BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-316D24.T7 (MSMg01no316_d24.b1) | MSMg01-316D24.TJ (MSMg01no316_d24.g1) |
ACC | AG436652 | AG436653 |
length | 738 | 751 |
length of high quality (start - end) | 342 (77 - 418) | 303 (64 - 366) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no316_d24.b1 PHD_FILE: MSMg01no316_d24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:57:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no316_d24.g1 PHD_FILE: MSMg01no316_d24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:57:57 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCTTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAAATCC
GCGGAATTCTTTCCCTATCTCAGGATTTCTCATCTTGGTATTGTTTCTGT
GGGGAAATCAATCCAGTTTTTATCTTTTCCACTTACACCACCTTTTCCTA
GAATATAACCTGCTATGAATTCGAACAATACCTGCTTTCTTTCTTTGCCT
TGCTTATGAATGTGCAAGTGTGGGTGTGAGAAAAGCCAGAGTTCCCTGGG
ACAGGGCAGGGCCCCAGGCTTGGAACAGCTTGGGAAGGGGGTGGGGGTGG
GCTGGGGTCAGTGCCCAATGTGGGTAGTTGGGCTATTCTGGCCCTCAGCG
GAGGGTGCTTTGCCCTACATCAGCACCACCAGAGTAAGCTGTGCTCTGGG
TGTGTGAGTACTGCTTCCACCCCCCCCACCTCCTGAATGCCTTGCTGAGG
TAGAATCCAGCTGACCTCCTGGGGCCTGCTGGCTTTGCAGACAGAAATGT
AACTGCTGTGGGTGAGCTGGTGCTCCTACAGAAGGCCTGGGCTTGGTTCC
CTGCACCCACATCGGGTAGCTTACAACTGCCTGTAACCCCAGTTCTAGCG
AATCTTGCGGCCCTTTTATGGCCTCTCTCAGGATTTGCACCCACATGGGG
GCCATGCCGACAACCAGTTTACCACCCAACCTGTATAGCACTTATTTCTA
AATAATGAATAGGATCCGAGTTGACTACACACTCCTCG
| NCGATGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXTATTTCTGGAATTCCAGGCCTACAGGCCTACATGTGT
CACCTGAAGTTTATGCAAAGAGCAACACCTATTTAGCCACAAGAGGTGTG
TAGTGTTCCCACCAGAACTAGGTGGTAAGACCTTATGCTGAAGACACAGC
ATGCTCTGACTGCAGGGCGTACTGAAATCAAGCTGGCATTGAACCGGAAG
TTGCTTCCTTGCTGGCTAGCCCGTATCACTCTGGAAAGCACTATGATGGC
TGCTGAGGGAGAAATGGCATCAGCATTGTTACTCACCTGTGGACCGGGGA
ACCACACTCCTGACCCGTTTTTTTCCCCCCCCCTCTGGTGCAGTAGTGGG
GCGACCAGCTGCTTTCTTATCCCCCCCAGGAATGACACATAGAAAACTCA
TGTCTGCTATGGTAACCCTGGTCACAAGCGCATGGCATGCTCTGTAGAGG
GGAAGCTGCTATTGTCTGTTAAGTAGGTGTGGTGCCCCTGTCATAGTGTT
TTCTAATGAGTCTCTGTTTATGTGCCTACGTTATGATTGTTCTCATCTTA
TCTTCTCCTTTGCCGCTGTTTCTACTCGTTCTCTTTTAACTAGATTTTTT
GTCCTTGTTATCTTTTTCACTCTTGTTTTGCCTCTCTCCATATACTTGGC
TTTTTTCCCCCCCCTTCCCTTTTCGTGTTATCCCTCCCCCCTTCTCCCCA
C
|
quality values | Open.Hide. 0 3 3 3 9 13 16 13 10 9 12 12 24 29 23 23 19 17 17 28 37 37 37 37 37 33 33 37 37 29 28 26 26 22 27 27 13 7 7 7 8 8 7 7 7 11 8 8 12 16
25 30 28 30 30 31 31 36 33 50 50 50 47 27 21 11 11 11 9 9 9 9 9 10 13 13 18 22 24 29 33 33 36 36 59 59 59 53 48 48 48 48 48 57 57 57 53 53 53 53
53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 57 57 57 44 44 30 30 21 21 38 38 50 51 51 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57
50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 57 57 68
68 57 57 57 57 54 54 54 57 57 59 59 57 59 57 54 57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 48 48 48 48 59 59 59
48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 25 18 11 11 11 13 15 16 15 11 18 21 34 41 59 59 59 59 43 43 43 47 59 59 47 43 43 43 42
39 42 42 48 47 54 54 59 59 68 59 59 48 43 44 32 24 18 18 12 18 11 12 19 25 32 41 41 26 19 13 13 13 13 18 22 25 28 32 35 43 57 59 59 47 59 43 39 35 43
34 34 34 34 34 32 35 35 43 59 37 37 37 37 37 25 23 18 17 13 16 18 21 19 13 13 11 11 15 16 13 10 10 21 13 13 8 8 8 10 25 31 33 33 33 30 30 37 36 36
39 35 35 32 41 37 37 37 37 37 37 41 41 44 37 37 37 37 37 37 36 37 37 30 30 30 41 41 59 39 33 30 39 37 47 47 47 39 35 37 35 43 43 57 46 48 48 48 48 54
54 46 46 43 39 32 28 23 20 19 17 17 19 29 28 35 39 40 33 28 25 25 25 25 37 32 32 15 15 14 18 18 32 32 39 37 37 43 27 27 28 28 31 34 27 25 24 24 26 29
33 34 34 37 35 28 32 20 19 19 29 29 26 18 14 14 21 28 37 28 28 19 21 15 21 19 22 33 30 37 30 32 30 34 22 21 27 27 28 22 23 23 20 20 32 30 23 14 13 14
26 18 25 31 16 15 8 8 8 8 8 8 18 25 24 20 18 18 23 20 19 19 19 15 13 6 6 8 8 12 12 12 28 28 32 23 12 12 17 16 19 12 18 14 14 13 19 11 10 8
9 10 11 13 21 15 9 9 9 10 9 9 9 12 10 9 11 8 8 6 6 10 8 10 6 6 7 9 11 10 12 12 10 9 9 8 10 9 9 9 9 13 16 28 25 20 13 9 9 8
8 6 6 10 10 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 12 9 9 | Open.Hide. 0 3 6 6 10 10 9 9 9 19 21 32 31 32 41 41 41 41 32 37 39 39 41 42 50 50 50 50 47 37 25 23 11 9 9 10 10 9 10 9 10 10 21 17 32 31 32 43 37 47
47 50 47 47 44 50 50 50 47 32 22 12 13 9 9 8 7 9 9 9 11 13 13 27 23 33 29 29 29 31 36 48 59 57 57 57 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 59 53 50
48 48 47 43 57 57 47 47 47 57 57 50 53 50 47 47 37 44 37 47 39 34 20 13 11 8 8 8 8 10 24 29 25 41 50 37 41 41 47 47 50 53 53 57 57 57 53 53 53 53
53 50 50 50 53 50 50 68 57 57 57 57 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 59 57 57 48 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 52 52 52 52 52 47 50 59 59 57 48 48 48 57 57 57 54 57 54 57 54 54 57 57 57
57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59 54 57 54 59 59 57 54 54 54 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 54 57 57 54 48 48 57 57
57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 57 57 53 50 50 59 59 59 47 29 21 11 12 12 11 15 15 12 12 12 12 21 21 37 36 59 59 39 36 36 43 43 43 39 39 43 39 42
47 47 57 57 57 59 59 48 48 47 43 41 24 18 12 12 11 11 15 17 16 11 9 11 10 10 9 8 8 8 8 10 9 12 11 12 11 11 11 18 23 28 29 20 17 14 15 18 15 18
24 22 32 33 33 33 30 30 24 28 20 23 16 27 11 9 9 8 8 8 8 9 10 10 15 12 19 12 12 12 11 11 12 11 10 10 10 10 15 19 13 15 30 15 15 18 26 28 25 25
25 34 33 43 43 43 43 43 32 30 16 16 16 24 19 19 23 32 32 40 37 39 39 36 30 30 30 30 30 39 29 32 22 17 17 17 14 14 9 9 9 19 18 17 18 15 11 11 12 11
12 15 13 15 15 20 26 23 19 19 19 29 30 40 32 32 32 27 32 15 15 14 20 23 15 15 16 12 12 11 11 11 11 11 11 19 19 15 10 12 9 9 9 8 10 10 10 18 14 20
28 21 19 11 11 12 12 15 12 11 19 10 10 13 12 14 12 19 9 10 10 13 10 12 10 12 10 10 10 10 10 12 13 8 10 6 6 8 8 8 8 13 15 12 7 6 8 8 15 10
10 14 10 13 10 9 8 8 11 11 8 8 9 10 12 15 19 15 13 17 11 11 11 11 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 12 13 9 9 9 9 9 9 9 20 10 10 8 8
8 8 10 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 14 12 9 9 9 12 9 9 10 10 10 8 8 8 8 6 6 7 10 8 10 8 8 8 10 9 9 9 9 10 9 8 8 6 6
6 8 15 22 22 16 12 12 10 16 10 6 8 6 6 8 6 12 21 20 18 10 10 8 8 6 6 8 6 8 10 16 16 12 12 15 22 28 16 16 8 8 8 8 8 8 10 10 15 18
15 |