| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-106M01.T7 (MSMg01no106_m01.b1) | MSMg01-106M01.TJ (MSMg01no106_m01.g1) |
|---|
| ACC | AG320750 | AG320751 |
|---|
| length | 735 | 1,915 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 319 (59 - 377) | 589 (126 - 714) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_m01.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_m01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_m01.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_m01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:39 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TATTCTGGATTTCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXCGCGGAATTCTTTGTTCACCTCTGAGCCCCATTTTTAAATGG
GGTTATTTGATTTTCTGAAGTCCACCTTCTTGAATTCTTTATATATGTTG
GATATTAGTACCCTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATC
TGTTGGTGGTCTCTTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAAC
TTTGGAGTTTCATTAGGTCCGATTTGTCAGTTGTCGATCTTACAGCACAA
GCCATTGCTGTTCTGTTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCGTATCTTCAAG
GCTTTTCCCCACTTTCTCCTCTATAAGGTTCAGGGTCTCTGGCGTTATGT
GAAGTTCTTTGATCCATTTAGATCTGGCCTTAGTACTAGGAGATATGGAT
GGATGCGAGTCGCATTCTTCTACATGATAACTGGCAGTTGTGCTCAGGCT
CCTCTGTTGAAAATGCTGTCCTTTCTTCCCCTGTATGGCTTTAGCTCCCT
TGGCTAAGACGTGGTTGATCGTACGCTGTTGTGTTTCTATTCTTTGTCCG
CTTCTGTTCTATTTCTTTGTCTCTACTCTGGCCCGTCTCCTCCGCCACTG
GCTTGCCTTTTGTTTTCCCCGACTTGCTATGTTAGTTAAGCCTTTAATGT
CACTGTCTTGGGTATCTCCCCCCATAGGGGATCTT
| NTCGACAAAATCTTTTTTNNNAAAGTATCGTCGNCGCGTGCNCGAAXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGCCATTTACTTGATAAAT
GTAGAAATGCCACTATAGGAGCAGTGACAACTAATTATCATTGTGGGAAT
AAAGTTTTACAATACAACTTCCAGCTAGAGCAGCTGAGACTTCTGTTTGT
GCTGTAACACAAAAGAAGCCCTGTGAAGGTGTTCATTATCAACTTGACAG
TAACTAGAAGCACCTGCGAGAAGGGCCTCTGCAAATGTCAATGAATGAGT
ATCTTGATTATGTTAATGGATGTGAGAAGACCTATCTGTGAGTATTTTAA
TTACAGTGAACCTCCCATAGACTTAGATATTTGAATACTTGGTATCCAGT
AAGTGGCACTCTCTGGGTAGGTTTAGCATGCTTGGCCTCGATGGATGAAC
TGTGTCAATGGGGGTGGGCTGTGAAGTTTTAAAGATAGTCACCATTTGGA
GTGCCCTTTCTTTGCTACAAGCTTGCAATTTAAGATATGAGCATGTAGCT
TGTCACTCCAGCTTCCATGCCTCTTGTCATACCTACCACTTCTCTGCAAT
GATGTTGGACCTCTGGAACCATAAGTCCCAATAAATTATCCCTTTTATAT
CTTGCAGTGTAATGATGTTTTGTGTCAGCAAGAGAAAAGTTATACTGCAT
CTTATTTGTATCTGTACCATTCCATGTACAGAGAAGAGAAGAGTGCAAGT
GAAGAGAGGGAGAGAGTGAGCACCTGCCTGCGCGCATTAATTACCCTATT
CTTCTGATGACACATGAAGTGTGACTAGGCATGTTAAGCTCTAGTTGCCT
TGACACTCTCACCCTGATGGAAGGGTAACTTGAACTATGAACTTAAAGAA
ATCCTTTAAAGTTAAGAGCCAAAGTTGCAAAAAAAAAACCTAACCCAGTT
CTTAAAACTTCCAGAAAATCCAATAATGCCATGAGTTGCAAGGACCCAGG
AAGTGAAACCAGTTTTCCCTATTATCACCTGAACTGAGCCAGGGTCCTAA
CTGTCCCCCATTATCGAACTCGAAAACCTGCCAAATAATCTTCCCCTGGA
CCCCCTGGGGGGATTCCATGGAAATGGGGCTATGTACCTCCCTAAAGCTT
AAAAAACCCAAAAACGTTAAAACCCCCCCCGATAACTGGGTTTAAAAGAA
AAGCTGTCAAACTAAATTACTGAACATTTGTCCTCTCCAATTGGCGGATA
TTTGGGGCAATTTAGACCCAAAATAAAGAAAACCCTTTTATTCAAATGGC
TCTCTACCCTGTTATTTCTCCAAAACCTTTCGGTTTTTTAAAGAAAAACT
GCAACAATCTCTCTCTCTTTGGAAAATTTCAGAGCCTGGAAAAAAACCCC
CGGCCTTTGTTCCAGAAAATAAATATGCCTCAATCTGAAGAAACATATGG
GGAATTGTTGTCTATATTTCTGTAAATTACCCCCGCGATCCAAGCTACAA
AAAAAAACTTGTTGAGCCCTTCTCCAATAATATTACCTCTATANTTTCTC
ACNATTTCTATNNTATACTATTCCATCTAACACACGNNTNNNNNNNNNNN
NNNNTNTTATNNNNTNTNNNNNTACTTTNNTCTACTNCCTCTTCTCTTTT
CCTCCTCTTAATTACTTTCTACTCTCTTTCTTAACTCTCCTATACTTTCT
CCACTTTCTCTATCTTCTAACATCATCTTATTTCTTCTCCCTCTCTTCCT
TCTCCTTCCCCTCTCCCCTTCACTTCCTTAATCTCTCTTTCTCTTACCTC
TATTCTTCTTTACTTCTTTTCTTCTCCTCTTCTTCCTCCTTAACTCTTCA
TATCTCTCTCTCTACTCTACTTTTCTTCTCTCTCTCTCACCTGACTCTAC
CACCTATCCTAACTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 8 8 8 7 9 9 13 9 9 9 17 19 14 15 14 18 11 13 19 16 20 16 18 16 13 17 10 8 8 19 19 33 43 48 22 22 17 14 14 11 15 9 12 9 10 11
11 15 15 26 26 33 24 24 28 34 44 47 36 36 36 36 36 33 50 50 50 39 25 14 10 9 9 9 12 16 22 26 37 37 46 33 33 36 36 36 36 47 47 48 48 36 36 39 43 28
28 36 39 42 48 48 50 50 50 50 50 50 50 54 68 54 54 48 48 46 42 41 41 47 41 41 48 48 54 54 32 32 15 15 15 24 32 47 57 57 57 57 54 47 47 50 50 50 48 42
41 41 46 57 42 50 47 21 21 11 15 15 41 34 57 57 57 50 50 38 42 19 16 11 21 21 50 50 50 50 50 50 35 35 30 42 46 46 46 46 59 59 57 57 52 52 52 32 30 12
15 13 27 27 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 59 59 59 52 52 57 57 43 43 42 43 39 43 43 57
57 57 57 44 43 27 32 33 43 43 52 52 43 50 43 43 52 27 27 12 11 11 32 34 57 50 28 15 8 8 11 8 8 13 32 32 59 57 57 57 38 32 15 12 12 12 12 14 32 32
43 35 35 42 44 44 35 35 35 44 44 57 57 59 57 48 48 44 44 39 43 37 42 42 42 42 43 47 44 48 48 48 48 59 47 39 24 14 12 12 13 24 24 54 44 43 29 32 28 32
20 23 11 15 15 30 32 39 39 35 35 29 34 26 32 30 39 39 48 43 57 39 37 35 13 13 8 8 8 15 21 18 11 11 11 17 19 29 24 19 11 8 8 8 8 13 16 23 23 26
28 32 34 34 25 25 32 34 28 28 12 12 9 17 9 9 9 9 9 9 8 8 9 9 9 9 11 12 12 16 15 11 12 11 15 15 13 13 13 12 13 12 11 11 11 11 11 11 11 11
12 10 9 10 15 15 12 8 9 9 9 12 12 24 25 37 28 32 15 15 10 10 8 7 7 11 12 17 10 10 6 6 8 8 11 11 11 10 13 8 8 8 12 17 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 9 12 12 12 14 13 14 24 25 32 25 24 14 10 8 13 8 8 10 8 8 8 12 9 10 9 9 10 13 11 17 13 10 8 8 8 12 10 9 9 10 13 16 15 13 10
10 10 10 10 10 11 7 7 6 6 6 6 8 8 9 9 11 11 11 12 18 10 8 8 8 8 12 15 20 20 13 19 14 11 13 10 11 11 8 8 8 8 8 8 22 15 20 10 14 12
15 10 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 13 9 9 9 10 10 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 10 12 12 10 10 10 10 12 11 19 12 10 8 8 8 10 8 8 10 10 10 13
10 9 9 9 9 9 12 12 12 10 10 9 8 12 8 8 9 9 11 14 13 11 8 8 8 8 8 6 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 12 12 12 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 8 10 10 13 12 10 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 11 13 8 | Open.Hide. 0 3 8 7 9 9 9 11 8 8 8 6 6 8 9 11 11 3 0 0 0 3 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 3 0 3 6 8 6 6 6 3 0 3 6 6 6 17 10 7 6
6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 10 8 8 12 22 19 25 24 22 22 18 18 21 17 15 18 20 22 28 28 28 26 26 28 32 32 28 28 28 28 33 23 23 23 17 26 28 30 24 24
15 22 22 28 23 19 15 10 10 11 9 9 7 8 9 10 8 8 8 8 10 11 13 11 17 17 20 28 33 35 35 35 35 35 35 35 37 37 42 47 37 37 36 37 37 42 43 43 42 42
53 35 35 47 53 31 31 39 37 28 25 19 13 9 9 10 12 17 22 31 33 33 33 31 31 35 30 30 35 42 42 42 33 33 37 42 40 40 40 47 53 47 47 47 47 42 42 42 40 41
41 47 47 47 50 50 50 68 68 68 68 59 57 54 54 54 57 57 57 50 48 48 46 46 46 48 51 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 50 50 48 48 48 48 48 48 48 48
48 48 48 50 51 51 51 51 57 57 48 57 50 46 46 46 46 46 50 50 50 50 50 68 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 68 68 62 62 62 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 52 52 59 59 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 47 57 57 68 68 68 54 54 54 54 54 54 54 57 57 54 48 48 42 46 43 42 43 43 32 32 39 39 43 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 50 50 42
42 42 47 44 43 41 37 37 41 37 37 41 37 37 30 22 22 22 32 28 28 39 37 37 39 39 39 43 43 37 37 41 41 43 41 47 47 47 48 48 53 48 48 48 40 40 40 41 41 43
39 31 31 33 34 34 32 28 28 32 29 30 37 37 37 37 32 31 31 37 37 28 28 13 12 12 23 15 20 18 21 30 22 22 22 29 26 28 30 31 20 23 12 12 12 23 23 34 31 23
28 28 34 22 18 14 23 23 34 36 34 26 26 12 10 15 11 11 18 15 18 19 19 28 28 30 34 34 39 22 18 10 10 10 10 12 11 11 11 11 11 11 17 17 34 34 31 30 27 19
15 14 9 9 9 9 9 18 12 22 19 19 10 12 12 20 20 24 15 15 12 18 11 11 14 10 11 11 12 16 10 12 9 12 12 23 17 20 15 11 10 11 15 18 25 25 19 19 18 19
28 31 28 23 19 26 24 22 22 12 11 11 11 14 15 14 9 9 9 9 10 12 12 19 13 14 9 9 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 10 13 13 10 15 15 29 25 14 12 12
8 10 8 8 8 8 15 16 17 12 12 10 11 9 10 10 9 10 13 18 16 20 20 19 14 12 8 8 8 9 10 18 11 10 9 9 10 10 16 17 18 11 8 8 8 17 8 11 11 15
11 14 10 10 8 8 8 8 10 13 13 21 15 18 11 10 11 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 8 10 8 11 20 13 11 19 14 10 13 9 9 11 9 9 11 10 11 13 13 7 7
6 9 10 9 11 12 13 15 15 8 8 8 8 8 8 17 17 16 12 9 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 10 10 10 8 10 15 19 15 17 16 10 11 11 10 10 10 8 8 8 8
6 6 6 8 8 9 9 9 9 11 9 10 11 12 8 8 8 8 8 9 9 8 8 10 10 10 8 11 10 12 10 13 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7
6 6 6 6 11 12 15 16 15 11 12 10 10 10 10 10 9 9 10 8 8 8 8 9 11 11 9 8 8 8 8 8 8 10 10 6 8 6 6 6 8 15 10 8 8 8 8 8 16 19
12 9 8 9 8 8 12 16 18 27 19 18 15 15 8 10 6 6 8 6 9 8 8 6 6 6 9 16 18 12 11 11 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 16 11
11 11 23 18 18 10 10 10 10 11 15 15 12 12 11 12 12 11 10 10 17 16 10 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 11 12 12 11 11 11 11 8 15 7 7 10 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 7 6 10 6 10 12 11 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 7 6 8 6 6 8 8 6 6 10 10 10 9 9 12 12 12 10 10 8 8 6
6 13 15 15 13 8 8 8 8 8 8 10 9 15 15 11 11 11 18 13 20 12 13 9 9 11 10 13 12 12 10 11 16 11 11 11 13 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6
6 6 6 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 13 8 8 8 10 15 10 9 9 9 12 11 10 17 17 22 21 15 8 8 8 10 13 12 8 6 6
6 8 10 11 11 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 6 8 8 13 13 15 21 14 11 14 16 20 13 13 11 11 11 12 12 8 12 8 9 9 9 9 10 9 13 21 14 14 15 20 18
11 11 8 11 13 13 12 8 7 7 10 10 8 8 6 6 8 8 11 12 12 6 10 6 7 7 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8
9 8 6 6 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 6 6 8 8 12 11 11 11 11 9 12 10 8 8 6 6 8 8 10 7 7 8 8 8 8 8 6 6 8
11 14 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 17 18 7 9 9 9 9 9 19 22 22 8 8 6 6 6 8 10 10 8 8 6 8 6 6 8 3 0 3 8 9 12 8 8
7 3 0 3 6 8 8 6 6 8 3 0 0 3 13 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 9 9 9 10 3 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 3 0 3 17 17 3 0 0 0 0 3 0 3 0 0 0 0 0 3 14 14 7 7 3 0 0 3 10 10 9 11 3 0 3 6 6 10 10 10 10 10 8 8 8 8 9
10 19 15 28 15 14 8 8 8 10 10 14 18 18 8 8 8 9 9 9 11 8 12 13 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 12 12 10 8 8 6 8 8 12 6 6 8
8 8 8 8 10 8 8 12 18 11 12 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 10 13 13 10 10 10 10 8 10 8
8 6 6 8 8 11 11 16 10 12 9 7 10 8 10 8 8 10 8 8 9 12 12 10 8 8 8 8 8 9 11 11 15 12 14 14 12 11 9 8 8 8 18 17 9 9 10 11 8 8
6 6 8 8 12 13 8 10 10 8 8 6 7 12 8 6 8 8 8 9 7 6 8 12 10 8 8 12 12 8 10 6 7 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 6 10 6 9 10 8 8
8 8 8 12 8 10 10 15 12 10 10 16 10 10 9 9 10 6 6 6 7 7 14 19 13 15 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 9 15 15 8 8 7 7 7 8 12 13 13 13 13
10 10 10 12 9 8 8 15 13 15 10 8 8 6 6 |
|---|
