BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-505I04.T7 (MSMg01no505_i04.b1) | MSMg01-505I04.TJ (MSMg01no505_i04.g1) |
ACC | AG580131 | AG580132 |
length | 756 | 767 |
length of high quality (start - end) | 626 (75 - 700) | 229 (330 - 558) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no505_i04.b1 PHD_FILE: MSMg01no505_i04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:33:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no505_i04.g1 PHD_FILE: MSMg01no505_i04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:33:26 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GCGCTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCGAGATGATCCG
CGGAATTCTAAGCCTACCTTGAAGGCAAGTGATTTTACTATGCTACTTGA
AAAGAAATCACCCATTTTGATTAATCTATAGAATTTCGCGATTGTTTTTA
TTATTAAAAGGCTGATTGTTGTAGGGTTAATATTTTTAGTTACCTGTCTT
GTTAGCCCTCCTGAGCTACAGTGAAAGCTTACAGACTCCTTTTCTGCTGA
TGATAAATAGATAAATAGAGCTGGTTCTGTTCACCTTCACAACACACTTC
CAAACTCATAAACTGAGCTGTTATTTCCGAAGAGCTATTTATGTCTTGAC
ATTGTTGGATTAGAGCTGCCTTTGTACTTTGAGTTCCTCCATAGTGAAGT
GAAACATAACTTAGTACATAAATAAACTGCAATCTACCTCTAAGCATATT
CTTCCAACAATTACCCGCATCTCAGTGGATCATAACAGTCAAGCTTCAGT
AATCTCATACTGCCAACCCATCCGACCATGTCTCTCTATGAGGCAAAGCC
TCATCATAGCTTTCACAAATGAGGCAGATGCTGAGCCCTAAGCACTCAAG
CTGTTCCTCTGTATCGTTGTTTTTTCTGTTAGTACACATCCTGCTGACAT
TTGTGGGTGGAAGGCTTTGAACCCCTCCTAGTTCAGAATGCTATTAGATT
TACAAATCATTCTTTGCTAGAATAAACTCTGTCAAATTTAGAGTCCCTTA
AAACAA
| ACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGATCTTTCCAAGACTTTTATC
ATGAATGGGTGTTGGATCTTGTCAAATGCTTTCTCAGCATCTAATGAGAT
GATCATGTGGTTTTTGTCTTTGAGTTTGTTTATATACTGGATTATGTTGA
TGGATTTTTGTATATTAAACCATCCCTGCATCCCTGGGATGAAACCTACT
TGGTCAGGTTGGATGATTGTTTTGATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGTGAG
AACTTTATTGAGGATATTGTATTTTATATTCATAAGGGAAATTGGTCTGA
AGTTCTCTATCTGTGTTGGGTCTTTTTGTGGTTTATGTATCAGAGTAATT
GTGGCTTCATAGAATGAGTTGTGTAGAGTATCTTCTGTTTCTATTTTGTG
GAATAGTTTGTGAAGAACTGGGTATAGATCTTTGAAGGTCTGATAGAACT
CTTCACTAAACCCATCTGGTCCTGGGCTTTTTTTGGTTGGGAGACTATGA
ATGACAGCTTCTATTTCCTTAGGGGATATAGGACTGTTTAGATCATTAAC
CTGATCTTGATTTAACTTTGGTACCTGGTATCTGTCTAGAAACTTGTCCA
TTCCATCCAGGTTCTCCCGTTTTGTTGAGTATAGCCTTTTGTAGAAAGCA
TTGATGGTGTTTTAAATTTCTTCCCGATTTGTTGTTATGGCTCTCTTTTC
CATTTCGGAGTTTGTTA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 6 6 6 8 8 8 10 16 25 44 44 37 37 37 32 29 29 37 25 19 12 10 12 23 23 47 28 25 22 16 15 9 9 6 7 7 6 6 6 10 11 10 10 15 10 12 13 25
33 41 31 31 31 31 37 37 59 29 27 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 11 17 13 13 28 28 35 39 37 47 53 53 53 53 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68
68 68 68 68 68 42 42 47 47 47 47 47 47 47 48 48 59 50 50 50 50 50 47 57 48 48 48 44 44 68 50 50 50 40 48 42 35 35 42 44 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 50 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 57 57 57 59 57 57 57 59
59 68 59 44 43 33 43 43 52 52 52 43 44 44 52 52 57 52 52 52 57 57 68 68 57 57 54 54 50 57 50 44 43 57 43 44 43 48 48 50 59 59 57 54 54 59 59 59 59 59
57 57 57 43 43 43 44 44 57 57 68 68 68 57 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 54 59 59 59 46 43 43 40 40 43 42 42 35 35 39 39 43 43 43 48 48 43 48 43 43
43 43 47 47 47 43 41 41 43 44 48 48 48 47 41 37 21 21 16 18 15 12 12 12 27 15 12 11 15 24 28 47 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 47 47 57 54 54 54 57 59 59 59 59 57 59 59 57 57 68 68 57 57 43 44 47 43 43 43 42 44 44 68 68 59 57 68 68 68
68 57 57 48 48 48 57 59 54 54 47 59 59 44 44 43 43 44 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 52 52 43 50 42 43 52 52 52 52 52 52 43 44 44 57 57 59 59 59 59 52
52 52 43 43 37 38 57 57 57 57 57 59 52 52 52 52 52 59 59 52 57 50 50 35 50 50 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 52 52 43 50 57 59 50 43 35 29 43 44
59 59 57 57 54 54 54 57 57 57 44 44 37 37 37 42 42 48 48 46 44 46 43 39 39 37 37 42 59 59 47 47 47 47 48 48 48 59 46 46 37 37 37 43 43 47 44 35 28 31
31 25 25 41 41 41 43 40 48 48 34 35 34 25 25 36 37 48 57 59 59 43 43 35 39 32 41 30 37 37 59 59 59 30 30 17 17 26 28 30 34 59 39 32 32 34 28 28 30 32
33 59 39 43 39 39 39 39 28 30 29 29 35 34 34 25 24 29 37 43 47 59 59 59 46 37 37 35 30 32 32 32 28 32 32 32 35 32 32 31 31 43 43 43 39 37 33 30 30 37
37 59 41 41 37 36 31 41 41 39 32 31 32 32 35 36 43 43 43 30 29 22 24 30 30 32 25 17 24 21 24 24 16 20 11 11 11 19 25 36 36 36 39 30 32 22 22 17 24 24
15 15 8 8 8 12 17 22 21 22 25 32 32 27 29 35 28 32 20 21 17 17 21 20 24 24 28 24 28 28 28 24 28 18 18 15 15 11 17 10 10 10 23 17 19 20 27 24 8 15
6 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 13 3 0 3 23 23 32 37 41 32 33 33 33 33 33 37 37 37 39 25 25 6 6 6 7 7 7 6 8 9 10 10 14 17 15 12 11 15 25 32
36 36 33 33 33 33 41 41 23 24 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 10 12 12 20 20 33 33 43 43 48 53 53 53 57 59 50 50 50 40 40 47 53 50 50 57 57 53 68 68 68
53 53 50 50 48 48 48 50 54 68 68 68 68 68 48 48 39 39 39 48 43 57 47 41 41 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 50 50 50 50 50 68 68 68 68 57 57 57 57 52 52 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 51 51 57 68 68 68 68 68 68 68
68 50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 54 57 57 59 59 57 50 50 50 50 50 50 57 57 54 54 57 59 59 59
47 31 31 15 15 12 18 19 44 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 50 53 53 57 57 57 59 59 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 47 47 41 30 29 14 13 9 9 9 12 12 9 9 9 10 11 23 20 30 30 34 47 50 59 59 48 48 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 47 43 43 43 43 47 47 57 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 59 44 44 31 31 33 44 42 48 48 57 57
68 68 57 59 57 44 44 35 32 32 44 44 59 59 59 57 57 54 54 57 57 57 59 57 52 52 52 52 52 54 59 59 59 59 57 57 54 54 50 57 50 54 54 59 57 57 57 43 43 44
44 48 47 57 43 43 43 44 44 44 31 28 36 40 41 39 42 42 43 43 37 43 43 42 42 35 35 35 42 42 47 57 48 39 39 36 36 31 23 23 36 36 36 40 36 57 48 57 57 57
43 41 28 23 23 28 32 43 43 40 39 39 30 30 36 39 47 59 39 35 35 37 37 32 32 25 24 24 34 30 31 35 39 37 25 28 27 23 23 22 24 21 28 14 21 21 34 30 37 43
43 39 39 37 28 28 17 13 19 16 22 17 14 14 23 15 12 12 19 18 11 11 13 25 25 28 24 24 20 20 19 15 23 15 15 10 21 23 37 37 20 17 13 8 8 9 28 28 35 29
29 32 33 30 28 33 33 33 33 43 43 43 43 39 39 31 32 31 24 19 12 10 10 14 13 13 10 10 11 10 15 10 10 10 10 13 16 16 10 10 8 8 10 15 17 12 12 12 12 12
12 19 23 24 18 18 19 15 13 11 9 10 10 10 12 11 12 13 10 10 10 19 17 15 15 16 10 8 8 8 8 12 15 16 18 14 21 21 21 12 12 12 9 10 8 8 8 8 8 6
8 8 11 11 22 11 14 14 16 21 19 19 17 9 8 8 11 9 12 12 16 12 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 9 8 15 6 6 6 8 10 15 12 9
9 9 10 12 13 9 9 9 9 10 10 17 12 15 15 11 11 |