| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-142H19.T7 (MSMg01no142_h19.b1) | MSMg01-142H19.TJ (MSMg01no142_h19.g1) |
|---|
| ACC | AG347084 | AG347085 |
|---|
| length | 1,217 | 1,235 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 560 (137 - 696) | 613 (131 - 743) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_h19.b1 PHD_FILE: MSMg01no142_h19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:02:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_h19.g1 PHD_FILE: MSMg01no142_h19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:02:13 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CGTTCTTNNNNNNTTCACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCTCTGTTTAGGTCTTTCCCTATATGTTCCATCAGAATATTT
GGTTTTTTGAGGTTTCCTTTGAGTTCATTATATACCTTTTGGGTGTTAGC
CCTCTATTGGATATAGAGTTAATGAAAATATTTTCTCATTTTGCAGCCTG
CTAACTGTAGATCTTAGTGGCTGTGCTATTGATGTTCTGACTCTTTCTTT
TTCTTCTTCTTGGTTTCTTCTTTGAGCTACTTATCATTGTTCGTTGTCCA
TGACTATGTATATTTATTAAAATTAGTTTGAAAATATGATGAAGTACACT
CTATTTCGCTTACTATTATTTATTTCTTTAAGATAACTTATAAAGTAATG
GGTTTTTTGTTGGAATGAGAGGCACGCATGCCCTTAGTTCTTGTTCTTAT
TCCCTTGCCCTCTTCACTGTCCTCTCCAAACAGCTGTGATGCCTGTCCTC
ACTGTTGAGTCCTTTCTTCATGTACTCATCATCCTGGGCTAAGGGAAAAG
GTAGTATAGCCCTTTCTAACTCCCTTGCTCTGGAGAGCCATCCTCGACTC
TCGTGGTTTTCGGTCTACTTCATGAATTACTCTAATGAATGTGTTGGATA
TAAATATGAATCTCTAGCCCAGTCTGCTAAGATAAAGCGTGCGATGCTTG
GCTTACTGGGTCTGGCTTATTTTGCTTTAGCTGACCTGCTTTAGCTCCAT
CCAGCTTCCTTAAAACACCATGACTTACATTTTATTTATGGCTATACAAA
ATTTGATTGTGCACATGTGCCATATTTTTATCCATTTATATATGTGGATA
AACATTTGGCCTGTTTCTTATCTCTTTTGATTTGTGTATCTTTAATCTTT
GATGCGTACATATTCTATGGTTTGTTCATGTAAAAGTCCTTGGGTAATAA
ACCTTGGTGGTTTTTCCTTGGTTCATTGGAAAACTATTCTTTTCTTTTTG
ATGTACCCCCCACTCTGATATCTGTCTATGAATTTTTCCCTTTTTCTTGG
AAAAAATATTTTTTTATTTTCTTTTTCTCCTCTTTCCCCAAATAATTATC
TTTCTTTTGTAAATACTTCTATATTTTTTTTTTTATCTTCTTTTTTTATG
TCCTCTCTCCTTTTTTTCATTTTTTTCATTTTTCTATATTCTTCTGGTTT
CATTTANTCATTCTTTT
| CCCCNCCATCATTGGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTAAGGCTCCGTGTGTACCCATTTTTTTC
ATCAGAATGCTTGGATTATGCATGTATACCTTCTTGACTTCGTTATATAT
TTGGAGTGTTAGCTCTCTATTGGACATGGAGTTGGTGAAAGTATTTTCAC
ATTCTTCAGCCTGCACTTTTGTCCTGTTAATGGTGTCCTTTGCCCTGCAG
AAGATTTTCACTTTCATGAAGTCCAATTTAATAAGTGTAGATCTTAGTGG
ATGTGCTATTGTTGTTCTGTTTAGAAACTTGTCTCTAGTATCAATGTTTT
CAAGGCTATACCCTAATTTCTCTTCTACTATTAGATTTAGTGTATCCATT
TTTATTTTGAGGGCTTTGATCCACTTGGACTTGAAGTTTGTGTAGTTTGA
TAAATATGGATCCTTTGGCATTCTTCTACATGCAGACATGGAGTTAGACC
ATCACCATTTGTTGAATATGCTTCCTTTCTTTTTTCTCTATATGTATTTC
TGGTTTTCTTAATTAAAAAAAATCTACAAGTGTTGCAGTAAATATGCAAC
TCAAATATGCCCCGGCAGTGAAAACACAACTGACTTAATATGCATACGTG
CTGTGCACCTAGGTTAGGCATATCTACCACTACATCTTTTGGGTTTTCCA
ATTTGTGGAGTACCTGCTTTTAAACTGTTATCCAATGATTCTTTAGATTT
CCTATATGTCTCTTGTTCTGTCCCCAGTTTTGTTTCTGATTTTGTTAATT
TTGACATTCTCTTTGTCATATAGTTAGTTTGCATAAGGGCTCTGTCTATC
ATATTTGATTTTTCTCAAAAAACCAACTCTTTTATTTCATTGATTCTTTG
TGCTGCTCCGTTTATTTCTGCTATTGACTTCCGCCCTCAGTTTTAATATT
TTCCAGAATTCCTCTTCCCTCTGTTGTGTCTTGCCCCTTTTTTTCCTGGA
ACCTTTTCGAGTTTGTTGGTTTATCTTGTCATTATCTAAATATCTCCCTA
TTTTTTAATAGGTACCGCCTTTTTGGCATTATTATTTTCCCCTCCTTATC
TCTGTCTTATTTTTATTTTCCTCCCTATATTTGGGGACCCCACAATTTAT
CTCCTCTTTCTTCTTCATCTTCAATAAGATGCGTTGCTTTTTTTCTGTAT
GTTTCTTTCTTCACCCAACATCTCACTGTTTCTAT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 0 3 7 7 7 7 7 8 8 8 10 11 11 8 8 8 8 10 15 15 8 8 8 8 10 10 22 23 42 33 28 28 28 32 37 42 43 48
48 48 43 43 43 50 42 42 53 42 42 36 36 36 35 31 31 31 31 31 41 27 21 11 11 9 9 7 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 10 15 17 34 37 50 50 50 50 48 47 43
43 40 43 47 53 53 50 50 50 37 37 34 21 10 9 9 9 9 11 25 23 28 25 21 21 14 16 15 23 25 30 23 13 10 8 8 8 18 21 32 59 50 50 48 41 47 47 47 47 42
57 57 43 43 43 47 47 53 57 48 42 48 48 48 48 50 50 53 43 48 46 46 47 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 57 59 59 59 43 39 37 44 48 57 68
68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 48 48 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52
57 57 68 68 68 57 57 52 52 52 62 62 68 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 52 52 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 52 52 52 62 43 43
31 31 21 33 12 13 12 15 18 16 33 33 62 62 62 62 62 52 52 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 44 44 44 57 52 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 52 57 59 59 59 59 59 59 59 57
57 59 52 52 52 57 57 57 57 57 43 50 50 59 59 68 59 59 43 43 43 59 59 68 59 68 68 59 59 57 57 54 57 57 59 59 59 57 59 57 47 42 42 35 35 35 43 42 48 48
59 44 43 43 57 59 59 37 37 41 41 47 47 59 57 57 57 46 46 43 43 46 47 57 59 48 43 43 47 43 57 48 48 48 48 43 44 36 39 43 59 59 59 57 48 48 48 48 48 50
59 59 41 39 39 38 35 36 39 40 47 41 46 40 40 48 48 48 48 59 59 57 57 48 48 48 48 48 48 50 57 47 43 43 43 43 43 57 57 43 43 39 43 37 37 28 30 37 44 46
54 54 54 57 54 46 46 47 47 37 44 30 30 28 34 34 43 43 43 43 43 43 47 43 43 32 35 22 24 21 11 11 21 25 28 30 30 39 37 29 22 16 16 16 27 24 22 10 13 8
8 10 15 19 14 20 18 28 24 18 18 19 21 23 29 29 31 28 35 28 28 28 37 40 39 37 25 25 18 18 22 23 23 12 12 11 22 18 28 28 23 23 28 25 19 21 21 24 17 19
13 12 12 18 26 28 30 27 29 37 37 31 31 27 32 23 24 16 16 16 19 32 32 37 33 30 19 14 14 11 17 21 23 37 17 10 9 8 8 9 19 16 13 16 13 10 8 9 9 12
12 14 19 16 15 13 9 9 8 8 8 8 8 8 10 13 19 21 22 22 17 17 16 21 12 12 8 8 8 8 12 10 9 9 13 12 10 8 10 10 11 12 13 10 8 8 8 8 8 8
8 10 9 12 16 23 15 10 10 8 8 10 8 10 9 10 9 9 8 8 8 8 10 10 11 16 17 19 13 8 8 8 15 15 15 8 8 6 6 8 8 11 15 8 8 8 8 8 7 10
10 8 8 7 7 9 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 7 7 8 8 8 8 12 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 9 9 8 9 8 8 8 8 8
8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 10 11 8 8 8 10 10 8 8 8 6 8 7 6 8 8 10 10 10 11 10 12 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 8 8
8 8 8 8 9 12 12 19 22 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 9 9 6 8 6 6 8 10 9 8 8 9 9 12 11 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 10 9 9
9 10 10 10 10 11 9 9 9 15 13 10 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 14 7 7 8 8 6 6 8 8
8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 26 28 23 23 23 19 17 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 10
9 9 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 8 8 8 6 6 8 12 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 8 9 7 7 8 6 8 8
8 8 8 8 6 3 0 3 8 8 8 10 12 11 14 12 11 | Open.Hide. 7 7 7 3 0 3 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 11 6 6 6 6 8 10 15 8 6 8 6 8 10 12 19 19 22 9 10 10 17 19 29 17 28 31 21 21 10 10 11
24 21 35 35 35 36 53 53 50 50 50 50 42 39 23 15 9 9 9 10 11 16 12 10 11 9 9 8 8 8 7 9 9 23 23 31 31 31 31 31 36 53 53 53 57 59 57 53 53 53
41 41 37 46 46 23 19 9 9 10 10 9 9 9 10 10 12 12 14 9 14 13 15 16 28 25 17 11 11 11 17 19 37 37 37 50 50 44 44 53 47 50 50 42 42 53 53 53 53 53
50 59 59 59 57 48 48 48 50 48 43 43 42 46 48 43 43 43 50 47 50 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 68 57 59 59 59 59 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 57 59 59 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 43 43
43 52 52 52 59 59 68 59 59 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 43 43 50 50 44 44 43 52 52 57 59
59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 34 34 18 17 15 27 27 47 47 43 57 47 54 57 59 59 59 57 44 44 28 20 20 28 32 44 59 57 57 57 59 59 59 68 68
68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 47 47 47 36 30 25 21 11 11 11 18
29 36 41 46 46 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 43 43 36 43 47 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 39 39 23 20 11 11 12 29 34
59 59 68 59 59 57 57 46 46 43 44 46 57 59 59 59 57 57 57 44 44 42 47 54 48 48 43 48 48 57 57 57 50 43 44 43 33 33 37 50 50 50 57 57 57 54 50 50 43 42
42 59 47 52 52 57 57 57 44 44 23 23 23 44 44 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59
59 57 59 59 41 38 24 28 22 38 38 68 59 59 59 57 57 57 59 57 52 52 52 57 43 43 35 43 43 52 57 57 57 57 44 43 33 33 33 44 43 52 52 57 57 38 32 14 14 16
38 38 50 38 41 50 44 59 48 48 48 43 43 35 43 43 43 57 44 44 42 33 33 35 41 35 35 33 33 35 41 32 24 19 11 11 11 12 12 32 32 47 48 46 42 37 30 23 23 15
15 15 25 25 35 37 37 43 39 44 44 43 43 43 46 48 59 59 54 54 54 59 59 57 48 40 40 28 28 28 28 30 33 33 39 39 39 48 43 41 48 48 42 42 41 41 59 40 32 29
29 37 37 37 30 30 35 37 30 30 22 15 10 8 9 12 12 13 11 14 19 23 37 39 32 37 24 28 28 28 33 33 30 39 37 43 43 19 19 14 14 14 17 21 22 25 19 25 16 11
11 11 10 14 17 13 18 14 14 13 14 10 10 10 22 23 15 15 22 32 32 31 26 32 20 19 19 25 26 19 21 17 17 9 10 10 10 10 13 19 21 24 22 15 15 22 22 22 30 32
33 36 28 11 8 8 8 8 10 19 21 30 28 28 17 12 10 9 9 10 10 10 11 11 21 22 28 37 22 25 10 10 10 13 13 12 9 8 7 8 6 6 6 6 10 8 8 8 10 10
18 21 30 37 21 28 18 28 28 33 33 24 28 12 12 10 10 10 10 10 10 11 26 14 10 11 10 9 12 19 19 27 19 15 15 14 25 21 18 16 21 18 22 22 24 28 28 18 16 8
8 8 8 8 10 11 11 12 9 8 10 8 8 8 17 18 28 15 15 11 8 8 13 15 20 15 18 17 14 17 10 8 8 8 15 8 10 9 9 9 9 8 15 8 8 8 8 12 13 22
23 13 11 8 8 8 8 11 13 13 8 8 6 6 10 8 8 8 8 7 6 13 6 9 9 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 7 8 8 20 17 9 9 9 9 8 10 10 11 15 20
15 11 11 11 8 10 10 8 6 6 13 15 34 26 31 17 15 14 14 12 10 10 8 8 8 8 7 8 8 10 11 10 10 10 10 12 10 10 8 8 8 8 10 10 12 11 16 9 9 9
8 10 9 9 14 8 10 10 9 10 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 7 8 8 8 10 9 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
10 11 10 8 8 8 9 9 9 9 10 10 7 10 9 9 10 11 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 9 17 18 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9
10 8 8 8 8 8 8 8 15 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 10 9 9 6 6 6 6 8 8 10 13 10 12 12 9 9 9 11 9
9 9 13 10 8 6 8 6 6 6 10 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 7 7 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 |
|---|
