BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-397D20.T7 (MSMg01no397_d20.b1) | MSMg01-397D20.TJ (MSMg01no397_d20.g1) |
ACC | AG497626 | AG497627 |
length | 855 | 1,063 |
length of high quality (start - end) | 250 (64 - 313) | 68 (67 - 134) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no397_d20.b1 PHD_FILE: MSMg01no397_d20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:09:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no397_d20.g1 PHD_FILE: MSMg01no397_d20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:09:36 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGAGAATCCGCGGAATTCTAG
ACAAATTGTCAATCTATTTATTTTCCATCCAGGCAGCTTTGGAAATTTAT
CCCTTATACCAGCTAAGTAGATAGAGGGGGAAAATAGTGTAATAAAAAAA
CTAGATTGAAAAGAATTAGCTCTCCTCTTAAAGGAAAATTGGTCTGTTTA
TTTGTGGAATTTGCTTTTTCCCCAGGATTACTGCCTGCTGCTGATGTTGG
TTTAAAGTAGATGCTCAGCTCTGGTCTTGAAATCCTGGATTTGTTTGCAG
CTGCACTTACTGGATATTTTTTTTATTTAAGTTTGGCACTTTGAATATAT
TTTTCCTCCTTCTTCTTTTCCTCCCTCCCATATTTAGCCTATATGTTTCA
ATTATTGCCCCCCCCCCACCAACGCCTTAATAAATTGATTTTAGTTTTTT
ATTGTATCCCCCCCCCCGCCCCCCGCAACATATTGATTTATTTTCTTTTC
CCTTTTTTCTTCCTCCCGTTTCCTTTCTTCCCTTTTTTATTCTTTTGGCG
TACCACTCCTTCTCTCTATTTTTTCCTTGTTGGCCTTCTTTCTTATCCTC
CTCCCCCATTCCCTCTCTATCACCAGTTGTTTTTTTCTTCTTTCCTTGCT
TCATTCTATTCCCGCCTCTTTACACTGATTCCTTTTTATTCCGCCCCGCC
CTTCCCTTTCTATTCCCTTTATCCTTCCTTTCCGCTCTCCCTCTTTCTTT
TTCTTTCCTCCCATCCTTTTCTCCCTCCCTTTTTCCCCCCCATTCCTTTA
TTTTTCATCCCCTTCTCACTACCACTCTTTATCCTTTCTTTTTTGCACCT
TTCTG
| TGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXTATTTAGATTTGTACTTGATTATTTTTAAAAATT
AGGTTGTTTGATATTTCCCTAATTGAGTTCTTTACATATCTCCCGCCCTC
CCTCTTTTTTCTGCCCGGCGGGGGCGCCTTCCTCCCTCGTCCCCCTTCCC
TTCTTTCCTTCTTCCCCCTTCCCCCTCCCCCCCTTCCCCCTTCCCCCCCC
CCCTCTTTTTTTTCGTCTGTGCCTCCTCCCCTCTCCTTCCTTCTCCCTCT
CCCCTTCTCTCCCCCCACGTCCCCCCCCCCCTTTTCGTCCCTTCTTCCCC
CCGTCTCCCCCCCCCCCCCCTTANAACTTGTCTTTTTCCTCCCCTCTCTT
AGTCACCGTTGGGCATTCGCTTCTCTTTTCCCCCTTCGCCTTCTTTTCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCTACCCACCAACTCTCTCTCTCCCCGCTCTTCCTT
TCTCCCCCCGCCTTCTCCCCCTTCTCGTTCTCTCTCCGCTTGGCTTCCTC
CTTCCCCTCTCCCTCCTCCTCGTCTTGTCCTCCCAATCTCTATCCTCCCT
CCCCCGCTGCTACTCTTTCTCTCCCCTTCTCCTTTCATCTTTCCTTCCCC
TCACCCACACCTACTCCCGCCCTTGTCCTCACGCTTCCTTCCCTTCTATC
AATCTATCGTCCCCCGCCCCTCTCATTCTCTTCTCCATTTTCTTCTTCCC
TTCCCCCCATCATTCCCCTCCGCCGTTTTATCCTCGCGCCTCGCTCTCCC
GCCCGTATTCACTTCCTTATCTCTATTCTCTTATATCTTACCGCCTCTTC
TCCCCTCCGCCTATCTGGTATATACTCCTCCCTTCATCATCCTCACGTCT
CTCCGGTTCCTTCCCTCGAACCTAGCGCGCTTTCCTTGTTTATGTAGTCT
CGATACTCTCTTGTACTTTCTCTCATGCGTGTCACTCTCACTTCGTCCTC
ACATCGTATCGCTATCTTTGCTTTGTCCCGCATGCTCTACGCTCTATCCC
GACACTTCCTCTN
|
quality values | Open.Hide.18 22 22 18 18 18 15 15 15 19 22 18 24 25 34 34 37 22 17 16 16 19 21 25 10 11 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 10 12 12 15 12 23 26 33 33 33 31 39 37 28
25 16 17 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 13 21 24 33 37 43 47 59 59 59 50 50 36 36 37 42 37 37 37 37 48 50 53 53 59 57 68 68 68 47 47 50 50 50 47 68 68
53 53 57 57 68 57 57 48 42 20 15 10 10 14 30 23 23 24 16 16 28 38 50 50 59 59 57 57 57 57 57 51 51 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 50 50 50 50 50 50 59 59 59 59 50 50 50 46 46 46 57 54 54 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 46 52 57 52 57 54 54 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 54 50 50 44 46 50 50 50 50 57 57 57 57 57 54 59 54 59 59 68 68 57 43 42 39 37 30 24 14 14
14 34 32 44 44 43 41 41 31 32 30 42 37 57 57 59 54 54 57 59 59 59 54 54 54 59 44 41 28 17 17 27 30 39 37 33 28 28 29 37 39 39 43 43 43 43 43 43 48 48
43 59 57 41 37 26 26 20 23 28 34 17 15 8 8 7 7 10 12 11 11 9 9 10 13 20 29 32 36 36 35 39 30 11 18 9 9 8 15 20 24 18 18 19 22 23 28 32 33 43
43 43 36 34 25 25 25 25 21 19 19 14 14 12 26 30 29 24 22 20 15 15 11 10 10 11 11 16 16 12 12 12 22 16 15 15 15 12 22 21 11 11 11 15 15 16 18 18 10 9
9 10 12 17 12 14 14 14 18 24 27 34 22 17 13 15 8 8 8 9 9 10 10 19 17 13 8 8 8 10 10 8 8 8 9 9 9 9 10 11 10 9 9 10 10 10 10 9 10 8
8 8 9 9 9 10 10 12 10 13 10 11 11 12 10 8 8 6 6 8 8 13 8 8 8 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 15 11 10 10 8 8 8 8 8 15 16 14 10
10 11 12 12 10 10 16 15 12 10 10 10 11 11 11 8 8 6 6 8 10 11 11 12 21 16 15 14 9 9 9 9 14 16 28 13 12 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 8 6 6
8 8 6 6 7 7 10 10 12 12 11 11 8 10 8 8 6 6 8 7 10 9 8 8 8 13 17 13 12 12 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 9 8 8
10 8 8 8 8 8 8 8 10 13 12 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 12 12 14 12 9 11 11 13 13 11 10 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8 10 10 10 10 12 7 9 9 6 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 12 11 8 8 8 8
9 9 8 8 8 6 6 8 8 9 10 11 8 10 8 8 8 11 8 9 9 8 17 10 10 10 13 10 10 17 12 11 6 6 6 10 10 15 23 23 10 10 7 6 8 8 8 10 11 19
13 9 8 8 15 12 17 17 17 10 10 8 8 8 10 8 9 9 10 11 12 10 14 12 9 9 9 10 11 11 16 16 22 13 12 8 8 8 8 10 10 8 9 8 8 8 8 8 6 6
8 12 19 18 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 11 8 8 10 13 8 8 8 8 7 7 7 7 8 8 8 8 8 9 8 12 7 8 15 8 10 8 8 8 8 8 8 7 10 8
11 8 8 6 6 | Open.Hide. 9 9 8 8 8 14 18 20 31 28 28 28 22 28 29 32 32 37 37 37 36 21 16 6 6 6 6 6 6 6 6 10 11 11 11 9 11 11 20 19 29 30 37 33 33 47 47 44 59 44
36 36 13 7 6 6 6 6 6 6 6 8 19 19 28 33 39 39 43 43 48 47 53 50 42 42 42 43 43 43 47 57 48 53 53 53 53 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 57 48 53
53 57 57 57 48 48 43 43 37 26 34 28 28 18 18 11 11 10 11 18 23 28 28 24 24 22 28 28 48 39 25 21 10 10 10 10 8 8 10 10 12 15 13 9 9 10 15 10 12 8
8 15 15 15 13 14 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 6 8 9 9 9 9 8 8 10 10 9 9 9 9 10 10 12 13 7 7 8 8 10 10
10 13 13 12 15 23 11 11 11 22 22 25 27 22 20 17 15 11 11 13 19 17 22 17 18 15 12 13 14 11 9 10 8 8 8 9 9 13 8 10 10 10 13 18 16 11 10 9 9 9
10 14 13 8 8 8 15 15 23 17 13 8 8 8 8 8 10 8 11 11 8 8 8 8 8 10 10 12 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 10 16 18 16 15 15 12 10 9 10 8 8
8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 13 8 11 12 12 9 8 8 8 8 10 9 11 11 10 14 15 13 17 10 10 6 7 7 6 6 6 11 7 7 7 9 9 9 9 9 9 9 14 9
10 8 8 6 11 7 6 8 8 10 10 10 10 10 10 11 11 13 13 8 8 6 3 0 3 8 8 14 8 6 6 8 8 9 10 10 11 11 18 18 16 12 8 8 8 8 15 10 10 9
11 11 8 8 6 6 6 8 9 9 9 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 9 10 14 23 14 18 19 19 12 8 8 8 8 8 9 8 8 12 12 17 19 17 17 17 16
24 30 32 18 9 9 9 9 18 32 22 14 10 11 10 12 8 8 8 10 8 6 8 6 6 8 8 10 9 8 8 6 6 8 8 10 12 15 13 8 9 9 15 14 16 10 13 7 9 10
10 10 10 14 18 15 18 8 8 8 8 8 8 10 13 13 12 12 9 9 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 16 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 6 6
8 6 10 10 18 16 11 13 8 8 8 8 8 11 11 8 9 9 15 19 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 12 18 13 10 10 9 10 10 10 10 8 8
8 10 14 11 9 9 9 9 11 11 11 18 10 11 10 15 8 8 8 8 8 12 12 10 15 13 10 14 13 9 13 10 14 11 11 10 10 10 11 10 9 9 10 10 13 7 7 8 6 8
8 8 8 8 12 12 12 11 12 12 9 9 9 7 8 13 11 6 6 6 7 10 10 10 9 9 14 13 11 9 12 10 9 9 12 18 24 15 10 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 13 8 8 8 6 6 8 8 10 7 7 7 7 8 10 18 13 12 12 16 10 9 8 8 13 10 15 12 9 9 7 7 8 6 10 8 15 15 12 12 11 14 9 11 12 16 17
20 22 25 16 12 8 8 8 8 11 9 9 9 12 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 12 12 6 6 6 6 6 7 10 6 6 6 10 8 10 8 8 8
8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 10 9 12 15 13 10 8 8 8 8 11 12 19 14 18 10 13 7 7 8 8 8 8 6 6 6 13 15 11 6 6 6 6 6 11 15 14 11 8 10
8 8 8 6 8 6 6 6 6 10 11 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 11 11 9 8 8 8 8 12 12 25 12 12 6 6 8 8 11 11 11 16 11 11 6 6 6 6 8 8 9
14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 9 9 11 11 11 12 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 16 17 11 9 9 8 13 7 7 7 8 6 6 6 6 6 6
8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 13 12 7 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 21 26 22 10 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 6
6 6 6 8 8 9 9 9 7 8 8 8 8 8 8 11 11 12 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 9 7 10 8 9 9 9 8 8 11 11 6 6 6 8 8 6
6 6 8 10 7 6 6 6 10 9 17 3 0 |