BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-211B11
Chromosome6 (Build37)
Map Location 37,296,966 - 37,386,314
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCreb3l2
Upstream gene9330158H04Rik, Chrm2, EG620863, LOC100039370, Ptn, LOC100039514, Dgki, EG665024
Downstream geneAkr1d1, LOC665046, Ybx1-ps2, LOC100039636, LOC665102, Trim24, Svopl, Atp6v0a4, LOC100039657, D630002J15Rik, D630045J12Rik, LOC665125, Zc3hav1l, Zc3hav1, Rpl30-ps1, Ttc26, D130059P03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-211B11.bB6Ng01-211B11.g
ACCGA029261GA029262
length1,1221,155
definitionB6Ng01-211B11.b B6Ng01-211B11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,385,192 - 37,386,314)(37,296,966 - 37,298,132)
sequence
gaattcactggtctggggacaaccagaatttagggttcagaatttagcat
ttgaataaatagcagcaccactccaacccccaacagtgtaggattgaaaa
cattggcttagattaatcatttagggatgaaagagataccagagaccagg
tgtgattgttggtataatagtctgtcaaaagttttgtttgattaacaaag
gtgtgccccccccccccctgtctctcaaaggtgggacagcaactagaaaa
atgttttaaatggataattattagccacgcatgagaacaaaagaacaagc
ccggaatctatgccacttgcaaagtctaaggattgtttaggtgtgctgtg
agtatccaaggagggaccgttagaatggtaggaaaaaaaaaatcatggaa
tacttacaacgcttgattatggagctagggttagagatgtatagggaggg
agtgtcctggctcactgcctgggacatgcagaattaactacattatccag
acttccagcatcagagtccagtactggggctaggggtatctagcagggcc
agtgatcttgctcaccatggaaggcaagaaggcaagagtgactccttccg
ttccaaggccacagcaggctgagagctgaaggccgttttcaaagctgttt
tcctacttgcatgggactgttgaaatattgacgaggcagcgtgtatctct
ccacaacaaggacttcccgccacagcctggctctctgctgacttgtgtgg
ggaatggccctgaggccttgctggtcatttgctggggttgagcctatggc
tgtagggccccagtgaatgcctgtttcctgcctggagaattaagaggaaa
tgacaagacctgtcattaccatcgttgagttaacccttgaaccaatccct
ccctgctctctggatgttcaacaagctcttccacataaaagtccaagtga
ccttgtttttcccctggggtgaattatataggctctggcatacattagtg
ggttttattatgaaagatctgagaatccagttcgaaaaggagttgccccc
tcgaagacagactacttgagtcagaacatgactcaagttttctgtaccct
cctgatgctaggtcagcaggaa
gaattccaagggcctaggtaccagcacagagcgagagctctggggagacc
gcatccttatggtcttgatgactattcagcccatggagaaggtgtggcta
gagaaggggaaagcgaccgtcaagtggctgaattccagtcccctttctac
tttcaattacttttatgactttaacctcaccggatctcatattgattagc
aggagaacaacaagatctctaagatgcactttaagaccaagttcctaaga
gtctaaaaatcagagcaagaggagaaagactgcatcccacagccttttag
aggcagagcaaaacaagtggtaaatgttacaaacaccttcctggaacggg
cagggtggtagatgtgcatcatttaggcaaagtggccatggggatgaaga
acaggatgtctcaggagtgagacaagggcgggccttcctgagaaggcttg
cgggcgtcctgagagcttgcatcccgagtggtcagtgatcgtcctgagcg
gcagaggggtttgcagcagtactgctaggaatgaatactgttgccgattg
tgcttaggagggagggtcccctgggacaccctctcacttgcatctgactt
gattgcatgcaattagtggatcatcatagtgatcttagtcacgaggtaca
ttccttccaagtgtctgtcagctctggagcaagagggaacagggctctct
gccctgcctggctggccccatccggagtcttgaggtcagaagcaaggatt
cctttcctctagaaaccaataacatgccaggagtctcttgctgaatttag
tgcaaacgagtccagactggtactcctcatctgggtatcttagccaggag
gggcgttgctctcctcaagtgatgaatgccacacacattgtgtcacatta
tctgcaggtccctctacatctcacaccacgtcttgcaatcctggtcccta
tccacatttgtcatctgtttgactttctgtcaagctgcctccaaagacat
ggtcagagaagcatcaacagtagcacaacacagcttgtgtgtccttttgg
tctaggcctgtgctagtcaaacacatgttgatgtgacattggccaaggtt
ccccgccaactgctcctgcagcttggtctgggaccgggttaaatatgttt
acacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_37385192_37386314
seq2: B6Ng01-211B11.b_51_1172 (reverse)

seq1  TTCCTGCTTGACCTTAGCAAACAGGAGGGTACAGAAAAACTGAAGGCATG  50
      ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||  || ||||
seq2  TTCCTGC-TGACC-TAGC-ATCAGGAGGGTACAG-AAAACTTGAGTCATG  46

seq1  -TCTGACCTCAAGAAGTCTGTCTTCGAGGGGGCAAACTCCTTTACGACTC  99
       ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   
seq2  TTCTGA-CTCAAGTAGTCTGTCTTCGAGGGGGC-AACTCCTTTTCGAACT  94

seq1  GAATTCTCAGATTCTTCAT-ATAAAACCCACT-ATGTATGCCAGAG-CTA  146
      | ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||
seq2  GGATTCTCAGATCTTTCATAATAAAACCCACTAATGTATGCCAGAGCCTA  144

seq1  TATAATTCCACCCAGGGGAAAAACAAGGTCACTTGGAACTTTTATGTGGA  196
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TATAATTCACCCCAGGGGAAAAACAAGGTCACTTGG-ACTTTTATGTGGA  193

seq1  AGAGC-TGGTGAACATCCAGAGAGCAGGGAGGGATTGGTTCAA-GGTTAA  244
      ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGAGCTTGTTGAACATCCAGAGAGCAGGGAGGGATTGGTTCAAGGGTTAA  243

seq1  CTCAACGATGGTAATGACAGGTCTTGTCATTTCCTCTTAATTCTCCAGGC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACGATGGTAATGACAGGTCTTGTCATTTCCTCTTAATTCTCCAGGC  293

seq1  AGGAAACAGGCATTCACTGGGGCCCTACAGCCATAGGCTCAACCCCAGCA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAACAGGCATTCACTGGGGCCCTACAGCCATAGGCTCAACCCCAGCA  343

seq1  AATGACCAGCAAGGCCTCAGGGCCATTCCCCACACAAGTCAGCAGAGAGC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACCAGCAAGGCCTCAGGGCCATTCCCCACACAAGTCAGCAGAGAGC  393

seq1  CAGGCTGTGGCGGGAAGTCCTTGTTGTGGAGAGATACACGCTGCCTCGTC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGTGGCGGGAAGTCCTTGTTGTGGAGAGATACACGCTGCCTCGTC  443

seq1  AATATTTCAACAGTCCCATGCAAGTAGGAAAACAGCTTTGAAAACGGCCT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTCAACAGTCCCATGCAAGTAGGAAAACAGCTTTGAAAACGGCCT  493

seq1  TCAGCTCTCAGCCTGCTGTGGCCTTGGAACGGAAGGAGTCACTCTTGCCT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTCTCAGCCTGCTGTGGCCTTGGAACGGAAGGAGTCACTCTTGCCT  543

seq1  TCTTGCCTTCCATGGTGAGCAAGATCACTGGCCCTGCTAGATACCCCTAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCCTTCCATGGTGAGCAAGATCACTGGCCCTGCTAGATACCCCTAG  593

seq1  CCCCAGTACTGGACTCTGATGCTGGAAGTCTGGATAATGTAGTTAATTCT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGTACTGGACTCTGATGCTGGAAGTCTGGATAATGTAGTTAATTCT  643

seq1  GCATGTCCCAGGCAGTGAGCCAGGACACTCCCTCCCTATACATCTCTAAC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTCCCAGGCAGTGAGCCAGGACACTCCCTCCCTATACATCTCTAAC  693

seq1  CCTAGCTCCATAATCAAGCGTTGTAAGTATTCCATGATTTTTTTTTTCCT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGCTCCATAATCAAGCGTTGTAAGTATTCCATGATTTTTTTTTTCCT  743

seq1  ACCATTCTAACGGTCCCTCCTTGGATACTCACAGCACACCTAAACAATCC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTCTAACGGTCCCTCCTTGGATACTCACAGCACACCTAAACAATCC  793

seq1  TTAGACTTTGCAAGTGGCATAGATTCCGGGCTTGTTCTTTTGTTCTCATG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACTTTGCAAGTGGCATAGATTCCGGGCTTGTTCTTTTGTTCTCATG  843

seq1  CGTGGCTAATAATTATCCATTTAAAACATTTTTCTAGTTGCTGTCCCACC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGCTAATAATTATCCATTTAAAACATTTTTCTAGTTGCTGTCCCACC  893

seq1  TTTGAGAGACAGGGGGGGGGGGGGCACACCTTTGTTAATCAAACAAAACT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGAGACAGGGGGGGGGGGGGCACACCTTTGTTAATCAAACAAAACT  943

seq1  TTTGACAGACTATTATACCAACAATCACACCTGGTCTCTGGTATCTCTTT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACAGACTATTATACCAACAATCACACCTGGTCTCTGGTATCTCTTT  993

seq1  CATCCCTAAATGATTAATCTAAGCCAATGTTTTCAATCCTACACTGTTGG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCTAAATGATTAATCTAAGCCAATGTTTTCAATCCTACACTGTTGG  1043

seq1  GGGTTGGAGTGGTGCTGCTATTTATTCAAATGCTAAATTCTGAACCCTAA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGGAGTGGTGCTGCTATTTATTCAAATGCTAAATTCTGAACCCTAA  1093

seq1  ATTCTGGTTGTCCCCAGACCAGTGAATTC  1123
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGGTTGTCCCCAGACCAGTGAATTC  1122

seq1: chr6_37296966_37298132
seq2: B6Ng01-211B11.g_67_1221

seq1  GAATTCCAAGGGCCTAGGTACCAGCACAGAGCGAGAGCTCTGGGGAGACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGGGCCTAGGTACCAGCACAGAGCGAGAGCTCTGGGGAGACC  50

seq1  GCATCCTTATGGTCTTGATGACTATTCAGCCCATGGAGAAGGTGTGGCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCTTATGGTCTTGATGACTATTCAGCCCATGGAGAAGGTGTGGCTA  100

seq1  GAGAAGGGGAAAGCGACCGTCAAGTGGCTGAATTCCAGTCCCCTTTCTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGGGGAAAGCGACCGTCAAGTGGCTGAATTCCAGTCCCCTTTCTAC  150

seq1  TTTCAATTACTTTTATGACTTTAACCTCACCGGATCTCATATTGATTAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAATTACTTTTATGACTTTAACCTCACCGGATCTCATATTGATTAGC  200

seq1  AGGAGAACAACAAGATCTCTAAGATGCACTTTAAGACCAAGTTCCTAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAACAACAAGATCTCTAAGATGCACTTTAAGACCAAGTTCCTAAGA  250

seq1  GTCTAAAAATCAGAGCAAGAGGAGAAAGACTGCATCCCACAGCCTTTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAAAAATCAGAGCAAGAGGAGAAAGACTGCATCCCACAGCCTTTTAG  300

seq1  AGGCAGAGCAAAACAAGTGGTAAATGTTACAAACACCTTCCTGGAACGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGAGCAAAACAAGTGGTAAATGTTACAAACACCTTCCTGGAACGGG  350

seq1  CAGGGTGGTAGATGTGCATCATTTAGGCAAAGTGGCCATGGGGATGAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTGGTAGATGTGCATCATTTAGGCAAAGTGGCCATGGGGATGAAGA  400

seq1  ACAGGATGTCTCAGGAGTGAGACAAGGGCGGGCCTTCCTGAGAAGGCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGATGTCTCAGGAGTGAGACAAGGGCGGGCCTTCCTGAGAAGGCTTG  450

seq1  CGGGCGTCCTGAGAGCTTGCATCCCGAGTGGTCAGTGATCGTCCTGAGCG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGCGTCCTGAGAGCTTGCATCCCGAGTGGTCAGTGATCGTCCTGAGCG  500

seq1  GCAGAGGGGTTTGCAGCAGTACTGCTAGGAATGAATACTGTTGCCGATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGGGTTTGCAGCAGTACTGCTAGGAATGAATACTGTTGCCGATTG  550

seq1  TGCTTAGGAGGGAGGGTCCCCTGGGACACCCTCTCACTTGCATCTGACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAGGAGGGAGGGTCCCCTGGGACACCCTCTCACTTGCATCTGACTT  600

seq1  GATTGCATGCAATTAGTGGATCATCATAGTGATCTTAGTCACGAGGTACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGCATGCAATTAGTGGATCATCATAGTGATCTTAGTCACGAGGTACA  650

seq1  TTCCTTCCAAGTGTCTGTCAGCTCTGGAGCAAGAGGGAACAGGGCTCTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTCCAAGTGTCTGTCAGCTCTGGAGCAAGAGGGAACAGGGCTCTCT  700

seq1  GCCCTGCCTGGCTGGCCCCATCCGGAGTCTTGAGGTCAGAAGCAAGGATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGCCTGGCTGGCCCCATCCGGAGTCTTGAGGTCAGAAGCAAGGATT  750

seq1  CCTTTCCTCTAGAAACCAATAACATGCCAGGAGTCTCTTGCTGAATTTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCTCTAGAAACCAATAACATGCCAGGAGTCTCTTGCTGAATTTAG  800

seq1  TGCAAACGAGTCCAGACTGGTACTCCTCATCTGGGTATCTTAGCCAGGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAACGAGTCCAGACTGGTACTCCTCATCTGGGTATCTTAGCCAGGAG  850

seq1  GGGCGTTGCTCTCCTCAAGTGATGAATG-CACACACATTGTGTCACATTA  899
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGGCGTTGCTCTCCTCAAGTGATGAATGCCACACACATTGTGTCACATTA  900

seq1  TCTGCAGGTCCCTCTACATCTCACACCCACGTCTTGCAATCCTGGTCCCT  949
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGGTCCCTCTACATCTCACA-CCACGTCTTGCAATCCTGGTCCCT  949

seq1  ATCCACATTTGTCATCTGTTTTGAC-TTCTGTCCAGCTGCCTCCAAAGGA  998
      |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||
seq2  ATCCACATTTGTCATCTG-TTTGACTTTCTGTCAAGCTGCCTCCAAA-GA  997

seq1  CAATGGTCAGAGAAGCATCAACAGTAGCACAAACACAGC-TGTGTGTCCC  1047
      | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| 
seq2  C-ATGGTCAGAGAAGCATCAACAGTAGCAC-AACACAGCTTGTGTGTCCT  1045

seq1  TTTGGTCTAGGCCTGTGCTAAGTTCAAACACCATG-TGATGTGACCATTG  1096
      ||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||| |||||
seq2  TTTGGTCTAGGCCTGTGCTA--GTCAAACA-CATGTTGATGTGA-CATTG  1091

seq1  CCCAGAAGTTTCCCCCGCCACCTGCTTCTCTGCAGCTGGTGCTGGGGACC  1146
       ||  ||| || |||||||| |||||   |||||||| |  || ||||||
seq2  GCC--AAGGTT-CCCCGCCAACTGCT--CCTGCAGCTTGGTCT-GGGACC  1135

seq1  GGGGTTAATAATGTTTACACC  1167
       |||||||  |||||||||||
seq2  -GGGTTAAATATGTTTACACC  1155