BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-226F23
Chromosome6 (Build37)
Map Location 110,587,717 - 110,727,569
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGrm7
Upstream genenone
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-226F23.bB6Ng01-226F23.g
ACCGA040332GA040333
length1,0101,072
definitionB6Ng01-226F23.b B6Ng01-226F23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(110,726,560 - 110,727,569)(110,587,717 - 110,588,788)
sequence
gaattcagtccatccaattattcctgacagggaaactgcatagaacattc
tgtttattattgctttaatatactacatttaaagaataaggagaactttt
tacatagaagcaggcagtggcatcagtggattctgtcactattatagtcc
gatagtgcctttgcaatcgctatagtagcaataactcaacacacagcaca
aaattacaaattttagattaagccgtgtgatgttcagtggtaattattaa
ctaggccaaacctagaattaccaaggagatatgtgtgtcagagattattt
tgaagactttaataaatagatgaagatccatctaattttttattttgtga
ggacacacattgtctgggcaaagggccctggactatgaaatcaagagaga
gtgtgttttcctactaccatgcattcattactctcttctgactgaggagt
aatataaccagacacttcaagctctttttttttttttttgactttcctac
catgaaggaccacacctagaactgtgaatccttcctcgtgggagttgttt
ctatcaaagtcttgtatcaaagcaacaggtaagtaaagaaagataaagta
tactggcaaacatgggcaggcctgacaattcagttttcttcattggtact
agagtgagcagaagtctcagctgtacatcatcaacatctaaaggttaaca
ccattacctcaaattttaaatcactacacctcagtcatttgttgcttgtg
ttcattacaaatatttataacttagtaccttattattggcttttgcagtt
tcaatagcctcaacagttggtaggaaagttcccaagatacaagaggtttt
caattctatcctttcatttatatatttaatagctcgctctctctctctct
ctctctctctctctctctctcatgtgtgtctctttctcttcatgtgtgtg
tgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatgtgtgtgtgtaagtgtggctgtc
atgttcatgt
gaattcccatccacggccaatttaagaagtcattgaagagatttgggaaa
tagggtagaatatgagtgcttccaggatggcttgactggaaaggaagaga
aaatcttttgcttgacaagtaaaaagtccatcatgctgctctcttatttg
taggacataaaaccattccaggaagtttggtaacatagagcaggtcaaga
ccaggagactcagtgggcacacacctgaggcttaaccatcttccagcttc
ctgcaaaactcctgacttggaacacttgccatgcttctcacatcaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaatgtgtcctaggttacattggcccagaacaggctcc
atgaggtacctagaggccaggagggcttagccaataagcttcccttctca
aacatttcttcccacaaaaagtatttaatctcagacccaccctgagaagt
ggggtatggttttatgcatccattttcggacacaacaataacctgtttaa
aaccatggactatctcttttcaccaagagccactgtggggcaccatggag
aacgccttcacctacagaggtttaacctactctcctgccaaaggcctctc
cgaccagctcaagctttctcatgtctcaggctgtgcttttccatcctcag
agtggtgcctcaactcttccctacaactcagaacccactcaggtagtgta
gggtaagctcagtcaaagtgcccccatgcagactccagccaacatctcta
tacttactcacatctatggaagggatacatgtttaaggtcaataaaatat
ggtatggaagagaggtctagcattatgcaatgaatcctcttcattactat
gattttctctaaattagcctcatgctcttacccaaagggccagtgagtaa
tgttctctctctctagtaaagggagaaatggggttgggatcactgagatc
aggatgaacaaagcacattggacacagtcaaccttaacacaaatatacta
atatagtatttgtatgctgaaataatttttaaaatatagttaattacttt
caccttttctgtaatatgagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_110726560_110727569
seq2: B6Ng01-226F23.b_46_1055 (reverse)

seq1  ACATGCACATAGACA-CCACACATACACACACACATGCACACACACACAC  49
      ||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAACAT-GACAGCCACACTTACACACACACATGCACACACACACAC  49

seq1  ACACACATGCACACACACATGAAGAGAAAGAGACACACATGAGAGAGAGA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACATGCACACACACATGAAGAGAAAGAGACACACATGAGAGAGAGA  99

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCTATTAAATATATAAATGAAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCTATTAAATATATAAATGAAA  149

seq1  GGATAGAATTGAAAACCTCTTGTATCTTGGGAACTTTCCTACCAACTGTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAGAATTGAAAACCTCTTGTATCTTGGGAACTTTCCTACCAACTGTT  199

seq1  GAGGCTATTGAAACTGCAAAAGCCAATAATAAGGTACTAAGTTATAAATA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTATTGAAACTGCAAAAGCCAATAATAAGGTACTAAGTTATAAATA  249

seq1  TTTGTAATGAACACAAGCAACAAATGACTGAGGTGTAGTGATTTAAAATT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAATGAACACAAGCAACAAATGACTGAGGTGTAGTGATTTAAAATT  299

seq1  TGAGGTAATGGTGTTAACCTTTAGATGTTGATGATGTACAGCTGAGACTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTAATGGTGTTAACCTTTAGATGTTGATGATGTACAGCTGAGACTT  349

seq1  CTGCTCACTCTAGTACCAATGAAGAAAACTGAATTGTCAGGCCTGCCCAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCACTCTAGTACCAATGAAGAAAACTGAATTGTCAGGCCTGCCCAT  399

seq1  GTTTGCCAGTATACTTTATCTTTCTTTACTTACCTGTTGCTTTGATACAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCCAGTATACTTTATCTTTCTTTACTTACCTGTTGCTTTGATACAA  449

seq1  GACTTTGATAGAAACAACTCCCACGAGGAAGGATTCACAGTTCTAGGTGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTGATAGAAACAACTCCCACGAGGAAGGATTCACAGTTCTAGGTGT  499

seq1  GGTCCTTCATGGTAGGAAAGTCAAAAAAAAAAAAAAAGAGCTTGAAGTGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTTCATGGTAGGAAAGTCAAAAAAAAAAAAAAAGAGCTTGAAGTGT  549

seq1  CTGGTTATATTACTCCTCAGTCAGAAGAGAGTAATGAATGCATGGTAGTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTATATTACTCCTCAGTCAGAAGAGAGTAATGAATGCATGGTAGTA  599

seq1  GGAAAACACACTCTCTCTTGATTTCATAGTCCAGGGCCCTTTGCCCAGAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAACACACTCTCTCTTGATTTCATAGTCCAGGGCCCTTTGCCCAGAC  649

seq1  AATGTGTGTCCTCACAAAATAAAAAATTAGATGGATCTTCATCTATTTAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTGTCCTCACAAAATAAAAAATTAGATGGATCTTCATCTATTTAT  699

seq1  TAAAGTCTTCAAAATAATCTCTGACACACATATCTCCTTGGTAATTCTAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTCTTCAAAATAATCTCTGACACACATATCTCCTTGGTAATTCTAG  749

seq1  GTTTGGCCTAGTTAATAATTACCACTGAACATCACACGGCTTAATCTAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGCCTAGTTAATAATTACCACTGAACATCACACGGCTTAATCTAAA  799

seq1  ATTTGTAATTTTGTGCTGTGTGTTGAGTTATTGCTACTATAGCGATTGCA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTAATTTTGTGCTGTGTGTTGAGTTATTGCTACTATAGCGATTGCA  849

seq1  AAGGCACTATCGGACTATAATAGTGACAGAATCCACTGATGCCACTGCCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCACTATCGGACTATAATAGTGACAGAATCCACTGATGCCACTGCCT  899

seq1  GCTTCTATGTAAAAAGTTCTCCTTATTCTTTAAATGTAGTATATTAAAGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTATGTAAAAAGTTCTCCTTATTCTTTAAATGTAGTATATTAAAGC  949

seq1  AATAATAAACAGAATGTTCTATGCAGTTTCCCTGTCAGGAATAATTGGAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATAAACAGAATGTTCTATGCAGTTTCCCTGTCAGGAATAATTGGAT  999

seq1  GGACTGAATTC  1010
      |||||||||||
seq2  GGACTGAATTC  1010

seq1: chr6_110587717_110588788
seq2: B6Ng01-226F23.g_65_1136

seq1  GAATTCCCATCCACGGCCAATTTAAGAAGTCATTGAAGAGATTTGGGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCATCCACGGCCAATTTAAGAAGTCATTGAAGAGATTTGGGAAA  50

seq1  TAGGGTAGAATATGAGTGCTTCCAGGATGGCTTGACTGGAAAGGAAGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGTAGAATATGAGTGCTTCCAGGATGGCTTGACTGGAAAGGAAGAGA  100

seq1  AAATCTTTTGCTTGACAAGTAAAAAGTCCATCATGCTGCTCTCTTATTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTTTGCTTGACAAGTAAAAAGTCCATCATGCTGCTCTCTTATTTG  150

seq1  TAGGACATAAAACCATTCCAGGAAGTTTGGTAACATAGAGCAGGTCAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACATAAAACCATTCCAGGAAGTTTGGTAACATAGAGCAGGTCAAGA  200

seq1  CCAGGAGACTCAGTGGGCACACACCTGAGGCTTAACCATCTTCCAGCTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGACTCAGTGGGCACACACCTGAGGCTTAACCATCTTCCAGCTTC  250

seq1  CTGCAAAACTCCTGACTTGGAACACTTGCCATGCTTCTCACATCAAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAAAACTCCTGACTTGGAACACTTGCCATGCTTCTCACATCAAAAAA  300

seq1  AAAAAAAAAAAAAAATGTGTCCTAGGTTACATTGGCCCAGAACAGGCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAAAAATGTGTCCTAGGTTACATTGGCCCAGAACAGGCTCC  350

seq1  ATGAGGTACCTAGAGGCCAGGAGGGCTTAGCCAATAAGCTTCCCTTCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGTACCTAGAGGCCAGGAGGGCTTAGCCAATAAGCTTCCCTTCTCA  400

seq1  AACATTTCTTCCCACAAAAAGTATTTAATCTCAGACCCACCCTGAGAAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTCTTCCCACAAAAAGTATTTAATCTCAGACCCACCCTGAGAAGT  450

seq1  GGGGTATGGTTTTATGCATCCATTTTCGGACACAACAATAACCTGTTTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTATGGTTTTATGCATCCATTTTCGGACACAACAATAACCTGTTTAA  500

seq1  AACCATGGACTATCTCTTTTCACCAAGAGCCACTGTGGGGCACCATGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATGGACTATCTCTTTTCACCAAGAGCCACTGTGGGGCACCATGGAG  550

seq1  AACGCCTTCACCTACAGAGGTTTAACCTACTCTCCTGCCAAAGGCCTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCCTTCACCTACAGAGGTTTAACCTACTCTCCTGCCAAAGGCCTCTC  600

seq1  CGACCAGCTCAAGCTTTCTCATGTCTCAGGCTGTGCTTTTCCATCCTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACCAGCTCAAGCTTTCTCATGTCTCAGGCTGTGCTTTTCCATCCTCAG  650

seq1  AGTGGTGCCTCAACTCTTCCCTACAACTCAGAACCCACTCAGGTAGTGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTGCCTCAACTCTTCCCTACAACTCAGAACCCACTCAGGTAGTGTA  700

seq1  GGGTAAGCTCAGTCAAAGTGCCCCCATGCAGACTCCAGCCAACATCTCTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAAGCTCAGTCAAAGTGCCCCCATGCAGACTCCAGCCAACATCTCTA  750

seq1  TACTTACTCACATCTATGGAAGGGATACATGTTTAAGGTCAATAAAATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTACTCACATCTATGGAAGGGATACATGTTTAAGGTCAATAAAATAT  800

seq1  GGTATGGAAGAGAGGTCTAGCATTATGCAATGAATCCTCTTCATTACTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGGAAGAGAGGTCTAGCATTATGCAATGAATCCTCTTCATTACTAT  850

seq1  GATTTTCTCTAAATTAGCCTCATGCTCTTACCCAAAGGGCCAGTGAGTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTCTCTAAATTAGCCTCATGCTCTTACCCAAAGGGCCAGTGAGTAA  900

seq1  TGTTCTCTCTCTCTAGTAAAGGGAGAAATGGG--TTGGATCACTGAGATC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||
seq2  TGTTCTCTCTCTCTAGTAAAGGGAGAAATGGGGTTGGGATCACTGAGATC  950

seq1  AGGATGAACAAAGCACCATGGACAACAGTCAACCTTAACACAAATATACT  998
      ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGAACAAAGCACATTGGAC-ACAGTCAACCTTAACACAAATATACT  999

seq1  AATATAGTATTTGTTAATGCTGATATAATTTTTAAAATATAGTTTTATTT  1048
      ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||
seq2  AATATAGTATTTGT--ATGCTGAAATAATTTTTAAAATATAG--TTAATT  1045

seq1  ACTTTCAC--TTTCTGT-ATATGAGAA  1072
      ||||||||  ||||||| |||||||||
seq2  ACTTTCACCTTTTCTGTAATATGAGAA  1072