BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-168C19.T7 (MSMg01no168_c19.b1) | MSMg01-168C19.TJ (MSMg01no168_c19.g1) |
ACC | AG365443 | AG365444 |
length | 1,008 | 1,154 |
length of high quality (start - end) | 447 (28 - 474) | 224 (499 - 722) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no168_c19.b1 PHD_FILE: MSMg01no168_c19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:37:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no168_c19.g1 PHD_FILE: MSMg01no168_c19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:37:13 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNTTGCTATGGGCCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTT
TGTTCAGCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTTTCTGGAG
TCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGTCCCCTATCCAA
TTTGGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCCATCTGTTGGTGGCCTTTTTGTCT
TATTGACGGTGTCTTTTGCTTTGCAGAAGCTTTGCAATTTTATGAGGTCC
CATTTATCGATTCTTGATCTTACAGCAAAAGCCATTGCTGTTCTATTCAG
GAATTTTTCCCCTGTACCCATATCTTTGAGGCTTTTCCCTACTTTCTCCT
CTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCCTTTTTTTTTTTA
GATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAGAAATGGATCAATTCTTTTTTTTTT
CCCCCCCCCCCCTCNAGTTGTGNCAGCACCAAAAAAAAAGGAGGCTGTCT
TTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATA
GGTGTGTGGGTTCATCTCTGGGTCTTCAATTCTGTTCCATTGGTCTACTT
GTCTGTCACTATACCAGTACCATGCAGTTTTGATCACAATTGGACATAGT
ACTACCGGAGGATCCCGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATG
TCCCAACCGATAAGAAGAACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTG
GTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCTCCAGAGGA
ATGGATACCGAAAATGTGGGTCTTTTTATCCATGGGATTTTTATTTTTCT
TTTTTTCAAAAGTAATTTTTTTATATCCCTTTCCCTATTTGCTTGTTCTT
TTTGCGTTCTTTTCTCCCCCCCTTGCTACCCCTCTCCTCCCCTTTTTCTT
TTTTTTCCCCTCTCCTCGTACTCCTCCTCTTTTCTTTTTATCTTTATCCT
CTATAACT
| NNNAAATCAAGGNTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACACAGGGTTGTCTGATGCCCTAGAGGGTC
TGTAACAGAAAAGGCTTGAGGTTATCATCTGGCACTCATCCTCTGGACTC
AAGGTCAGGTATGCAGACATTCTGCTAGATGGTTGGCTGGAGAACACTTT
TCAAGGGCCACAGACCCAGAAAAGTCTCCACAGCCATCCACAAAGACTAA
CGAGGATGCTAACTCATCCCAATTTCGTCCCCAAAAGCCAACCTTGGAGA
ATACAACCTTGTCTCCAGATTCTGTAAAAGCAACTGCAATGTGCCCCCTT
CCTAATAAGCCCAGGTCCTGGGGAAACAGATTGAAGTCTGGTATTTTTTT
ACAGTCTTGAGGCCAAGAGGAAAAGAGAAAAGTTCCGAGGGAATTTTTTT
TTCCCCCCCCCCTGAGAGGNAGAGGAAGCAAAAAAAAAAAGGGGAAGNAA
AGTCAGACTGATCCTATAGCAGCACAAGGAAAATGAGGCAATGACTATCC
CTGCAACCCTGAGCTCTCTGCTGGCACTGTGGGAGACATGTGCAATGTCT
CTGTATCCATACAGCACAAGGGATAGCCAAGGGTCTAGCTGTGTATTCAC
ATGGCCTTCCACCTTCAGGAAGCAGACAGGACAAAGACCAATCTGCTTAG
TGACAAGAAATGGAACCAAGACAGGGTACTGATGTCCACAGTACAAAAAG
TAGGCAGTGAAGCTGGGATAGCAGGTTTGGGAAAGTCAAGGTTAAGAGTT
CCAGACCTAGCCTGTGAACAAAGAAACTAGGATTTATATTGCTTCCTCCT
AAGTCCAAGGGGTCCTTCACAAGGGTCAAAGAGATCACTTATTCCCTCCG
CCCTTTTGAAAAAATCCCCAAAATTGGTTAATTTGGTTGGGGAAATCTAA
AAAAACCCTCCTAATTTTTTTTTTTTGAAAAATTTTTTTGAATATTATGT
ATTTCTCTTCCCTTTCTTTTTCAAATTTAGTAAATTTTTATTTTTATTTA
TTAAATTGTGTCTTTTCTTGCTTTTCTAAAAAAAACAATATTTTCTTTCT
CTCTTGCTTTGATATTCTTCTTTAATATATAATATTTATTATTTTCTCTC
CTTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 7 9 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 11 15 9 8 8 8 8 8 15 21 38 38 38 33 36 33 33 33 33 37 37 44 44 37 32 32 37 37 37 47 42
50 50 31 31 30 30 30 35 47 42 36 42 33 33 33 34 32 36 36 36 43 47 48 48 48 54 48 48 57 57 57 68 68 43 43 42 41 43 43 43 43 46 46 54 48 57 48 47 57 57
68 68 68 57 57 57 48 48 50 50 50 50 50 51 51 51 51 51 51 50 50 47 47 47 42 47 50 50 51 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 51 68 51 51 51
51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 26 9 9 9 10 19 41 44 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 62 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 48 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 23 29 15 14 10 10 9 8 8 8 11 21 21
47 47 50 50 50 50 53 53 57 57 59 59 57 57 57 57 57 50 57 57 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 46 27 25 12 16 19 23 25 29 37 30 23 13 11 11
11 19 19 22 23 32 32 27 32 26 24 14 18 3 0 3 29 29 41 23 23 3 0 3 15 15 16 11 11 11 10 12 12 14 13 11 11 12 11 9 9 9 9 9 12 21 37 41 59 59
59 59 59 59 59 59 59 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 68 59 57 54 57 57 57 57 57 68 68
68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59
54 54 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 59 44 39 40 39 39 34 34 39 39 39 39 39 34 34 39 39 40 41 36 36 36
43 43 48 48 57 57 47 47 42 36 34 37 34 34 39 47 36 34 25 25 25 37 37 41 47 59 59 44 44 41 37 37 44 44 44 47 47 41 41 41 41 41 41 39 32 17 19 11 14 14
23 11 11 10 17 18 28 32 30 30 23 24 14 20 13 18 18 31 32 37 41 41 41 41 40 40 32 34 23 23 23 28 34 39 48 48 48 48 37 34 31 28 28 34 28 27 18 12 9 9
9 9 15 16 30 37 25 18 8 8 8 8 8 10 12 12 12 14 17 12 10 10 10 15 15 18 17 14 12 13 11 8 8 12 8 15 8 12 13 13 8 8 8 8 8 12 16 18 10 13
12 14 11 10 13 11 11 12 12 13 14 17 21 16 20 19 17 12 9 10 10 9 9 17 9 11 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 10 9 9 12 12 9 13 10 8
10 10 10 8 8 9 9 10 13 10 8 6 6 8 10 12 15 11 14 13 15 10 8 8 15 8 8 6 6 6 8 8 8 8 12 8 8 8 10 8 8 8 8 10 6 6 8 8 13 17
11 10 9 10 10 13 13 15 19 24 19 18 16 11 11 12 15 12 24 22 11 11 11 11 6 8 6 6 10 8 8 10 10 18 18 18 15 15 11 9 9 14 10 9 9 12 12 12 13 12
21 19 15 13 12 12 15 23 19 10 10 10 11 10 9 10 9 9 9 10 10 8 10 11 16 12 10 15 12 11 10 11 10 15 19 16 15 12 8 6 8 7 7 10 8 10 8 8 6 6
6 8 8 8 8 8 8 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 8 8 6 6 6 6 9 9 15 9 8 9 8 10 13 25 19 14 10 10 10 19 19 27 10 19 10 16 12 10 10 12 24 21 43
43 43 19 34 28 43 43 43 43 57 42 42 35 35 32 42 37 46 46 43 43 43 43 43 37 37 36 30 22 28 24 40 28 33 32 35 35 35 36 40 18 18 11 13 13 32 19 20 20 27
31 32 42 37 32 32 20 15 15 16 16 18 32 32 43 32 33 33 43 44 43 32 32 32 32 30 37 37 37 32 24 36 32 22 43 43 52 52 52 52 43 43 32 32 28 32 35 43 43 52
52 43 43 38 38 38 44 44 35 35 33 43 38 38 13 13 13 26 26 39 43 42 43 39 34 34 19 19 20 38 35 44 35 35 29 35 31 31 23 32 18 17 18 38 38 45 52 52 57 57
57 43 39 39 39 43 43 52 62 43 43 31 31 31 44 38 38 14 14 14 20 20 26 43 43 35 43 43 43 43 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 44 44 27 27 27 39 39 35 43
39 39 39 35 35 35 43 42 52 52 57 52 39 39 39 37 37 52 57 57 52 52 52 43 43 35 38 38 43 50 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 57 43 43 38 38 18 23 17 17 17
38 38 48 57 57 57 43 43 43 43 32 36 35 43 32 38 23 23 23 38 36 42 42 24 24 13 13 17 30 30 41 32 32 35 42 35 42 42 28 28 27 32 32 47 44 59 43 48 43 46
43 43 39 37 37 31 36 32 32 35 42 47 39 39 35 24 28 24 25 15 34 19 25 25 40 28 30 14 14 14 28 28 34 34 34 28 28 23 26 18 15 10 9 16 12 11 8 8 8 10
13 22 26 25 28 23 34 32 39 35 39 39 57 41 34 15 15 15 24 24 25 18 18 18 24 24 39 39 59 47 43 43 43 31 31 14 14 12 25 18 11 11 13 11 11 13 13 11 11 11
11 11 9 9 11 9 9 9 17 14 15 10 10 15 13 20 15 27 3 0 3 15 12 11 11 11 11 11 9 18 9 8 10 10 10 10 10 9 9 10 10 17 11 11 11 14 3 0 3 27
23 41 32 32 20 20 20 28 28 43 39 43 37 43 43 30 30 32 40 40 40 40 30 39 39 46 46 48 57 57 43 43 43 39 39 31 41 44 44 44 30 30 39 39 43 47 47 47 59 44
41 41 30 44 44 48 47 40 36 24 24 14 18 18 28 41 42 42 42 35 41 41 33 37 36 28 25 30 17 24 24 12 12 12 12 12 32 24 28 23 36 36 34 32 30 30 30 41 41 39
39 42 35 37 37 43 43 43 43 41 41 37 42 39 42 42 47 48 40 40 25 25 25 33 25 37 37 47 43 43 40 40 23 23 28 32 35 37 28 28 23 23 23 28 31 37 34 30 32 32
34 33 24 29 27 28 37 32 34 28 28 28 37 30 37 28 34 28 28 24 25 23 24 11 12 12 25 25 36 39 39 40 32 23 15 11 11 18 23 23 30 30 37 37 36 32 16 16 11 11
12 19 26 34 34 23 20 20 28 28 28 20 22 28 37 34 32 28 20 20 19 23 22 24 15 12 12 12 18 18 28 23 28 28 28 30 32 30 20 13 11 11 18 20 30 28 28 28 25 17
21 14 14 15 24 19 16 16 12 11 10 10 12 19 13 10 10 10 14 10 19 22 23 16 11 11 11 15 12 11 9 8 8 8 8 11 16 28 23 17 12 10 9 15 9 9 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 9 10 8 9 8 9 8 12 13 18 21 18 23 25 19 19 14 14 14 18 26 19 19 19 13 10 11 9 8 8 8
8 10 10 11 11 15 17 15 12 10 13 10 9 9 9 13 10 6 6 6 10 8 16 9 10 10 10 10 11 10 11 11 11 11 11 16 16 13 11 11 11 10 12 7 7 6 6 6 6 8
8 11 14 21 19 19 11 8 8 10 8 9 8 9 9 9 11 17 10 10 10 11 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 15 15 8 8 8 6 8 11 10 11 11 14 15
19 26 15 10 9 9 9 11 11 15 16 13 13 10 10 9 8 8 8 10 10 10 13 10 13 10 10 12 12 11 11 12 12 23 19 20 19 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 13 16 10 10 8 8 6 6 10 8 8 6 6 10 8 10 8 10 16 10 10 11 15 12 15 10 8 8 8 10 8 9
10 9 9 9 9 8 10 11 10 8 8 9 10 10 12 10 8 8 8 8 8 8 23 10 10 10 10 13 10 12 11 21 20 11 8 8 8 8 8 10 11 18 9 11 9 8 8 8 8 8
8 9 10 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 6 7 9 9 9 15 15 8 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 9 12 12 11 14 12 21 16 16 10 8 8 8 8
8 8 10 8 |