BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-331L12.T7 (MSMg01no331_l12.b1) | MSMg01-331L12.TJ (MSMg01no331_l12.g1) |
ACC | AG447944 | AG447945 |
length | 819 | 742 |
length of high quality (start - end) | 195 (71 - 265) | 599 (76 - 674) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no331_l12.b1 PHD_FILE: MSMg01no331_l12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:17:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no331_l12.g1 PHD_FILE: MSMg01no331_l12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:17:40 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCANCACGAGACCGCGG
AATTCCAGGATTACTGACATTACCGTGTATACTGTATCTTTTTTATGATG
TATGAGAACACAGACAAAGTTATCAAGCTAAAGCATTTCCTACTATACAA
AAATCTTTAATGCCAGCAAAGATTGCAACAGTTTTAACAAAGGCAACTGT
GGTTGATGACTTANAAGTTGGTCTCTATTTTANANATCATTTTATTGTTG
AATAATGTGAANTAATTGNCACAAATGTGTTGACAGTAAATAAAGGAGGA
AATGGNAANNAAAGACTATCTAAATCCTGAAACTCATTTGGTAATGGANN
NANGGNTGACTGGTGAGTAATCTAATTAAAAAAAAAACCCTTCTTCCCAG
TATAAAGTTCCCAGCCCCCCCAAAAAAAAAACAAAANGGTTTTTTTTTAT
TTNTCTATTCACCAACCCCCCTTNCCCCCTTCCCCCCCCGAGATACCCAN
AAACACCCCCCAATATAAATTTTTATTNNTAAATTATCTCTATTTCTTCA
CTTATCCTCTCTTATTTTTCCTCTCCTCTCTCTCCCCTTTTATTATTATT
CTCTCTCTCCCCCCACACCACCCCCCCTTTCTCGTTTGACAACNNNCTTC
TATCCTTCTAATCCCCCCTCTTCTCTCCCTTTTCCCTCTTTCTCTTTTCT
CCTTTAAACCCNCNNNATAATAACTAATACCNNANANGACTCTCCTTTTT
TTATTTCTAGGGGTGAGGGGGCCCGGTTCTNTTTACCTTCTTTCTTTCCT
TTTNTAGTTTTNTTCTTCA
| GAATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACAGAATATGTACTCACTGATGAGT
GGGTATTAGCTCAGAAACTTAGGCTACCGAAGATATAAGATACAATTTGC
TAAACTCATGAAACTCAAGAAGTACAAAGACCAAAGTGTGGACATTTTGC
CCCTTCTTAGAATTGGGAACAAAACACCCTTGGAAGGAGTTACAGAGACA
AAGTTTGGAGCTGTGACAAAAGGATGGACCATCTAGACACTGCCATATCC
AGGGATCCATCCCATAATCAGCTTCCAAATGCTGACACCATTGCATACAC
TAGCACGATTTTCCTGAAAGGTCCCAGATAGAGCTGTCTCTTGTGAGACT
ATGCTGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTAAGCTATTGG
ATGGATCACACTGCCCCAATGGAGGAGCTATAGAAAGTACCCAAGGAGCT
AAAGGGATCTGCAATCATATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTA
CCCCCCTGGAGCTCATGTCTCTAGCTGCATATGAATCAGAAAATGACCTA
TTTGGCCATCAGTGGAAAGAGAGTCCCATTAGTCGTGAAAACTTTATATG
CCTCAGTACAGGGAAACGACAGGGCCAAGATATGGCAGTGTCTGGATGCG
GTGTGGATTGGGGAGCATGTGGGGGACTTTTGGGTTACATTT
|
quality values | Open.Hide. 8 11 8 8 8 9 13 28 34 33 44 44 44 39 39 37 37 37 37 37 42 37 37 42 37 25 25 19 15 3 0 3 9 9 9 3 0 3 7 6 6 6 6 8 8 21 21 42 37 31
31 31 31 37 30 23 19 8 6 6 6 6 6 8 9 12 11 15 15 22 22 20 27 28 59 59 53 57 57 57 53 53 57 57 57 57 57 57 57 59 59 53 53 53 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
51 51 51 51 50 50 68 68 50 50 50 51 48 57 48 48 48 59 57 50 50 47 47 47 51 54 68 68 68 68 68 68 68 68 57 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57
57 53 50 41 41 37 37 37 37 39 27 27 3 0 3 27 23 39 39 41 32 32 28 34 34 41 41 41 39 25 25 3 0 3 0 3 16 16 28 34 39 47 47 48 59 48 46 50 47 41
39 44 44 41 41 43 43 59 25 25 3 0 3 7 7 7 7 3 0 3 13 8 9 9 9 9 19 30 44 47 39 34 34 20 20 25 34 30 36 33 40 40 44 44 50 50 50 50 42 37
37 37 23 18 3 0 3 3 0 0 3 7 7 7 8 19 16 12 12 10 10 10 10 21 25 39 39 44 37 34 25 25 30 34 33 39 39 39 34 24 14 18 12 8 6 7 7 3 0 0
0 3 0 3 3 0 3 23 23 19 11 11 10 11 15 19 19 18 15 18 18 18 20 18 17 13 14 11 8 10 8 9 12 12 10 12 12 11 10 9 8 10 8 8 8 8 10 11 12 19
11 11 18 14 14 12 12 12 15 19 28 10 8 8 8 8 11 21 21 19 19 18 19 19 23 14 14 11 8 9 9 9 11 17 11 3 0 3 13 9 9 9 10 10 11 9 15 13 11 11
9 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 7 9 9 9 9 12 10 3 0 3 17 19 8 8 8 10 10 10 19 19 8 7 8 8 11 9 8 8 7 8 10 15 17 3 0
3 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 15 13 13 8 10 3 0 0 3 7 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 7 7 6 8 8 9
9 9 10 10 16 10 8 6 6 8 8 10 8 8 9 10 8 8 8 8 10 8 10 9 8 8 19 12 8 8 8 11 15 17 10 17 8 8 6 6 8 8 8 11 11 8 8 8 9 9
9 21 9 12 13 9 9 9 11 12 16 12 12 10 10 10 15 10 10 13 13 17 27 27 23 21 10 8 8 6 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 7 3 0 0 0 3 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 6 8 6 6 7 7 19 21 21 8 8 8 22 12 8 8 8 8 8 6 7 7 13 15 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 8 19 14 9 10 10
9 8 10 8 8 8 8 6 6 8 3 0 3 0 0 0 3 6 6 6 9 9 11 11 11 11 8 8 6 6 3 0 0 3 0 3 0 3 10 10 10 23 23 25 17 8 8 8 8 8
8 8 9 9 9 11 9 9 9 10 8 8 7 8 8 8 8 8 9 16 10 9 9 9 8 7 9 9 6 3 0 3 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 7 3 0 3 8 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 6 6 8 7 8 6 6 8 13 17 30 32 37 37 41 47 50 39 44 43 43 43 36 39 39 41 41 27 27 12 9 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 9 15 12 15 25 32 33 33
33 33 33 33 42 41 25 23 11 14 11 12 12 11 12 17 17 18 13 9 9 16 19 29 30 37 37 37 41 41 53 36 38 38 42 42 57 59 59 59 59 57 50 50 53 50 50 50 57 57
59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 53 50 48 47 47 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 59 57 68 68 68 50 50 47 50 50 51 57 50 50 47 50 50 50 57 68 50 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 62 62 62 52 52 52 62
62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 39 39 39 39 35 35 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 59 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 59
68 68 68 68 59 59 57 52 52 52 43 44 32 32 13 24 24 33 42 42 43 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 43 52 52 52 50 57 52 52 52 57 57 57
57 57 57 52 52 54 52 57 52 52 52 57 57 47 44 50 46 46 46 43 43 43 44 59 59 59 59 59 59 57 47 43 47 47 59 59 59 57 57 59 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57
57 54 54 59 57 57 57 50 47 47 47 47 47 48 48 48 48 54 59 59 59 48 48 48 48 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 43 39 33 32 32 33 36 47 37 37 30
37 37 40 43 44 44 44 37 37 39 39 39 31 37 32 34 34 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 34 34 28 28 28 34 30 31 24 24 15 14 11 13 12 17 19 25 30 30 37 37 33
33 33 28 28 24 37 32 30 31 28 27 27 29 20 18 18 20 23 25 28 37 37 37 37 36 37 37 46 34 28 24 28 23 17 12 9 9 12 19 34 41 41 32 41 23 20 20 32 32 43
43 43 37 37 28 21 18 11 12 12 16 16 16 15 15 15 24 37 33 31 28 19 19 14 14 10 15 10 8 6 6 6 10 8 9 11 9 16 13 10 10 10 10 12 12 17 22 24 19 14
14 18 21 17 15 10 10 9 9 9 10 9 9 11 11 11 11 18 18 22 23 15 16 11 11 11 11 12 20 20 24 18 14 16 10 10 9 9 9 15 15 14 |