BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313J22.T7 (MSMg01no313_j22.b1) | MSMg01-313J22.TJ (MSMg01no313_j22.g1) |
ACC | AG435494 | AG435495 |
length | 1,250 | 1,217 |
length of high quality (start - end) | 418 (40 - 457) | 376 (73 - 448) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_j22.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_j22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:31 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_j22.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_j22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:31 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (61,554,943 - 61,555,345) | (61,522,253 - 61,522,625) |
---|
sequence | NNTTTGTNNNNNNGGTCACTGGGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCTCCATCACTGGAATCCTGAGTTTCTCATCCTTCTGTTCCT
CCTTGCGCCATATTTTCCCAGCATGTTCTCCGAACTACTAAGTTTTCAAT
CACTCATACCTATATCTTATGTTCAGGGTCTACTAATTAGGAATCTAACA
GATGCCACTCCTTGGATCTGGGTAGTATGACTGTTTTGATGGTCTAGTAC
CAAAGTTTGTTTGTGATATAGCACTAAATATATGAAGTAGCATAATATAT
ATGTTAAATGTTAGAAGTTGTAATTCAGTTTTACATAGATTGATGCATTT
CTTAAAATAATCATCTACATTTAATTCATATGTTCAGCAAGTGTATAGAA
AGCAACTTGATACCTGGAAAGTTTTAGTCCTTTAATCCCATCTCTGACCT
CCTGAATTTTTTGAAGCACTCAGAACTCCTGTTATTTTGTTTAAACATAC
CCGAAGAGTATTTGATTAGCTGTTCTCCACTTCATTTTTTTTAATTTTTG
TTCTTTTAAATTTATTTATTTAAATGTGTAATACCAAGAGAGAACGTACC
TTTAAGTTTAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA
TATATATATTCAGAAGTTCCNATAATTAAACTATTGCAACTCCTTANAAA
CAAAATTCAGCACAAAAGAAGACAACATGACATTTCTAAATGGCTAAGCG
AATGTGCATTTCTTTCAGAATTCATTTGGCCTGAATAAGACTTTTACTCG
AATACTAGTGCTTAGGTTTGCCTTATACTTATGCACATTATTGTCCCAAA
CAATTTTTAGAGCATTTTTCGGATGGCAATATGAATGTATTTTCCGATAA
CTACTCAATTTTGAATTGCCTCCGATTTTGAAAGCACAATTGATTTTTAG
TGAGAACTTTTTTAAAATATTCCCTTGCCCCCTGCTATTTTTTTATTTAA
AGGGCTAATATTTTCTTCCGAGGGTGCCCTCTAAAAAGATTTACTCCTTC
CGCTCTTTTTGGGGGGCGTGGTGTTTTTTTCTCTTTTCCAACCCCCCTGC
AAGAAAAAAACCTCGGGTTCTTTAAATTTTTTCCCCCCGCCATATCTGCC
TATTATCTTCTCAGCACAGACCACAAAGCTTATACTTTTATTCCTCGCTG
TGTGATTTCCTCCCCCCCCTCCTCTCTCTCCCCTCGTTGTGGGCTCCTTT
| NNNTTACAACATGGNAGNCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCATGGTATTTGAAATATGTGATCTTCC
AAATAACCTTGTATGGAGCTAACATTTCCTGTACCATTTGAATATATATG
AACACCATTTTTGGTGTTTAAGTGTAATACTTAAAAATTTTTAATTTTAT
GTTGCTGTTATTATTGTTACTTTTTTTTTATGTACATGTATATATGTGTC
CCACAAGTGTGCATAGAGCCACCAGTGGCCAGAAGAGGGCATCATATTCT
CTGAAACCCAGTTCCTCAGAAAGCAACAGTTGCTGAACACTCTTTCTATG
CCTATAATGTAATTCTTGCTAACATGTTTTACCCAATATATTATTTTTTT
TGAAATGTTTTATATACAAATTACACTGAAAATATCAATTACATATTTTT
TTTTTTCCCCCCCCCCANANNCCCCCCTCCCCCCCAAAAAAAGAGGGGGG
GGACCNNCNNANNNNCNNNGCCNNNNANNGATTCTTACTCCTATTANCCA
TATAAATANACAACTAATCTGGCTTTGTGAATACTATTTGTTATGCTAGA
CTATAACTTGGAATTTCAATTGAATGCAATTCTTAGAGTAAGTCCAGTCC
TGAAATTAGCTACAACTTTCTGTTGCTGCAGATTGTCCTCCTGGTGGGAG
CATCTATGCATTGAGCAGTGGCTGTGGCTCTAGGCTAGAGTCAGTTTCAA
AAACCTGTGTTGTATCCCAGCCTGCAAATGCTGAATGCTCTCCAGCTGAC
TTTTCCGTGGNTACTAGAACCCAGACCCTGGATTAGGATAGTCTCTGAAT
GCTATTAAGTTTAACACCGCTGAATCCCCCCTCCCCCTGAAGACCCCTCC
TGAACCCAAAATTCCACCCTATATCCCCTTTTACTCAGTTTTCCCCCCCC
GCTTTCCCCCAGAAATCAAACTTGGCCCTTCTGGGTTTGAAGCTTCCCCA
CTTCCAGTCCCGGTTTTCTTAAGGAAGCCCAAAATAAATGGTGTACAGAA
CCCATTACCCCCTTGTACACAATCGACCATTTCCCTTAGTCTCATCCACT
CCCCTCCCTAAAAAATTTCCCGACTTATTCCCCATCCGCTAATCCCCCCC
CCCCTCAACCCACCCCCACACCTCTCTTCTACCTCTCACCAATTCTCTTT
CCCCTCCTTCCCCCTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 7 7 7 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 13 14 14 16 13 15 8 8 8 19 22 37 36 37 40 40 37 37 42 42
32 36 36 39 39 48 43 43 48 47 42 32 22 24 24 29 42 42 47 47 50 50 68 57 48 47 47 47 48 48 50 50 50 47 47 47 47 47 50 47 48 47 48 48 43 51 43 43 48 43
48 43 43 43 43 48 48 47 42 42 42 43 43 53 53 53 57 57 48 48 48 48 33 33 33 33 31 22 23 12 11 11 12 19 25 30 31 31 31 31 31 36 53 50 38 57 42 42 39 44
39 42 42 47 42 42 48 48 48 50 68 68 68 53 53 42 41 41 47 47 50 53 53 48 54 48 50 57 53 50 50 54 57 57 68 57 48 42 36 36 39 59 59 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
68 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 41 41 32 30 30 32 44 48 68 68 68 68 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 43 27 25 11 8 8 9 9 9 10 11 11 11 21 23 23 28 28 28 21 29 29 44 44 57 59 59 59 59 59 59 59 59 47 48 47 47 41 41 41 27 23 13 13 13 12 12 11 15
15 23 25 28 28 31 34 39 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 59 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 54 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 23 25 23 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 57 57 57 48 44 39 28 24 20 32 32 35 35 31 23 23 3 0 3 25 22 23 20 31 32 32 40 47 59 59 59 59 46 43 30 30 22 24 34 37 23 23 3 0 3 23 23
37 39 41 41 39 32 32 15 15 13 15 19 22 15 32 32 41 43 41 37 39 32 33 33 33 33 36 39 59 59 59 50 30 31 23 28 18 28 33 37 33 30 31 34 39 39 39 39 31 39
32 37 43 39 33 33 33 33 33 27 34 35 31 23 23 12 11 9 9 12 12 12 10 14 15 27 30 27 15 25 13 24 24 32 20 16 16 18 18 10 16 11 24 28 32 36 26 26 14 14
14 13 20 15 15 16 23 23 16 11 12 10 17 9 9 9 16 13 17 11 11 11 21 21 26 14 14 14 28 28 43 27 23 10 10 10 16 16 33 41 43 43 36 16 16 15 12 18 15 21
15 11 12 16 11 18 10 10 8 8 8 13 13 24 32 22 25 19 15 12 8 9 9 9 9 9 12 19 21 34 34 39 23 21 9 9 9 10 10 16 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12
14 16 23 18 15 13 12 13 13 19 19 12 22 22 23 25 23 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 10 12 10 9 9 11 15 16 12 11 8 15 15 15 17 11 15 10 13
13 10 7 7 7 8 10 11 11 10 9 8 13 11 10 10 10 10 11 11 19 10 10 9 9 10 9 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 13 10 11 10 8 8 8 8 13 8
10 10 11 13 11 12 11 14 9 9 9 9 9 13 15 15 10 13 8 7 6 6 7 6 7 8 8 12 8 8 8 8 10 11 10 10 8 8 9 10 13 13 13 11 6 6 6 8 8 8
10 10 15 8 8 8 16 12 9 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 10 10 12 8 6 6 8 10 8 8 6 7 10 15
10 10 10 9 9 23 11 9 12 7 7 8 8 9 9 9 12 12 12 11 11 9 9 8 9 8 8 15 15 26 15 15 11 10 9 16 9 9 7 9 9 8 10 6 6 8 10 10 8 6
6 6 6 8 6 6 6 8 12 11 8 8 8 8 8 19 10 10 9 8 13 12 12 10 8 10 10 9 9 12 8 8 6 6 8 8 17 12 10 9 9 9 14 10 10 9 9 9 9 10
10 6 6 6 6 8 8 10 13 10 6 6 7 8 9 8 8 6 12 12 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 13 10 9 9
| Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 7 7 8 7 7 3 0 3 3 0 3 6 6 6 7 8 12 13 8 6 7 7 7 7 3 0 3 10 10 13 25 21 33 29 29 28 29 29 32 36 36 38
38 42 42 42 34 28 40 36 48 48 48 48 48 39 37 43 43 57 57 43 59 46 36 41 31 21 12 12 19 33 42 68 68 68 68 68 68 68 47 51 43 48 48 42 40 39 33 31 28 30
25 31 32 43 43 37 35 34 34 28 35 35 35 31 41 50 33 28 25 21 19 10 10 11 19 22 39 41 37 31 30 30 30 29 31 30 36 32 37 37 43 53 53 53 53 53 53 53 53 53
57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 51 50 50 50 50 50 57 57 35 34 28 36 36 36 28 37 42 48 57 57 59 57 43 43 43 44 44 48 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 68 57 59 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 57 52 43 57 57 44 38 34 28 35 35 35 43 44 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 41 41 41 59 47 52 52 52 52 57 57 57 68 59 59 59 54 57 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 29 34 20 20 20 34 34
59 59 57 57 57 57 54 57 59 68 68 68 68 68 59 59 54 59 59 59 59 59 59 47 43 43 47 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 33 29 11 11 10 11 13 16 19
26 26 30 18 14 13 13 13 16 26 26 24 24 15 12 11 3 0 3 0 0 3 8 8 10 10 10 10 11 12 13 15 15 11 11 11 16 20 31 17 17 9 9 9 8 8 8 8 9 8
10 12 21 25 3 0 0 3 0 0 3 0 0 0 0 3 0 0 0 3 29 3 0 0 0 0 3 0 0 3 27 27 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 29 29 3 0 3 29 29
59 59 59 59 59 29 27 3 0 3 27 27 59 59 59 47 47 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59
59 59 59 59 54 54 54 44 44 59 54 54 54 57 57 57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 43 43 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 48 47 47 59 47 59
44 44 39 39 39 40 39 39 35 35 47 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43 30 28 28 43 43 54 48 48 47 47 54 42 40 40 43 48 48 48 48 48 43
43 57 57 57 57 59 57 57 50 50 50 48 25 25 11 11 11 12 27 24 37 41 43 43 30 28 19 16 10 17 21 25 27 33 27 30 17 17 17 30 30 43 39 34 26 18 23 23 37 37
30 30 28 26 19 22 27 25 22 19 13 10 10 10 10 16 16 12 9 12 12 22 30 28 28 28 22 13 21 16 20 22 22 26 24 25 14 14 14 25 24 24 19 22 22 31 31 29 33 27
25 19 17 19 14 14 10 10 10 3 0 3 8 10 10 7 8 8 15 11 8 8 8 8 9 9 9 9 15 10 11 13 15 15 14 10 10 10 12 10 8 8 8 8 8 10 10 12 14 19
19 21 20 22 16 13 9 11 17 10 9 9 9 12 10 12 10 10 10 9 9 11 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 8 9 9 15 16 11 10 9 8 8 8 10 8 9 8 10 8 8
8 8 8 8 9 8 8 8 10 15 8 9 9 15 10 10 10 10 11 12 10 10 8 10 10 9 15 16 22 12 10 9 10 10 10 8 8 8 10 12 9 10 10 10 9 10 10 19 11 10
10 14 15 10 8 8 8 8 6 6 6 7 7 7 9 9 11 9 9 10 10 9 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 9 12 9 8 8 8 8 7 8 6 6 8 8 10 11 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 6 6 6 8 9 11 12 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 9 8 13 8 8 8 8 6 6 6 10 11 11 9 8 8 8 8 8 10
10 11 10 9 9 9 10 10 9 12 10 11 17 11 11 8 8 6 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 10 8 8 6 8 6 6 8
8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 11 11 8 8 6 6 8 8 9 12 10 10 8 8 8 9 11 10 10 10 8 10 10 9 9 7 9 9 15 10 10 12 13 14 10 9 10 10 15 12
12 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 14 11 11 14 10 10 6 7 8 8 9 9 9 14 8 8 7 7 6 8 10 8 8 6 6 8 8 10 14 15 11 8 8 8 8 9 9
9 12 18 18 18 9 11 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 |