B6Ng01-194A14.g_65_1002

seq1  GAATTCCAGTGCGCACCTTACTTCCTCACTCTCTCCTTGTCTCTCCTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTGCGCACCTTACTTCCTCACTCTCTCCTTGTCTCTCCTGGG  50

seq1  CCCGGGGCCAGGTGGTCTACTTCACAGCCACTTTCCCTTACCTCATGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGGGGCCAGGTGGTCTACTTCACAGCCACTTTCCCTTACCTCATGCTG  100

seq1  GTGGTCCTGTTGATTCGAGGAGTGACACTGCCCGGAGCAGCCCAAGGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCCTGTTGATTCGAGGAGTGACACTGCCCGGAGCAGCCCAAGGAAT  150

seq1  TCAGTTTTACCTGTACCCCAACATCACACGTCTGTGGGATCCCCAGGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTTTACCTGTACCCCAACATCACACGTCTGTGGGATCCCCAGGTGA  200

seq1  GAAGCTGCCCAAAGTAGGGCTCTGGGGGTGTTTGAGCTATATGGAGTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGCCCAAAGTAGGGCTCTGGGGGTGTTTGAGCTATATGGAGTATC  250

seq1  CCGGATCTTGGATGGTCCCCAATGCATCTGTGGTGGTAGTGGTCTGTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGATCTTGGATGGTCCCCAATGCATCTGTGGTGGTAGTGGTCTGTGTG  300

seq1  GTGGGGGCGGAAGTGTTCCGTTCTGCAGATATGGGTCAGCAGTTGTTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGGCGGAAGTGTTCCGTTCTGCAGATATGGGTCAGCAGTTGTTTAT  350

seq1  GGTCATAGGGAGCCTGCCACTGCTCTTTCTTGGTCTACCGCTGCCCCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATAGGGAGCCTGCCACTGCTCTTTCTTGGTCTACCGCTGCCCCAGG  400

seq1  GAACCCAGAGACTTGTGACCCTGGCAATAACCCATCGGGGCTAAACGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCAGAGACTTGTGACCCTGGCAATAACCCATCGGGGCTAAACGTCT  450

seq1  GTCTTAACGTCTTAACGGAGCTGTGCCCCTCTCCTCTCCTCATTCTCAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTAACGTCTTAACGGAGCTGTGCCCCTCTCCTCTCCTCATTCTCAAA  500

seq1  TCCAGTGCTTCCCTCTGAGCTTCCTCCCTTGTTTCTCCCCCTCTCAGCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTGCTTCCCTCTGAGCTTCCTCCCTTGTTTCTCCCCCTCTCAGCCT  550

seq1  GCCACTCCCTTTTGCCCTGTGGTGCCCCTTCTCTGGCCCAGTGACCTGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACTCCCTTTTGCCCTGTGGTGCCCCTTCTCTGGCCCAGTGACCTGAC  600

seq1  CCTCTAGCCTCTGCTTCCTGCTCCTCCCCTAGCAGTTGGGCTGGTGTTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTAGCCTCTGCTTCCTGCTCCTCCCCTAGCAGTTGGGCTGGTGTTCC  650

seq1  TGTCAGTTGTCTCTTTTCCTTCAGGCCCCCTCTTTTCGGTCTACCCTGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGTTGTCTCTTTTCCTTCAGGCCCCCTCTTTTCGGTCTACCCTGCA  700

seq1  GCTTCAGTGTGTACAGGGAGGAGTGCTGGAGGGTGGTGTTAAC-TTTCCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GCTTCAGTGTGTACAGGGAGGAGTGCTGGAGGGTGGTGTTAACTTTTCCA  750

seq1  GAGCAGCACAGAGCAGACCGATTGTAAAGCTCTTGCTTCTGG-CAAGTGT  798
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GAGCAGCACAGAGCAGACCGATTGTAAAGCTCTTGCTTCTGGCCAAGTGT  800

seq1  CTGCTTGGCAGCCGCCTTGAAGG-AC-GGTCAAGTGGC-CTGGCAC-GGA  844
      ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||
seq2  CTGCTTGGCAGCCGCCTTGAAGGTACGGGTCAAGTGGCTCTGGCACGGGA  850

seq1  GGAGACTGCTCA-CA-TACTGCCCACG-CTTCCTTGGCTCAGAGGAGAGA  891
      |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACTGCTCATCATTACTGCCCACGCCTTCCTTGGCTCAGAGGAGAGA  900

seq1  CTGTGTATTAG-TCAGTGATACCCCTTG-GTTTGGGGG  927
      ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||
seq2  CTGTGTATTAGTTCAGTGATACCCCTTGTGTTTGTGGG  938