| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-130H17.T7 (MSMg01no130_h17.b1) | MSMg01-130H17.TJ (MSMg01no130_h17.g1) |
|---|
| ACC | AG338225 | AG338226 |
|---|
| length | 1,258 | 714 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 774 (124 - 897) | 117 (74 - 190) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no130_h17.b1 PHD_FILE: MSMg01no130_h17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:44:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no130_h17.g1 PHD_FILE: MSMg01no130_h17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:44:17 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NCCATCTCTNNNNNNGACATTGGNCGCTAAGACTCCANAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCTCTGGTTTCACTGACCTCTAAAGGCTCTTACAATCTTCTA
CACATTGATACACTCCCCTTGACTATCATTCAGCTTACACACTACAACTG
TACCATAATTTAACAAGCTAAGGGTGTCTAGAGAAAATATGACAACTACT
TTCAAGTATTCAAGGGTTATGAAATAGAAGATAAAACACGTTTGTTTAAT
CTTATACTCCAAGGACTGACTAGAAAAATACATGGAAAATTTCAGACTGG
TAACAATGTTTGAATTAGATTCTTTCCAAGAACGTCACAGGCTATTTGTT
CATTGCTGAATGTACTTTGAAACAAAGAGTATCATAAAAGCAAGAAATCT
GTACTACTAATAGGATGTTAGACTAAGCCTAATTCTCTGAACCTGATAAA
CCACTCTGACCACACCCCTCCATTTTCACGTCATGCACTATCTTATTCTC
TTTTCATCTGGTCTCCAACCTGTTAATTATAACTGTAGCCCTATGATGAG
TCCATGTGCTCCTGGCCTACCACCTGTACATGGCTTTGCTTTCTTCCCTG
CTTAACCACTTCAGCCACTTTCAACCCCATGTCACTCCAGTCTCTAAGTC
TCACTTGCTCAGCTGACTTTCTAATTTGAATGAGTTGAACCATTCACATT
TTGTTTGCTTCTACAGTCAGGTAGACCTAAAAAGAAAATTACACAACCAC
GTGAGATGCTGTCAGCATACACCAATGGTTAGTGCTCAGTGGGGGCACTT
GACACTATCTAGTACCTTCCAGGCTTCTACAAACTCTCAAACTAATGTGA
AACAATAACTAGAAAAGAGCTGAGCAATCAGCCAGTGAGGTGGTTTAGCA
GATAAAGGCACTTACAGCAAATAAAGCCTGATTATCTGAGCTCAATCTCT
GAGATCCAAATGCCAGAAGAAGAGAATCAAGTCCCCCCAGTTGTCCTTTG
CCCTGAGGAAACTGAATTAAAAGAACTGCTGTTTAATTTCAGGCCCATTC
TGGCTTTATAAAGGAGATCCCAAGGGCCCCAAGGGGCTCCGGGAAATAAA
AAACCTTAACCCCCAGAGTTTGGATGCGGCAACCCAACCCCTTCCCCCAA
TATAAATTTAAAAAAATTATTTTTCCTTTCCCGTTAGGTGTGTAAAAGAG
AGAGAGGGTGTCTCTTTAAGGGAGGCCCTCTAGGTCCAGGGAGGCTGTCT
CCCTCTCT
| CGAATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATGATCAGATGCAATTCCTGATTTGGT
CTAAGTCCTTTCGGGAAACGAGTTGGATTTAAATCATGGGGGGTGGGGGT
TTGGGGAGACTGAGGGTAGTCGACAGAAAGTCTACTTCGGTATCAAGACT
AGAATGTTCCCCTTCCTCATAGAACACCAAGAGAGCTGCATCGTTGATAG
AACGAGCACATGAGCTTCCGTGCCTTCCAAGCATGTACTCGCAGCACCAA
AAAAATTACGCCTGTTTTTTTTTCATGCTCACAGAGAGCATCTGATCTAC
GTTGTTTTTTTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCTAAATCTGTGTACATAATTG
AACGTTGTGCCCCCCCAATATAAAACTAATAGGAGGGGGCGGGGCTCCCT
CTATTACTACCGACACAAAAAACGCTATCCGATTGACCCTATTATTTGAC
CAACAGCACTCTCTAACGAAATATATCTCCATCAAACTACAATACCACGT
AATCCACGCGACTCTAACCGAATCCCCGATTTGCCCTACATATGCAGATA
CACCCCCCCTCTTAACCTCCACTTGTCACCTCTCCCCCCTCTCCAAAACC
CCTGTCTATCCTATTCACCACTGCTTTCACTCTTCGCACATCACCCGACG
ACAGGAGATACTTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 3 9 9 8 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 10 15 8 8 8 3 0 3 8 19 19 22 28 24 26 31 33 47 47
47 47 42 42 42 50 50 50 50 53 42 38 36 36 36 31 31 31 31 31 23 23 15 15 12 9 9 9 9 8 6 7 6 6 8 14 19 27 26 12 12 12 26 26 36 50 36 38 42 42
42 36 53 36 36 31 31 31 31 31 22 21 11 11 11 10 8 9 8 8 8 8 10 14 19 29 29 37 39 48 48 30 27 10 10 10 10 12 27 27 37 37 40 40 40 47 57 53 47 47
47 47 47 42 50 51 51 50 68 50 50 50 53 50 54 50 50 47 47 48 47 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 48 43 43 43 43 46 42 59 59 57 57 57 57 57 68 68
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 59 68 68 57 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 57 57 57 52 52 43 52 52 52 57
57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 48 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 54 57 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 53 50 50 50 50 37
31 24 9 10 8 8 8 8 8 13 25 34 41 41 41 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 50 50 50 53 50 57 59
59 48 48 48 43 39 39 39 35 21 12 10 8 8 8 10 12 14 12 15 30 30 47 59 59 53 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 54 54 54 48 57 57
59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 52 52 52 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 54 54 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 54 54 54 57 68 59 59 59 59 59 57 57 48 57 57 57 59 57 57 47 47 39 47 47 41 48 47 50 42 41 39 44 44 39 39 44 44 44 47 47 47 59 48 48 48 48 48
57 47 47 42 42 42 42 42 43 59 59 59 59 59 59 59 48 48 43 41 41 40 39 39 39 39 31 31 31 34 34 31 20 25 12 12 16 25 27 39 37 39 39 39 37 37 33 33 33 33
41 47 47 47 47 47 57 50 48 48 48 46 46 46 41 39 39 39 32 32 39 39 30 30 31 59 39 41 39 35 29 29 28 32 37 37 37 43 37 37 37 34 18 12 11 12 17 22 37 32
37 41 44 41 41 31 27 15 15 19 15 25 21 27 24 31 39 39 41 41 37 32 25 16 23 19 19 19 23 22 30 25 27 32 32 28 28 28 24 25 32 28 19 14 9 11 9 9 13 19
11 10 15 20 21 27 30 20 16 10 10 10 21 19 32 24 14 14 12 12 17 25 34 27 31 25 22 22 21 22 18 24 22 16 12 11 8 8 8 8 10 16 14 14 14 13 14 12 12 9
9 9 9 9 11 10 13 21 14 10 12 10 10 10 13 11 11 8 8 8 8 8 8 11 9 10 12 12 10 11 13 17 20 19 27 13 9 8 10 9 9 10 10 10 10 10 10 15 14 10
9 9 14 10 13 9 9 9 15 10 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 12 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 9 9 8 10 10 10 9 9 9 11 8 8 6 6 8 6 8
10 7 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 11 10 6 8 6 6 6 7 8 10 7 7 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 13
10 7 7 6 7 8 11 11 12 19 15 25 23 11 6 6 6 8 6 11 9 11 10 9 9 9 9 10 11 10 12 16 12 17 9 9 9 10 17 13 13 17 10 9 9 11 11 11 13 9
7 9 9 9 9 9 12 12 10 14 17 15 15 11 12 11 6 8 6 6 13 19 15 8 8 8 8 11 10 8 8 10 11 11 11 11 12 12 11 9 9 9 11 9 8 8 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 11 13 11 11 11 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 6 6 6 6 6 10 11 9 8 7 7 7 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 9 10 13 13 10 8 8 9 19 17 10 10 9 22 22 33 31 31 33 22 22 10 11 13 25 27 25 16 12 10 11 8 6 6 6 10 15 15 20 15 19 12 19 27 36 35 35 31
31 31 31 37 30 23 13 9 6 6 7 7 6 6 6 10 10 11 13 22 26 33 30 30 35 36 36 35 35 35 35 37 37 50 50 50 50 50 50 50 57 50 50 50 50 50 50 50 47 47
47 53 57 57 57 57 57 48 48 48 48 47 47 39 25 22 15 12 12 12 12 21 25 31 33 37 39 48 48 50 53 53 50 50 50 50 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 54 48
48 48 54 46 46 43 43 43 48 48 54 48 44 39 37 37 36 36 30 32 32 38 24 32 20 20 20 28 28 30 30 30 35 30 32 27 19 15 19 11 11 11 11 11 18 15 15 24 12 12
12 19 15 32 32 28 28 32 43 32 38 27 27 27 43 38 43 43 28 19 11 11 11 23 24 12 12 12 24 24 32 21 20 20 20 20 20 21 23 23 23 23 36 28 26 18 18 11 11 11
11 11 12 12 11 11 19 23 23 32 24 24 13 15 15 31 28 28 14 14 14 18 32 19 18 11 16 16 14 14 18 28 28 24 14 12 12 12 12 12 11 11 11 10 10 17 18 24 24 14
14 14 21 21 22 14 11 15 8 8 8 8 8 8 7 8 6 15 24 18 15 19 22 28 26 25 23 23 23 28 18 18 13 24 24 19 18 18 18 23 24 18 20 9 9 9 12 12 10 12
16 23 12 15 12 10 9 9 8 9 8 9 9 11 15 22 24 28 28 37 37 37 27 27 24 14 11 9 9 9 15 12 12 11 12 15 15 10 8 8 8 8 8 10 15 15 18 11 10 10
10 10 10 11 10 8 10 13 22 12 10 15 16 10 15 6 6 6 8 6 6 11 16 20 8 8 6 6 8 8 10 12 11 11 11 11 10 8 8 8 8 10 8 10 10 10 11 19 15 18
16 15 13 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 10 9 9 12 21 15 13 13 10 10 10 10 10 10 12 10 10 10 8 8 8 8
8 8 16 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8 9 11 9 8 8 8 8 8 8 7 6 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 10 10 10 10 9 11 10 8 8 8 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 7
6 8 8 11 12 13 12 13 9 7 10 8 9 10 10 10 8 8 8 9 9 6 6 7 7 8 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 12 8 10 8 8 8 8 11 13 10 8 8 8
8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 8 8 8 8 8 8 10 11 11 9 9 9 9 9 9 10
9 9 9 10 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 |
|---|
