BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-173B02.T7 (MSMg01no173_b02.b1) | MSMg01-173B02.TJ (MSMg01no173_b02.g1) |
ACC | AG368787 | AG368788 |
length | 722 | 703 |
length of high quality (start - end) | 321 (46 - 366) | 296 (57 - 352) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no173_b02.b1 PHD_FILE: MSMg01no173_b02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no173_b02.g1 PHD_FILE: MSMg01no173_b02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:40 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAAGGCCCATACCTAAACATGATAAAAGCAATATACAACAAACCAG
TAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCCACTAAAA
TCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGT
ACTTGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGA
TACAAATTGGAAAAGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATG
ATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCTACCAGAGAACTCCTAAACCT
GATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGCATATAAAATAAACTCAAACAAGT
CAATGGCCTTTCTCTATACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGAAATTAGG
GAAACAACACCCTTCTCAATAGTCACAAATAATATAAAATATCTTGGCGT
GACTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTATATGATAAAAACTTCAAATCTC
TGAAGAAAGAAATTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGC
TCATGGATTGGCAGGATCAACATTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGC
AATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATTCCAACTCAATTCTTCA
ACGAATTAGAAGGAGCAATTTG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXACCTCTCTTCAGGGTTGATGGGAAACAACTGCCTCAAAAGGGCC
CAACTTTTAAAGGCTTTCTTTGCTGTTGTTGCTTTGTGAAGTACGAATAC
CTGTGCTCATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAT
CATACACTCACTGATGATGGGGAATCACAAAGGAACTTAAACGATACATG
TGATAAGCTGTGTTTGAACACCATGTACTACCCATACTCCTAATGGGCAA
ATTATTATTTTTTTACTTTGATCATTATAATGTGATCAGCTTTATTTTAT
GTGCCCCTCCCCAACTCTTAAATTATTGAGAGAAGCAATCTGATTTGAGT
CAACATTTTCCTCCATAGCAGAATAGCCATATCTTTAGAAAGTTACAATG
TTCTATAATGTAGTACCTATATTTTCTAAGAAAGTTAAATGCTCAGTTTT
TAAAATGGTGTTATGCTGAAATTAACTGAAAAGGTTTGCTGTGAAAATTT
TAAGAAGGGTCTGAAAATTTTAATTGGTTAAAAAAAAGGGGCCCGAAAAA
AAAAAGGTCTTTAAAAAAAAGAAACAATTTTCTTTTGGAATTTTTTTTAT
ACACCCCGGAACACGCGCAAATAATTTAATACATTGAGCACTCTCTTATA
AAA
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 8 14 32 37 33 32 30 27 28 37 37 37 37 37 41 41 43 43 48 28 28 28 28 28 28 47 47 53 50 48 48 48 57 57 42 42 28 20 20 32 41 47 46 43
43 42 42 42 41 37 37 42 47 37 37 46 46 50 47 48 48 44 59 48 47 47 47 48 50 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 48 48 48 48 48 57 57 47 37 50 50
50 50 43 35 43 43 50 50 50 37 37 37 50 57 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 59 52 54 54 57 57 57 57 57 54 54 57 57 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57
52 52 52 57 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59
45 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 43 35 43 43 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 52 59 59 68 68 68 57
57 52 52 52 57 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 59 59 68 59 59 50 48 48 50 57 59 59 57 57 50 50 48 57 57 68 68 68 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 44 47 47 47 59 48 54 54 44 44 43 43 43 47 47 48 48 59 59 57 57 57 57 48 48 48 43 59 59 43 43 43 43
44 44 57 57 57 50 48 48 48 32 32 28 20 23 23 23 24 22 22 24 13 12 12 11 15 12 13 12 12 12 12 12 13 19 28 36 59 59 59 43 43 43 40 44 43 48 48 57 57 43
43 43 44 44 43 39 30 30 42 43 48 48 48 43 43 46 34 57 48 48 57 57 68 68 68 68 59 57 47 47 47 57 47 54 54 57 54 57 57 59 59 59 57 57 54 54 57 54 54 57
57 57 59 57 48 48 48 44 44 43 43 44 50 48 47 44 44 43 57 44 50 50 35 35 42 42 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 50 50 57 57 57 57
57 43 43 52 52 52 59 52 52 44 59 57 59 59 59 59 54 54 54 59 59 68 57 57 48 48 48 59 57 68 57 57 57 57 59 68 59 59 54 57 42 39 35 35 42 43 42 42 43 47
43 59 59 68 68 59 59 57 57 54 54 54 54 54 54 59 54 57 59 57 47 43 37 37 32 28 23 32 41 43 43 48 48 48 57 59 59 57 57 48 43 43 43 43 48 48 43 41 41 41
41 41 39 39 36 37 39 39 39 37 37 39 39 39 43 46 46 46 48 48 48 48 47 47 43 41 41 59 37 37 37 37 31 31 41 34 34 34 41 37 39 30 25 25 25 31 35 39 39 39
37 37 35 35 33 37 37 47 47 39 37 33 30 30 37 43 43 43 34 34 28 30 37 39 39 36 36 30 33 37 37 39 39 35 37 31 32 32 37 31 32 31 34 31 24 32 32 32 30 30
37 37 41 43 41 32 32 35 35 31 36 31 37 41 41 37 37 37 37 37 37 31 | Open.Hide.25 31 39 39 34 30 28 32 34 43 34 34 41 41 25 28 34 23 22 10 10 12 21 21 25 12 12 15 28 28 31 42 36 34 36 32 32 30 40 43 57 42 42 42 42 42 41 32 34 31
48 48 43 43 54 46 46 37 42 42 47 47 47 37 38 36 37 42 48 57 57 57 50 50 48 42 37 43 42 44 44 57 57 48 48 44 50 44 44 43 43 37 57 57 59 59 43 41 23 32
38 50 52 52 52 52 52 57 57 59 59 59 52 52 43 59 52 52 52 59 57 54 52 52 57 57 57 68 57 57 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 43 43 52 52
52 57 57 57 43 43 39 52 52 57 57 52 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52
57 57 57 59 57 52 52 52 45 45 52 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 43 43 43 52 52 52 52 59 57 59 44 44 43 43 43 50 50 57 52 52 52 50 50 43 52 52 59 57
57 68 68 57 50 50 35 35 43 50 59 68 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 44 57 57 57 48 48 48 57 57 54 54 48 57 48 48 47 47 43 43 47 44 47 43 59 59 59 59 59
59 68 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 48 59 57 57 48 48 48 48 48 57 48 57 57 46 46 43 46 46 48 48 39 39 35 31 26 28 25 23 20 20 28 34 25 21
12 11 11 11 18 15 10 10 10 10 10 12 12 12 15 25 28 47 59 59 59 59 59 59 50 57 57 59 59 59 59 59 57 48 40 40 37 40 43 46 46 48 48 57 57 59 59 59 59 35
37 37 47 47 57 59 37 37 35 35 35 34 34 43 30 34 36 37 37 37 37 36 36 30 30 24 17 18 25 34 39 47 47 59 30 29 13 13 12 23 15 28 22 12 15 8 8 8 13 17
23 23 28 28 37 32 37 30 30 18 12 9 9 9 10 9 12 16 10 11 11 14 18 18 13 10 9 9 7 7 7 9 8 11 8 9 10 10 10 13 8 8 8 11 8 8 9 14 21 18
16 19 15 17 9 12 12 12 12 12 18 15 15 15 17 11 10 12 10 8 8 11 11 11 10 10 10 10 8 8 8 9 10 14 9 10 10 10 8 8 10 10 9 10 9 10 11 11 8 8
10 8 8 8 9 9 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 10 9 9 10 10 8 9 9 9 10 8 19 12 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 10 12 12 15 19 21 28
25 26 30 18 11 10 10 10 10 6 6 8 7 7 13 22 16 10 11 11 11 12 7 12 9 9 10 6 11 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 13 10 9 11 12 12 17 13 9 9 9
6 6 6 6 8 9 9 8 6 6 8 6 11 8 8 8 8 8 8 10 14 8 8 8 12 12 8 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 7 10 7 7 7
11 12 7 |