BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-167C04.T7 (MSMg01no167_c04.b1) | MSMg01-167C04.TJ (MSMg01no167_c04.g1) |
ACC | AG364737 | AG364738 |
length | 719 | 751 |
length of high quality (start - end) | 663 (36 - 698) | 278 (76 - 353) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no167_c04.b1 PHD_FILE: MSMg01no167_c04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:35:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no167_c04.g1 PHD_FILE: MSMg01no167_c04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:35:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTCAAC
TCCTCCAGCACCATGTCTGCCTGGATGCTGCCATGCTTCCCACCATGACA
ATAATGGACTAAACCTCCGAAACTGTAAGCCAGCCTCAATTAAATGTTTG
CCTTTATACGAGCTGCCTTGGTCATGATATCTCTTCACAGCAATGGAAAC
CCTAACTAAAACAAGCAGCAATAGAGGACATGGACTGTGGACCTCTATCC
TCCCAACCAGCACGCACACATACACCACATACACACATAATAATAATAAT
AATAATAATAATAATAATAATAATAATGTTTGACATTTTGACTTGAATAA
ATATTTCTCCATAAAAATACAACTTGTTAATAAGTACTTGTAAAGATATT
AAACATCACTAATCATTAGTAAAGTGTACACAATGAGGGCTGGAGAGATG
GCTCAGAAGTTAAGAGCACTTGCTGCTCTTGCAGAAGACTGGAGCTTTTT
TCCCAGCATGCACAGGGAGCAGCTCACAACCAGGGGATCTGACATTCTAT
CTGACCTCTATGGATACCCATAAACATGGAAACACACACAAGCACACAAG
CACACAAATAAAGTAAATTAAACAAGAAGAAAATAAGGTATTATGTCATA
CTCCTAAGACAGTTAGTAGTAAAAAGGAAAGAGATGGGTGTTGCTGAAGA
TGAGGAGGAATCCATTGTG
| CGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTTCTAACTGCACATGCTCCGTGG
TTGTTACTGGTCAGATCAGGAGGACAGACACTGGGCATCTGTCATGTGTT
GGTCCTCAAGGTGGGCACCAGGCATAGAGAACTGATCACTCATAACTACT
AATCAAGAAATATTAGCTGGGGCTGGTGGTGCTTGCTTGTAATCCCAACA
CTAGAGAGTCTGGGGCAGGAGGGTCACCATAAATTTGAGGTCAGCCTAGG
CTACATAGTCAAGAAATTAAATTAAAGGGGTGTGGGTTGGGAGTGGGGAG
ATGNNTTCTCCCCCCCCCCCCCGNAGCTTTTTTTAATGAATTATCTTTAC
CCCCAATTTCCCCCCCCCATTTAAATATTTCCCTCTTTTTTCTCTCCTTT
CTATGCTTTTTGCAATTTCTTATACATCTTCTCGCCTCCAACTGCTTTTT
TATTTTTGCCCTTTCTCTAGGCGGCTAATTCTATTCCCTTTAGACCACAT
TCCCTTACCCTGCGCATTTTTTAATTACTTTTCCCCCCTTTTAAACTGAT
TTTTTTTTTCTCCTCACCTTTTTCTCGCCCCCCCTGTTTATGTTTTTGTA
TTCCCCCAGCCCCCCTTTTTTGTTTTAATCTCCCGTCCCTTTTTCCCCCC
ACCCCTTCCCCACCTCTTTTTCTTGTTCCTTTTTTCACCCCCTCCATCTT
T
|
quality values | Open.Hide.11 11 25 25 41 39 21 15 8 8 8 15 19 37 59 30 30 31 29 29 15 23 12 12 12 10 10 11 11 11 15 15 21 22 28 28 59 47 48 36 36 36 36 50 36 36 33 33 33 32
26 28 23 21 18 14 12 18 24 28 30 33 33 31 31 50 53 53 57 57 59 59 53 53 53 53 53 53 57 50 50 50 50 53 53 68 68 68 47 47 47 47 47 51 51 51 50 50 50 50
50 51 68 68 68 54 54 54 57 57 59 59 57 57 57 57 57 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68
68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68
62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 52 52 43 59 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 59 57 57 57 57 52 52 57 57 52 52 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59
59 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 54 50 50 43 50 52 57 59 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 57 57 47 47 47 57 59 57 57 59 59
68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 68 54 54 57 57 57 59 54 54 54 47 47 43 43 46 57 57 57 57 57 48
48 57 48 48 48 48 43 43 43 48 48 57 57 57 57 48 44 43 43 40 37 37 32 32 30 30 32 41 44 41 37 44 44 44 44 44 41 37 44 44 44 41 41 59 43 43 40 40 40 59
59 43 46 46 30 30 24 28 13 24 22 31 30 43 46 43 48 48 40 40 40 41 39 39 44 41 41 37 37 37 37 31 31 20 26 19 22 30 39 39 39 37 39 37 41 28 27 13 14 14
30 30 24 17 17 25 20 25 28 31 35 37 37 39 39 43 35 35 28 | Open.Hide. 6 6 6 13 13 8 11 9 11 20 17 30 28 30 35 31 34 41 37 37 41 39 39 39 39 39 33 19 11 6 6 6 6 7 8 6 6 6 6 10 10 17 17 22 16 26 34 41 47 47
47 37 37 37 41 35 22 17 9 16 11 9 9 9 9 12 23 34 28 20 24 28 28 31 31 36 33 36 43 48 48 48 57 57 59 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 68
68 68 68 59 59 59 57 57 57 48 47 47 47 48 48 54 57 57 57 47 47 47 57 57 48 54 57 48 48 48 48 57 57 57 68 57 57 47 57 57 57 48 54 57 57 57 68 68 57 57
59 59 43 35 50 50 43 43 59 59 68 59 59 59 57 57 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 51 50 50 52 52 57 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57
59 57 57 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 52 57 57 59 59 68 68 59 59 52 57 57 59 57 57 57 59 59 68 57 57 54 57 57 57 59 54 54 54
50 50 59 59 57 59 59 59 48 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 44 57 43 42 42 44 44 54
57 57 59 59 59 68 59 59 47 43 36 36 30 28 28 25 23 28 20 20 20 23 41 37 59 59 59 57 48 48 48 59 48 47 43 39 39 43 47 43 48 59 59 59 59 40 40 40 37 37
23 25 3 0 0 3 8 13 13 22 15 10 12 11 21 13 16 15 10 9 9 9 3 0 3 9 9 8 8 10 10 10 10 19 14 9 9 8 10 10 18 10 10 11 11 13 13 11 11 10
10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 22 23 18 12 9 8 8 8 8 10 10 15 9 8 8 8 8 10 10 8 7 10 10 10 10 8 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8
9 8 8 8 8 8 10 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 6 6 10 8 8 13 15
11 12 12 13 12 12 8 8 15 19 21 18 8 8 8 8 8 8 8 11 10 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 6 7 10 10 11 10 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6
8 8 9 11 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 12 12 14 14 15 15 10 9 9 9 9 13 12 11 11 8 8 9 9 8 8
10 12 14 11 15 14 18 23 17 13 10 8 8 8 10 9 9 11 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 23 10 8 8 7 7 10 10 8 6 6 6 6 10 12 13 8 8 8 8
10 9 9 11 11 12 10 8 8 8 12 12 27 27 37 30 30 30 15 13 7 7 6 7 8 10 10 10 12 10 9 9 9 9 9 9 13 12 18 19 19 11 8 8 8 8 10 10 8 8
8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 13 13 10 8 8 7 6 8 8 10 10 10 9 12 12 11 12 12 18
14 |