BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-217G08.T7 (MSMg01no217_g08.b1) | MSMg01-217G08.TJ (MSMg01no217_g08.g1) |
ACC | AG396935 | AG396936 |
length | 1,345 | 718 |
length of high quality (start - end) | 422 (30 - 451) | 236 (126 - 361) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_g08.b1 PHD_FILE: MSMg01no217_g08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_g08.g1 PHD_FILE: MSMg01no217_g08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:54 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNGGTCAGTGTGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CTATGAATCCTCTACCCTGTAGTTATCCAGGACTGGTCGAATTTTTTAGG
TAAGATGATTTTGAGTATATTCATCCACGTAGTTTATATGTCAGTGACAG
TTATGAGTGAAATGTAATAAATATAAAGACCTTTCCTCTGTTTTTGTCAA
GTCATAGTGTGAAAATTAACTAACTGGCAGCATATGGGCATGATATTATC
CCAGTCTCCATTTCAAATCTTTGCATTCAGATAGAACAGGGTGATATAAC
TTTGATGGTATAAGACTACATTGAACAAGGTACTTGTGCCCATGAGGAAT
ATAGCTTCATAGCTCCTTTTTAATCAGTGATTAGCCTATAAATTGGCATG
ATTTATAGAGTTACAGATGCACCCTCCTGTTGGTCCCATTTCTTCTGTGT
TTTTTTTTTCCCCCCCCCCCTCTNAAGTGTGGTTTATCTAAAAAAAAAGG
GGGGTTGATATTCATATCCATTGTCTCTAAGTAGTACCTCTAACTGCTGA
GATTTGGTCTGTTGCTATGTATGTAATGCTAAATTCTATAACTGAGGTTC
TGGGCCTACAAATGAGTTCTCATGTTTACATGGTTTTGTGAAAACCTTGT
TCCTTCATTTAAAAGTATTGTTTAAATAAAATTCACTACAGTCAATTACT
TGGAGGGATTAGAAGCAGGTGGGTTTTGAGTTATCTTTTTGAGGTAGAGA
AGATATAGTATATAGAGAGTCCAGTATGACATGGAGCTAAAGGTGAATGT
ATAAGGTTTTCACCCATGTATTACATGAATCTTGGTATCATGTCCATTTA
CTTTATCTGATTGTATTAAATACTACCTTATATGTCAAATATTTAATGTG
AATTATTGACTGGAAATTATATTTCTATTCTTCAAAGCCCTTATACTTTT
CTGTCCTTTTTAATTAATATGATCGTTTATATCTTCCATTCTTTAACTAT
ATGATTTCACCTTATTACATATTTCCCGTTTTTTATTTAATTTATTTAAC
CCATAATTATAACTCTATTATGATTACTCTATTTTTTCTATATTCTCCAA
TCCTATTTCTCATTATCTCTATAAATATTTGATTTCTACTCTATCTTTTT
TTTTTATTACTATTCTCAGCTATATAATAATTCTTTTTTCACTTCTCTGT
TTTTCTTATATCATTTTCATACTTATTCTCCTTCTATTTTTCTTCACTAT
TCTTCTTTTCCTATATACAGTTCTTATTACCTACTCTATTATGTGCATCT
CTATATTAATTGATTGAATATATCATATACTATTAATTATCACTA
| CCATGATGTGCGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACATAAAACCAGACACAATGAAACG
TATAGAGGAGAAAGTATGGAAAACTCTCGAAGATATGGGCACAGGAGAAA
AAATTCCTGAAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCAAGAATCGACT
AATGAGACCTCATAAAATTGCAAAGCTTCTGTAAGGCAAAAGACACTGTC
AATAATACAAAAAGGCCACCAACAGATTGGGAAATGCAAATCATAACAAC
CATGATATTCCAACTCACACCTTTCTGAATGGCTAAGATGGAAAATTAAG
GTGACTGCAGATGTTTTTTTAGCACCCCCAGCAACCCCACCGCTCTATTG
CTGGTGGTATTGCAAGCTGGTACACACGACTTAGAAAATCATTCTGGCCA
TTTCTCAGAATATTGGACATAGTATGTAGTATTTTTATTCATATGAAATA
ATGACTTTTCTTGTGATGCATTCATACACACATATCATTGTTCTCTCTCT
CTCTCTGCATGAGTGCGCGCCTTTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGA
TACAGACAGTGATAGAGAGTTATCGTCACTTTCTTTCTCCTTTTTTTCTT
CCACTTTTCTTTTTTCTCCCCTTTTTTTTTATTTCCCCTTTATCCCCCCC
TCCCCCCATTCTCTCTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 9 9 10 10 10 16 11 14 13 19 10 8 8 12 16 10 8 8 10 12 13 15 16 34 39 28 28 24 22 22 29 33 33 37 37 39 37 32 29 30 37 41
37 37 37 37 37 48 48 48 59 57 47 47 47 53 43 42 42 42 40 40 40 37 47 42 43 43 39 39 39 35 39 39 48 48 48 50 50 51 46 46 42 42 48 48 47 42 42 37 37 28
28 28 32 40 59 59 57 57 57 68 68 57 57 46 46 46 46 50 57 57 57 47 47 30 32 12 11 10 10 13 17 24 43 57 50 57 57 57 57 47 48 48 57 57 57 54 57 57 57 50
50 50 50 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 44 44 43 62 52 62 62 62 68 68 68 68
62 62 52 52 47 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 68 62 62 52 45 45 57 57 52 52 52 52 52 57 57 39 39 39 43 57 57 59 57 57 57 57
59 59 57 57 57 57 52 52 52 52 44 44 33 33 33 43 43 57 57 57 57 59 59 52 43 43 57 43 37 37 43 43 52 57 59 52 52 43 43 52 52 52 43 44 43 52 57 57 57 52
52 52 52 43 43 52 50 43 43 44 44 44 43 43 50 57 57 57 57 57 57 48 48 42 59 43 43 37 44 57 44 44 37 39 43 43 57 57 48 57 59 59 43 44 37 37 32 25 24 27
27 32 44 32 27 12 11 11 18 23 36 42 37 35 35 35 37 43 43 54 54 54 59 59 59 48 47 43 43 37 43 37 41 41 43 39 59 39 47 47 48 48 47 46 34 34 30 28 26 23
20 18 19 26 28 28 21 19 11 11 11 13 21 30 37 39 32 19 12 9 9 9 3 0 3 27 27 30 28 16 10 10 8 8 8 10 10 12 12 14 14 27 32 18 16 9 8 8 8 11
9 12 9 6 6 6 7 15 14 6 6 8 10 17 36 41 47 46 48 44 44 39 47 39 48 59 59 59 47 41 32 29 16 16 15 19 26 31 43 43 54 43 42 28 28 20 41 25 40 30
30 30 42 40 42 22 22 22 32 32 42 47 59 44 44 43 44 44 57 44 44 46 57 44 43 42 42 35 35 35 33 33 42 42 42 44 47 47 44 43 43 41 30 32 14 14 24 32 42 59
44 30 24 14 14 14 32 32 39 35 35 35 32 32 28 28 37 44 46 59 54 44 41 28 19 19 27 27 20 23 23 14 14 17 24 26 32 24 24 26 26 23 33 37 33 33 33 33 31 31
22 24 24 32 32 28 28 28 34 34 24 25 31 31 37 39 41 37 33 32 30 25 22 23 19 19 24 29 33 33 24 28 17 16 10 10 16 19 19 22 28 19 22 12 12 19 15 14 17 19
15 10 14 12 13 9 12 12 19 19 11 15 15 11 11 11 16 16 16 11 11 10 9 9 9 9 12 17 15 15 8 15 6 6 8 12 19 19 28 16 16 11 11 11 11 9 9 11 12 11
11 11 11 15 14 18 10 10 8 8 8 8 9 11 11 10 11 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 10 10 9 10 12 11 10 10 12 6 9
11 10 10 8 11 11 11 8 8 8 8 8 11 13 8 8 8 8 10 7 9 13 11 8 6 8 8 8 8 8 10 10 15 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 9
9 10 10 10 8 8 6 6 8 10 19 19 10 10 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 11 9 10 10 13 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 13 11 11
11 11 13 18 19 22 12 8 8 8 8 8 8 9 9 10 13 15 14 16 14 10 10 8 8 8 8 8 11 11 12 19 16 12 10 9 9 9 9 9 10 10 10 10 9 10 11 17 11 8
8 8 8 8 10 13 19 10 8 8 7 7 10 10 10 12 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 7 8 6 6 8 8 10 10 10 10 12 12 12 12 12 12 14 11 10 10 9 8 8 8
10 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 6 8 9 12 16 19 13 11 8 10 9 9 8 9 8 11 8 11 11 11 16 12 15 11 9 8 8 10 15 17 10 10 10 10
11 10 9 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 10 10 11 8 8 9 9 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 10 8 9 9 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 10 18 13
10 11 6 6 6 6 6 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 7 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 7 7 6 8 8 10 19 18 14 9 9 10 8 10 8 8 8 8 6 8
8 12 8 8 8 13 8 8 6 6 8 8 10 10 18 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 12 8 8 8 8 8 8 9 10 15 14 10 12
8 7 7 10 7 9 8 8 10 8 8 8 6 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 7 7 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 8 10 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 10 8
8 8 8 7 7 10 9 7 10 8 9 9 9 9 7 7 7 8 10 10 8 10 10 9 9 9 10 8 8 8 6 6 8 13 10 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 10 10 10 9 9 15 9 9 9 9 9 14 30 37 37 39 30 33 30 37 37 43 43 43 43 40 40 40 41 37 23 23 10 10 10 15 17 24 25 24 11 11 11 24 27 37 28
28 28 37 32 37 28 28 28 37 26 29 33 24 28 23 24 24 21 13 17 22 22 29 21 20 20 32 32 32 23 27 23 28 28 37 39 40 39 39 35 35 35 37 39 42 37 35 35 35 42
42 44 36 25 23 28 28 28 28 36 36 42 42 37 23 19 19 13 14 15 16 11 11 11 11 11 24 21 38 38 35 35 35 50 36 36 25 17 20 38 38 43 37 33 43 28 33 43 57 57
50 50 46 46 46 46 57 52 44 42 32 26 32 43 43 52 43 43 39 39 39 43 43 52 57 59 57 59 59 59 57 57 43 39 33 33 33 44 42 33 33 33 42 39 37 37 37 37 57 57
43 43 32 33 24 32 43 50 57 57 32 32 20 21 20 32 32 50 43 43 35 35 42 43 52 52 52 44 44 42 33 33 43 36 42 33 33 31 35 35 35 35 37 37 42 42 57 57 57 43
32 32 24 16 11 11 11 20 24 35 35 35 35 37 42 43 43 43 42 41 41 39 39 37 37 39 42 37 28 28 32 28 42 44 44 44 37 35 35 35 30 30 12 12 12 19 19 25 28 28
36 36 43 40 40 48 43 43 33 33 28 37 37 34 32 28 28 28 37 28 32 30 30 10 8 8 8 8 15 28 25 25 30 28 34 23 23 28 31 28 28 28 28 28 35 34 36 25 19 19
30 17 20 28 28 28 28 24 15 12 9 8 8 8 8 12 12 8 8 8 9 9 11 12 12 12 10 12 9 9 9 9 9 9 9 11 11 13 15 15 22 19 25 29 30 25 35 28 34 34
32 24 21 21 13 13 12 12 10 21 28 23 20 20 17 20 27 31 26 28 30 26 15 17 8 8 8 9 15 10 10 10 10 10 10 18 27 24 19 19 19 12 12 15 16 14 10 10 10 16
22 37 37 30 24 28 23 19 15 10 10 10 22 20 12 13 13 15 20 16 11 11 15 18 20 13 9 8 8 8 8 10 21 28 43 43 43 37 37 37 43 36 36 34 39 28 34 25 25 25
40 28 28 22 22 22 18 26 20 23 23 34 34 39 32 30 28 28 28 30 32 47 36 36 25 25 12 12 11 12 11 12 12 22 22 16 12 11 11 10 10 9 9 8 8 10 12 12 27 30
19 20 18 19 18 23 15 13 18 12 9 9 9 10 8 8 8 8 9 12 12 12 12 16 12 12 18 22 15 12 11 9 10 10 10 15 10 10 10 10 12 21 13 10 8 8 8 8 8 8
8 9 12 9 9 11 15 11 11 11 10 10 10 10 10 11 12 12 10 10 10 10 9 9 9 9 8 8 8 6 8 10 10 10 15 12 13 8 8 8 8 10 10 10 11 10 10 9 9 11
14 9 10 14 19 21 24 20 17 17 26 23 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 22 23 14 14 15 11 8 9 9 10 10 15 14 14 12 13 11 11 11 12 16 10 8 8 8 10 10
10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 |