BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-461J08.T7 (MSMg01no461_j08.b1) | MSMg01-461J08.TJ (MSMg01no461_j08.g1) |
ACC | AG546672 | AG546673 |
length | 784 | 773 |
length of high quality (start - end) | 244 (77 - 320) | 363 (76 - 438) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no461_j08.b1 PHD_FILE: MSMg01no461_j08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:35:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no461_j08.g1 PHD_FILE: MSMg01no461_j08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:35:14 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (111,790,179 - 111,790,422) | (111,597,115 - 111,597,477) |
---|
sequence | CTCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAAAGATCCG
CGGAATTCCCTATCTTTTTCTCTCATTCCCTTTCCTTTCCTTCCTTCTCC
ACCTTCCCTCTTTTCTTCTCCTCTCTTTCCCTTCCCCTCCCTTCCTATCT
TTCCCTGTCTTCCGTTTTGATGAGTATTTAATAAGCACTTTCTTTGTACC
CAGTATTGAACTCACTATTGCCTAGTACAACATCAGTATTACTGAAAAGC
ATTCTTCCTTATTGAGAGTCGTTTCCAAGATCTAGCTATCTTTGAAACAC
AGTCGGCATTTGCAAGTGGCTTTGTTTCTGATTATGTACCCAGAGTCTAG
CCCATCTGATGAAGTCATATATTTCTTGTGCTAGAGGAGTTTAGCTTCGG
GATCTTAACTCCTCTTTTATAGCCAGCCATGTGTTAACCTGCCATTAGTT
TTCCATAATTCCTTGAGCATTTTTTCTTCAGCACTGGAGTTTGAACCCAG
GCTTTATGTATGCTAGACAAGTGTTCTATCCTTGAGCTATAGTCCCTTGC
TTGCCAATTTCTAAACAGTTTGTCACTTCCTATATGAGCTTTTTTTTTTT
TCTTTTTCTTAAAGTAACCTACATCTCTTGCCGCTATTTACTGACATCTT
CCCTTATCGAACACTATGTTTCAACACCTTGTTGCCCACAATTAACTGTC
TCACCCTCACAACCCTCCCTATTCTTTTGTTGTTCCTTATCCCTCCACAT
TCGTTGACCCTCCCCCACATCTTTGTTTTCTCCN
| TTCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGGTTTAATGAGCTGCCACAGCCCA
CTTGCAAGGTGGGTTGGAATTTGCATTGACTCAGCTTTCTTTGAGCCCTC
CATTCTTCTGTAAATAACCCTTACCCACATTCCTAAAAATCACTCTGATG
ATCTCAGTGGCTAGCCAAGTTAGATTTTAGTGGAATCATTACTTGGTTCT
ATTGGCAGCTCCTTATCTGAGCCGAGTGGACATTTGTTTGTATCTCCAAA
AGAAAAGTCATTCAGCATGATTCTATGTCCTGAGTTCATAGGAGACAATT
TAAAATATCTAGAATTCGTTAAGGCATACTCAGATTTTGTCATTCAAGGC
AACCTCCTTAAAGCTGGCATCAGTCCATTCTAACAAGGTGACTTGCAGTG
TATCATCCCAGAGATTAAGTTATTGAGCCCGGACAGATATGGTTCACTCA
TTACAGATGCATCGTATGTTGTATTCATCCACCTTCTAGGCTAAACAAAG
TGTATATAAATGGAGCTTCCTTTCCCTGCTCGATTCATTTATCCCCCCAT
TTCTTTTTTAACTGATCCTTCTCATATTTTTTCGTTGTTTTCCCCACACT
TCGCTTTCCACATTTTCTCTTTTTCTCTCCCCTCATATTTCCTTCCTAAT
CATTCACCGCTCTAAATTTCCTTTTCTACTATATCTCTCTCCTCTCTTTA
CTTACCTCTACTTCTTATACACG
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10 17 19 28 19 20 20 21 28 28 29 31 32 30 33 29 29 37 48 30 28 24 22 20 19 25 9 9 7 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 12
18 12 23 23 31 31 44 33 59 59 47 44 44 27 19 13 12 9 9 8 8 8 10 11 11 11 21 21 34 37 43 47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 48
48 42 47 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 54 48 48 47 47 44 44 47 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 52 43 43 35 43 43 52 52 52 57 57 57 52 52 52 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 59 57 52 52 57 57 57 68 68 68 57 57 43 43 37 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 43
57 57 57 34 41 20 23 23 28 35 44 57 57 57 43 39 42 39 57 46 57 57 57 48 48 41 41 41 48 57 57 46 43 43 43 47 59 59 59 68 59 59 48 48 39 39 35 35 35 32
34 28 30 30 39 37 43 35 39 39 59 59 48 37 36 24 19 15 9 9 9 9 9 9 10 12 10 14 12 27 27 41 42 41 41 48 48 48 48 59 48 48 43 43 39 39 39 59 40 48
43 59 43 43 48 59 57 57 42 42 28 24 20 20 20 37 37 41 41 32 37 43 44 46 59 59 48 43 44 46 43 39 35 35 35 42 42 42 37 37 32 44 42 35 24 29 29 16 16 13
18 21 36 36 46 59 57 34 41 24 28 32 39 42 48 43 40 28 21 18 13 13 19 10 10 13 26 18 19 19 17 17 17 30 24 20 17 21 22 31 28 28 28 28 19 25 15 19 17 16
22 12 12 12 19 13 17 17 17 24 16 20 20 14 14 9 10 10 10 12 11 12 14 24 22 31 21 19 11 9 9 9 9 9 17 11 11 11 22 22 32 32 28 24 20 28 18 12 12 12
11 11 9 9 9 9 9 14 12 15 12 12 11 11 9 10 10 10 10 10 15 12 12 12 12 18 12 11 9 10 8 8 8 10 9 11 8 8 8 8 8 8 8 7 7 12 9 8 8 8
8 8 10 14 13 10 10 11 17 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 11 12 11 21 11 11 10 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 13 9 10 10 11 14 30 21 17
8 8 8 11 12 11 8 7 7 10 8 9 9 11 8 8 6 6 8 8 6 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10
10 11 10 10 10 10 10 11 11 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 10 13 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 7 8 8 8 8 9 16 10 10 8 8 8 8 8 8
10 9 9 8 10 10 8 8 8 8 9 11 11 13 15 15 14 15 15 15 10 8 8 10 15 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 6 6
8 6 6 6 6 6 6 6 8 15 22 19 17 10 10 10 11 10 12 10 10 10 14 11 11 11 15 10 8 6 6 8 3 0 | Open.Hide. 7 7 6 6 8 8 10 9 9 9 22 23 11 9 9 9 9 10 14 30 30 17 17 17 30 28 39 44 44 39 25 25 9 7 7 7 6 6 8 12 16 16 13 19 22 26 39 37 33 36
36 47 36 33 50 50 50 42 25 25 10 9 9 9 9 12 12 11 9 9 14 16 17 24 24 33 33 36 50 59 57 42 42 42 43 43 57 59 59 47 50 48 48 48 50 48 42 42 42 50
50 47 47 47 47 42 47 48 54 59 57 68 57 54 44 44 37 37 42 42 50 47 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57 57 54 54 54 54 54 54 57 57 57 59 68 59 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 57 57 50 50 50
68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 43 43 50 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57
57 44 37 28 25 28 30 42 42 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 43 43 43 48 57 59 59 47 43 43 48 48 46 54 57 59 48 54 54 59 57 57 59 59 59 48 48 47 47 47 47
48 48 48 59 59 47 43 43 43 43 43 43 43 34 34 18 22 12 12 12 12 12 12 12 16 16 25 25 47 59 47 47 47 46 39 39 39 39 39 39 43 57 48 40 40 29 29 35 42 42
43 42 30 30 32 43 47 47 34 31 20 20 20 32 37 59 43 43 37 43 39 32 32 42 42 43 44 44 57 59 59 43 43 43 59 57 57 57 48 57 48 57 57 57 37 37 42 42 42 42
32 36 36 44 44 59 43 43 43 43 43 43 43 43 21 18 14 18 18 24 11 8 8 8 8 12 19 43 50 50 43 43 37 43 43 19 24 17 14 14 15 15 18 30 18 18 21 21 30 32
32 36 37 32 35 27 32 20 19 19 15 12 13 11 18 17 13 11 11 12 13 13 20 19 24 15 17 14 15 14 14 14 16 12 12 12 11 10 10 12 10 9 9 9 9 10 12 10 11 11
16 17 14 13 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 6 7 8 8 8 10 10 9 9 11 10 12 10 13 19 14 11 10 9 9 11 11 11 11 9 9 9 9 10 8 8
8 8 10 8 8 8 9 9 10 11 11 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 12 8 8 8 8 8 8 7 7 8 10 8 8 10 10 19 15 22 10 10 10 10
15 15 25 19 16 11 10 10 8 8 6 6 8 10 10 10 16 8 10 11 12 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 10 10 8 8 8 10 12 8 8 8 10 8
8 8 8 8 13 11 12 14 14 10 10 10 10 8 10 9 9 10 12 10 13 15 8 8 8 8 8 8 8 6 8 15 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 12 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 9 11 15 13 10 12 9 9 9 9 12 15 11 11 11 12 16 24 19 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 15 9 8 8 12 12 8 8 8 12 12 8 9 9
8 10 6 6 8 8 8 10 8 10 15 12 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 |