| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-313N23.T7 (MSMg01no313_n23.b1) | MSMg01-313N23.TJ (MSMg01no313_n23.g1) |
|---|
| ACC | AG435674 | AG435675 |
|---|
| length | 1,258 | 1,231 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 294 (152 - 445) | 269 (128 - 396) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_n23.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_n23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:56:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_n23.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_n23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:56:04 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (74,387,518 - 74,387,810) | (74,228,374 - 74,228,642) |
|---|
| sequence | NNCCCCTCTTGNGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGACCGCGGAATTAT
CTTGTCGGGGACACTTAAAACCCCTCTTTCCTTANATTTTACTATTTTTA
TCTTTTGAAAAGCTTACCCATGCCTTATGTTATGACTTAGGTTGTGGCCT
TGAAACTTTTCTTCTTTTATAAATTATTTTGATAGCTACATTTTTTTCCT
TTTCCATATTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACC
AAAAGTCCCCCATACCCCATAGCTACCTTTTTATTAATTGATTATTTTGC
TATATCATGAAGGATTTGGCATATTTATTTGATTATAGCAAAATGATATC
TGATTCCCTGTGTATCAATTTTTCTTTGATCTAATAGTGTTTAAAGTTTG
ACTAATAGTCAAGTATTTCTAGATTTTCCTCATATTGATTTCTATTCATG
CCACTGCCATTAGAAAAGATGCTTTATCTGAACTCAGTGTTGTTTCCATA
CTAAGCCCTTGAGTGAAAGAAGTCTATGTATTTCTAGAGGTGGCTACTCT
GGACTTCCAAAGGAAACTATAAAAAATAAGGTCAGAAAAGAAAAAACAGA
AACTAACAGTCTTTGCATAATTTATAAACTACATTAAAATGACAACATAT
TATATGGAAATTTATTTTCAAGACCAAGAATAACATATTACCACCTATTA
GAGAATCTATTTCTGCAGAATGGTCCATATAAATTTAGGAGAATATCAAT
AATCTGTGGTTGTATGGTGTTTCTTTTAGCATTGTCCGGCCAAGTTATTT
AAATCAAGCTTCAGAATCTCTACTTTTGTCCTTAGTATCTATATAATTAT
CCCCTTTTATTTTCCATGCGGAAAAAACCAATTTTCTTTCTACTAGAATC
TAGAATTTACCTATGACCCCCACTCGGATCATACCCTGTGAACCACTTTT
TCCAAAGTTATCTATAAGTATGAAGAACCTCCACTTTCCCCTAGGGGGGG
CGACTCCATCCTACTCCCCTATTGATCCTTTGCCGAGAATCCTTTAATAA
ATCAATTTTTATCTATGGGATCTTGTCTAACTCATCACTAACTCACTACA
TTATTATCTCTCCAATCGGAAGCATATAANCTTTCCACCTTTATTTTTTC
CCCCGAATCTGGTGGTATCTCTCATGCAAACATATATCCGTTCTCTCTGT
TCCTCCTCTTCTCTCCTAGAATCATAATTATGTCCCTTCTTACCATCTTA
TCACTCCC
| NNNCCTTTCACGTGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCACACCAAACTATGAAAAGTGAGATCA
AAACTGACAGACAATAGAGCCCACCTCCAACGTCATGTGCTATACTAACA
AAGTGTGTATGGGTTGAGCAGCAAGACCAACTTGATTTATCACTTCTCCA
TACCTGCTCGAACCCAGGGTCTCAAATAAGTTGAACACAACTGTGACGTT
TGCAGATGAAATGAAAAGTATTTCAAATAAGAAACAGGTAATTGTTATCA
GAAGTTGACATAGGAAGGGAGTCAACCAGTAACACTGTGTTTGTAAACAC
CAAATATAGACACACAAGTGGGAAAGGTTTATTGTTATGAGAGAGAAGGT
TGCAGGATCCTCTCAGTGAATGTTAGCACTGATAATCTGGAGGTATGCTA
TTTTTTTTTTACCGCCCCCATCTGGCATGCCTGCCACAAAAAAAAAGAGT
TTCGATGGTTACTTTTCAGTTGCATGCAGGATAAAATAAGGTAAGTGCCT
ATAACTGAACAAGATCTGGCTGCTGTTGGACAGGGACAGTAGCTGTAAAG
GAGCTTTGACTTCTTTGGTTTACTAATCAGAAATTTGTCAACATGTGTCC
TTTGTGCATTTAGACAGATGGTAACTTGAATTCATAAAGTAGAAATGTTC
TTCCCACCTTTGAATTTCTTCTTTTAAACATCCTGTAAACTTATAGAAAT
ATGCACAAGATTGTTTCAGAAATTCTTATAAGATAAGGGCTTTTGTGTTC
ATTTTTGTTAATTCAGAAAATCTAATCAAATCTCTAACCTCTTTCTGACA
ATACCAAATACAGTTGCACGCTGCAGAAGGAAGCCTATCTTGGCCTGATT
ATATAAACCTACAATAATTCCTGCTTAAAAAGGTTTTCAATATCCAAATC
CTTGAGGAGGTAGTTGTTGTTTTCTCCTCCCCTAATATTCCATCCTCCTC
TTTCCTATATTTAATAATGTATCCTCTTCTTCTTAAATTCTTACCCTTCT
TTTCAACTCTTACTTATTTCCTCCTTTCTCAATTTTTTTCCTCCCTTCAA
CCCCACCTAACCTTTCCCCTCCCCTATCATATCTCTTCTTCATTCTTCCT
TCAACTTCTCCACTTCTTCACTCTCCCTCCTCTCATTTCTCCCCTCTTAT
TCTTACGCTACAGCTTTCTGACTTCACTCTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 10 13 13 13 11 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 19 21 13 11 16 13 8 9 9 12 11 11 11 16 16 11 16 10 10 10 14
15 15 18 8 8 6 6 6 9 7 11 8 8 8 7 9 10 10 10 17 18 9 9 9 13 12 17 27 34 34 28 18 18 3 0 3 23 18 32 28 33 33 33 33 33 33 30 30 30 21
19 10 12 12 9 9 9 11 13 8 11 11 9 9 9 8 12 9 9 10 15 19 21 24 28 33 30 26 22 20 20 23 23 15 15 10 13 13 11 9 11 16 11 17 18 20 24 20 22 24
24 26 21 20 25 33 37 39 39 41 36 36 36 39 32 31 32 37 27 27 12 10 8 6 8 8 10 10 34 34 26 19 15 11 11 12 16 18 12 12 12 25 30 47 47 46 37 37 30 30
30 37 27 39 39 39 42 43 39 39 39 39 32 32 27 15 12 12 18 28 30 43 33 33 30 28 32 28 37 36 32 32 48 48 39 44 39 39 31 36 35 30 30 28 35 37 44 44 59 48
48 48 57 57 57 36 36 33 33 37 32 42 42 42 42 43 43 44 32 40 35 43 43 27 27 11 11 11 29 34 57 57 57 50 50 57 52 52 52 44 50 43 43 43 43 52 50 43 37 37
37 43 50 43 57 47 47 47 50 43 37 43 43 44 44 42 42 25 22 28 16 20 32 42 46 43 43 43 57 47 57 48 48 48 43 43 39 41 39 39 37 32 37 39 48 48 44 44 37 43
43 43 43 48 48 43 43 31 31 15 24 19 28 37 37 36 30 30 28 37 37 43 48 48 48 48 47 47 43 47 35 37 35 32 32 20 18 9 12 12 12 9 9 9 11 12 13 26 34 37
41 39 39 39 30 30 21 19 12 11 11 12 22 26 36 37 32 37 33 33 30 37 39 46 46 48 48 57 47 37 32 30 30 37 37 46 41 41 27 28 12 12 11 11 11 11 9 9 9 23
23 19 19 17 26 19 34 34 37 37 39 37 37 28 22 22 17 18 18 32 32 39 43 32 32 23 23 23 16 10 10 8 8 8 13 18 16 23 28 28 28 36 44 44 34 34 23 23 23 34
34 32 32 28 35 31 32 32 39 34 34 28 31 30 39 39 37 33 22 20 18 19 19 16 18 18 30 25 35 59 39 34 47 32 25 18 12 12 13 21 15 14 14 17 30 30 48 48 43 39
37 30 30 34 25 18 14 13 16 18 33 28 28 28 28 30 32 39 39 30 30 23 22 18 18 18 15 25 15 20 20 28 31 32 28 22 20 30 23 28 24 24 19 18 20 20 23 24 24 20
16 16 17 24 23 29 25 19 11 12 12 24 25 25 24 11 11 11 19 19 28 28 28 28 23 23 14 14 16 21 16 16 23 21 30 15 15 13 15 19 23 14 21 17 22 28 28 34 34 34
39 39 43 34 37 30 30 28 32 28 31 30 30 25 24 24 21 23 11 11 8 13 8 8 8 8 11 15 14 15 17 11 11 11 10 15 21 22 18 9 10 11 16 12 9 14 9 7 10 8
10 15 25 22 31 34 32 28 30 28 30 25 21 18 15 18 12 10 10 11 15 11 11 15 13 12 15 15 27 22 24 22 22 22 22 17 12 10 12 10 14 20 32 29 30 16 10 9 8 10
11 12 12 12 13 9 9 9 9 10 13 22 26 19 15 10 10 10 9 10 9 11 14 24 21 17 15 10 10 10 18 11 14 10 10 10 9 9 12 10 10 9 9 10 15 8 8 12 15 15
10 8 10 13 10 10 10 10 8 8 8 8 7 7 8 10 9 9 9 9 8 9 15 15 19 15 19 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 13 13 15 10 12 11 13 12 11 11 12 12
16 13 9 9 10 10 13 13 10 8 8 8 13 8 8 8 10 7 8 8 8 8 8 10 9 9 11 10 10 10 12 13 15 23 13 12 10 10 10 10 8 8 6 6 6 8 10 10 10 10
10 10 10 10 13 13 13 13 8 12 10 9 9 9 10 13 13 13 13 12 8 8 8 8 9 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 11 14 9 9 11 12 12 26 26
11 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 6 6 8 11 12 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 12 14 19 15 10 9 9 10 9 9 10 10 11 12 6 6
6 6 8 6 11 9 9 9 9 8 8 8 8 7 8 12 18 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 7 8 8 6 8 7 9 9 15 11 12 12 13 12 11 11 11 11 11 10
10 10 9 9 12 17 13 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 15 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 11 12 11 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 10 10
10 6 6 6 8 8 8 8 10 11 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 7 3 0 3 8 8 9 9 10 10 10 11 15 11 6 7 7 13 11 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 10 9 8 8 8 8
6 6 6 6 8 10 10 10 11 10 11 11 11 12 11 18 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 12 10 23 10 10 10 10 8 8 8 8 8 11 12 12 10 8
8 12 8 8 8 8 10 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 6 6 6 7 12 10 13 8 8 8 7 7 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 8 8 8 16 16 23 28 22 18
20 19 19 17 17 20 24 24 30 33 37 39 39 30 31 30 24 12 17 18 21 15 12 12 12 15 17 15 20 24 28 21 23 12 22 19 32 32 43 33 25 21 12 12 16 26 25 37 30 30
25 27 39 32 22 22 11 11 11 15 11 11 11 23 23 13 13 19 25 14 10 8 8 8 8 10 10 15 19 30 30 37 37 28 28 22 31 31 34 32 32 34 34 42 42 39 39 32 32 30
30 32 31 32 28 25 17 17 17 30 32 30 36 24 31 26 28 28 28 25 28 34 39 35 35 33 25 14 8 8 6 6 6 10 12 19 22 34 37 26 16 10 10 8 8 15 24 24 33 25
30 30 32 32 43 40 43 43 43 43 43 48 48 43 48 43 41 33 42 30 28 36 39 39 41 48 42 33 33 25 28 30 36 42 39 29 29 25 33 33 43 43 43 46 46 34 34 25 24 24
30 26 26 24 25 30 32 32 25 25 31 32 32 30 28 22 22 34 34 47 39 39 37 33 32 36 43 28 32 15 15 13 26 26 35 32 32 30 24 24 19 20 23 32 32 57 57 34 34 14
14 14 23 23 30 39 37 41 48 43 48 36 37 23 28 31 36 30 30 44 44 68 57 57 43 57 44 40 36 36 28 30 30 42 38 44 20 20 20 20 18 34 32 43 43 34 30 20 20 20
31 31 43 43 46 47 43 37 22 23 11 11 11 28 28 46 43 43 39 35 39 34 33 36 27 27 14 14 14 27 28 43 43 43 43 43 43 34 34 25 25 25 28 29 26 19 12 11 11 12
12 11 11 12 13 21 21 27 27 24 28 25 27 25 28 13 13 13 28 28 48 48 34 34 32 32 37 30 30 43 43 37 43 41 41 41 39 39 22 23 12 12 12 21 22 22 15 15 11 11
11 19 19 28 31 18 18 14 13 9 9 9 9 9 11 12 14 13 13 14 14 25 25 59 59 59 59 43 32 30 28 28 20 20 20 21 19 21 16 19 20 20 29 19 18 11 11 9 12 12
12 15 11 11 11 25 25 44 48 48 59 59 59 59 57 48 43 37 40 28 28 37 40 47 42 42 33 32 32 32 30 37 37 42 42 30 32 32 20 20 17 19 17 20 21 28 32 39 37 43
35 35 35 35 32 28 34 25 31 35 37 34 34 28 30 30 24 15 15 16 16 28 34 39 35 23 21 11 11 10 10 10 15 13 22 21 26 22 19 19 12 12 12 25 22 28 28 37 37 39
33 16 14 9 13 19 31 32 29 33 34 34 42 43 39 37 28 20 16 14 15 10 10 12 16 22 23 12 9 9 12 16 19 30 28 26 17 22 25 20 20 27 28 28 18 23 18 15 19 23
26 31 34 33 34 34 33 33 36 27 28 12 12 11 15 12 20 26 32 25 14 19 15 19 21 33 37 37 35 35 28 34 25 25 25 34 26 25 18 16 9 9 9 18 17 20 20 20 26 26
19 28 23 28 21 22 19 19 23 37 37 39 27 25 32 30 25 25 30 33 30 30 29 25 15 12 8 8 8 8 8 15 22 32 32 31 33 37 29 24 20 20 12 11 9 10 10 16 15 23
23 19 19 12 12 12 23 14 9 8 6 8 8 18 9 12 13 9 8 10 8 8 12 15 18 15 11 14 13 13 10 9 9 10 8 8 8 10 13 20 24 19 17 13 8 8 8 8 8 12
15 17 13 17 8 8 8 8 9 10 10 15 17 17 10 9 9 11 10 10 13 8 9 9 9 10 12 18 12 10 12 12 20 19 22 15 9 10 10 8 8 8 8 8 19 17 15 9 9 10
15 15 10 10 16 11 15 15 13 13 10 17 18 20 15 21 18 18 12 12 12 18 15 13 10 9 9 11 8 8 8 8 8 10 8 8 9 10 10 20 15 11 10 10 9 9 13 9 8 8
10 10 12 12 10 11 8 8 8 8 13 10 10 10 9 15 19 26 12 15 14 19 19 11 11 10 14 10 10 8 9 8 8 10 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 19 15 15 8 8 8
6 6 11 8 9 9 9 9 8 8 7 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 10 10 10 10 12 16 13 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 10 10 13
13 13 11 10 10 9 8 8 8 8 8 11 12 15 15 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8
8 10 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 10 12 8 8 8 7 8 8 11 10 9 10 10 10 10 9 10 10 20 11 9 9 8 8 8 8 10 9 11 11 11 11 10 11
8 11 10 8 6 6 8 8 8 9 8 11 11 9 9 10 10 10 12 11 12 11 11 11 13 12 12 10 19 10 10 9 12 10 10 10 8 8 10 12 6 6 8 10 10 14 13 11 6 6
8 8 8 8 8 10 8 9 9 15 12 9 9 8 8 10 10 8 8 8 8 13 13 9 13 8 8 11 12 13 10 10 9 9 10 11 17 16 11 9 9 9 12 10 10 8 6 8 6 6
8 8 10 11 10 10 10 10 11 10 8 8 6 6 10 10 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 11 10 8 |
|---|
