BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305I01.T7 (MSMg01no305_i01.b1) | MSMg01-305I01.TJ (MSMg01no305_i01.g1) |
ACC | AG430448 | AG430449 |
length | 1,254 | 1,251 |
length of high quality (start - end) | 409 (31 - 439) | 391 (71 - 461) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_i01.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_i01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:31 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_i01.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_i01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:31 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGGGCTCACTCGNCCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CTACATAGTTATTTATTTAGTAATATTTCCTAGTGCCTTTATACATCATA
CCATTACTTTTCTTATTGTGTATTCTCCTAATTCCCAAACAATTATCAAT
AATATACTACTGCTTTTCTTTCCCTTGGAGTTTTTCATCCAATTTAAGAT
GTTAACTCAATGAATATAGCCATGGGATCTTTGTAAATATACTGACAGTT
TGAGATTACAAACATCTTTTTACACAAGTTGATTGCATATTGTCATTTTT
TTTTCTGAAATGCTCAGTAGGAAAGAAGAGCTTAACAGATGAGCAGATAT
GACTTAACTTCACCATTATCCAATCTAAGCAGCTCAAGATCTCTTTGTTT
ATGCTTGTTTTTCTGCTGGTCTCTCTTTCTTTTTCNTNTTCCNTTTTTTT
TTTTTCTCCCCCCCCCCNCNTTTTTCCTTTTTCTTAAAAAAAAAAGAGGG
CGTTTTTGNTTCTTTTTGAGTTTTGCGTTTTGTGTTTTGACCCTTTGACA
GGAAGTTATCCCCAGCTGCAATTTCACCAACCAAAATTACATCCTGAAGC
GACTGTTAGTTTAGTACATTAGCAGGGGCTACAATTTCAATGTGACATTC
CACTAATTGTTATTAGGCTTAAAAGACTCCAAATTCCAGAGATGACCTTT
TCAGAACTGCCTAATTGGAAGAGTTCCCATCCTTCCCAGGGACTTCATAT
TTAGCATCTATAAATAATCTACAGGAACATTTGCCAATATCAAGCACACT
GTGAAGTCACTTCCACTTATTCTGATCCCCACATCTTATCCCATTCATCA
CTTGGACTGAAGCATTTAACCGCTATCAGCCTTCTTTCCTAACAATGGTA
ATTATTTCCAGCATTTTTAATGGAAAATTCAATTATAAAACCTTCAAAGA
CTTACCCCATTTAAATGCAATAAAAACTATCAGCTTAACAATAAATAAAG
GATAAAAGCTAAACCTTTAAAGATAAAAGAATCTGAGGATAGCCTTAACT
TGAAGCAAAATCTCGAAAGGGGAAACCCTAAATCTAAAAACTATTCTTTT
CATTTAACGAGAACCCTTTAGACCGGTTTTAAAACCCCTCCCGAATAGGG
TTTTGGGCTTTTTATTTCTTCTTAAAAAAAAAAATTGCTTTTTGGCCCCG
GCCTATACAAAAAAAATCTTCTAACAACTTTTTAATTTGGTATTTATAAC
CCAA
| NNGGATTTCACGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGATCTGGCCATAGATTAATCAACATCCT
GGCCTTTTGATGCACCTGCTGCAAGCAAAACACAATCTCCCCAGGTGTGG
CTTGGCATGATTGAGAGGTAGTCAGTGATAAGACTCCCTGGGCATGTCAC
CAACCTAAGACAGGGATCAAACCAATGCTGTTTGTCACCCAAGGACGGGT
AAGGGGCATGGCTGCGGGGGGCTATCTACAGACATTCTCTCTGCCAAAAA
AGAAAAAAGGGGGAATTGTTAGGAGCAGGTGTGGCGGCAGTCCTAAAGGC
GCCAGGGACTGTAGCTAAGTCATATGACTTGCACCTGACTTCCTCATATT
TTTTACAAACATCTTGAGTGCTGCGCAGGTGTACCAGGATTCAGGTGAAT
CTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCTGNTGNCCTGATTAACTAAAAAAAAGG
GGCTGGTGAGGTGGCGTGACCTGCTGTGCGTGGATGGGAACTGAGAGTAT
AAAAGAGTGAGAGGCCCGGGTTAGAGGGAGGATTATTATTCGAGAGAGGA
TTACTATTAGGGGGGAGATATAAACAGGGGAGATATAAACAAGGGAGATA
TAAACAAGGAAGATATAAACAGGGGAGATATAAACAAGGGAGATATAAAC
AAGAAGAAATAGGACTGAATAAACGTGTGCAGAAGGATCCTGTAGCAGTG
TCGTTCTTGCTGGCGAGTTGGGGGCGCGCTCGACAGTCTGCACAACTCTT
CGAGGCTTTTCCCCACTTTCTCCTCTATAAGTTTCATTGTCTCTGGTTTT
ATGTGGAGTTCCTTGATCCACTTAGGTTTGACCTTGGTACAAGGAGATAG
GAATGGATCGATTTGCATTCTTCTAAATAATAACCACCAGTTGTGCCAGC
ACCATTTTTTGAAATGCTGTCTTTTCTCCCCTGGATGGTTTTTTTCTCCC
TTGCCAAAAATCAATGGACCAAGGGGGGGGTTCATTTTCTGGGCTTCAAT
TCATTTCATTGGGCCAATTGTCTGCCAAAAATCAATTACCATGGCTTTTT
TACCCAATGTTCTTTAACAAAGCCTTTATAAATTGTGGGTTCCCCCAAAG
TTTTTTATTTTCTAAAAAATTTTTCTCCCCACGTTTTTTTTATCTCCCCA
AAATTTCCAACTCATTTTTTTTTTTTTTATAACAATCTGATCTTTATGTC
C
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 8 9 9 9 9 9 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 13 9 8 8 8 8 8 19 21 36 31 36 33 28 28 33 33 33 33 37 39 39 39 39 39 39 29
28 23 14 14 10 23 23 36 36 36 36 53 53 53 53 53 50 50 47 53 47 48 48 50 50 50 54 68 68 68 47 47 47 47 51 48 46 42 42 47 47 39 39 39 48 48 48 48 54 54
57 57 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 50 50 68 68 51 51 51 50 51 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50
50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 62 62 62 57 52 52 57 57 57 68 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 68 68
57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 43 36 34 32 35 28 28 27 44 44 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 53 50 50 50 41 47 47 59 27 33 12 12 11 12 12
12 13 30 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 59 39 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 23 27 3 0 3 0 3 7 7 3 0 3 27 27 29 12 19 29
39 39 27 25 12 10 10 10 17 19 26 32 21 21 13 13 3 0 3 0 3 29 29 59 38 41 28 18 20 20 15 15 15 11 11 11 12 16 25 29 24 24 19 7 6 6 6 6 6 10
10 10 10 21 30 29 29 3 0 3 29 29 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 57 68 57 57 57
57 48 43 43 43 59 59 59 59 59 59 57 57 54 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 68 68 57
57 59 68 68 68 59 59 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 43 59 47 43 57 57 57 57 57 59 59 59 59 47 47 47 47 44 44 44 37 37 44 44 39 41 42 50 42 48 48 48
48 50 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 43 43 25 25 25 43 43 57 57 57 57 57 59 59 59 59 47 43 40 43 43 39 39 39 37 37 37 41 41
39 47 35 36 31 37 43 59 59 59 59 27 27 12 12 12 17 19 37 23 27 12 14 15 32 32 47 41 41 30 32 32 47 39 43 37 37 37 38 43 43 42 43 43 48 48 48 48 47 47
37 44 43 50 59 59 59 59 59 59 44 32 31 25 24 15 15 20 23 21 30 28 41 41 30 24 23 25 30 30 39 32 30 28 27 30 32 39 39 40 39 39 39 59 59 43 43 43 43 43
37 43 37 39 30 30 21 23 12 14 17 25 21 25 30 32 22 23 10 9 9 10 16 25 28 28 25 24 26 29 32 37 37 23 23 12 13 10 16 11 8 8 8 19 19 32 32 28 31 28
28 18 20 14 13 25 19 22 19 13 10 12 12 17 19 9 10 9 13 10 14 15 12 8 10 8 8 8 8 11 11 17 13 14 14 21 18 15 10 15 12 11 11 11 11 19 13 10 10 10
12 10 9 10 10 9 9 10 17 15 8 8 6 7 9 9 9 14 14 20 23 16 11 9 9 9 19 13 13 12 17 17 12 15 16 17 23 22 16 10 9 10 13 10 8 10 10 10 10 11
16 9 11 12 9 8 8 9 13 12 27 34 15 15 12 15 10 13 13 12 13 21 25 27 27 25 10 10 6 6 6 8 9 9 10 13 10 12 12 14 34 22 25 23 28 15 10 9 9 9
9 9 9 13 14 20 13 10 10 10 10 10 10 13 10 11 12 25 16 19 12 15 11 11 11 16 19 11 11 11 10 10 10 8 10 8 13 10 9 12 9 10 9 10 10 11 9 9 8 8
6 6 8 6 6 8 8 17 15 9 10 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 16 11 12 12 19 16 13 10 10 10 10 9 14 14 9 10 9 8 7 6 9 9 13 13 13
10 10 12 23 12 9 9 7 7 7 8 8 8 12 12 15 13 12 11 11 12 9 9 9 9 10 15 17 12 12 12 16 15 17 28 18 14 10 9 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9
9 8 17 10 10 10 12 12 19 20 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 17 22 30 30 23 19 14 14 10 10 11 11 11 16 14 16 21 14 13 13 10 11 9 10 9
9 17 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 6 6 6 6 6 8 7 6 8 7 6 8 8 9 9 10 10 10 11 10 10 10 7 7 11 13 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 7 7 7 7 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 10 15 9 7 9 8 15 11 19 23 22 22 9 13 13 30 23 36 30 30 30 36 36 36 37 37 37 47
50 50 53 53 50 57 57 57 68 68 68 68 68 57 46 43 43 36 36 42 42 32 33 43 48 48 57 48 50 50 68 68 50 50 50 50 50 42 48 25 25 24 20 23 23 44 44 57 57 57
37 44 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 48 48 48 48 48 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68
68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 68 68 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 42 42 35 35 35 35 42 44 44 57 59 68 68 68 68 68 57 57 54 59 59 57 57 68 68 68 57
59 57 57 57 53 50 50 50 50 50 54 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 50 50 57 57 53 53 59 59 59 59 47 47 22 26 13 11
11 10 11 9 11 11 16 25 36 59 59 59 59 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 57 48 43 47 39 39 47 47 53 44 50 59 59 46 37 37 23 19 10
10 10 14 18 30 39 37 27 21 14 14 14 18 18 17 17 17 16 16 16 27 30 27 27 3 0 3 3 0 3 27 27 41 41 34 34 18 13 9 11 12 18 25 24 22 13 12 10 10 10
12 12 12 12 12 27 25 50 50 50 50 53 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 59 57 68 68 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 59 57 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 48 48 48 48 59 59 68 59 48 48 43 48 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 53 48 48 48 48 48 48 50 50 47 59 47
44 44 41 37 37 44 41 41 44 59 44 41 41 39 39 39 39 37 39 39 44 44 47 47 47 47 59 59 59 59 41 37 37 32 27 27 32 39 39 41 59 27 25 11 11 11 23 23 39 46
41 42 30 30 18 28 32 39 39 41 44 41 41 25 21 9 10 7 7 8 7 7 12 10 15 23 24 26 26 18 14 14 24 17 24 34 34 34 37 43 59 48 48 48 37 37 28 37 28 28
22 24 14 24 21 37 25 25 21 22 16 21 17 17 19 28 39 39 37 36 36 37 37 37 37 37 30 23 13 10 13 10 9 10 14 24 12 17 10 10 10 10 13 13 10 15 16 17 16 24
30 34 28 22 17 24 11 13 12 9 10 10 16 22 22 19 16 16 14 14 14 17 22 15 12 12 12 10 16 11 15 15 18 15 15 12 13 14 12 8 8 8 8 15 11 10 10 16 13 17
24 18 16 17 11 11 11 13 17 17 22 16 16 14 17 18 17 22 21 26 18 18 19 10 10 10 10 10 12 17 19 14 15 10 10 9 9 12 10 14 14 20 22 28 16 13 11 10 10 10
11 11 15 15 18 19 16 15 14 8 8 9 25 22 30 22 22 23 20 21 22 20 14 11 11 11 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 13 18 21 19 25 14 14 12 12 11 17 9
8 8 8 8 8 10 14 16 19 10 11 9 9 8 8 8 8 10 10 11 11 19 14 12 12 13 12 12 21 19 17 11 11 11 11 22 16 12 12 10 10 9 9 8 8 8 11 11 8 13
8 8 10 10 10 10 9 9 9 13 8 11 9 9 9 10 12 9 11 11 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 6 6 12 16 19 21 14 15
9 9 8 8 6 6 8 8 9 6 8 6 6 10 7 6 8 8 14 19 11 8 8 8 6 11 6 6 6 8 8 8 8 8 6 7 12 8 11 12 10 10 12 11 10 9 12 12 10 10
9 9 11 15 25 12 11 11 7 6 6 6 8 15 19 25 17 8 8 8 10 19 8 8 8 8 8 12 15 10 9 9 12 10 19 14 23 31 19 25 16 8 8 8 8 8 8 6 8 8
11 13 16 14 14 14 16 12 8 8 8 8 8 8 9 17 18 18 22 13 12 11 11 11 11 15 12 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 9 9 11 13 11 11
11 |