BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-197M02.T7 (MSMg01no197_m02.b1) | MSMg01-197M02.TJ (MSMg01no197_m02.g1) |
ACC | AG385357 | AG385358 |
length | 720 | 804 |
length of high quality (start - end) | 676 (45 - 720) | 183 (79 - 261) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no197_m02.b1 PHD_FILE: MSMg01no197_m02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:17:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no197_m02.g1 PHD_FILE: MSMg01no197_m02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:17:45 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCTAAAATTACACTAGTAATTATTAAGCCCTTTATAATAGGACGGCT
GTTATAAGTCTTCTCTGATATGAATACTGCAATGAAAACTCTGACAGTCT
TCAAGTGTCATGAGTTAATTGCTTCTGAGATAGAAAGCAGGCATTTACAA
CTTAGAGCACATTCCAAGAGGTTGTAAAACAATTAACCAAAGGTCATGAC
TAACATTCATTATAGGTGCAAATACTGACTGAGTTTATCTATACAAAACT
TCAGTGTCAACTCAGACACAAAAATTATGGTTTTTAACTTTCCATGAACT
TGTGGAGCCAGTGACAGAAAATTAATGTTTAGACAGATAATTACTCTTAG
TGGCTATGCATGTAAACATTCTCTGTTGTAAACTTCTTATTCAATTTATG
ATTTGAACTTATGTTTGAACGTTTGGTGAACTTTTGTAAAAAAACAAAAG
GTGGGGGGAATGCTTGGAAAACTAGGCAGAAAAAACTAGAAATGATTGCA
TTGCAGGGTATTACTGCATCAGAGCAGGAGGAGAGAGCAAGATTAGGCAG
AGGAAGGAAAAAGACAGCAGAGTAGAATAACTTATGAATTAAAAGAGAAC
TTAGAAATTAAGAGAGAAATACACAGAATGCAGAGAGAAAGAGGGACAAA
GAAGCTGCAGAGAGAGCAGA
| TCGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGTACAGTCCTCTTGGCACTT
TTTCCATCTATAGATACACTGTTTACTTAACACTCTGATATATACAGTTG
CTGATGCTTTAAACTTTAATTGAGAGAAAGAGAAATTATGAAACAGAACT
GGACTTGGGAGAGTGGACCCTTCACCTTGCCTGGGCAACACAGTAAAACT
GGTTCTGGTAGAGGGGAAGTAGGTGAGGCAGCCAAGAGGGAGCAGAAAAG
TGACCCCCCCCCTCTGTGTCCCAGGGGACAGAAAGCACACCAACTGCCCC
CCCGGGGCCGGAGTGTTTGTTCCCTCCCTTTTATCCCCCCTGGAGGGGGG
GGGCCNCCAGACTGCTGCAGANTAATTGACTGCCGACGGGAGAAGTTGCC
GTGTAGACACGAAAAGTGGGTGGCCTCTTACCCCACCCCCATCTAACAAA
TGTCCCCCCACCCTTGTAAACTTTTTCAAGTCTCCTCCATCCCGGTCTCA
CCCGCAAATATCTTTTTCTCTTTTCTCCGTTCTATACCTTTACCTACCCC
ACCCACCCTTCTAACCCACCACCCCTTCCAACATTGAGCCATTTCCTTCC
GAATATACACCCTTATTTTTTCTATTTTTACCGTCTGCAATCCCCGTCTA
CACCCCCTTTTNNTTTCCCTATCTTTATAGTGACCCGGAGCAAAAGAAAT
AGACTCTCTATTTATTTTTTTCCCTTCTTCCTTCTCTCCCCCTTCCTTCT
CTTG
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 11 30 37 32 33 32 32 27 27 37 19 23 22 24 24 24 43 39 29 29 31 31 34 34 44 44 53 50 50 57 57 57 57 26 29 15 19 19 30 28 37 31 42 42
30 29 42 42 39 37 44 42 51 50 43 43 39 32 32 28 37 40 44 57 57 68 68 68 68 68 68 57 44 42 31 42 42 46 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 44 46 43 50 43 43
43 57 57 68 68 68 44 44 35 42 43 43 52 52 52 52 57 57 51 51 50 50 47 47 52 52 52 52 52 52 52 54 54 57 57 57 57 43 44 43 52 52 57 57 41 37 43 33 33 43
43 39 39 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 44 43 57 57 57 68 57 59 57 57 57 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
62 44 44 44 44 44 43 43 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 43 43 62 62 62 62 62
62 62 52 52 52 62 43 39 39 62 62 68 68 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 44 62 39 39 62 62 62 62 62
43 43 39 43 43 52 45 45 52 62 62 43 43 31 44 43 43 43 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62
62 52 62 62 62 44 44 39 39 43 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 68 68 57 57 43 43 39 57 44 59 59 57 39 43 43 57 57 68 68 68 59 59 57 57 52 52 43 44 44 52
52 52 57 57 59 59 59 57 54 54 54 54 59 59 59 59 52 52 52 52 52 57 43 50 41 59 43 52 52 59 59 59 59 59 57 54 54 59 59 57 57 47 47 57 57 59 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 54 59 54 57 57 59 59 59 47 47 43 44 43 46 46 54 59 59 59 59 59 57 57 54 57 57 68 68 68 57 57 57 54 54 57 57 59 59
43 43 43 43 44 57 59 43 44 39 39 42 47 43 57 48 59 59 48 48 48 48 41 41 59 41 41 41 43 39 41 44 37 37 37 37 37 39 59 43 44 43 48 48 48 48 48 48 59 59
46 41 41 41 41 39 39 41 44 41 43 37 47 46 43 43 47 43 33 37 30 37 37 41 43 41 37 37 44 44 44 47 59 59 59 59 48 48 47 39 39 39 30 30 30 24 26 37 37 41
41 43 41 37 37 37 37 44 44 37 37 41 37 37 37 37 37 37 41 41 41 47 59 59 41 31 31 37 37 34 39 39 41 47 43 41 37 37 39 39 37 37 39 37 39 41 41 36 37 41
34 34 34 34 37 37 30 30 29 29 31 41 43 59 59 59 41 37 37 32 32 20 19 19 26 25 29 27 34 34 25 25 34 34 47 43 44 41 41 37 41 37 29 22 19 24 24 22 22 39
39 32 32 30 28 32 23 15 14 18 18 34 34 41 41 32 32 23 28 24 | Open.Hide. 3 3 6 6 10 8 8 8 8 8 8 15 18 35 32 37 37 37 37 47 39 37 37 37 37 37 37 32 32 39 39 37 37 30 30 25 28 32 28 30 29 28 28 28 33 32 53 47 53 53
53 36 36 37 37 37 47 53 53 53 43 43 28 19 14 18 18 23 42 34 68 68 42 42 47 50 50 50 48 48 50 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 50 50 46 46 46 48 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 57 44 47 37 43 43 43 44 44 68 68 68 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
59 50 50 47 47 47 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 47 47 42 42 42 42 53 53 53 53 53 57 57 57 57 48 48 48
48 48 48 50 48 39 59 34 34 25 34 30 36 32 25 25 27 37 37 37 59 59 40 40 40 43 43 44 44 41 41 44 36 32 28 28 28 26 35 36 26 22 9 8 8 11 10 11 19 37
29 34 31 31 39 39 32 19 26 13 13 13 27 23 11 11 11 17 21 28 12 9 8 9 8 11 10 10 9 9 9 9 12 9 10 9 8 8 11 8 8 8 9 11 11 10 11 10 10 10
10 11 10 11 10 15 14 15 11 9 9 9 9 9 11 10 12 9 9 10 10 10 10 10 8 9 8 8 8 8 14 17 12 10 10 8 8 8 8 8 6 9 7 8 8 8 8 15 10 9
9 10 9 15 13 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 10 10 11 10 11 9 9 12 9 11 11 10 10 10 8 10 6 6 6 6 6 14 20 14 10 8 6 6 6 9 13 13 15 17 17
13 10 8 8 3 0 3 8 6 6 6 15 19 30 16 12 9 15 9 9 3 0 3 7 6 8 8 6 9 9 9 6 8 6 6 8 8 11 10 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8
10 10 9 6 6 6 6 8 8 10 11 12 17 17 9 10 9 9 9 9 12 10 8 8 11 10 9 8 6 6 6 13 8 11 11 11 16 16 15 9 10 10 8 8 8 8 13 14 14 10
8 8 8 6 7 11 10 10 10 13 12 15 11 11 10 10 11 13 12 12 14 14 18 25 19 16 16 10 10 8 10 6 6 8 8 8 8 8 10 12 10 11 11 10 9 9 9 8 6 6
6 7 7 10 8 8 8 8 8 8 8 10 14 16 12 11 8 13 8 8 8 11 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 11 10 10 10 15
10 10 10 11 11 11 15 15 12 12 12 10 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 10 10 11 19 13 11 9 9 10 10 10 8 8 8 6 6 6 8 9 10 10 10 10 10 12 10 10 9
9 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 13 10 10 10 11 15 21 13 9 8 8 8 8 10 12 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 13 10 8 8 8 8 8 11 11
11 11 10 9 7 6 6 8 8 13 3 0 0 3 8 8 8 9 8 8 8 8 10 10 10 10 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 9 11 11 9 9 9 12 9 7
6 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 11 8 8 8 11 18 11 9 8 8 8 8 8 9 9 9 13 10 10 10 16 15 9 6 8 6 6 8 12 13 9 13 9 9 7 10 9 14 12
8 8 8 7 |