BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-129M19.T7 (MSMg01no129_m19.b1) | MSMg01-129M19.TJ (MSMg01no129_m19.g1) |
ACC | AG337715 | AG337716 |
length | 726 | 729 |
length of high quality (start - end) | 611 (43 - 653) | 290 (75 - 364) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no129_m19.b1 PHD_FILE: MSMg01no129_m19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:43:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no129_m19.g1 PHD_FILE: MSMg01no129_m19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:43:20 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAAGAGGATCCGCGGAA
TTCTCTTCAATGACCTCTTGTTTAGGCTACTTTAGGTAGGCGTGGGAGGG
TAGGGATTGTCACAGAAGCCTTCCATCTTCCTCTCAACTACGCCTCTGCA
TCCATTGATAGCACTGCAAACTATTCAGTGCTTCCTTGCTCTTTATATTC
ATCAGGAACATGGATTATGGTTTCCACATGGTTTCTGGAAGCACAGACCA
AGAATGGTGTGGTCCCTGACTGTAGTAGGCCCATGGACCTAGGCAAGGCT
CTTGAAACATCGCTGATCATATACATTACCATGGCCTCAGTGGGTGGTGC
AGGCTATTCACATCACTATGGAACTCAGTGGCAGCATGTCTCATGAACAT
TAATATGGCTTCACCCTGGAGCACAGACCAAGAATATTCATGTGGCCTTT
GGTGGTAACACAGCCATGGACATTGTTTTAGTGTCTCCATGCTGTGAAGT
GACACCATGACCAAGGCAACTCTTATAAAGGACAACATTTGATTGCAGCT
GGATTATTGGTTCTGAGGTTTAGTCCATTATCATAATGGCACGAAGCATG
ACAGCATCTAAGCAGGCATAATTCTGGAGGAGCTGAGAATTCCACATCTT
GTTCAGAAGGCAAGTAGGAGAAGACTGTCTTTCAGGCTATTAGGAGGAAG
CTCTCTCANAGCCTACCCACACAGTG
| CAATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGAACTCAGCAGTCTTTGAACT
TTCCTTCTTTGAAATAAAAATGTCTCCTGTGCTCATTGTGAATGAGTGCC
TCGGTCCCAGATAAAGCGTTTGTGTTTGCTTTTCATGATCTGACGTGTTG
CTTCCCAGGTTCGCTTTGTCTGTGATAAGCAATACCCACATCCTTTTGAC
TTATATTATGCACAATTTTAGTATTTCAAGTTGATTTAGGTTTGCGGTTG
CAAACAAGGAGTTTATACAGGTCGGGCTGGAGTAGGTATTTTAATAAGTA
AAATAAATAAATATTTTTTAAGGAGAATGCAAAGAATGTGGCTTGATCGC
TTCAGATACTTTTTGACCCACAAATGTTGAGTTTACCTGTTTTTTTTTGT
TTTTTTTTTTTTGTGGGTAAAATAGTTTTGGGTTTTCAATGTGCGGCTGG
CAGAGAAAGTAACCTTGGGTTTGTTTTATTTTATTCTTCCTTGTGATAGC
AAATAGAATAGGTGTTAACCTAATGTCTGACCGTCTCGAGTAAATGCTTC
ATCCAAGGGAATTTATCGAAACAGTTTCCATTTCCGAAGTCGTCATCTTT
CCTTAATAACAAAATGCATGTTACTTTTTGAGATAAAACTTTTAATTTCT
GCTGGCCTTTAAGTTCGGTTAACTTATTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 12 12 19 30 39 41 39 39 39 37 37 37 23 24 25 28 28 28 47 48 28 28 28 25 23 19 22 11 13 16 9 9 9 9 9 9 9 9 10 13 16 28 31 41 31 31 31
31 36 36 59 59 30 26 19 12 13 10 16 13 16 13 14 15 23 23 25 28 32 34 43 48 50 50 59 59 47 43 33 26 14 14 18 31 34 47 47 47 59 59 50 47 47 47 50 39 44
39 43 43 42 42 42 47 47 50 53 53 53 43 42 42 33 36 36 43 43 59 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 44 44 35 35 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 57 57 43 43 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 52 45 45 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 52 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 57 44 44 35 33 33 27 27 33 33 33 35 47 43 48 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 36 36 27 28 28 42 44 59 59 59 57
54 54 54 57 57 57 57 59 48 48 44 59 44 43 43 47 59 44 39 35 32 37 44 44 48 57 39 39 35 33 33 35 35 35 43 43 39 43 43 57 57 57 59 59 59 48 48 48 57 57
48 48 48 59 59 59 59 59 59 28 25 13 14 14 14 15 19 14 14 24 24 39 47 43 39 39 43 59 47 43 39 37 37 37 37 48 43 59 57 47 43 37 37 42 42 43 43 48 48 59
43 37 32 23 31 28 32 37 44 44 57 48 59 48 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 47 47 57 48 42 37 37 42 44 57 57 57 57 57 57 54 48 47 44 43 43 42 43 43 43 48
50 57 54 54 57 57 57 54 57 48 43 36 32 23 23 20 24 20 28 30 42 42 44 48 44 44 44 37 43 40 44 37 36 28 22 22 32 36 42 39 36 28 23 23 21 26 24 27 27 28
19 22 25 29 20 28 24 30 28 40 43 43 40 39 39 32 30 30 18 24 16 10 10 15 17 24 24 37 37 37 37 32 30 24 28 19 22 14 14 14 26 26 26 22 17 17 29 30 37 43
40 43 39 36 36 36 37 37 37 33 23 21 13 15 15 18 25 32 43 50 50 34 34 24 28 19 30 30 41 41 40 32 32 16 20 11 9 8 8 8 8 10 12 13 13 28 28 34 31 24
22 18 16 17 12 11 11 12 12 16 16 16 20 25 25 23 15 15 18 18 20 15 19 14 12 12 9 9 10 9 11 15 13 10 12 12 22 17 30 16 19 12 13 13 19 17 24 24 25 30
30 34 34 37 37 21 20 3 0 3 23 22 30 28 22 16 16 17 19 16 21 12 11 11 11 11 | Open.Hide.15 15 15 9 9 11 9 11 23 18 34 35 39 47 47 47 50 39 44 50 53 53 50 50 50 50 47 47 25 25 11 6 6 6 6 7 6 11 10 19 21 18 23 21 24 37 33 33 36 36
36 33 44 50 50 42 36 27 22 9 11 11 14 16 17 16 12 16 15 21 22 27 33 33 43 33 36 36 38 50 50 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 37 37 35 28 28 36 19 19 15 19 19 34 34 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 59
59 57 57 57 68 68 57 57 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 68
68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 57 57 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57
54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 32 32 21 18 13 12 12 19 28 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 37 37 28 28 28 37
37 48 48 59 47 59 59 32 32 15 15 11 11 9 9 9 9 9 18 15 11 11 11 11 11 11 13 8 8 8 8 8 15 32 44 48 53 37 37 28 28 25 37 37 37 39 47 40 48 48
48 44 43 36 36 43 43 48 50 48 44 59 34 28 19 15 12 11 9 9 9 10 14 24 37 37 37 35 37 35 39 39 47 59 59 59 48 48 48 57 57 59 59 59 59 59 57 57 54 59
59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 41 34 20 20 20 32 32 30 39 41 44 32 32 20 28 28 44 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 54 42 32 24 12 12 12 13 13 15 18 31 31
33 23 18 18 14 14 27 32 42 43 46 50 57 57 57 59 59 59 43 43 43 43 44 48 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 37 37 43 44 57 57 59 59 48 48 48 42 42 30 30 32
28 27 21 22 11 11 16 25 36 32 42 39 43 43 46 46 54 47 48 48 48 42 42 35 39 39 43 43 42 37 30 30 31 40 59 59 43 33 33 32 37 32 32 32 35 37 31 30 21 17
17 19 26 15 15 11 18 16 16 11 18 19 34 30 34 31 32 24 24 16 16 12 22 22 27 31 39 41 41 41 32 32 15 15 13 20 14 12 12 12 25 25 30 30 30 31 39 39 34 34
22 22 16 19 11 8 8 8 12 15 13 17 30 34 21 21 16 24 21 23 17 17 21 24 17 11 8 8 8 11 9 14 14 28 25 25 9 9 9 11 19 19 27 23 19 20 20 20 30 30
36 37 24 19 18 20 20 18 26 19 14 11 17 11 16 13 13 15 24 32 29 31 41 37 39 37 37 35 31 |