BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-130K24.T7 (MSMg01no130_k24.b1) | MSMg01-130K24.TJ (MSMg01no130_k24.g1) |
ACC | AG338377 | AG338378 |
length | 975 | 1,135 |
length of high quality (start - end) | 60 (43 - 102) | 797 (88 - 884) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no130_k24.b1 PHD_FILE: MSMg01no130_k24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:44:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no130_k24.g1 PHD_FILE: MSMg01no130_k24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:44:36 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCTGGCAATACTAGCTCTCGCTGGTTCTCAGAAATCTGAGGGAGAGCTGA
GCNTGACTCTNTGAGTAGCAACATCACATCGTGGGTTTTNTTCCCNAGTG
TCCCAACAAGTGGGAAGAAGTCAATCCCATTGGGATGGGCATTCAGACAT
GGGTCTCCCAGCCAACTTCCTCTGAACAGCAGCATCGCGTCAAAACCACA
TCCTCANNCAACTTTTCCCCTTCCCGCCTGGCTATTGACACNNAGTAATA
CCAATGGGCAGTAAGCATCCAACCTCCCATGGCTTGGAAGATGCCNTCCN
NTCCGCACATTTGGGTTTTGCCAGCCCCCAGAAGAAANATGGATATTTTG
GGAAATTTTTGTTATTCTCAACCCGCCCCCGCCCTCCCAAAATGGGCTTT
GGATTGGAAATTTTAAAGAACCCTCTCCACACCCCCATGACAAACCAAAA
ATACAAACAGNNNGGGGGTTTGTTTATGCGNCTCTCCCCGTCTACTATCA
ATNNATCACACCCNNNNNCATTCTTCCACGGGACNAAACTTTCTTTTCCT
CGGGGCACTACCCTTCTAAGTGGCCACAACAAGAAAATTCTGGGGGTGCG
CTGCCCTCTCCTCGGGAGAGGNCCCAAGAGCGGGGGGGCGGTCCTCTCCA
CACCCCTCCCACAATACTAATCACACATGGANTNACAATAGTATATTTNN
NNNTTATCTTCCTTTNTTNNNCCCCACAAACNNNNAAAAACAAAATGAAG
AAGAAGACATCCGCTCCGTGTATTGGGCTNGNNNNNNNNNNNNNNNAAGT
TNTTNTNTNCNTTTCCCTCTACCTNTNCCCNNTNNNNCAAGGNNCNNNNN
NNNNAAGCCTCTCTATNNNNNNCTCTNCNCTTTCCTCCTTCCCCAATATA
AACCACCAAACATAAAAAAGAAGAG
| NCCCGCTCTTTNNNNTACGATGGNAGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCATTTTCTCCCTTTCGAGGTT
CCGATGACAAAACCAACACACCTTTACCACTTTCTATCCTGGGGAACCGG
TAAGGTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTAAAGCATCCTCACACACACTGGTA
ATGGATTACTGATGGGAACTTGGGTGACTCCAAAACAGACGCACTGGGAA
GTCTTCAGCCAGAGATGATGGCTTCCTTCGAGCCATGTACATGGCGTGCC
CATCTCCTAGTCTTCCCGAGTCTATACACTCTAGCCCTTCCCTAAGCCCC
GTGCAGATAGGGCAGGGTTGCATACACGTGGCTTAGTGGAGTGGCTGGGC
ACTCAGGCGGGATTCCAGTGACCCTCCATACTCACTCCCAGGGGAGGATG
TCAGCAGCCAAGGGGCCAACTGTGAGGACTGTTCCCTCGCAGACACAGCT
GGTCTTAGGAAGATGGCTGCTCTCCTGGGAGGACAGTGCTGTGCAGCATC
CCTCATTGTGAGACACTGAAGAGTGTCCGGGGACAGCTGGCGCTGCTTCA
GAGAGTGTCACAAATCACAGCAGCCAGTTACTGTGCTCTGAACCTTCTGT
GCTGAAAGTGCCACATTTTAGGCCTGGGTTTGGCAGTACAAAGAATATGC
ATAACTCAGTAGCAATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTC
ATTCATTCATTCATTCATAGTTTGGTTTCTCAAGTCATGATTTTTTTTTG
TTGTTTTTGTTTTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTGTAGACCTGG
CTGTGCTGAAACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAGATCCTTC
TGCCTCTACCTGCCTAATGCAGGGGATTAAAGGGTGTACCACGCCCTGAA
TGGTCCCGATCTTTGGGGGGGGATTTTTAAACCCCTCAGGGGATTTTTGT
GCCCCGGGTCCAAACTTCTTCTTAAAAACACCCATCTCCCCCTCTGGGTT
TTAAAGGGACCCTGGGACTCCAAAAAAGGGGTGAACCCCCAGGCCTTGTT
TGGGCCAAAAAAAAATTTTTTTTTTACCCTCCCCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 19 28 25 20 18 19 17 17 29 32 33 33 33 33 33 33 48 48 31 29 31 31 31 36 43 53 47 57 43 40 43 43 42 29 23 18 18 18 29 28 43 43 34 42 42 53
35 36 36 36 36 36 53 48 50 50 33 33 30 23 12 8 8 8 15 22 47 30 33 33 33 33 30 29 29 16 11 12 12 12 24 30 30 37 37 50 59 50 50 44 39 33 33 33 33 19
17 3 0 3 17 19 41 21 17 3 0 3 17 19 41 41 42 50 41 37 39 33 30 30 21 17 8 7 7 8 6 6 12 19 25 37 19 17 3 0 3 17 21 14 3 0 3 14 15 37
37 37 50 50 50 42 37 37 37 22 12 12 12 12 24 24 12 12 12 11 19 30 29 37 37 33 33 33 37 22 12 12 12 11 14 11 11 12 12 19 37 37 33 33 37 37 33 32 24 9
9 9 9 9 19 29 37 41 42 42 42 41 41 37 19 13 12 11 11 11 11 18 41 41 39 39 41 41 41 41 25 17 8 11 11 7 7 9 8 8 8 8 8 9 11 7 6 6 6 8
6 10 10 10 10 3 0 0 3 21 17 11 11 12 15 22 12 12 11 11 11 18 26 41 37 44 37 12 12 12 11 11 18 37 37 37 27 27 11 12 3 0 0 3 8 14 31 35 41 32
27 25 25 10 11 11 11 10 9 12 26 34 31 31 37 41 19 14 14 12 12 11 19 14 14 14 18 19 17 14 12 12 12 12 11 11 9 9 9 12 12 12 6 7 3 0 3 6 3 0
0 3 8 8 12 11 11 10 10 8 8 8 8 8 7 9 9 9 11 10 9 9 8 8 8 8 11 12 7 6 6 6 6 8 10 11 3 0 3 10 10 12 9 9 9 9 11 18 14 14
14 14 11 20 18 19 25 16 17 9 7 9 8 8 8 7 7 7 7 7 7 6 7 6 6 6 7 15 9 7 7 7 8 6 9 9 9 9 9 10 9 9 9 6 8 8 8 8 8 10
9 9 9 10 11 11 11 10 11 11 12 18 13 19 15 7 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 11 15 11 9 7 7 6 6 6 6 6 6 9 11 11 18 15 9
8 8 8 8 8 7 8 8 6 3 0 0 0 3 7 7 7 6 8 8 9 8 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 7 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8
6 3 0 0 3 11 13 10 8 8 6 8 3 0 0 0 0 0 3 6 8 10 9 6 6 6 6 6 7 8 11 11 9 3 0 3 8 8 6 6 6 11 6 6 7 6 6 6 7 6
10 9 12 7 9 9 9 9 10 9 7 10 6 7 7 7 8 8 10 9 9 9 9 9 12 8 8 8 6 6 6 7 9 11 13 15 6 6 6 6 6 7 11 10 10 9 10 9 9 9
10 9 6 8 8 6 6 6 7 7 8 10 15 8 8 8 6 6 6 6 3 0 3 7 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 16 16 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 11 8 7 6
6 8 8 10 11 11 10 11 8 6 6 6 10 6 6 6 6 6 6 10 8 8 6 7 6 6 8 8 6 7 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 7 7 6 6 3 0 0
0 0 0 3 6 6 6 6 10 6 6 6 6 9 3 0 3 3 0 0 0 3 7 7 8 8 8 7 9 9 3 0 0 0 0 3 8 7 6 7 7 8 7 7 6 6 6 6 6 7
7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 10 11 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 7 8 3 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6
3 0 3 3 0 3 0 3 0 3 0 3 6 9 9 9 8 7 7 7 7 7 9 3 0 3 0 3 9 3 0 0 3 0 0 0 0 3 6 6 6 3 0 0 3 0 0 0 0 0
0 0 0 0 3 7 6 6 6 11 11 12 9 9 9 3 0 0 0 0 0 0 3 12 9 3 0 3 0 3 15 11 8 8 7 7 7 8 8 9 16 7 7 6 6 8 6 6 8 8
8 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 6 7 11 12 7 6 6 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 3 7 7 7 10 8 8 3 0 3 8 10 10 9 9 15 9 11 14 15 8 8 8 6 8 8 9 15 18 20 23 22 29 29 29
22 19 10 10 24 26 35 35 37 43 42 42 42 36 36 36 36 33 33 50 50 42 41 39 25 15 9 9 9 11 12 11 16 12 10 10 10 15 23 29 30 29 30 34 47 36 50 36 38 36
42 47 47 42 42 42 38 38 53 53 59 59 59 59 47 47 27 25 12 8 8 8 6 6 6 10 15 15 33 33 33 33 31 33 36 36 38 38 50 50 47 47 48 50 50 53 53 53 53 50
50 50 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 50 50 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 54 47 47 57 57 57 57 57
57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 50 50 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 52 52 52 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 44 44 59 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 59 57 44 57 57 59 59 68 59 57 57 57 57 68 68 59 68
68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 54 48 47 59 43 43 43 47 47 48 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59
59 59 37 30 21 12 11 15 12 11 11 12 25 28 47 59 59 47 48 48 48 53 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 57 43 43 43 43 43 48 48 48
57 54 54 54 54 48 48 43 43 46 47 47 48 48 44 44 39 42 43 44 46 44 46 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 54 59 59 43 43 43 59 59 59 59 59 57 57
57 59 57 57 59 59 57 54 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 59 59
68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 59 59 52 52 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 45
45 45 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 59 59 57 47 47 59 59 59 59 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57
57 48 59 57 57 57 57 57 57 50 53 50 50 50 50 42 47 59 44 43 37 36 41 36 39 43 43 59 47 47 47 41 43 48 48 48 57 48 57 48 48 48 50 50 50 42 41 39 39 35
34 34 41 37 31 34 37 37 32 36 36 43 39 39 39 40 47 41 37 37 37 30 31 44 44 59 59 47 41 38 37 37 39 44 44 47 47 50 43 43 28 28 19 19 19 29 29 30 26 31
35 37 37 39 39 37 27 28 23 22 22 24 37 34 34 25 25 13 12 12 13 13 11 20 18 30 32 22 22 22 15 19 14 22 19 21 24 20 18 11 11 9 11 11 15 13 27 32 28 25
25 34 32 31 35 36 36 32 26 24 27 27 24 24 32 27 25 32 30 37 32 16 16 12 9 12 8 8 8 10 8 10 10 8 9 9 20 18 13 12 12 11 15 12 20 18 14 13 8 8
7 8 6 8 6 8 8 10 8 9 11 14 20 13 10 9 9 13 16 13 12 10 9 9 10 19 14 14 12 11 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 10 10 9 8 8 8 8 8 9
9 9 8 13 8 8 8 8 8 8 8 9 12 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10 9 9 8 8 8 8 9 8 8 8 9 9 9 13 14 10 8 8 7 8 8 10 8 8 9
10 8 10 10 10 15 10 11 11 11 11 13 11 11 11 11 11 10 9 9 9 9 9 10 12 8 6 6 6 6 8 7 8 8 10 9 16 9 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 15 23 23 9 8 8 8 8 8 15 17 14 11 12 11 11 11 12 8 6 8 8 8 8 8 8 |