BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-172M23.T7 (MSMg01no172_m23.b1) | MSMg01-172M23.TJ (MSMg01no172_m23.g1) |
ACC | AG368605 | AG368606 |
length | 711 | 716 |
length of high quality (start - end) | 316 (50 - 365) | 239 (127 - 365) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no172_m23.b1 PHD_FILE: MSMg01no172_m23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no172_m23.g1 PHD_FILE: MSMg01no172_m23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:21 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (149,378,970 - 149,379,278) | (149,494,647 - 149,494,883) |
---|
sequence | NATATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCCTTATCATTTCCATTATAGTTATTCCTTGTAACCATAATAT
AAACATAAATTTTCTTAGAAAGTCTGGCAAATTTTTGTATTTTAGTCAAC
AATTGAAAAATATAGGATATACTGCATTATAACTTCATGTAGATATCAAA
AAATGGTTCTGGGATAGTGGGAAAGGTGGTAGTAGACATTTTGTTGAATA
TAGGACTTCATTGATATCAAAGAGTGTTTGAGATTTATATAACAGAAATT
TCAGTAAAAAGCAGGAGACAATGTATGTTCCCAGACTGAAGTGCAGGTTC
TCAGTTCCTTCTTATTTTATTGCACACTCCCCACTGGGTCCACATAGATA
CCACCAGTAGACAGGCACTTAGCTTTCATAGAACTATCTATGCCTTGAAA
ACCCTTCTGGCTATTCCAGAACCCCTAGCTGAGTAGTATCTGCTTACCAG
ATGCAGTTCATTCAATACTTATAGACTAAGTCTATTGGATTATGGCACAA
CTTTGTTCAAAGTCCTTAATGTTTCATTTTTATTAAGTTGGAGATATGTG
CATGACACCACAAGCACAATAAATAATAAATAGTACATAACAAATAAATA
AATAATAAACAGTATTTATTTCACGAGTAGAAGAATTAACGGTTACGCTC
CCAGGCACTCC
| ATTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTACTCATTTAATATGTAAGCCTCTCT
CCTATTTTTATGTATCATTTCACCAATATGGCAATTTTACTTTGATATCT
TCATTTTAGACTGGTAACAATAAGGCTATTTCATACATCTTAATGGATGA
TTTTCAATTTTTTAACCAGTTATGAATGTAAAAAATTGTATAACTAATTC
TCTATTTGCCTTAAAAAATTTTAAACAGCTGGTTGTTTGTCAAGATTCAG
ACATAGCACTTACCCTGGCTTTATGTATGAAAAAGAAGTTTAGTCTAACA
GAAGGCATTTTTATTGTTCTCGCCCCCCCCCTGTCACCACTGTATATTAA
GCAGATGAATGCATCCATTTCCTGAAAATTGACAAAGATCAGGCTTGAAT
TTGAGGCTTAAGTTTAGAAAAACTTTTCTTTCTTCTGTATAAGAATTTTA
TTTCCACATTCTCTGACACATTTAGGTGTCTATCCTATTGCTTTCATATT
CTCTTTTTCCCCTGGCACCTCTTCATTTATGTTGCATGACTTTTTAGTAT
CTTTCCTTCAGCAATGAAATTAAAAAGAAAAAGATAAGAACCCTCCCCTT
CACTGCTCTTCTCACTCCTTTCAAGACAGTAACTTGTTCTGTGGCCCCAT
TGGCCTCAAACTCATG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 10 15 15 11 11 11 10 14 15 27 34 30 30 25 24 24 28 23 18 9 9 9 21 21 41 27 24 24 24 20 19 23 9 8 8 8 8 10 17 34 29 28 22 21 22 30
41 50 57 38 38 38 38 57 50 57 57 57 42 36 42 42 42 42 36 36 32 32 32 42 43 68 68 68 68 68 68 54 54 68 68 59 54 54 68 68 53 57 57 57 57 57 59 59 68 68
68 51 50 50 50 50 50 68 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 44 43 43 57 57 57 57 68 51 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57
57 57 57 57 57 57 57 46 46 46 46 46 48 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
50 50 50 50 50 50 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 50 50 54 54 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 57 57 54 57 57 57 48 48 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 48 57 57 57 57
43 39 39 43 43 48 48 48 57 48 48 48 48 48 59 37 37 35 35 23 19 8 10 8 8 8 10 16 32 28 39 39 39 47 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 59 59 59 57
48 48 48 48 41 59 59 27 25 10 10 8 7 7 8 7 7 7 7 7 10 15 7 9 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 16 12 12 27 26 28 32 30 35 31 39 39 40 40 43 44
59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 34 28 18 21 20 16 8 8 8 8 8 8 8 10 11 13 18 18 32 34 59 59 59 48 43 39 37 32 28 28
30 32 37 43 47 59 59 59 59 59 48 48 59 59 57 54 54 54 54 46 46 43 47 47 47 44 43 46 57 57 57 54 54 54 42 42 35 39 47 59 57 54 54 54 57 57 59 47 43 43
43 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 43 42 42 43 43 50 50 54 50 50 57 44 44 36 36 36 28 43 44 59 59 59 50 47 43 43 43 44 44 46 46 40 57 44 44 35 35 35
37 44 44 44 37 43 43 43 43 39 44 44 34 34 27 27 28 32 18 18 12 18 12 16 16 24 24 33 39 48 48 46 42 32 28 23 23 28 32 32 42 42 35 35 39 40 43 57 57 57
48 48 48 34 34 25 20 20 20 28 24 33 24 30 12 12 11 12 12 25 25 36 41 39 40 43 43 37 37 39 37 27 27 13 13 13 19 18 13 13 14 14 23 29 43 43 37 37 30 32
30 37 26 20 11 11 11 13 15 11 10 10 12 10 16 22 32 28 28 19 23 13 8 8 8 14 17 18 11 11 12 12 15 17 19 18 13 8 8 8 8 9 13 17 11 11 10 12 10 10
9 12 10 12 15 11 11 11 18 19 16 | Open.Hide. 6 6 6 8 6 6 8 11 13 29 32 36 37 41 41 50 50 50 50 50 48 50 57 57 57 57 57 53 48 48 34 34 23 28 24 28 29 26 30 30 24 23 28 14 14 28 34 42 50 50
42 42 42 40 36 40 44 57 44 42 41 41 37 41 41 41 40 44 33 42 48 41 48 50 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57
50 57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 50 41 28 15 11 8 8 8 17 9 9 9 11 11 11 13 21 25 37 37 37 48 48 48 50 57 59 59 59 57 57 50 50 50 53 50 50 50 50
50 50 50 54 57 59 59 57 59 59 57 57 57 57 54 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 52 54 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 59 57 57 57 54 43
43 43 43 44 57 44 48 48 57 57 59 59 59 59 57 57 57 54 54 32 32 28 37 32 30 30 39 34 59 47 57 57 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 57 59
59 59 59 59 47 40 40 47 59 27 19 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 14 21 19 15 12 12 17 17 12 18 21 34 37 59 59 50 48 57 48 48 48 57 43 57 59 59
59 59 59 59 59 59 57 53 48 48 43 43 43 43 47 44 57 48 57 47 47 37 35 35 30 22 8 8 8 8 8 10 10 13 25 24 36 39 43 44 44 43 37 40 40 47 43 48 48 48
48 43 47 43 43 43 43 43 43 43 43 43 54 57 43 46 43 43 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 54 59 59 44 41 27 26 26 44 44 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 48 48 48 57 48 48 48 59 50 57 57 57 57 50 50 57 57 43 43 43 59 43 52 52 44 44 48 48 48 59 59 59 59 57 57 59 57 57 48 48 48 57 57 57
54 54 54 59 59 57 54 54 54 57 57 57 57 42 42 28 32 32 47 47 54 34 34 20 20 20 32 34 47 54 59 57 57 54 54 54 54 54 54 54 57 57 59 43 41 32 37 30 28 40
40 48 59 57 57 48 37 30 24 17 17 17 24 24 30 37 37 43 39 39 37 32 28 32 24 21 15 17 17 30 29 30 23 23 21 24 16 23 18 24 24 31 35 32 35 30 37 32 18 19
21 32 32 33 36 47 30 30 21 30 30 34 23 23 23 34 34 46 43 37 37 32 29 23 27 20 15 15 21 23 17 20 26 32 23 17 11 11 11 21 19 23 18 18 18 18 25 23 31 24
30 24 25 25 22 32 37 32 29 29 35 36 32 33 30 25 |