BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-265O08
Chromosome6 (Build37)
Map Location 86,727,527 - 86,885,039
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnxa4, 2610306M01Rik, Aak1
Upstream geneLOC623273, Cml5, Cml4, LOC100043504, LOC100043508, Cml2, LOC665177, 1700019G17Rik, Cml1, Tprkb, EG434057, LOC665213, Dusp11, Figla, Add2, Tgfa, LOC665233, LOC100043094, LOC100043527, 2010309E21Rik, Snrpg, Pcyox1, Tia1, C87436, 2310040G24Rik, Pcbp1, Asprv1, Mxd1, 2610209M04Rik, Gmcl1
Downstream geneLOC100043555, Nfu1, Gfpt1, D6Ertd527e, Antxr1, Gkn1, Gkn2, 1190003M12Rik, Bmp10, Arhgap25, Prokr1, 2010301N04Rik, 1810020O05Rik, AB041550, LOC100043118, EG545864, Gp9, Rab43, Isy1, Cnbp, Copg, 8430410A17Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-265O08.bB6Ng01-265O08.g
ACCGA069427GA069428
length1,1591,136
definitionB6Ng01-265O08.b B6Ng01-265O08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,727,527 - 86,728,684)(86,883,914 - 86,885,039)
sequence
gaattctctttaaagctcatctcatcttccctccaaaataaagtggtgga
gtcctggggactatttgttcttataatctttatatacatacttcctatat
atgggccaaggtgtagtttctcatgtttcagtttcctcatgggctacata
gaatcaataccaagaattagtaatatgaggactaatcaagctatgacccc
aaattcttagaatggtaaacacattgtgaacctgacaacatctctctatt
ctctttactactatttgttctagaacaatctggccccatatgtgagaact
gactgtacacaacagtgggatcaagtgaaacagatccaagattgttcaga
gtgaaactttctgggcacttagtgatagaagaggtttttacccagcagca
atgccaggtggctcttttgtcaggcattaggacaaaagtgactccaccca
acccagaacgtacctatcttacctcaagcaaatatcaaagagacaggaag
tcccggcaccagagtctggtagtagtaaagcccccatccatcatcacctt
agtggtttttgtttggttgtaagctaggaagccacgtggaaaggagaggt
tagagaccaaccagagctactcagaggcaatcacggtggttagatgcaag
caagatggctgctatcaggccaaggtaaacctgcgggtcattctctcgca
atagactttccctctatgtgtctgttgtcacggactatctattcacagct
tccctgatgcagacttacaggatgaaactgagttctgtggataaatgctg
gctggcgatggctgcaaaaataatgtgactctatacttagacacggtaac
taattcaatttatgtgtattttacctcagcttttgtgtatgtgtgcatgt
gcacatacatgctcttttgggtgcatgtatgtatgtaggtatgtgcatac
atgtgagtgtggaggtcaaaaggtcaactataggtgtcattcccttctta
gcatcctgtcttttgagaccacatctgctcactggccctggaagcttgcc
aatagatcattgcatgtgcatctagtattgtaacctccacgtccagatgt
cgtctgggtcggaagaacccaaactcggttctagcaagctatctgttgca
tttcattaa
gaattcagcttgagtttttactttctttctctttgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgaggacaggggtagagaaagatttactacctgcggcattt
aacagttctttccaaagcagtgtctttcctgaacaaaggaatcatgaggg
ttttagttgggtaacctgctcaaatttataaaggaaagcagacacatttc
tgaacatgctccaacttggcttttaacagtttctctttaaaaaatatatg
aaaaaaaaaaagccctgccttgcaagctttgacgagtacaatagcatcta
gacccagcatttcagtcatacttaagcattcccagatggccggctggctg
gaagatgcagcatcagctgaattgcttctcagcacccggctgctgctcat
gggatttaatccttcccacgggtgctcctgagtaccacccaggcactgga
aatcacctcacactttggcccacagagcggatagctatggtgatggttgt
aaacccaaggttattaagaagggttcctgaaggttgaggaaagaaaacat
gaggaaactggacattatggcttttatacagatgcaaggtaaaataaaga
tttgtgaattaactataccattttacttttgttttaaagacttaggggag
ggtcctatgagtctgtgtttgactgaagcgtaggctctcgactggtccag
tggaacagtggggcagtctggagagctgccccagcttctcagggtccatg
gaaagctgttcttgactacacaaagtgcacataccaatgctcaaaatgac
aaagttaccccaggaagcagcctcaagtatcaagtaaacagcggaacccc
tcagcatcaacagtaaagctcacctatgccccctcctgcacagtggatca
gaaagcaccgcttgacacagaaataagcagcccccaagagagatggacaa
tcacaggaaacgtgcccacagcaaactttctggagaactttgtgtgagaa
gaattttagagaagagaatgggatgagaaagattaggttgagcagtgttc
tatgattactccttctcagaacaattcttatgtaggaaaggtactgccca
aggagattgccagaaattgtgtaaaccaattgagag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_86727527_86728684
seq2: B6Ng01-265O08.b_49_1207

seq1  GAATTCTCTTTAAAGCTCATCTCATCTTCCCTCCAAAATAAAGTGGTGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTTAAAGCTCATCTCATCTTCCCTCCAAAATAAAGTGGTGGA  50

seq1  GTCCTGGGGACTATTTGTTCTTATAATCTTTATATACATACTTCCTATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGGGGACTATTTGTTCTTATAATCTTTATATACATACTTCCTATAT  100

seq1  ATGGGCCAAGGTGTAGTTTCTCATGTTTCAGTTTCCTCATGGGCTACATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCCAAGGTGTAGTTTCTCATGTTTCAGTTTCCTCATGGGCTACATA  150

seq1  GAATCAATACCAAGAATTAGTAATATGAGGACTAATCAAGCTATGACCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAATACCAAGAATTAGTAATATGAGGACTAATCAAGCTATGACCCC  200

seq1  AAATTCTTAGAATGGTAAACACATTGTGAACCTGACAACATCTCTCTATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCTTAGAATGGTAAACACATTGTGAACCTGACAACATCTCTCTATT  250

seq1  CTCTTTACTACTATTTGTTCTAGAACAATCTGGCCCCATATGTGAGAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTACTACTATTTGTTCTAGAACAATCTGGCCCCATATGTGAGAACT  300

seq1  GACTGTACACAACAGTGGGATCAAGTGAAACAGATCCAAGATTGTTCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTACACAACAGTGGGATCAAGTGAAACAGATCCAAGATTGTTCAGA  350

seq1  GTGAAACTTTCTGGGCACTTAGTGATAGAAGAGGTTTTTACCCAGCAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAACTTTCTGGGCACTTAGTGATAGAAGAGGTTTTTACCCAGCAGCA  400

seq1  ATGCCAGGTGGCTCTTTTGTCAGGCATTAGGACAAAAGTGACTCCACCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAGGTGGCTCTTTTGTCAGGCATTAGGACAAAAGTGACTCCACCCA  450

seq1  ACCCAGAACGTACCTATCTTACCTCAAGCAAATATCAAAGAGACAGGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGAACGTACCTATCTTACCTCAAGCAAATATCAAAGAGACAGGAAG  500

seq1  TCCCGGCACCAGAGTCTGGTAGTAGTAAAGCCCCCATCCATCATCACCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGGCACCAGAGTCTGGTAGTAGTAAAGCCCCCATCCATCATCACCTT  550

seq1  AGTGGTTTTTGTTTGGTTGTAAGCTAGGAAGCCACGTGGAAAGGAGAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTTTTTGTTTGGTTGTAAGCTAGGAAGCCACGTGGAAAGGAGAGGT  600

seq1  TAGAGACCAACCAGAGCTACTCAGAGGCAATCACGGTGGTTAGATGCAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGACCAACCAGAGCTACTCAGAGGCAATCACGGTGGTTAGATGCAAG  650

seq1  CAAGATGGCTGCTATCAGGCCAAGGTAAACCTGCGGGTCATTCTCTCGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATGGCTGCTATCAGGCCAAGGTAAACCTGCGGGTCATTCTCTCGCA  700

seq1  ATAGACTTTCCCTCTATGTGTCTGTTGTCACGGACTATCTATTCACAGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACTTTCCCTCTATGTGTCTGTTGTCACGGACTATCTATTCACAGCT  750

seq1  TCCCTGATGCAGACTTACAGGATGAAACTGAGTTCTGTGGATAAATGCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGATGCAGACTTACAGGATGAAACTGAGTTCTGTGGATAAATGCTG  800

seq1  GCTGGCGATGGCTGCAAAAATAATGTGACTCTATACTTAGACACGGTAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCGATGGCTGCAAAAATAATGTGACTCTATACTTAGACACGGTAAC  850

seq1  TAATTCAATTTATGTGTATTTTACCTCAGCTTTTGTGTATGTGTGCATGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCAATTTATGTGTATTTTACCTCAGCTTTTGTGTATGTGTGCATGT  900

seq1  GCACATACATGCTCTTTTGGGTGCATGTATGTATGTAGGTATGTGCATAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATACATGCTCTTTTGGGTGCATGTATGTATGTAGGTATGTGCATAC  950

seq1  ATGTGAGTGTGGAGGTCAAAAGGTCAACTTTAGGTGTCATT-CCTTCTTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| 
seq2  ATGTGAGTGTGGAGGTCAAAAGGTCAACTATAGGTGTCATTCCCTTCTT-  999

seq1  AGCATCCTGTCTTTTGAGACCACATCT-CTCACTGG-CCTGG-AGCTTGC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||
seq2  AGCATCCTGTCTTTTGAGACCACATCTGCTCACTGGCCCTGGAAGCTTGC  1049

seq1  CAAATAGACCATT-CATGTTGCCTCTAAGTA-TGT-ACCTCCACGTCCAG  1093
      | |||||| |||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||
seq2  C-AATAGATCATTGCATG-TGCATCT-AGTATTGTAACCTCCACGTCCAG  1096

seq1  ATGGTCGGTCTGGGTTCAGAGGA--CCAAACTCGGGTTCTAGCCAAGCTA  1141
      || ||| ||||||| || || ||  |||||||| |||||||| |||||||
seq2  AT-GTC-GTCTGGG-TCGGAAGAACCCAAACTC-GGTTCTAG-CAAGCTA  1141

seq1  TCT-TTCCATTTCCTTAA  1158
      ||| || |||||| ||||
seq2  TCTGTTGCATTTCATTAA  1159

seq1: chr6_86883914_86885039
seq2: B6Ng01-265O08.g_68_1203 (reverse)

seq1  CTCTCCAATGTGGTTTTCACAATTCCTGGCAATTCTTCCTTTGGGGCAGC  50
      |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||   |||||  |||||| 
seq2  CTCT-CAAT-TGGTTTACACAATTTCTGGCAAT--CTCCTT--GGGCAGT  44

seq1  TCCTTTCTTACAT-AGA--TGTTCTGAGA--GAGTAATCCATAG-ACACT  94
       |||||| ||||| |||  ||||||||||  ||||||| ||||| |||||
seq2  ACCTTTCCTACATAAGAATTGTTCTGAGAAGGAGTAAT-CATAGAACACT  93

seq1  GCTCAACTTAATCTTTCTCATCCCA-TCTCTTCTCTAAAATTCTTCTCAC  143
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAACCTAATCTTTCTCATCCCATTCTCTTCTCTAAAATTCTTCTCAC  143

seq1  ACAA--GTCTCCAG-AAGTTTGCTGTGGGCACG-TTCCTGTGATTGTCCA  189
      ||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ACAAAGTTCTCCAGAAAGTTTGCTGTGGGCACGTTTCCTGTGATTGTCCA  193

seq1  TCTCTCTTGGGGGCTGCT--ATTCTGTGTC-AGCGGTGCTTTCTGATCCA  236
      ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTTGGGGGCTGCTTATTTCTGTGTCAAGCGGTGCTTTCTGATCCA  243

seq1  CTGTGCA-GAGGGGGCATA-GTGAGCTTTACTGTTGATGCTGA-GGGTTC  283
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTGTGCAGGAGGGGGCATAGGTGAGCTTTACTGTTGATGCTGAGGGGTTC  293

seq1  CGCTGTTTACTTGATACTTGAGGCTGCTTCCTGGGGTAACTTTGTCATTT  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGTTTACTTGATACTTGAGGCTGCTTCCTGGGGTAACTTTGTCATTT  343

seq1  TGAGCATTGGTATGTGCACTTTGTGTAGTCAAGAACAGCTTTCCATGGAC  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATTGGTATGTGCACTTTGTGTAGTCAAGAACAGCTTTCCATGGAC  393

seq1  CCTGAGAAGCTGGGGCAGCTCTCCAGACTGCCCCACTGTTCCACTGGACC  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGAAGCTGGGGCAGCTCTCCAGACTGCCCCACTGTTCCACTGGACC  443

seq1  AGTCGAGAGCCTACGCTTCAGTCAAACACAGACTCATAGGACCCTCCCCT  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCGAGAGCCTACGCTTCAGTCAAACACAGACTCATAGGACCCTCCCCT  493

seq1  AAGTCTTTAAAACAAAAGTAAAATGGTATAGTTAATTCACAAATCTTTAT  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTTTAAAACAAAAGTAAAATGGTATAGTTAATTCACAAATCTTTAT  543

seq1  TTTACCTTGCATCTGTATAAAAGCCATAATGTCCAGTTTCCTCATGTTTT  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCTTGCATCTGTATAAAAGCCATAATGTCCAGTTTCCTCATGTTTT  593

seq1  CTTTCCTCAACCTTCAGGAACCCTTCTTAATAACCTTGGGTTTACAACCA  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTCAACCTTCAGGAACCCTTCTTAATAACCTTGGGTTTACAACCA  643

seq1  TCACCATAGCTATCCGCTCTGTGGGCCAAAGTGTGAGGTGATTTCCAGTG  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCATAGCTATCCGCTCTGTGGGCCAAAGTGTGAGGTGATTTCCAGTG  693

seq1  CCTGGGTGGTACTCAGGAGCACCCGTGGGAAGGATTAAATCCCATGAGCA  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGTGGTACTCAGGAGCACCCGTGGGAAGGATTAAATCCCATGAGCA  743

seq1  GCAGCCGGGTGCTGAGAAGCAATTCAGCTGATGCTGCATCTTCCAGCCAG  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCGGGTGCTGAGAAGCAATTCAGCTGATGCTGCATCTTCCAGCCAG  793

seq1  CCGGCCATCTGGGAATGCTTAAGTATGACTGAAATGCTGGGTCTAGATGC  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGCCATCTGGGAATGCTTAAGTATGACTGAAATGCTGGGTCTAGATGC  843

seq1  TATTGTACTCGTCAAAGCTTGCAAGGCAGGGCTTTTTTTTTTTCATATAT  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTACTCGTCAAAGCTTGCAAGGCAGGGCTTTTTTTTTTTCATATAT  893

seq1  TTTTTAAAGAGAAACTGTTAAAAGCCAAGTTGGAGCATGTTCAGAAATGT  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAGAGAAACTGTTAAAAGCCAAGTTGGAGCATGTTCAGAAATGT  943

seq1  GTCTGCTTTCCTTTATAAATTTGAGCAGGTTACCCAACTAAAACCCTCAT  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCTTTCCTTTATAAATTTGAGCAGGTTACCCAACTAAAACCCTCAT  993

seq1  GATTCCTTTGTTCAGGAAAGACACTGCTTTGGAAAGAACTGTTAAATGCC  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCCTTTGTTCAGGAAAGACACTGCTTTGGAAAGAACTGTTAAATGCC  1043

seq1  GCAGGTAGTAAATCTTTCTCTACCCCTGTCCTCACACACACACACACACA  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGTAGTAAATCTTTCTCTACCCCTGTCCTCACACACACACACACACA  1093

seq1  CACACACACAAAGAGAAAGAAAGTAAAAACTCAAGCTGAATTC  1126
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACAAAGAGAAAGAAAGTAAAAACTCAAGCTGAATTC  1136